B3GAT2 - B3GAT2

B3GAT2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2D0J
Идентификаторы
Псевдонимы	B3GAT2, GLCATS, бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607497 MGI: 2389490 ГомолоГен: 50574 Генные карты: B3GAT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q13 Начинать 70,856,679 бп[1] Конец 70,957,060 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание ионов металлов • галактозилгалактозилксилозилпротеин, активность 3-бета-глюкуронозилтрансферазы Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • мембрана • Мембрана Гольджи Биологический процесс • метаболический процесс гликозаминогликанов • гликозилирование белков • процесс биосинтеза протеогликана хондроитинсульфата • метаболический процесс хондроитинсульфата • углеводный обмен Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	135152	280645
Ансамбль	ENSG00000112309	ENSMUSG00000026156
UniProt	Q9NPZ5	P59270
RefSeq (мРНК)	NM_080742	NM_172124
RefSeq (белок)	NP_542780	NP_742122
Расположение (UCSC)	Chr 6: 70,86 - 70,96 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Галактозилгалактозилксилозилпротеин 3-бета-глюкуронозилтрансфераза 2 является фермент что у людей кодируется B3GAT2 ген.^[4][5]

Продукт этого гена представляет собой трансмембранный белок, принадлежащий к семейству глюкуронилтрансфераз, и катализирует перенос глюкуроновой кислоты, связанной с бета-1,3-связью, на концевую галактозу в различных гликопротеинах или гликолипидах, содержащих Gal-beta-1-4GlcNAc или Gal- остаток бета-1-3GlcNAc. Кодируемый белок участвует в синтезе углеводного эпитопа природного киллера-1 человека (HNK-1), сульфатированного трисахарида, участвующего в миграции клеток и адгезии в нервной системе.^[5]

Использование антитела HNK-1 для исследования нервного гребня

Антитела против эпитопа HNK-1 сыграли большую роль в исследованиях нервный гребень, особенно у птичьего эмбриона.^[6] Первым антителом против этого эпитопа был NC-1,^[7] что позволило значительно упростить анализ путей миграции нервного гребня. У птиц, и особенно у других позвоночных, результаты окрашивания HNK-1 следует интерпретировать с осторожностью, поскольку эпитоп не является уникальным для нервного гребня.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112309 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Имия К., Ишизаки Т., Сейки Т., Сайто Ф., Инадзава Дж., Ока С., Кавасаки Т. (октябрь 2002 г.). «Клонирование кДНК, геномная структура и хромосомное картирование глюкуронилтрансферазы-S мыши, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Ген. 296 (1–2): 29–36. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00840-5. PMID  12383500.
5. «Ген Entrez: B3GAT2 бета-1,3-глюкуронилтрансфераза 2 (глюкуронозилтрансфераза S)».
6. Броннер-Фрейзер М (май 1986 г.). «Анализ ранних стадий миграции ствола нервного гребня у эмбрионов птиц с использованием моноклональных антител HNK-1». Dev. Биол. 115 (1): 44–55. Дои:10.1016/0012-1606(86)90226-5. PMID  3516760.
7. Винсент М., Тиери Дж. П. (июнь 1984 г.). «Маркер клеточной поверхности для клеток нервного гребня и плакод: дальнейшая эволюция в периферической и центральной нервной системе». Dev. Биол. 103 (2): 468–81. Дои:10.1016/0012-1606(84)90334-8. PMID  6202575.

внешняя ссылка

• Человек B3GAT2 расположение генома и B3GAT2 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для человеческого галактозилгалактозилксилозилпротеина 3-бета-глюкуронозилтрансферазы 2 (B3GAT2)

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О. (2002). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XXII. Полные последовательности 50 новых клонов кДНК, которые кодируют большие белки». ДНК Res. 8 (6): 319–27. Дои:10.1093 / днарес / 8.6.319. PMID  11853319.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Маркос I, Галан JJ, Borrego S, Antiñolo G (2003). «Клонирование, характеристика и картирование хромосом человеческого гена GlcAT-S». J. Hum. Genet. 47 (12): 677–80. Дои:10.1007 / с100380200103. PMID  12522689.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Какуда С., Ока С., Кавасаки Т. (2004). «Очистка и характеристика двух рекомбинантных глюкуронилтрансфераз человека, участвующих в биосинтезе углевода HNK-1 в Escherichia coli». Protein Expr. Purif. 35 (1): 111–9. Дои:10.1016 / j.pep.2003.12.021. PMID  15039073.
• Какуда С., Сато Ю., Тонояма Ю. и др. (2005). «Различные акцепторные особенности двух глюкуронилтрансфераз, участвующих в биосинтезе углевода HNK-1». Гликобиология. 15 (2): 203–10. Дои:10.1093 / glycob / cwi001. PMID  15470230.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Шиба Т., Какуда С., Исигуро М. и др. (2006). «Кристаллическая структура GlcAT-S, глюкуронилтрансферазы человека, участвующей в биосинтезе углеводного эпитопа HNK-1». Белки. 65 (2): 499–508. Дои:10.1002 / prot.21118. PMID  16897771. S2CID  31290955.