Аполипопротеин B - Apolipoprotein B
Аполипопротеин B (ApoB) это белок что у людей кодируется APOB ген.
Функция
Аполипопротеин B является основным аполипопротеин из хиломикроны, ЛПОНП, IDL, и ЛПНП частицы (ЛПНП - широко известные неправильное употребление "Плохо холестерин "когда в отношении обоих сердечное заболевание и сосудистое заболевание в целом), который отвечает за перенос толстый молекулы (липиды ), включая холестерин, по всему телу всем клетки внутри всех ткани. Хотя все функциональные роли ApoB внутри частиц ЛПНП (и всех более крупных) остаются в некоторой степени неясными, он является основным организующим белком (всей сложной оболочки, включающей / несущей молекулы жира внутри) компонентом частиц и абсолютно необходим для образования этих частиц. Также ясно, что АпоВ на частице ЛПНП действует как лиганд для рецепторов ЛПНП в различных клетках по всему телу (то есть, менее формально, ApoB указывает на то, что частицы, несущие жир, готовы войти в любые клетки с рецепторами ApoB и доставить жиры внесены в камеры).
Благодаря механизмам, понятным лишь частично, высокие уровни ApoB, особенно связанные с более высокими концентрациями частиц ЛПНП, являются основным фактором бляшки это причина сосудистое заболевание (атеросклероз ), обычно сначала становясь явно симптоматический в качестве сердечное заболевание, Инсульт и многие другие осложнения на весь организм после десятилетий прогрессирования. Существуют значительные доказательства того, что концентрации ApoB[5][6] и особенно ЯМР анализ[7] (специфические для концентраций частиц ЛПНП) являются лучшими индикаторами физиологии сосудистых / сердечных заболеваний, чем общий холестерин или холестерин ЛПНП (при условии, что Национальные институты здравоохранения США с начала 1970-х годов). Однако, прежде всего, по причинам исторической стоимости / сложности, холестерина и оценочных ЛПНП-холестерин по расчету, остается наиболее часто продвигаемым липидным тестом на фактор риска атеросклероза. ApoB обычно измеряется с помощью иммуноанализов, таких как ELISA или же нефелометрия. Утонченный и автоматизированный ЯМР Методы позволяют измерять различия между множеством различных частиц ApoB.
Генетические нарушения
Высокий уровень ApoB связан с сердечными заболеваниями.Гипобеталипопротеинемия это генетическое расстройство что может быть вызвано мутацией в гене ApoB, APOB. Абеталипопротеинемия обычно вызвано мутацией в гене MTP, MTP.
Мутации в гене APOB100 также может вызвать семейная гиперхолестеринемия, наследственная (аутосомно-доминантная) форма нарушения обмена веществ Гиперхолестеринемия.
Исследования на мышах
Наиболее важная информация о гомологе мышиного ApoB, mApoB, получена из мышь исследования. Мыши со сверхэкспрессией mApoB имеют повышенные уровни «плохого холестерина» ЛПНП и сниженные уровни HDL «хороший холестерин».[8] Мыши, содержащие только одну функциональную копию гена mApoB, демонстрируют противоположный эффект, будучи устойчивыми к гиперхолестеринемия. Мыши, не содержащие функциональных копий гена, нежизнеспособны.[9]
Молекулярная биология
В белок происходит в плазма в 2 основных изоформах, ApoB48 и ApoB100. Первый синтезируется исключительно тонкий кишечник, второй по печень.[10] АпоВ-100 - самый крупный из белков группы апоВ, состоящий из 4563 аминокислот.[10] Обе изоформы кодируются APOB и одним мРНК транскрипт больше 16 кб. ApoB48 генерируется, когда стоп-кодон (UAA) в остатке 2153 создается Редактирование РНК. Кажется, есть транс-активный тканеспецифический ген сплайсинга, который определяет, какая изоформа в конечном итоге продуцируется.[нужна цитата ] С другой стороны, есть некоторые свидетельства того, что СНГ-действующий элемент несколько тысяч бп upstream определяет, какая изоформа производится.[нужна цитата ]
В результате редактирования РНК ApoB48 и ApoB100 имеют общую N-концевую последовательность, но ApoB48 не имеет C-конца ApoB100. Рецептор ЛПНП область связывания. Фактически, ApoB48 называется так, потому что он составляет 48% последовательности для ApoB100.
ApoB 48 - это уникальный белок хиломикронов тонкого кишечника. После того, как большая часть липидов в хиломикроне абсорбируется, ApoB48 возвращается в печень как часть остатка хиломикрона, где он подвергается эндоцитозу и деградации.
Клиническое значение
Преимущества
Роль в врожденной иммунной системе
Липопротеины очень низкой плотности и липопротеины низкой плотности мешать проверка кворума система, которая активирует гены, необходимые для инвазивного Золотистый стафилококк инфекционное заболевание. Механизм антагонизма включает связывание ApoB с S. aureus автоиндуктор феромон, предотвращающий передачу сигналов через свой рецептор. Мыши с дефицитом ApoB более восприимчивы к инвазивной бактериальной инфекции.[11]
Побочные эффекты
Роль в инсулинорезистентности
Избыточное производство аполипопротеина B может привести к липид-индуцированному стресс эндоплазматического ретикулума и резистентность к инсулину в печени.[12]
Роль липопротеинов и атеросклероза
ApoB100 находится в липопротеины происходящие из печени (ЛПОНП, IDL, ЛПНП[13]). Важно отметить, что на липопротеин печеночного происхождения приходится одна молекула ApoB100. Следовательно, используя этот факт, можно количественно оценить номер липопротеиновых частиц, отмечая общую концентрацию ApoB100 в кровотоке. Поскольку существует один и только один ApoB100 на частицу, количество частиц отражается концентрацией ApoB100. Тот же метод может быть применен к отдельным классам липопротеинов (например, ЛПНП) и, таким образом, позволяет считать их тоже.
Хорошо известно, что уровни ApoB100 связаны с ишемическая болезнь сердца, они намного лучше предсказывают это, чем концентрация ХС-ЛПНП.[14][15] Причина: ХС-ЛПНП не отражает фактическую концентрацию частиц, а холестерин не может растворяться или перемещаться (в воде) без частиц, которые его переносят. Простой способ понять это наблюдение - это тот факт, что ApoB100, один на частицу, отражает фактическую концентрацию липопротеиновых частиц (независимо от их холестерина или другого содержания липидов). Таким образом, можно понять, что количество липопротеиновых частиц, содержащих ApoB100, которые могут переносить липиды в стенки артерий, является ключевым фактором, приводящим к атеросклерозу и сердечным заболеваниям.
Один из способов объяснить вышесказанное - это учесть, что большое количество липопротеиновых частиц и, в частности, большое количество частиц ЛПНП приводят к конкуренции рецептора ApoB100 (т.е. рецептора ЛПНП) периферических клеток. Поскольку такая конкуренция продлит время пребывания частиц ЛПНП в циркуляции, это может привести к большей возможности для них подвергнуться окисление и / или другие химические модификации. Такие модификации могут уменьшать способность частиц очищаться классическим рецептором ЛПНП и / или увеличивать их способность взаимодействовать с так называемыми рецепторами «скавенджеров». Конечный результат - шунтирование частиц ЛПНП к этим рецепторам поглотителей. Рецепторы мусорщиков обычно находятся на макрофаги, с макрофагами, нагруженными холестерином, более известными как "пенные ячейки ". Клетки пены характеризуют атеросклеротические поражения. В дополнение к этому возможному механизму образования ячеек пены, увеличение уровней химически модифицированных частиц ЛПНП может также привести к увеличению эндотелиальный повреждать. Это происходит в результате токсического действия модифицированного ЛПНП на эндотелий сосудов, а также его способности привлекать иммунные эффекторные клетки и способствовать тромбоцит активация.
Исследование INTERHEART показало, что соотношение ApoB100 / ApoA1 более эффективно для прогнозирования риска сердечного приступа у пациентов, перенесших острый инфаркт миокарда, чем измерение только ApoB100 или ApoA1.[16] (ApoA1 является основным белком ЛПВП.[17]) В общей популяции это остается неясным, хотя в недавнем исследовании ApoB был самым сильным маркером риска сердечно-сосудистых событий.[18] Небольшое исследование предполагает, что добавление к флувастатин ежедневное лечение омега-3 жирными кислотами, содержащими 460 мг E-EPA и 380 мг E-DHA (этиловые эфиры), может снизить уровень ApoB48 у диабетиков с гиперлипемией 2 типа.[19]
Взаимодействия
Было показано, что ApoB взаимодействовать с апо (а),[20] PPIB,[21] Рецептор кальцитонина[21][22] и HSP90B1.[21][22] Взаимодействие ApoB с протеогликаны, коллаген, и фибронектин считается причиной атеросклероз.[23][24]
Интерактивная карта проезда
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]
- ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430".
Регулирование
В выражение из APOB регулируется цис-регуляторные элементы в APOB 5 ′ UTR и 3 ′ UTR.[25]
Редактирование РНК
В мРНК этого белка подлежит Цитидин к Уридин (От C до U) для конкретного сайта Редактирование РНК. ApoB100 и ApoB48 кодируются одним и тем же геном, однако различия в транслируемых белках происходят не из-за альтернативного сплайсинга, а из-за события редактирования тканеспецифической РНК. Редактирование мРНК АпоВ было первым примером редактирования, наблюдаемым у позвоночных.[26] Редактирование мРНК ApoB происходит во всех плацентарные млекопитающие.[27] Редактирование происходит посттранскрипционно по мере возникновения полинуклеотиды не содержат отредактированных нуклеозидов.[28]
Тип
C to U-редактирование мРНК ApoB требует редактирующего комплекса или холоэнзим (эдитосома), состоящая из C-U-редактирующего фермента Фермент редактирования мРНК аполипопротеина B, каталитический полипептид 1 (ApoBEC-1), а также другие вспомогательные факторы. ApoBEC-1 - это белок, который у человека кодируется APOBEC1 ген.[29][1] Он является членом цитидин дезаминаза семья. Одного ApoBEC-1 недостаточно для редактирования мРНК ApoB [30] и требует хотя бы одного из этих вспомогательных факторов, Фактор комплементации APOBEC1 (A1CF)[31] для редактирования. A1CF содержит 3 неидентичных повтора. Он действует как субъединица связывания РНК и направляет ApoBEC-1 к мРНК ApoB после редактируемого цитидина.[32] Известно, что в состав холофермента входят и другие вспомогательные факторы. Некоторые из этих белков были идентифицированы. это CUG-связывающий белок 2 (CUGBP2 ),[33] SYNCRIP (богатый глицин-аргинин-тирозин связывающий белок РНК, GRY-RBP),[34] гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин (hnRNP) -C1,[35] Связывающий белок ApoBEC-1 (ABBP) 1, ABBP2,[36] Регуляторный связывающий белок сплайсинга KH-типа (KSRP), Bcl-2-ассоциированный антоген 4 (BAG4),[37] и вспомогательный коэффициент (AUX) 240.[38] Все эти белки были идентифицированы с помощью анализов обнаружения, и было продемонстрировано, что все они взаимодействуют с РНК ApoBEC-1, A1CF или ApoB. Функция этих вспомогательных белков в редактирующем комплексе неизвестна. Помимо редактирования мРНК ApoB, часть редактирования ApoBEC-1 также редактирует мРНК NF1. Редактирование мРНК мРНК ApoB является наиболее ярким примером этого типа редактирования РНК от C до U у людей.
Место расположения
Несмотря на то, что это транскрипт длиной 14 000 остатков, единственный цитидин предназначен для редактирования. Внутри мРНК ApoB обнаружена последовательность из 26 нуклеотидов, необходимая для редактирования. Это известно как мотив редактирования. Эти нуклеотиды (6662–6687) были определены как существенные в экспериментах по сайт-специфическому мутагенезу.[39] Часть этой последовательности из 11 нуклеотидов, расположенная на 4–5 нуклеотидов ниже сайта редактирования, является важной областью, известной как последовательность закрепления.[40] Область, называемая спейсерным элементом, находится на расстоянии 2-8 нуклеотидов между редактируемым нуклеозидом и этой закрепляющей последовательностью.[41] Также существует регуляторная последовательность 3 'для сайта редактирования. Считается, что активный сайт ApoBEC-1, каталитического компонента редактирующего холофермента, связывается с богатой AU областью закрепленной последовательности с помощью ACF в связывании комплекса с мРНК.[42]Отредактированный остаток цитидина расположен на нуклеотиде 6666, расположенном в экзоне 26 гена. Редактирование на этом сайте приводит к изменению кодона с кодона глутамина (CAA) на стоп-кодон внутренней части (UAA).[26] Компьютерное моделирование обнаружило необходимость редактирования, отредактированный цитидин находится в петле.[40] Выбор отредактированного цитидина также сильно зависит от этой вторичной структуры окружающей РНК. Есть также некоторые признаки того, что эта область петли образуется между закрепляющей последовательностью и 3'-регуляторной областью мРНК ApoB.[43] Предполагается, что предсказанная вторичная структура, образованная мРНК ApoB, обеспечивает контакт между редактируемым остатком и активным сайтом APOBEC1, а также для связывания ACF и других вспомогательных факторов, связанных с редактированием.
Регулирование
Редактирование мРНК ApoB у людей регулируется тканями, при этом ApoB48 является основным белком ApoB тонкого кишечника человека. Он встречается в меньших количествах в толстой кишке, почках и желудке вместе с неотредактированной версией.[44]Редактирование также регулируется с точки зрения развития: неотредактированная версия переводится только на ранней стадии разработки, но отредактированная форма увеличивается во время разработки в тканях, где может происходить редактирование.[45][46]Было показано, что редактируемые уровни мРНК ApoB изменяются в ответ на изменения в диете. воздействие алкоголя и гормонов.[47][48][49]
Сохранение
Редактирование мРНК ApoB также происходит у мышей и крыс. В отличие от людей редактирование происходит в печени у мышей и крыс с частотой до 65%.[50] Это не наблюдалось у птиц или меньших видов.[51]
Последствия
Структура
Редактирование приводит к изменению кодона, создающему стоп-кодон в рамке считывания, что приводит к трансляции усеченного белка ApoB48. Этот стоп-кодон приводит к трансляции белка, у которого отсутствует карбоксильный конец, который содержит домен связывания LDLR белка. Полный белок ApoB100, который содержит почти 4500 аминокислот, присутствует в VLDL и LDL. Поскольку многие части ApoB100 находятся в амфипатическом состоянии, структура некоторых из его доменов зависит от основных липидных состояний. Однако известно, что у LDL имеется такая же общая укладка, имеющая пять основных доменов. Недавно первая структура ЛПНП при температуре человеческого тела в естественных условиях была обнаружена с помощью криоэлектронной микроскопии с разрешением 16 ангстрем.[52] Подтверждена полная укладка ApoB-100 и картирована некоторая гетерогенность в локальной структуре его доменов.
Функция
Редактирование ограничено теми стенограммами, которые указаны в тонкий кишечник. Эта более короткая версия белка имеет функцию, специфичную для тонкого кишечника. Основная функция полной длины печень экспрессированный ApoB100 является лигандом для активации LDL-R. Однако редактирование приводит к тому, что в белке отсутствует эта связывающая область LDL-R белка. Это изменяет функцию белка и более короткого белка ApoB48 как специфических функций по отношению к тонкому кишечнику. ApoB48 идентичен амино-концевому 48% ApoB100.[53] Функция этой изоформы заключается в абсорбции жира в тонком кишечнике и участвует в синтезе, сборке и секреции хиломикроны. Эти хиломикроны транспортируют пищевые липиды к тканям, в то время как оставшиеся хиломикроны вместе с соответствующими остаточными липидами за 2–3 часа поглощаются печенью за счет взаимодействия аполипопротеин E (ApoE) с рецепторами липопротеинов. Это доминирующий белок ApoB в тонком кишечнике большинства млекопитающих. Это ключевой белок в экзогенном пути метаболизма липопротеинов. Белки кишечника, содержащие ApoB48, метаболизируются до остаточных частиц хиломикрона, которые захватываются остаточными рецепторами.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084674 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020609 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Лим Дж.С., Ли Д.Х., Пак Дж.Й., Джин Ш., Джейкобс Д.Р. (2011). «Надежность измерения холестерина липопротеинов низкой плотности, холестерина липопротеинов не высокой плотности и аполипопротеина B». Журнал клинической липидологии. 5 (4): 264–272. Дои:10.1016 / j.jacl.2011.05.004. PMID 21784371.
- ^ Якобсон Т.А. (2011). «Открытие нового липидного« апо-текари »: включение аполипопротеинов в качестве потенциальных факторов риска и целей лечения для снижения сердечно-сосудистого риска». Труды клиники Мэйо. 86 (8): 762–780. Дои:10.4065 / mcp.2011.0128. ЧВК 3146376. PMID 21803958.
- ^ Кармена Р., Дурье П., Фрючарт Дж. К. (2004). «Атеросклероз: развивающаяся биология сосудов и клинические последствия». Тираж. 109 (23): III – 2. Дои:10.1161 / 01.CIR.0000131511.50734.44. PMID 15198959.
- ^
Маккормик С.П., Нг Дж. К., Вениант М., Борен Дж., Пьеротти В., Флинн Л. М., Грасс Д. С., Янг С. Г. (1996). «Трансгенные мыши, которые сверхэкспрессируют аполипопротеин B мыши. Доказательства того, что последовательности ДНК, контролирующие экспрессию гена аполипопротеина B в кишечнике, далеки от структурного гена». Журнал биологической химии. 271 (20): 11963–11970. Дои:10.1074 / jbc.271.20.11963. PMID 8662599. - ^ Фарезе Р.В., Руланд С.Л., Флинн Л.М., Стоковски Р.П., Янг С.Г. (1995). «Нокаут гена аполипопротеина B мыши приводит к эмбриональной летальности у гомозигот и защите от гиперхолестеринемии, вызванной диетой, у гетерозигот». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (5): 1774–1778. Bibcode:1995PNAS ... 92.1774F. Дои:10.1073 / пнас.92.5.1774. ЧВК 42602. PMID 7878058.
- ^ а б Chen SH, Yang CY, Chen PF, Setzer D, Tanimura M, Li WH, Gotto AM Jr, Chan L (1986). «Полная кДНК и аминокислотная последовательность человеческого аполипопротеина B-100». Журнал биологической химии. 261 (28): 12918–12921. PMID 3759943.
- ^ Петерсон М.М., Мак Д.Л., Холл PR, Алсуп А.А., Александр С.М., Салли Е.К., Савирес Ю.С., Чунг А.Л., Отто М., Грешам HD (2008). «Аполипопротеин B - это врожденный барьер против инвазивной инфекции Staphylococcus aureus». Клеточный хозяин и микроб. 4 (6): 507–509. Дои:10.1016 / j.chom.2008.10.001. ЧВК 2639768. PMID 19064256.
- ^ Су Кью, Цай Дж., Сюй Э., Цю В., Берецки Э., Сантха М., Адели К. (2009). «Аполипопротеин B100 действует как молекулярная связь между стрессом эндоплазматического ретикулума, вызванным липидами, и резистентностью к инсулину печени». Гепатология. 50 (1): 77–84. Дои:10.1002 / hep.22960. PMID 19434737. S2CID 205869807.
- ^ Энциклопедия MedlinePlus: Аполипопротеин B100
- ^ Кромвель В.К., Отвос Д.Д., Киз М.Дж., Пенсина М.Дж., Салливан Л., Васан Р.С., Уилсон П.У., Д'Агостино Р.Б. (декабрь 2007 г.). «Количество частиц ЛПНП и риск сердечно-сосудистых заболеваний в будущем в исследовании Framingham Offspring - значение для лечения ЛПНП». Журнал клинической липидологии. 1 (6): 583–592. Дои:10.1016 / j.jacl.2007.10.001. ЧВК 2720529. PMID 19657464.
- ^ Снайдерман А.Д., Ламарш Б., Контуа Дж. Х., де Грааф Дж. (Декабрь 2014 г.). «Анализ несогласованности и гордиев узел холестерина ЛПНП и не-ЛПВП по сравнению с апоВ». Текущее мнение в липидологии. 25 (6): 461–467. Дои:10.1097 / MOL.0000000000000127. PMID 25340478. S2CID 23464159.
- ^ Маккуин М.Дж., Хокен С., Ван X, Оунпуу С., Снайдерман А., Пробстфилд Дж., Стейн К., Сандерсон Дж. Э., Хасани М., Волкова Е., Казми К., Юсуф С. (июль 2008 г.). «Липиды, липопротеины и аполипопротеины как маркеры риска инфаркта миокарда в 52 странах (исследование INTERHEART): исследование случай-контроль». Ланцет. 372 (9634): 224–233. Дои:10.1016 / S0140-6736 (08) 61076-4. PMID 18640459. S2CID 26567691.
- ^ ван дер Ворст EP (2020). «Липопротеины высокой плотности и аполипопротеин А1». Респираторные белки, липопротеины и другие белки жидкостей организма позвоночных и беспозвоночных. Субклеточная биохимия. 94. С. 399–420. Дои:10.1007/978-3-030-41769-7_16. ISBN 978-3-030-41768-0. PMID 32189309.
- ^ Бенн М., Нордестгаард Б.Г., Йенсен Г.Б., Тибьерг-Хансен А. (2007). «Улучшение прогнозирования ишемической сердечно-сосудистой болезни среди населения в целом с использованием аполипопротеина B: исследование сердца в Копенгагене». Артериосклер Thromb Vasc Biol. 27 (3): 661–670. Дои:10.1161 / 01.ATV.0000255580.73689.8e. PMID 17170368.
- ^ Вальдивьелсо П., Риоха Дж., Гарсия-Ариас С. и др. (Январь 2009 г.) «Жирные кислоты омега-3 вызывают заметное снижение аполипопротеина B48 при добавлении к флувастатину у пациентов с диабетом 2 типа и смешанной гиперлипидемией: предварительное сообщение». Кардиоваск Диабетол. 8:1. Бесплатный полный текст
- ^ Малагуарнера М., Ваканте М., Руссо С., Малагуарнера Дж., Антич Т, Малагуарнера Л., Белла Р., Пенниси Дж., Гальвано Ф, Фриджола А. (2013). «Липопротеин (а) при сердечно-сосудистых заболеваниях». BioMed Research International. 2013 (650989): 1–9. Дои:10.1155/2013/650989. ЧВК 3591100. PMID 23484137.
- ^ а б c Чжан Дж., Гершовиц Х (февраль 2003 г.). «Возникающий липидированный аполипопротеин B транспортируется к Гольджи в виде не полностью свернутого промежуточного продукта, что подтверждается его ассоциацией с сетью молекулярных шаперонов эндоплазматического ретикулума, GRP94, ERp72, BiP, кальретикулином и циклофилином B». J. Biol. Chem. 278 (9): 7459–7468. Дои:10.1074 / jbc.M207976200. PMID 12397072.
- ^ а б Линник KM, Herscovitz H (август 1998 г.). «Множественные молекулярные шапероны взаимодействуют с аполипопротеином B во время его созревания. Сеть шаперонов, резидентных в эндоплазматическом ретикулуме (ERp72, GRP94, кальретикулин и BiP) взаимодействует с аполипопротеином b независимо от его липидного состояния». J. Biol. Chem. 273 (33): 21368–21373. Дои:10.1074 / jbc.273.33.21368. PMID 9694898.
- ^ Халил М.Ф., Вагнер В.Д., Голдберг И.Дж. (2004). «Липопротеин (а) при сердечно-сосудистых заболеваниях». Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов. 24 (12): 2211–2218. Дои:10.1161 / 01.ATV.0000147163.54024.70. PMID 15472124.
- ^ Табас I, Уильямс KJ, Borén J (2007). «Задержка субэндотелиальных липопротеинов как инициирующий процесс при атеросклерозе: обновление и терапевтические последствия». Тираж. 116 (16): 1832–1844. Дои:10.1161 / cycleaha.106.676890. PMID 17938300.
- ^ Понтрелли Л., Сидиропулос К.Г., Адели К. (2004). «Трансляционный контроль мРНК аполипопротеина B: регуляция с помощью цис-элементов в 5'- и 3'-нетранслируемых областях». Биохимия. 43 (21): 6734–6744. Дои:10.1021 / bi049887s. PMID 15157107.
- ^ а б Пауэлл Л.М., Уоллис С.К., Пиз Р.Дж., Эдвардс Ю.Х., Нотт Т.Дж., Скотт Дж. (Сентябрь 1987 г.). «Новая форма тканеспецифического процессинга РНК производит аполипопротеин-B48 в кишечнике». Клетка. 50 (6): 831–840. Дои:10.1016/0092-8674(87)90510-1. PMID 3621347. S2CID 37938313.
- ^ Fujino T, Navaratnam N, Jarmuz A, von Haeseler A, Scott J (июль 1999 г.). «C → U-редактирование мРНК аполипопротеина В у сумчатых: идентификация и характеристика APOBEC-1 американского опоссума Monodelphus domestica». Nucleic Acids Res. 27 (13): 2662–2671. Дои:10.1093 / nar / 27.13.2662. ЧВК 148475. PMID 10373583.
- ^ Лау PP, Xiong WJ, Zhu HJ, Chen SH, Chan L (октябрь 1991 г.). «Редактирование мРНК аполипопротеина B - это внутриядерное событие, которое происходит посттранскрипционно одновременно со сплайсингом и полиаденилированием». J. Biol. Chem. 266 (30): 20550–20554. PMID 1939106.
- ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2011-07-26. Получено 2011-02-24.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
- ^ Наваратнам Н., Фуджино Т., Бейлисс Дж., Джармуз А., Хау А., Ричардсон Н., Сомасекарам А., Бхаттачарья С., Картер С., Скотт Дж. (Январь 1998 г.). «Цитидиндезаминаза Escherichia coli обеспечивает молекулярную модель для редактирования РНК ApoB и механизм распознавания субстрата РНК». J. Mol. Биол. 275 (4): 695–714. Дои:10.1006 / jmbi.1997.1506. PMID 9466941.
- ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2011-07-26. Получено 2011-02-24.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
- ^ Блан В., Кеннеди С., Дэвидсон Н.О. (октябрь 2003 г.). «Новый сигнал ядерной локализации во вспомогательном домене фактора комплементации апобек-1 регулирует ядерно-цитоплазматический импорт и перемещение». J. Biol. Chem. 278 (42): 41198–41204. Дои:10.1074 / jbc.M302951200. PMID 12896982.
- ^ Анант С., Хендерсон Дж.О., Мукхопадхьяй Д., Наваратнам Н., Кеннеди С., Мин Дж., Дэвидсон Н.О. (декабрь 2001 г.). «Новая роль РНК-связывающего белка CUGBP2 в редактировании РНК млекопитающих. CUGBP2 модулирует редактирование C в U мРНК аполипопротеина B путем взаимодействия с апобек-1 и A1CF, фактором комплементации апобек-1». J. Biol. Chem. 276 (50): 47338–47351. Дои:10.1074 / jbc.M104911200. PMID 11577082.
- ^ Блан В., Наваратнам Н., Хендерсон Дж. О., Анант С., Кеннеди С., Джармуз А., Скотт Дж., Дэвидсон Н. О. (март 2001 г.). «Идентификация GRY-RBP как аполипопротеина B РНК-связывающего белка, который взаимодействует как с апобек-1, так и с апобек-1 фактором комплементации, чтобы модулировать редактирование C в U». J. Biol. Chem. 276 (13): 10272–10283. Дои:10.1074 / jbc.M006435200. PMID 11134005.
- ^ Грив Дж, Леллек Х, Раутенберг П, Гретен Х (1998). «Ингибирование комплекса ферментов редактирования мРНК аполипопротеина B с помощью белка hnRNP C1 и комплексов hnRNP 40S». Биол. Chem. 379 (8–9): 1063–1073. Дои:10.1515 / bchm.1998.379.8-9.1063. PMID 9792439. S2CID 25911416.
- ^ Лау П.П., Вильянуэва Х., Кобаяши К., Накамута М., Чанг Б.Х., Чан Л. (декабрь 2001 г.). «Белок DnaJ, апобек-1-связывающий белок-2, модулирует редактирование мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem. 276 (49): 46445–46452. Дои:10.1074 / jbc.M109215200. PMID 11584023.
- ^ Лау П.П., Чан Л. (декабрь 2003 г.). «Участие шаперонного регулятора, Bcl2-ассоциированного атаногена-4, в редактировании мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem. 278 (52): 52988–52996. Дои:10.1074 / jbc.M310153200. PMID 14559896.
- ^ Шок Д., Куо С. Р., Штейнбург М. Ф., Болоньино М., Спаркс Д. Д., Спаркс К. Э., Смит Х. С. (февраль 1996 г.). «Вспомогательный фактор, содержащий белковый комплекс массой 240 кДа, участвует в редактировании РНК аполипопротеина B». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (3): 1097–1102. Bibcode:1996PNAS ... 93.1097S. Дои:10.1073 / пнас.93.3.1097. ЧВК 40037. PMID 8577721.
- ^ Дэвис М.С., Уоллис С.К., Дрисколл Д.М., Винн Дж. К., Уильямс Г. В., Пауэлл Л. М., Скотт Дж. (Август 1989 г.). «Требования к последовательности для редактирования РНК аполипопротеина B в трансфицированных клетках гепатомы крысы». J. Biol. Chem. 264 (23): 13395–13398. PMID 2760026.
- ^ а б Шах Р.Р., Нотт Т.Дж., Легрос Дж.Э., Наваратнам Н., Грив Дж. К., Скотт Дж. (Сентябрь 1991 г.). «Требования к последовательности для редактирования мРНК аполипопротеина B». J. Biol. Chem. 266 (25): 16301–16304. PMID 1885564.
- ^ Дрисколл Д.М., Лакхе-Редди С., Олекса Л.М., Мартинез Д. (декабрь 1993 г.). «Индукция редактирования РНК в гетерологичных сайтах последовательностями в мРНК аполипопротеина B». Мол. Клетка. Биол. 13 (12): 7288–7294. Дои:10.1128 / MCB.13.12.7288. ЧВК 364799. PMID 8246950.
- ^ Грив Дж., Наваратнам Н., Скотт Дж. (Июль 1991 г.). «Характеристика фермента редактирования мРНК аполипопротеина B: отсутствие сходства с предложенным механизмом редактирования РНК у кинетопластидных простейших». Nucleic Acids Res. 19 (13): 3569–3576. Дои:10.1093 / nar / 19.13.3569. ЧВК 328381. PMID 1649450.
- ^ Ричардсон Н., Наваратнам Н., Скотт Дж. (Ноябрь 1998 г.). «Вторичная структура сайта редактирования мРНК аполипопротеина B. Au-связывающие белки взаимодействуют со стержневой петлей». J. Biol. Chem. 273 (48): 31707–31717. Дои:10.1074 / jbc.273.48.31707. PMID 9822632.
- ^ Тэн Б., Верп М., Саломон Дж., Дэвидсон Н.О. (ноябрь 1990 г.). «Редактирование матричной РНК аполипопротеина B регулируется в процессе развития и широко экспрессируется в тканях человека». J. Biol. Chem. 265 (33): 20616–20620. PMID 2243107.
- ^ Ву Дж. Х., Семенкович С. Ф., Чен Ш., Ли У. Х., Чан Л. (июль 1990 г.). «Редактирование мРНК аполипопротеина B. Подтверждение чувствительного анализа и биологии развития редактирования РНК у крыс». J. Biol. Chem. 265 (21): 12312–12316. PMID 2373694.
- ^ Гликман Р. М., Роджерс М., Гликман Дж. Н. (июль 1986 г.). «Синтез аполипопротеина B в печени и кишечнике человека in vitro». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (14): 5296–5300. Bibcode:1986PNAS ... 83.5296G. Дои:10.1073 / pnas.83.14.5296. ЧВК 323938. PMID 3460091.
- ^ Баум К.Л., Тэн ВВ, Дэвидсон Н.О. (ноябрь 1990 г.). «Редактирование матричной РНК аполипопротеина B в печени крыс. Модуляция голоданием и возобновление питания с высоким содержанием углеводов». J. Biol. Chem. 265 (31): 19263–19270. PMID 2229075.
- ^ Лау П.П., Кэхилл Д.Дж., Чжу Х.Дж., Чан Л. (октябрь 1995 г.). «Этанол модулирует редактирование мРНК аполипопротеина B у крыс». J. Lipid Res. 36 (10): 2069–2078. PMID 8576634.
- ^ Чан Л., Чанг Б.Х., Накамута М., Ли У.Х., Смит Л.К. (март 1997 г.). «Редактирование мРНК апобек-1 и аполипопротеина В». Биохим. Биофиз. Acta. 1345 (1): 11–26. Дои:10.1016 / S0005-2760 (96) 00156-7. PMID 9084497.
- ^ Чан Л. (январь 1993 г.). «Редактирование РНК: исследование одного режима с мРНК аполипопротеина B». BioEssays. 15 (1): 33–41. Дои:10.1002 / bies.950150106. PMID 8466474. S2CID 314984.
- ^ Таруги П., Альбертацци Л., Николини С., Каландра С. (март 1990 г.). «Отсутствие аполипопротеина B-48 у цыплят Gallus domesticus». J. Lipid Res. 31 (3): 417–427. PMID 2341807.
- ^ Кумар В., Мясник С.Дж., Орни К., Энгельхардт П., Хейкконен Дж., Каски К., Ала-Корпела М., Кованен П.Т. (май 2011 г.). «Трехмерная криоЭМ-реконструкция нативных частиц ЛПНП с разрешением 16 Å при физиологической температуре тела». PLOS ONE. 6 (5): e18841. Bibcode:2011PLoSO ... 618841K. Дои:10.1371 / journal.pone.0018841. ЧВК 3090388. PMID 21573056.
- ^ Knott TJ, Pease RJ, Powell LM, Wallis SC, Rall SC, Innerarity TL, Blackhart B, Taylor WH, Marcel Y, Milne R (1986). «Полная последовательность белка и идентификация структурных доменов человеческого аполипопротеина B». Природа. 323 (6090): 734–738. Bibcode:1986Натура.323..734K. Дои:10.1038 / 323734a0. PMID 3773997. S2CID 536926.
Маккормик С.П., Нг Дж. К., Вениант М., Борен Дж., Пьеротти В., Флинн Л. М., Грасс Д. С., Янг С. Г. (1996). дальнейшее чтение
- Mahley RW, Innerarity TL, Rall SC, Weisgraber KH (1985). «Липопротеины плазмы: структура и функции аполипопротеинов». J. Lipid Res. 25 (12): 1277–1294. PMID 6099394.
- Итакура Х, Мацумото А (1995). «[Аполипопротеин B]». Ниппон Риншо. 52 (12): 3113–3118. PMID 7853698.
- Чумакова О.С., Затейщиков Д.А., Сидоренко Б.А. (2006). «[Аполипопротеин B: структура, функция, полиморфизм гена и связь с атеросклерозом]». Кардиология. 45 (6): 43–55. PMID 16007035.
- Йе Дж (2007). «Зависимость метаболических путей холестерина хозяина от жизненного цикла вируса гепатита С». PLOS Pathog. 3 (8): e108. Дои:10.1371 / journal.ppat.0030108. ЧВК 1959368. PMID 17784784.
внешняя ссылка
- База данных редактирования РНК (DARNED).
- Прикладные исследования аполипопротеина-B
- Человек APOB расположение генома и APOB страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.