ПТПРЗ1 - PTPRZ1

ПТПРЗ1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3JXF, 3С97, 5AWX
Идентификаторы
Псевдонимы	ПТПРЗ1, HPTPZ, HPTPzeta, PTP-ZETA, PTP18, PTPRZ, PTPZ, R-PTP-zeta-2, RPTPB, RPTPbeta, фосфакан, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа Z1, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа Z1
Внешние идентификаторы	OMIM: 176891 MGI: 97816 ГомолоГен: 2136 Генные карты: ПТПРЗ1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q31.32 Начинать 121,873,089 бп[1] Конец 122,062,036 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 A3.1 Начинать 22,875,502 бп[2] Конец 23,052,916 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • фосфопротеинфосфатазная активность • фосфатазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность протеинтирозинфосфатазы • активность трансмембранного рецептора протеина тирозинфосфатазы • гидролазная активность • связывание интегрина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • перинейрональная сеть • внутренний компонент плазматической мембраны • клеточная мембрана • внеклеточный матрикс • синапс Биологический процесс • аксоногенез • дефосфорилирование белков • дифференцировка олигодендроцитов • регуляция пролиферации предшественников олигодендроцитов • развитие центральной нервной системы • дифференцировка гемопоэтических клеток-предшественников • обучение или память • дефосфорилирование пептидилтирозина • дефосфорилирование • цитокин-опосредованный сигнальный путь • регулирование миелинизации • отрицательная регуляция апоптотического процесса нейронов • положительная регуляция дифференцировки олигодендроцитов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5803	19283
Ансамбль	ENSG00000106278	ENSMUSG00000068748
UniProt	P23471	B9EKR1
RefSeq (мРНК)	NM_001206838 NM_001206839 NM_002851 NM_001369395 NM_001369396	NM_001081306 NM_011219 NM_178180 NM_001311064 NM_001361349
RefSeq (белок)	NP_001193767 NP_001193768 NP_002842	NP_001074775 NP_001297993 NP_001348278 NP_035349
Расположение (UCSC)	Chr 7: 121,87 - 122,06 Мб	Chr 6: 22.88 - 23.05 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза рецепторного типа zeta также известный как фосфакан является фермент что у людей кодируется ПТПРЗ1 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген является членом рецепторная тирозинфосфатаза семейства и кодирует однопроходный мембранный белок типа I с двумя цитоплазматический домены тирозин-протеинфосфатазы, домен альфа-карбоангидразы и домен фибронектина III типа. Были описаны альтернативные варианты сплайсинга, которые кодируют различные изоформы белков, но их полноразмерная природа не определена.^[7]

Клиническое значение

Экспрессия этого гена индуцируется в рак желудка клетки, ремиелинизирующие олигодендроциты поражений рассеянным склерозом и в клетках почек эмбриона человека под гипоксический условия. Как белок, так и транскрипт сверхэкспрессируются в глиобластома клетки, продвигая свои гаптотаксический миграция.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106278 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068748 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Арияма Т., Хасэгава К., Инадзава Дж., Мидзуно К., Огимото М., Катагири Т., Якура Х. (июнь 1995 г.). «Присвоение гена дзета-рецептора человеческого протеинтирозинфосфатазы (PTPRZ) полосе хромосомы 7q31.3». Cytogenet Cell Genet. 70 (1–2): 52–4. Дои:10.1159/000133990. PMID  7736789.
6. Леви Дж. Б., Канолл П. Д., Сильвеннойнен О., Барнеа Дж., Морс Б., Онеггер А. М., Хуанг Дж. Т., Канниццаро ​​Л. А., Парк С. Н., Драк Т. (июнь 1993 г.). «Клонирование протеинтирозинфосфатазы рецепторного типа, экспрессируемой в центральной нервной системе». J Biol Chem. 268 (14): 10573–81. PMID  8387522.
7. «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRZ1, рецепторного типа, Z-полипептид 1».

дальнейшее чтение

• Крюгер NX, Сайто H (1992). «Человеческая трансмембранная протеин-тирозин-фосфатаза, PTP zeta, экспрессируется в головном мозге и имеет N-концевой рецепторный домен, гомологичный угольным ангидразам». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (16): 7417–21. Дои:10.1073 / пнас.89.16.7417. ЧВК  49721. PMID  1323835.
• Каплан Р., Морс Б., Хюбнер К., Кроче С., Хоук Р., Равера М., Рикка Г., Джей М., Шлессингер Дж. (1990). «Клонирование трех тирозинфосфатаз человека выявило мультигенное семейство рецептор-связанных протеин-тирозинфосфатаз, экспрессируемых в головном мозге». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (18): 7000–4. Дои:10.1073 / пнас.87.18.7000. ЧВК  54670. PMID  2169617.
• Крюгер NX, Streuli M, Saito H (1990). «Структурное разнообразие и эволюция человеческих рецептороподобных протеинтирозинфосфатаз». EMBO J. 9 (10): 3241–52. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07523.x. ЧВК  552056. PMID  2170109.
• Мортон С.М., Вейл Р.А., Хелмс С., Ли М., Куо В.Л., Грей Дж., Донис-Келлер Х. (1998). «Субрегиональная локализация 21 хромосомы 7-специфичных тегов экспрессируемой последовательности (EST) с помощью FISH с использованием недавно идентифицированных YAC и P1». Геномика. 46 (3): 491–4. Дои:10.1006 / geno.1997.5051. PMID  9441757.
• Оньянго П., Лубьева Б., Гарделлин П., Курцбауэр Р., Вейт А. (1998). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии пяти новых генов в хромосоме 1p36». Геномика. 50 (2): 187–98. Дои:10.1006 / geno.1997.5186. PMID  9653645.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Маэда Н., Итихара-Танака К., Кимура Т., Кадомацу К., Мурамацу Т., Нода М. (1999). «Рецептор-подобная протеин-тирозинфосфатаза PTPzeta / RPTPbeta связывает мидкин фактора роста, связывающий гепарин. Участие аргинина 78 мидкина в связывании с высоким сродством к PTPzeta». J. Biol. Chem. 274 (18): 12474–9. Дои:10.1074 / jbc.274.18.12474. PMID  10212223.
• Кавачи Х., Тамура Х., Ватакабэ И., Синтани Т., Маэда Н., Нода М. (1999). «Белковая тирозинфосфатаза zeta / RPTPbeta взаимодействует с семейством PSD-95 / SAP90». Brain Res. Мол. Мозг Res. 72 (1): 47–54. Дои:10.1016 / S0169-328X (99) 00204-1. PMID  10521598.
• Менг К., Родригес-Пенья А., Димитров Т., Чен В., Ямин М., Нода М., Деуэль Т.Ф. (2000). «Плейотрофин сигнализирует об увеличении фосфорилирования тирозина бета-бета-катенина за счет инактивации внутренней каталитической активности тирозинфосфатазы бета / дзета рецепторного типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (6): 2603–8. Дои:10.1073 / pnas.020487997. ЧВК  15975. PMID  10706604.
• Кавачи Х., Фудзикава А, Маэда Н., Нода М (2001). «Идентификация GIT1 / Cat-1 как молекулы субстрата протеинтирозинфосфатазы zeta / beta с помощью дрожжевой системы улавливания субстрата». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (12): 6593–8. Дои:10.1073 / pnas.041608698. ЧВК  34398. PMID  11381105.
• Thomaidou D, Coquillat D, Meintanis S, Noda M, Rougon G, Matsas R (2001). «Растворимые формы молекул адгезии нейрональных клеток NCAM и F3 способствуют миграции шванновских клеток: идентификация протеинтирозинфосфатаз дзета / бета в качестве предполагаемых рецепторов F3 на шванновских клетках». J. Neurochem. 78 (4): 767–78. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2001.00454.x. PMID  11520897. S2CID  24682985.
• Харрок С., Фуртадо Г.К., Брюк В., Розенблют Дж., Лафайль Дж., Чао М., Буксбаум Дж. Д., Шлессингер Дж. (2002). «Важнейшая роль рецептора протеинтирозинфосфатазы типа Z в функциональном восстановлении после демиелинизирующих поражений». Nat. Genet. 32 (3): 411–4. Дои:10,1038 / ng1004. PMID  12355066. S2CID  19800079.
• Müller S, Kunkel P, Lamszus K, Ulbricht U, Lorente GA, Nelson AM, von Schack D, Chin DJ, Lohr SC, Westphal M, Melcher T (2003). «Роль рецептора тирозинфосфатазы zeta в миграции клеток глиомы». Онкоген. 22 (43): 6661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1206763. PMID  14555979.
• Bonora E, Lamb JA, Barnby G, Sykes N, Moberly T, Beyer KS, Klauck SM, Poustka F, Bacchelli E, Blasi F, Maestrini E, Battaglia A, Haracopos D, Pedersen L, Isager T, Eriksen G, Viskum B , Соренсен ЕС, Брондум-Нильсен К., Коттерилл Р., ван Энгеланд Х., де Йонге М., Кемнер С., Стеггеуис К., Шерпенисс М., Руттер М., Болтон П. Ф., Парр Дж. Р., Поустка А., Бейли А. Дж., Монако А. П. (2005). «Скрининг мутаций и анализ ассоциации шести генов-кандидатов на аутизм на хромосоме 7q». Евро. J. Hum. Genet. 13 (2): 198–207. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201315. PMID  15523497.
• Поликратис А, Катсорис П., Courty J, Papadimitriou E (2005). «Характеристика передачи сигналов пептида, регулирующего аффинный гепарин, в эндотелиальных клетках человека». J. Biol. Chem. 280 (23): 22454–61. Дои:10.1074 / jbc.M414407200. PMID  15797857.
• Ван В., Дэвис Д.А., Хак М., Хуанг Л.Э., Ярчоан Р. (2005). «Дифференциальная регуляция гена с помощью индуцируемого гипоксией фактора-1альфа и фактора, индуцируемого гипоксией-2альфа, в клетках HEK293T». Рак Res. 65 (8): 3299–306. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-4130. PMID  15833863.
• Лу К.В., Джонг КА, Ким Г.Й., Сингх Дж., Диа эквалайзер, Ёсимото К., Ван М.Я., Cloughesy TF, Нельсон С.Ф., Мишель П.С. (2005). «Дифференциальная индукция миграции и роста глиобластомы двумя формами плейотропина». J. Biol. Chem. 280 (29): 26953–64. Дои:10.1074 / jbc.M502614200. PMID  15908427.