SSH1 - SSH1

SSH1
Идентификаторы
Псевдонимы	SSH1, SSH1L, протеинфосфатаза из рогатки 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606778 MGI: 2686240 ГомолоГен: 41299 Генные карты: SSH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.11 Начните 108,778,191 бп[1] Конец 108,857,590 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начните 113,937,094 бп[2] Конец 113,993,894 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • фосфопротеинфосфатазная активность • фосфатазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность протеинтирозинфосфатазы • связывание актина • гидролазная активность • активность протеинтирозин / серин / треонинфосфатазы Сотовый компонент • цитоплазма • проекция клетки • клеточная мембрана • середина тела • борозда декольте • цитоскелет • ламеллиподиум • цитозоль • конус роста • передний край ячейки • мембрана • неотъемлемый компонент мембраны Биологический процесс • регулировка сборки ламеллиподиумов • дефосфорилирование белков • регуляция аксоногенеза • регулирование полимеризации или деполимеризации актина • клеточный морфогенез • регуляция клеточного белкового обмена • дефосфорилирование пептидилтирозина • клеточный ответ на АТФ • организация актинового цитоскелета • дефосфорилирование • положительная регуляция синаптической пластичности • возбуждающая химическая синаптическая передача • положительная регуляция гибели нейронов • положительная регуляция кластеризации рецепторов глутамата AMPA • положительная регуляция сосудистой миграции гладкомышечных клеток • положительная регуляция возбуждающего постсинаптического потенциала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	54434	231637
Ансамбль	ENSG00000084112	ENSMUSG00000042121
UniProt	Q8WYL5	Q76I79
RefSeq (мРНК)	NM_001161330 NM_001161331 NM_018984	NM_198109 NM_001363469
RefSeq (белок)	NP_001154802 NP_001154803 NP_061857	NP_932777 NP_001350398
Расположение (UCSC)	Chr 12: 108,78 - 108,86 Мб	Chr 5: 113.94 - 113.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Для протокола SSH-1 см. Безопасная оболочка # Версия 1.x

Гомолог 1 протеиновой фосфатазы Slingshot является фермент что у людей кодируется SSH1 ген.^[5][6][7]

Семейство ADF (актин-деполимеризующий фактор) / кофилин (см. MIM 601442) состоит из медиаторов динамики актина, реагирующих на стимул. Белки ADF / кофилин инактивируются киназами, такими как киназа-1 домена LIM (LIMK1; MIM 601329). Семейство SSH, по-видимому, играет роль в динамике актина, реактивируя белки ADF / кофилин in vivo (Niwa et al., 2002) [предоставлено OMIM]^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000084112 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042121 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
6. Нива Р., Нагата-Охаши К., Такеичи М., Мизуно К., Уэмура Т. (февраль 2002 г.). «Контроль реорганизации актина с помощью Slingshot, семейства фосфатаз, которые дефосфорилируют ADF / кофилин». Ячейка. 108 (2): 233–46. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00638-9. PMID  11832213. S2CID  5576208.
7. «Ген Entrez: SSH1-гомолог рогатки 1 (Drosophila)».

дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Эндо М., Охаши К., Сасаки Ю. и др. (2003). «Контроль подвижности и морфологии конусов роста с помощью киназы LIM и Slingshot посредством фосфорилирования и дефосфорилирования кофилина». J. Neurosci. 23 (7): 2527–37. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.23-07-02527.2003. ЧВК  6742113. PMID  12684437.
• Кадзи Н., Охаши К., Шуин М. и др. (2003). «Связанные с клеточным циклом изменения активности фосфатазы Slingshot и роли в цитокинезе в клетках животных». J. Biol. Chem. 278 (35): 33450–5. Дои:10.1074 / jbc.M305802200. PMID  12807904.
• Охта Ю., Косака К., Нагата-Охаши К. и др. (2004). «Дифференциальная активность, субклеточное распределение и паттерны тканевой экспрессии трех членов семейства фосфатаз Slingshot, дефосфорилирующих кофилин». Гены Клетки. 8 (10): 811–24. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2003.00678.x. PMID  14531860. S2CID  24247372.
• Nishita M, Wang Y, Tomizawa C, et al. (2004). «Фосфоинозитид-3-киназа-опосредованная активация кофилинфосфатазы Slingshot и ее роль в индуцированном инсулином выпячивании мембраны». J. Biol. Chem. 279 (8): 7193–8. Дои:10.1074 / jbc.M312591200. PMID  14645219.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Дай С., Сармьер П.Д., Вигган О. и др. (2004). «Для эффективного проникновения сальмонеллы необходимы циклы активности АДФ хозяина и кофилина». Cell. Микробиол. 6 (5): 459–71. Дои:10.1111 / j.1462-5822.2004.00375.x. PMID  15056216. S2CID  20238982.
• Нагата-Охаши К., Охта Й, Гото К. и др. (2004). «Путь индуцированной нейрегулином активации кофилин-фосфатазы Slingshot и кофилина в ламеллиподиях». J. Cell Biol. 165 (4): 465–71. Дои:10.1083 / jcb.200401136. ЧВК  2172350. PMID  15159416.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Чжан З., Ню З., Юань В. и др. (2005). «Тонкое картирование и идентификация гена-кандидата SSH1 в диссеминированном поверхностном актиническом порокератозе». Гм. Мутат. 24 (5): 438. Дои:10.1002 / humu.9283. PMID  15459975. S2CID  22946257.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Сусайраджа Дж., Маити С., Вигган О. и др. (2005). «Взаимодействие между компонентами нового комплекса LIM-киназа-рогатка-фосфатаза регулирует кофилин». EMBO J. 24 (3): 473–86. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600543. ЧВК  548651. PMID  15660133.
• Ван И, Шибасаки Ф, Мизуно К. (2005). «Дефосфорилирование кофилина, вызванное сигналом кальция, опосредуется Slingshot через кальциневрин». J. Biol. Chem. 280 (13): 12683–9. Дои:10.1074 / jbc.M411494200. PMID  15671020.
• Нишита М., Томизава С., Ямамото М. и др. (2006). «Пространственная и временная регуляция активности кофилина с помощью киназы LIM и Slingshot имеет решающее значение для направленной миграции клеток». J. Cell Biol. 171 (2): 349–59. Дои:10.1083 / jcb.200504029. ЧВК  2171197. PMID  16230460.
• Ямамото М., Нагата-Охаши К., Охта Ю. и др. (2006). «Идентификация множества сайтов связывания актина в кофилин-фосфатазе Slingshot-1L». FEBS Lett. 580 (7): 1789–94. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.02.034. PMID  16513117. S2CID  27347823.
• Cai L, Marshall TW, Uetrecht AC, et al. (2007). «Coronin 1B координирует деятельность комплекса Arp2 / 3 и кофилина на переднем крае». Ячейка. 128 (5): 915–29. Дои:10.1016 / j.cell.2007.01.031. ЧВК  2630706. PMID  17350576.
• Kligys K, Claiborne JN, DeBiase PJ и др. (2007). «Семейство рогаток фосфатаз опосредует регуляцию Rac1 фосфорилирования кофилина, организацию ламинина-332 и поведение подвижности кератиноцитов». J. Biol. Chem. 282 (44): 32520–8. Дои:10.1074 / jbc.M707041200. ЧВК  2754063. PMID  17848544.