APOA2 - APOA2

APOA2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1L6L, 2OU1
Идентификаторы
Псевдонимы	APOA2, Apo-AII, ApoA-II, apoAII, аполипопротеин A2
Внешние идентификаторы	MGI: 88050 ГомолоГен: 1242 Генные карты: APOA2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.3 Начинать 161,222,292 бп[1] Конец 161,223,631 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H3 | 1 79,22 см Начинать 171,225,054 бп[2] Конец 171,226,379 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ингибитора липазы • активность гомодимеризации белков • связывание фосфатидилхолина • активность переносчика липидов • связывание рецептора аполипопротеина • связывание с рецептором липопротеиновых частиц высокой плотности • связывание холестерина • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • активность активатора фосфатидилхолин-стерол-O-ацилтрансферазы • связывание фосфолипидов • GO: 0017127 активность переноса холестерина • связывание липидов • связывание липопротеинов высокой плотности с частицами • связывание с белками теплового шока • рецепторное связывание Сотовый компонент • цитозоль • микрочастица крови • просвет эндоплазматического ретикулума • хиломикрон • липопротеиновые частицы очень низкой плотности • сферическая частица липопротеинов высокой плотности • внеклеточная область • ранняя эндосома • частица липопротеинов высокой плотности • внеклеточная экзосома • внеклеточный Биологический процесс • отрицательное регулирование импорта холестерина • отрицательная регуляция ремоделирования частиц липопротеинов очень низкой плотности • катаболический процесс диацилглицерина • липидный транспорт • регулирование стабильности белка • положительное регулирование этерификации холестерина • отток фосфолипидов • транспорт холестерина • положительная регуляция липидного катаболического процесса • ответ на глюкокортикоиды • GO: 0002719 отрицательная регуляция продукции цитокинов, участвующих в иммунном ответе • ответ на глюкозу • сборка частиц липопротеинов высокой плотности • ретиноидный метаболический процесс • ответ на эстроген • ремоделирование частиц липопротеинов высокой плотности • отрицательная регуляция активности липазы • регулирование всасывания холестерина в кишечнике • ремоделирование липопротеиновых частиц низкой плотности • острый воспалительный ответ • регенерация органов животных • катаболический процесс фосфолипидов • модификация пептидилметионина • отток холестерина • отрицательная регуляция транспорта холестерина • гомеостаз холестерина • процесс биосинтеза фосфатидилхолина • отрицательная регуляция активности транспортера холестерина • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция липидного катаболического процесса • окисление белков • ремоделирование частиц липопротеинов, богатых триглицеридами • ответ на наркотик • метаболический процесс триглицеридов • обратный транспорт холестерина • клиренс липопротеинов высокой плотности • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • метаболический процесс холестерина • регуляция липидного обмена • ремоделирование хиломикронов • сборка хиломикрона • липопротеиновый метаболический процесс • посттрансляционная модификация • метаболический процесс клеточного белка • транспорт • положительная регуляция фагоцитоза • стабилизация белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	336	11807
Ансамбль	ENSG00000158874	ENSMUSG00000005681
UniProt	P02652	P09813
RefSeq (мРНК)	NM_001643	NM_013474 NM_001305549 NM_001305550 NM_001305585
RefSeq (белок)	NP_001634	NP_001292478 NP_001292479 NP_001292514 NP_038502
Расположение (UCSC)	Chr 1: 161.22 - 161.22 Мб	Chr 1: 171.23 - 171.23 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

АпоА-II
структуры аполипопротеина a-ii и липидного суррогатного комплекса дают представление об аполипопротеин-липидных взаимодействиях
Идентификаторы
Символ	АпоА-II
Pfam	PF04711
ИнтерПро	IPR006801
SCOP2	1l6k / Объем / СУПФАМ
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Аполипопротеин A-II это белок что у людей кодируется APOA2 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует аполипопротеин (апо) A-II, который является вторым по распространенности белком среди частиц липопротеинов высокой плотности. Белок обнаруживается в плазме в виде мономера, гомодимера или гетеродимера с аполипопротеином D. Дефекты этого гена могут привести к дефициту аполипопротеина A-II или гиперхолестеринемии.^[6]

Взаимодействия

APOA2 был показан взаимодействовать с PLTP.^[7]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. ^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| px | alt = Путь статинов редактировать ]]

Путь статинов редактировать

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430".

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158874 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000005681 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цао Ю.К., Вэй К.Ф., Робберсон Д.Л., Готто А.М., Чан Л. (декабрь 1985 г.). «Выделение и характеристика гена аполипопротеина A-II человека. Электронно-микроскопический анализ РНК: ДНК-гибриды, нуклеотидная последовательность, идентификация полиморфного сайта MspI и общая структурная организация генов аполипопротеина». Журнал биологической химии. 260 (28): 15222–31. PMID  2415515.
6. «Энтрез Ген: APOA2 аполипопротеин A-II».
7. Pussinen PJ, Jauhiainen M, Metso J, Pyle LE, Marcel YL, Fidge NH, Ehnholm C (январь 1998 г.). «Связывание белка-переноса фосфолипидов (PLTP) с аполипопротеинами A-I и A-II: расположение связывающего домена PLTP в аминоконцевой области апоА-I». Журнал липидных исследований. 39 (1): 152–61. PMID  9469594.

внешняя ссылка

• Человек APOA2 расположение генома и APOA2 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Blanco-Vaca F, Escolà-Gil JC, Martín-Campos JM, Julve J (ноябрь 2001 г.). «Роль апоА-II в метаболизме липидов и атеросклерозе: достижения в изучении загадочного белка». Журнал липидных исследований. 42 (11): 1727–39. PMID  11714842.
• Калописис А.Д., Пастье Д., Чамбаз Дж. (Апрель 2003 г.). «Аполипопротеин A-II: помимо генетических ассоциаций с нарушениями липидов и инсулинорезистентностью». Текущее мнение в липидологии. 14 (2): 165–72. Дои:10.1097/00041433-200304000-00008. PMID  12642785.
• Фоллмер Э, Браст Дж., Ресснер А, Боссе А, Бурвикель Ф, Каесберг Б., Харрах Б., Робенек Х., Бёкер В. (1991). «Характер распределения аполипопротеинов A1, A2 и B в стенке атеросклеротических сосудов». Вирхов Архив А. 419 (2): 79–88. Дои:10.1007 / BF01600220. PMID  1908160.
• Диб С.С., Таката К., Пэн Р.Л., Кадзияма Г., Альберс Дж.Дж. (апрель 1990 г.). «Мутация сплайс-соединения, ответственная за семейный дефицит аполипопротеина A-II». Американский журнал генетики человека. 46 (4): 822–7. ЧВК  1683675. PMID  2107739.
• Гордон Дж. И., Симс Х. Ф., Эдельштейн С., Скану А. М., Штраус А. В. (ноябрь 1985 г.). «Внеклеточный процессинг проаполипопротеина A-II в культурах клеток Hep G2 опосредуется протеазой массой 54 кДа, иммунологически связанной с катепсином B». Журнал биологической химии. 260 (27): 14824–31. PMID  2414299.
• Lackner KJ, Law SW, Brewer HB (июнь 1985 г.). «Ген аполипопротеина A-II человека: полная последовательность нуклеиновой кислоты и геномная организация». Исследования нуклеиновых кислот. 13 (12): 4597–608. Дои:10.1093 / nar / 13.12.4597. ЧВК  321808. PMID  2989800.
• Knott TJ, Wallis SC, Робертсон ME, Пристли LM, Urdea M, Rall LB, Scott J (сентябрь 1985 г.). «Ген аполипопротеина AII человека: структурная организация и сайты экспрессии». Исследования нуклеиновых кислот. 13 (17): 6387–98. Дои:10.1093 / nar / 13.17.6387. ЧВК  321960. PMID  2995928.
• Чан Л., Мур М.Н., Цао Ю.К. (1986). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности кДНК человеческого аполипопротеина A-II». Методы в энзимологии. 128: 745–52. Дои:10.1016/0076-6879(86)28103-3. ISBN  978-0-12-182028-2. PMID  3088392.
• Миддлтон-Прайс HR, ван ден Берге Дж. А., Скотт Дж., Нотт Т. Дж., Малкольм С. (июль 1988 г.). «Региональная хромосомная локализация APOA2 в 1q21-1q23». Генетика человека. 79 (3): 283–5. Дои:10.1007 / BF00366253. PMID  3136074.
• Shelley CS, Sharpe CR, Baralle FE, Shoulders CC (ноябрь 1985 г.). «Сравнение генов аполипопротеинов человека. Apo AII представляет собой уникальное функциональное соединение интрон-экзон». Журнал молекулярной биологии. 186 (1): 43–51. Дои:10.1016/0022-2836(85)90255-4. PMID  3935800.
• Брюэр HB, Lux SE, Ронан Р., Джон К.М. (май 1972 г.). «Аминокислотная последовательность человеческого apoLp-Gln-II (апоА-II), аполипопротеина, выделенного из комплекса липопротеинов высокой плотности». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 69 (5): 1304–8. Дои:10.1073 / пнас.69.5.1304. ЧВК  426687. PMID  4338591.
• Lux SE, Джон К. М., Ронан Р., Брюэр Х. Б. (декабрь 1972 г.). «Выделение и характеристика триптических и цианогенбромидных пептидов apoLp-Gln-II (апоА-II), аполипопротеина высокой плотности плазмы». Журнал биологической химии. 247 (23): 7519–27. PMID  4344225.
• Мур М.Н., Као FT, Цао Ю.К., Чан Л. (август 1984 г.). «Аполипопротеин A-II человека: нуклеотидная последовательность клонированной кДНК и локализация ее структурного гена на хромосоме 1 человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 123 (1): 1–7. Дои:10.1016 / 0006-291X (84) 90371-1. PMID  6089788.
• Lackner KJ, Law SW, Brewer HB (сентябрь 1984 г.). «Аполипопротеин A-II человека: полная последовательность нуклеиновой кислоты препроапо A-II». Письма FEBS. 175 (1): 159–64. Дои:10.1016/0014-5793(84)80590-6. PMID  6090207.
• Гордон Дж. И., Буделье К. А., Симс Х. Ф., Эдельштейн К., Скану А. М., Штраус А. В. (ноябрь 1983 г.). «Биосинтез человеческого препроаполипопротеина A-II». Журнал биологической химии. 258 (22): 14054–9. PMID  6315718.
• Шарп Ч.Р., Сидоли А., Шелли С.С., Лусеро М.А., Плечи С.К., Баалле Ф.И. (май 1984 г.). «Человеческие аполипопротеины AI, AII, CII и CIII. Последовательности кДНК и количество мРНК». Исследования нуклеиновых кислот. 12 (9): 3917–32. Дои:10.1093 / nar / 12.9.3917. ЧВК  318799. PMID  6328445.
• Стоффель В., Крюгер Э., Дойцманн Р. (март 1983 г.). «Бесклеточная трансляция аполипопротеина AI печени человека и мРНК AII. Процессинг первичных продуктов трансляции». Hoppe-Seyler's Zeitschrift für Physiologische Chemie. 364 (3): 227–37. Дои:10.1515 / bchm2.1983.364.1.227. PMID  6407957.
• Knott TJ, Пристли LM, Urdea M, Scott J (май 1984). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей предшественник человеческого аполипопротеина AII». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 120 (3): 734–40. Дои:10.1016 / S0006-291X (84) 80168-0. PMID  6428397.
• Lackner KJ, Law SW, Brewer HB, Sakaguchi AY, Naylor SL (август 1984 г.). «Ген аполипопротеина A-II человека расположен на хромосоме 1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 122 (3): 877–83. Дои:10.1016 / 0006-291X (84) 91172-0. PMID  6433912.