Миофосфорилаза - Myophosphorylase

фосфорилаза, гликоген; мышца (синдром Макардла, болезнь накопления гликогена V типа)
3MSC.png
Миофосфорилаза[1]
Идентификаторы
СимволPYGM
Ген NCBI5837
HGNC9726
OMIM608455
RefSeqNM_005609
UniProtP11217
Прочие данные
Номер ЕС2.4.1.1
LocusChr. 11 q12-q13.2

Миофосфорилаза или же гликогенфосфорилаза, связанная с мышцами (PYGM) это мышца изоформа из фермент гликогенфосфорилаза и кодируется PYGM ген. Этот фермент помогает расщеплять гликоген (форма хранимого углевод ) в глюкозо-1-фосфат (нет глюкоза ), поэтому его можно использовать в мышечная клетка. Мутации в этом гене связаны с Болезнь Макардла (дефицит миофосфорилазы), болезнь накопления гликогена в мышцах.[2]

Структура

PYGM расположен на q рука из хромосома 11 в позиции 13.1 и имеет 20 экзоны.[2] PYGM, белок кодируемый этим геном, является членом семейства гликогенфосфорилазы и гомодимер что объединяется в тетрамер с образованием ферментативно активной фосфорилазы A. Она содержит сайт связывания AMP на p. 76, два сайта участвуют в ассоциации субъединиц на стр. 109 и стр. 143, и сайт, предположительно причастный к аллостерический контроль на стр. 156. В его состав входят 24 бета-нити, 43 альфа-спирали, и 11 витков. PYGM также имеет следующие модифицированные остатки: N-ацетилсерин на стр. 2, фосфосерин на стр. 15, 2014, 227, 430, 473, 514, 747 и 748, и N6- (пиридоксальфосфат)лизин на стр. 681. Есть посттрансляционная модификация в котором фосфорилирование из Сер -15 превращает фосфорилазу B (нефосфорилированную) в фосфорилазу A.[3][4][5] Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипции.[2]

Функция

Фосфорилаза это важный аллостерический фермент в углеводный обмен. Этот ген, ПИГМА, кодирует мышечный фермент, участвующий в гликогенолиз. PYGM имеет кофактор, пиридоксаль 5'-фосфат, что помогает этому процессу. PYGM находится в цитозоль, внеклеточная экзосома и цитоплазма. Очень похожие ферменты, кодируемые разными генами, обнаружены в печень и мозг.[2][4][5]

Каталитическая активность

((1-> 4) -альфа-D-глюкозил) (n) + фосфат = ((1-> 4) -альфа-D-глюкозил) (n-1) + альфа-D-глюкозо-1-фосфат[4][5]

Клиническое значение

Дефицит миофосфорилазы связан с Болезнь накопления гликогена типа V, также известный как «синдром Макардла».

Тематическое исследование показало, что дефицит миофосфорилазы может быть связан с когнитивные нарушения. Помимо мышц, эта изоформа присутствует в астроциты, где он играет ключевую роль в метаболизме нервной энергии. 55-летняя женщина с Болезнь Макардла имеет выраженное когнитивное нарушение с двусторонней дисфункцией префронтальный и лобная кора. Для оценки обоснованности этого утверждения необходимы дальнейшие исследования.[6]

Кроме того, мутации в генах миофосфорилазы наряду с дезоксигуанозинкиназа были связаны с мышцами гликогеноз и митохондриальная гепатопатия. G456A PYGM мутация и дублирование в экзон 6 dGK, который приводит к усеченному белку, были связаны с дефицитом фосфорилазы в мышцах, цитохром с оксидаза недостаточность печени, тяжелая врожденная гипотония, гепатомегалия, и отказ печени. Это расширяет текущее понимание болезни Макардла и предполагает, что такая комбинация мутаций может привести к сложному заболеванию с тяжелой формой болезни. фенотипы.[7]

Взаимодействия

PYGM имеет 64 двоичных файла белок-белковые взаимодействия включая 21 ко-комплексное взаимодействие. PYGM, похоже, взаимодействует с ПРКАБ2, WDYHV1, PYGL, PYGB, 5-аминоизатин, 5-nh2_капроилизатин, PHKG1, PPP1CA, PPP1R3A, DEGS1, SET, MAP3K3, INPP5K, PACSIN3, CLASP2, NIPSNAP2, SRP72, LMNA, TRAPPC2, DNM2, IGBP1, SGCG, PDE4DIP, PPP1R3B, ARID1B, TTN, INTS4, FAM110A, TRIM54, TRIM55, WWP1, AGTPBP1, Помпа и CDC42BPB.[8]

Рекомендации

  1. ^ «Банк данных белка RCSB - сводная информация о структуре 3MSC - гликогенфосфорилаза в комплексе с 2-нитробензальдегид-4- (бета-D-глюкопиранозил) тиосемикарбазоном».
  2. ^ а б c d «Гликогенфосфорилаза PYGM, ассоциированная с мышцами [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-08-31. Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
  3. ^ Карти Т.Дж., Грейвс ди-джей (июль 1975 г.). «Регулирование гликогенфосфорилазы. Роль пептидной области, окружающей остаток фосфосерина в определении свойств фермента». Журнал биологической химии. 250 (13): 4980–5. PMID  1150650.
  4. ^ а б c «PYGM - гликогенфосфорилаза, мышечная форма - Homo sapiens (человек) - ген и белок PYGM». www.uniprot.org. Получено 2018-08-31. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
  5. ^ а б c «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК  5210571. PMID  27899622.
  6. ^ Манкузо М., Орсуччи Д., Вольтеррани Д., Сицилиано Дж. (Май 2011 г.). «Когнитивные нарушения и болезнь Макардла: есть ли связь?». Нервно-мышечные расстройства. 21 (5): 356–8. Дои:10.1016 / j.nmd.2011.02.013. PMID  21382715. S2CID  36805481.
  7. ^ Манкузо М., Филосто М., Цуджино С., Ламперти С., Шанске С., Кокет М., Деснуэль С., ДиМауро С. (октябрь 2003 г.). «Мышечный гликогеноз и митохондриальная гепатопатия у младенца с мутациями в генах миофосфорилазы и дезоксигуанозинкиназы». Архив неврологии. 60 (10): 1445–7. Дои:10.1001 / archneur.60.10.1445. PMID  14568816.
  8. ^ «По запросу PYGM найдено 64 бинарных взаимодействия». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-09-05.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.