PTPRE - PTPRE

PTPRE
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JJD
Идентификаторы
Псевдонимы	PTPRE, HPTPE, PTPE, R-PTP-EPSILON, протеинтирозинфосфатаза, рецептор типа E, рецептор протеинтирозинфосфатазы типа E
Внешние идентификаторы	OMIM: 600926 MGI: 97813 ГомолоГен: 31387 Генные карты: PTPRE
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q26.2 Начните 127,907,061 бп[1] Конец 128,085,855 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 F3 | 7 81,27 см Начните 135,537,481 бп[2] Конец 135,686,293 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеинтирозинфосфатазы • фосфатазная активность • активность трансмембранного рецептора протеина тирозинфосфатазы • GO: 0001948 связывание с белками • фосфопротеинфосфатазная активность • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • ядро клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора инсулина • дефосфорилирование белков • дефосфорилирование пептидилтирозина • дефосфорилирование Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5791	19267
Ансамбль	ENSG00000132334	ENSMUSG00000041836
UniProt	P23469	P49446
RefSeq (мРНК)	NM_006504 NM_130435 NM_001316676 NM_001316677 NM_001323354 NM_001323355 NM_001323356 NM_001323357	NM_011212 NM_001316678 NM_001316679 NM_001316680 NM_001316681
RefSeq (белок)	NP_001303605 NP_001303606 NP_001310283 NP_001310284 NP_001310285 NP_001310286 NP_006495 NP_569119	NP_001303607 NP_001303608 NP_001303609 NP_001303610 NP_035342
Расположение (UCSC)	Chr 10: 127.91 - 128.09 Мб	Chr 7: 135,54 - 135,69 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза рецепторного типа эпсилон является фермент что у людей кодируется PTPRE ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства протеинтирозинфосфатаз (PTP). Известно, что ПТР представляют собой сигнальные молекулы, которые регулируют множество клеточных процессов, включая рост, дифференцировку, митотический цикл и онкогенную трансформацию. Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта этого гена, один из которых кодирует PTP рецепторного типа, который обладает коротким внеклеточным доменом, одной трансмембранной областью и двумя тандемными внутрицитоплазматическими каталитическими доменами; Другой кодирует PTP, который содержит отдельный гидрофильный N-конец, и, таким образом, представляет собой изоформу нерецепторного типа этого PTP. Исследования аналогичного гена на мышах подтвердили регуляторную роль этого PTP в путях передачи сигналов, связанных с RAS, цитокинами, индуцирующими передачу сигналов SATA, а также в активации потенциал-управляемых K + каналов.^[6]

Взаимодействия

PTPRE был показан взаимодействовать с участием KCNB1.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132334 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000041836 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. van den Maagdenberg AM, van den Hurk HH, Weghuis D, Wieringa B, Geurts van Kessel A, Hendriks WJ (апрель 1996 г.). «Присвоение гена протеина тирозинфосфатазы эпсилон (PTPRE) хромосоме 10q26 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 30 (1): 128–9. Дои:10.1006 / geno.1995.0026. PMID  8595895.
6. «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPRE, рецепторный тип, E».
7. Перец А., Гил-Хенн Х, Собко А., Шиндер В., Аттали Б., Элсон А. (август 2000 г.). «Гипомиелинизация и повышенная активность потенциал-управляемых K (+) каналов у мышей, лишенных протеинтирозинфосфатазы эпсилон». EMBO J. 19 (15): 4036–45. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.4036. ЧВК  306594. PMID  10921884.

дальнейшее чтение

• Роскоски Р. (2005). «Регулирование киназы Src путем фосфорилирования и дефосфорилирования». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 331 (1): 1–14. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.03.012. PMID  15845350.
• Крюгер NX, Streuli M, Saito H (1990). «Структурное разнообразие и эволюция человеческих рецептороподобных протеинтирозинфосфатаз». EMBO J. 9 (10): 3241–52. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb07523.x. ЧВК  552056. PMID  2170109.
• Адамс, доктор медицины, Керлаваж А.Р., Флейшманн Р.Д., Фулднер Р.А., Булт С.Дж., Ли Н.Х., Киркнесс Е.Ф., Вайншток К.Г., Гокейн Д.Д., Уайт О. (1995). «Первоначальная оценка разнообразия генов человека и паттернов экспрессии на основе 83 миллионов нуклеотидов последовательности кДНК» (PDF). Природа. 377 (6547 Прил.): 3–174. PMID  7566098.
• Муракава К., Мацубара К., Фукусима А., Йошии Дж., Окубо К. (1995). «Хромосомные присвоения 3'-направленных частичных последовательностей кДНК, представляющих новые гены, экспрессируемые в гранулоцитоидных клетках». Геномика. 23 (2): 379–89. Дои:10.1006 / geno.1994.1514. PMID  7835887.
• Окубо К., Ито К., Фукусима А., Йошии Дж., Мацубара К. (1996). «Мониторинг физиологии клеток по профилям экспрессии и обнаружение генов, специфичных для типов клеток, с помощью составленных профилей экспрессии». Геномика. 30 (2): 178–86. Дои:10.1006 / geno.1995.9887. PMID  8586417.
• Элсон А., Ледер П. (1996). «Идентификация цитоплазматической изоформы протеинтирозинфосфатазы эпсилон, индуцируемой сложным эфиром форбола». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (26): 12235–9. Дои:10.1073 / пнас.92.26.12235. ЧВК  40331. PMID  8618876.
• Гастьер Дж. М., Броуди Т., Пулидо Дж. К., Бусинга Т., Санден С., Ху Х, Майтра С., Буетоу К. Х., Мюррей Дж. К., Шеффилд В. К., Богуски М., Дуйк Г. М., Хадсон Т. Дж. (1996). «Разработка скринингового набора на новые (CAG / CTG) n динамические мутации». Геномика. 32 (1): 75–85. Дои:10.1006 / geno.1996.0078. PMID  8786123.
• Элсон А., Козак К.А., Мортон С.К., Веремович С., Ледер П. (1997). «Эпсилон-ген протеинтирозинфосфатазы соответствует хромосоме 7 мыши и хромосоме 10q26 человека». Геномика. 31 (3): 373–5. Дои:10.1006 / geno.1996.0061. PMID  8838320.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Толедано-Качальски Х., Элсон А (1999). «Трансмембранные и цитоплазматические формы протеинтирозинфосфатазы эпсилон физически связаны с адаптерной молекулой Grb2». Онкоген. 18 (36): 5024–31. Дои:10.1038 / sj.onc.1202883. PMID  10490839.
• Танума Н., Накамура К., Шима Х, Кикучи К. (2000). «Протеин-тирозинфосфатаза PTPepsilon C ингибирует передачу сигналов Jak-STAT и дифференцировку, индуцированную интерлейкином-6 и фактором ингибирования лейкемии в клетках лейкемии M1». J. Biol. Chem. 275 (36): 28216–21. Дои:10.1074 / jbc.M003661200. PMID  10859312.
• Перец А., Гил-Хенн Х, Собко А., Шиндер В., Аттали Б., Элсон А. (2000). «Гипомиелинизация и повышенная активность потенциал-управляемых K (+) каналов у мышей, лишенных протеинтирозинфосфатазы эпсилон». EMBO J. 19 (15): 4036–45. Дои:10.1093 / emboj / 19.15.4036. ЧВК  306594. PMID  10921884.
• Гил-Хенн Х., Волохонский Г., Толедано-Катчальски Х., Гандре С., Элсон А (2000). «Создание новых цитоплазматических форм протеинтирозинфосфатазы эпсилон путем протеолитического процессинга и контроля трансляции». Онкоген. 19 (38): 4375–84. Дои:10.1038 / sj.onc.1203790. PMID  10980613.
• Wabakken T, Hauge H, Finne EF, Wiedlocha A, Aasheim H (2002). «Экспрессия человеческого белка тирозинфосфатазы эпсилон в лейкоцитах: потенциальная фосфатаза, регулирующая путь ERK». Сканд. J. Immunol. 56 (2): 195–203. Дои:10.1046 / j.1365-3083.2002.01126.x. PMID  12121439. S2CID  19787656.
• Wabakken T, Hauge H, Funderud S, Aasheim HC (2002). «Характеристика, экспрессия и функциональные аспекты новой изоформы эпсилон протеинтирозинфосфатазы». Сканд. J. Immunol. 56 (3): 276–85. Дои:10.1046 / j.1365-3083.2002.01127.x. PMID  12193229. S2CID  35703266.
• Blanchetot C, Tertoolen LG, Overvoorde J, den Hertog J (2003). «Внутри- и межмолекулярные взаимодействия между внутриклеточными доменами рецепторных протеин-тирозинфосфатаз». J. Biol. Chem. 277 (49): 47263–9. Дои:10.1074 / jbc.M205810200. PMID  12376545.
• Тиран З., Перец А., Аттали Б., Элсон А. (2003). «Зависимая от фосфорилирования регуляция активности канала Kv2.1 в тирозине 124 с помощью Src и протеин-тирозинфосфатазы эпсилон». J. Biol. Chem. 278 (19): 17509–14. Дои:10.1074 / jbc.M212766200. PMID  12615930.
• Толедано-Катчальски Х., Краут Дж., Синес Т., Гранот-Аттас С., Шохат Г., Гил-Хенн Х., Юнг Й, Эльсон А. (2004). «Белковая тирозинфосфатаза эпсилон ингибирует передачу сигналов митоген-активированными протеинкиназами». Мол. Рак Res. 1 (7): 541–50. PMID  12754301.