Цитидиндезаминаза - Cytidine deaminase

CDA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1MQ0
Идентификаторы
Псевдонимы	CDA, CDD, цитидин дезаминаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 123920 MGI: 1919519 ГомолоГен: 1352 Генные карты: CDA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п36.12 Начните 20,589,086 бп[1] Конец 20,618,903 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 D3 Начните 138,338,424 бп[2] Конец 138,367,992 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • связывание нуклеозидов • активность цитидиндезаминазы • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность • идентичное связывание с белками • гидролазная активность Сотовый компонент • цитозоль • внеклеточная область • просвет секреторной гранулы • просвет третичной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 Биологический процесс • метаболический процесс цитозина • остатки пиримидиновых нуклеозидов • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • дезаминирование цитидина • отрицательная регуляция роста клеток • пиримидинсодержащие остатки соединений • отрицательная регуляция процесса обмена нуклеотидов • гомотетрамеризация белков • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	978	72269
Ансамбль	ENSG00000158825	ENSMUSG00000028755
UniProt	P32320	P56389
RefSeq (мРНК)	NM_001785	NM_028176
RefSeq (белок)	NP_001776	NP_082452
Расположение (UCSC)	Chr 1: 20.59 - 20.62 Мб	Chr 4: 138,34 - 138,37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитидиндезаминаза является фермент что у людей кодируется CDA ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует фермент, участвующий в пиримидин утилизация. Кодируемый белок образует гомотетрамер, который катализирует необратимое гидролитическое дезаминирование цитидин и дезоксицитидин уридин и дезоксиуридин соответственно. Это одна из нескольких дезаминаз, отвечающих за поддержание клеточного пула пиримидина. Мутации в этом гене связаны со сниженной чувствительностью к аналогу цитозиннуклеозида цитозин арабинозиду, используемому для лечения некоторых детских лейкозов.^[7]

Связанный индуцированная активацией (цитидин) дезаминаза (AID) регулирует антитело диверсификация, особенно процесс соматическая гипермутация.

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Активность фторурацила (5-ФУ) редактировать ]]

Активность фторурацила (5-FU) редактировать

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ФторпиримидинActivity_WP1601».

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158825 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028755 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kuhn K, Bertling WM, Emmrich F (февраль 1993 г.). «Клонирование функциональной кДНК цитидиндезаминазы человека (CDD) и ее использование в качестве маркера дифференцировки моноцитов / макрофагов». Biochem Biophys Res Commun. 190 (1): 1–7. Дои:10.1006 / bbrc.1993.1001. PMID  8422236.
6. Демонтис С., Терао М., Бривио М., Занотта С., Бруски М., Гараттини Э. (февраль 1999 г.). «Выделение и характеристика гена, кодирующего цитидин дезаминазу человека». Biochim Biophys Acta. 1443 (3): 323–33. Дои:10.1016 / s0167-4781 (98) 00235-8. PMID  9878810.
7. «Энтрез Ген: ЦДА цитидин дезаминаза».

дальнейшее чтение

• Вентворт Д.Ф., Вольфенден Р. (1976). «О взаимодействии 3,4,5,6-тетрагидроуридина с цитидиндезаминазой печени человека». Биохимия. 14 (23): 5099–105. Дои:10.1021 / bi00694a012. PMID  53069.
• Лалиберте Дж, Момпарлер Р.Л. (1994). «Человеческая цитидин дезаминаза: очистка фермента, клонирование и экспрессия его комплементарной ДНК». Рак Res. 54 (20): 5401–7. PMID  7923172.
• Saccone S, Besati C, Andreozzi L и др. (1995). «Отнесение гена цитидиндезаминазы человека (CDA) к полосе хромосомы 1 p35-p36.2». Геномика. 22 (3): 661–2. Дои:10.1006 / geno.1994.1448. PMID  8001985.
• Гран С., Боюм А., Йохансен РФ и др. (1998). «Ингибирование роста гранулоцит-макрофагальных колониеобразующих клеток цитидиндезаминазой человека требует каталитической функции белка». Кровь. 91 (11): 4127–35. PMID  9596658.
• Сомасекарам А., Джармуз А., Хау А. и др. (1999). «Внутриклеточная локализация цитидиндезаминазы человека. Идентификация сигнала функциональной ядерной локализации». J. Biol. Chem. 274 (40): 28405–12. Дои:10.1074 / jbc.274.40.28405. PMID  10497201.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK и др. (2002). «Анализ экспрессируемых последовательностей хрусталика взрослого человека для проекта NEIBank: более 2000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Vis. 8: 171–84. PMID  12107413.
• Тайси С., Полат М.Ф., Сари Р.А., Бакан Э. (2003). «Активность аденозиндезаминазы и цитидин дезаминазы в сыворотке крови у пациентов с системной красной волчанкой». Clin. Chem. Лаборатория. Med. 40 (5): 493–5. Дои:10.1515 / CCLM.2002.085. PMID  12113294.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Bransteitter R, Pham P, Scharff MD, Goodman MF (2003). «Индуцированная активацией цитидиндезаминаза дезаминирует дезоксицитидин на одноцепочечной ДНК, но требует действия РНКазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (7): 4102–7. Дои:10.1073 / pnas.0730835100. ЧВК  153055. PMID  12651944.
• Sun ZQ, Jiang B, Zhao XS и др. (2003). «[Экспрессия мРНК цитидиндезаминазы в клетках костного мозга от пациентов с острым лейкозом]». Чжунго Ши Ян Сюэ Е Сюэ За Чжи. 11 (3): 246–50. PMID  12844405.
• Винченцетти С., Костанци С., Кристалли Дж. И др. (2003). «Межсубъединичные взаимодействия цитидиндезаминазы человека». Нуклеозиды Нуклеотиды Нуклеиновые кислоты. 22 (5–8): 1535–8. Дои:10.1081 / NCN-120023028. PMID  14565460.
• Костанци С., Винченцетти С., Вита А. и др. (2003). «Человеческая цитидиндезаминаза: понимание каталитического механизма». Нуклеозиды Нуклеотиды Нуклеиновые кислоты. 22 (5–8): 1539–43. Дои:10.1081 / NCN-120023029. PMID  14565461.
• Ge Y, Jensen TL, Stout ML и др. (2004). «Роль мутаций цитидиндезаминазы и GATA1 в повышенной чувствительности к цитозинарабинозиду миелобластов синдрома Дауна и клеточных линий лейкемии». Рак Res. 64 (2): 728–35. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-2456. PMID  14744791.
• Винченцетти С., Де Санктис Дж., Костанци С. и др. (2004). «Функциональные свойства субъединичных взаимодействий цитидиндезаминазы человека». Protein Eng. 16 (12): 1055–61. Дои:10.1093 / белок / gzg117. PMID  14983087.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чунг С.Дж., Фромме Дж.С., Вердин Г.Л. (2005). «Структура цитидиндезаминазы человека, связанного с сильным ингибитором». J. Med. Chem. 48 (3): 658–60. Дои:10.1021 / jm0496279. PMID  15689149.
• Винченцетти С., Мариани П.Л., Каммертони Н. и др. (2005). «Изоферментные формы цитидиндезаминазы человека». Protein Eng. Des. Sel. 17 (12): 871–7. Дои:10.1093 / белок / гж101. PMID  15713780.
• Костанци С., Винченцетти С., Кристалли Г., Вита А (2007). «Человеческая цитидиндезаминаза: трехмерная модель гомологии тетрамерного металлофермента, выведенная из кристаллической структуры отдаленно родственного димерного гомолога». J. Mol. График. Модель. 25 (1): 10–6. Дои:10.1016 / j.jmgm.2005.10.008. PMID  16303324.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P32320 (Цитидиндезаминаза) на PDBe-KB.