Кератин 6С - Keratin 6C

KRT6C
Идентификаторы
ПсевдонимыKRT6C, кератин 6C, K6E, KRT6E, PPKNEFD
Внешние идентификаторыOMIM: 612315 ГомолоГен: 138409 Генные карты: KRT6C
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение KRT6C
Геномное расположение KRT6C
Группа12q13.13Начинать52,468,516 бп[1]
Конец52,473,805 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_173086

н / д

RefSeq (белок)

NP_775109

н / д

Расположение (UCSC)Chr 12: 52,47 - 52,47 Мбн / д
PubMed поиск[2]н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Кератин 6С (название белка K6C; название гена KRT6C), представляет собой цитоцитокератин, один из ряда изоформы из кератин 6 кодируется отдельными генами, расположенными в кластере генов кератина типа II человека. хромосома 12q. Этот ген был недавно обнаружен Проект "Геном человека" и паттерны его экспрессии у людей остаются неизвестными.

Кератины

Кератины являются промежуточная нить белки, которые образуют плотную сеть нитей по всей цитоплазма из эпителиальный клетки.[3] Кератины образуют гетерополимеры состоящий из кератина типа I и типа II. Кератины обычно экспрессируются в определенных парах кератиновых белков типа I и типа II в организме человека. ткань -специфические и клеточная дифференциация специфическим образом.

Кератиновые белки эпителиальных тканей обычно известны как «кератины» или иногда называются «эпителиальными кератинами» или «цитокератинами». Специализированные кератины волосы и гвоздь известны как "твердые кератины" или "трихоцит кератины ». Трихоциты представляют собой специализированные эпителиальные клетки, из которых состоят волосы и ногти. Кератины трихоцитов похожи по своим генам и структуре белка на кератины, за исключением того, что они особенно богаты сера -содержащий аминокислота цистеин, который способствует химическому сшиванию собранных твердых кератинов с образованием более структурно эластичного материала.

Как эпителиальные кератины, так и твердые кератины можно подразделить на кератины типа I (кислые) и кератины типа II (нейтрально-основные). Гены кератинов типа I расположены в кластере генов у человека. хромосома 17q, тогда как гены кератинов типа II расположены в кластере на человеческом хромосома 12q (исключение составляет K18, кератин типа I, расположенный в кластере генов типа II).

Как и тесно связанный KRT6A и KRT6B гены, KRT6C ген состоит из 9 экзоны разделенные на 8 интроны и находится в кластере генов кератина типа II у человека. хромосома 12кв. Кератин 6А и кератин 6B кодируются соседними генами, которые идентичны у интрон -экзон организация для KRT6C и более чем на 99% идентичны по своему ДНК кодирующие последовательности.

Генетические нарушения

Мутации в K6C были идентифицированы как способные вызывать диффузную и очаговую ладонно-подошвенную кератодерму.[4][5][6] Это было идентифицировано как форма Врожденная пахионихия.[7][8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170465 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ Куинлан Р., Хатчисон С., Дорожка В (1995). «Промежуточные белки филаментов». Белковый профиль. 2 (8): 795–952. PMID  8771189.
  4. ^ Уилсон, штат Нью-Джерси, Messenger AG, Leachman SA, O'Toole EA, Lane EB, McLean WH, Smith FJ (2010). «Мутации кератина K6c вызывают очаговую ладонно-подошвенную кератодермию». J. Invest. Дерматол. 130 (2): 425–9. Дои:10.1038 / jid.2009.215. PMID  19609311.
  5. ^ Bowden PE (2010). «Мутации в изомере кератина 6 (K6c) вызывают тип фокальной ладонно-подошвенной кератодермии». J. Invest. Дерматол. 130 (2): 336–8. Дои:10.1038 / jid.2009.395. PMID  20081885.
  6. ^ Акасака Е., Накано Х., Накано А., Тоёмаки Ю., Такиёси Н., Рокунохэ Д., Нисикава Ю., Корекава А., Мацудзаки Ю., Мицухаси Ю., Савамура Д. (2011). «Диффузная и очаговая ладонно-подошвенная кератодермия может быть вызвана мутацией кератина 6c». Br. J. Dermatol. 165 (6): 1290–2. Дои:10.1111 / j.1365-2133.2011.10552.x. PMID  21801157. S2CID  36039184.
  7. ^ ван Стинсель М.А., Куломб П.А., Каспар Р.Л., Милстон Л.М., Маклин И.В., Руп Д.Р., Смит Ф.Дж., Спречер Э., Шварц М.Э. (2014). "Отчет 10-го ежегодного собрания Международного консорциума конгенита пахионихии". J. Invest. Дерматол. 134 (3): 588–91. Дои:10.1038 / jid.2013.392. ЧВК  3930927. PMID  24518109.
  8. ^ О'Тул Э.А., Каспар Р.Л., Спречер Э., Шварц М.Э., Риттье Л. (2014). «Пахионихия конгенита загнана в угол: отчет о 11-м ежегодном собрании Международного консорциума конгенизированных пахионихий». Br. J. Dermatol. 171 (5): 974–7. Дои:10.1111 / bjd.13341. PMID  25124823. S2CID  1481875.

дальнейшее чтение