Ламинин, альфа 5 - Laminin, alpha 5

LAMA5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Y38
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMA5, Ламинин, альфа 5, субъединица ламинина альфа 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 601033 MGI: 105382 ГомолоГен: 4060 Генные карты: LAMA5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.33 Начинать 62,307,955 бп[1] Конец 62,367,312 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H4 | 2 102,7 см Начинать 180,176,373 бп[2] Конец 180,225,859 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная молекулярная активность • связывание интегрина • рецепторное связывание • структурная составляющая внеклеточного матрикса Сотовый компонент • внеклеточный матрикс • ламинин-5 комплекс • внеклеточная область • базальная мембрана • комплекс ламинин-10 • комплекс ламинина-11 • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внеклеточный • синаптическая щель • нервномышечное соединение • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • развитие волосяного фолликула • дифференциация клеток • регуляция эмбрионального развития • регулирование миграции клеток • распознавание клеток • развитие эмбриона • развитие легких • развитие мышечных органов • организация внеклеточного матрикса • морфогенез поляризованного эпителия • одонтогенез дентинсодержащего зуба • узел фокальной адгезии • ветвление участвует в морфогенезе зачатка мочеточника • регуляция клеточной адгезии • клеточная адгезия • регулирование пролиферации клеток • организация цитоскелета • ангиогенез • миграция клеток нервного гребня • морфогенез органов животных • интегрин-опосредованный сигнальный путь • дифференцировка эндотелиальных клеток • распространение клеток, зависящее от адгезии субстрата • морфогенез эмбрионального эпителия • клеточная пролиферация • миграция клеток • морфогенез ветвления эпителиальной трубки • ветвление, участвующее в морфогенезе слюнных желез • морфогенез ресничек • локализация белка на плазматической мембране • цитокин-опосредованный сигнальный путь • гистогенез • межклеточная адгезия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3911	16776
Ансамбль	ENSG00000130702	ENSMUSG00000015647
UniProt	O15230	Q61001
RefSeq (мРНК)	NM_005560	NM_001081171
RefSeq (белок)	NP_005551	NP_001074640
Расположение (UCSC)	Chr 20: 62.31 - 62.37 Мб	Chr 2: 180.18 - 180.23 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица ламинина альфа-5 это белок что у людей кодируется LAMA5 ген.^[5][6]

Функция

Компоненты внеклеточного матрикса оказывают огромное влияние на ткани по всему телу. В частности, ламинины, семейство гетеротримерных внеклеточных гликопротеинов, влияют на развитие и целостность тканей в таких различных органах, как почки, легкие, кожа и нервная система. Считается, что ламинины опосредуют прикрепление, миграцию и организацию клеток в тканях во время эмбрионального развития, взаимодействуя с другими компонентами внеклеточного матрикса. Ламинины функционируют как гетеротримерные комплексы альфа-, бета- и гамма-цепей, причем каждый тип цепи представляет отдельное подсемейство белков. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к альфа-подсемейству цепей ламинина и является основным компонентом базальных мембран. Для этого гена обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, но полноразмерная природа одного из них не установлена.^[6]

Взаимодействия

Ламинин, альфа 5, как было показано взаимодействовать с BCAM.^[7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130702 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015647 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Дуркин М.Э., Лоечел Ф., Маттей М.Г., Гилпин Б.Дж., Альбрехтсен Р., Вевер УМ (июль 1997 г.). «Тканеспецифическая экспрессия альфа5-цепи ламинина человека и картирование гена на хромосоме 20q13.2-13.3 человека и на дистальной хромосоме 2 мыши рядом с локусом мутации ragged (Ra)». Письма FEBS. 411 (2–3): 296–300. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8. PMID  9271224. S2CID  45286880.
6. «Энтрез Ген: ламинин LAMA5, альфа 5».
7. Парсонс С.Ф., Ли Джи, Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж. А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Энсти Д.И., Часис Д.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий альфа5-цепь, с высоким сродством». Кровь. 97 (1): 312–20. Дои:10.1182 / blood.V97.1.312. PMID  11133776.
8. Киккава Ю., Моулсон К.Л., Виртанен И., Майнер Дж. Х. (ноябрь 2002 г.). «Идентификация сайта связывания гликопротеина лютеранской группы крови на ламинине альфа 5 посредством экспрессии цепей химерного ламинина in vivo». Журнал биологической химии. 277 (47): 44864–9. Дои:10.1074 / jbc.M208731200. PMID  12244066.

дальнейшее чтение

• Утани А., Номидзу М., Ямада Ю. (январь 1997 г.). «Фибулин-2 связывается с короткими плечами ламинина-5 и ламинина-1 посредством консервативных аминокислотных последовательностей». Журнал биологической химии. 272 (5): 2814–20. Дои:10.1074 / jbc.272.5.2814. PMID  9006922.
• Руссель П., Кин Д.Р., Руджеро Ф., Шамплио М.Ф., Рест М., Берджесон Р.Э. (август 1997 г.). «Ламинин 5 связывает домен NC-1 коллагена VII типа». Журнал клеточной биологии. 138 (3): 719–28. Дои:10.1083 / jcb.138.3.719. ЧВК  2141627. PMID  9245798.
• Tiger CF, Champliaud MF, Pedrosa-Domellof F, Thornell LE, Ekblom P, Gullberg D (ноябрь 1997 г.). «Присутствие цепи ламинина альфа5 и отсутствие цепи ламинина альфа1 во время развития мышц человека и при мышечных дистрофиях». Журнал биологической химии. 272 (45): 28590–5. Дои:10.1074 / jbc.272.45.28590. PMID  9353324.
• Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). «Опосредованные белком ВИЧ изменения во взаимодействиях Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis. 45 (2–3): 255–9. PMID  9597096.
• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (1): 31–9. Дои:10.1093 / днарес / 5.1.31. PMID  9628581.
• Симидзу Х., Хосокава Х., Ниномия Х., Майнер Дж. Х., Масаки Т. (апрель 1999 г.). «Адгезия культивированных эндотелиальных клеток аорты крупного рогатого скота к ламинину-1, опосредованная дистрогликаном». Журнал биологической химии. 274 (17): 11995–2000. Дои:10.1074 / jbc.274.17.11995. PMID  10207021.
• Сын Ю.Дж., Скрэнтон Т.В., Сандерленд В.Дж., Бэк С.Дж., Майнер Дж.Х., Санес-младший, Карлсон СС (январь 2000 г.). «Белок синаптических везикул SV2 образует комплекс с альфа5-содержащим ламинином на поверхности нервного окончания». Журнал биологической химии. 275 (1): 451–60. Дои:10.1074 / jbc.275.1.451. PMID  10617638.
• Кёлер Д., Крузе М., Штёкер В., Стерчи Е.Е. (январь 2000 г.). «Гетерологически сверхэкспрессированный, аффинно очищенный человеческий меприн альфа является функционально активным и расщепляет компоненты базальной мембраны in vitro». Письма FEBS. 465 (1): 2–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01712-3. PMID  10620696. S2CID  22895580.
• Киккава Ю., Сандзен Н., Фудзивара Х, Сонненберг А., Секигучи К. (март 2000 г.). «Специфичность связывания интегрина ламинина-10/11: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа 3 бета 1, альфа 6 бета 1 и альфа 6 бета 4». Журнал клеточной науки. 113 (Pt 5) (5): 869–76. PMID  10671376.
• Champliaud MF, Virtanen I, Tiger CF, Korhonen M, Burgeson R, Gullberg D (сентябрь 2000 г.). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета / гамма цепей ламинина альфа1 и цепей ламинина альфа5 человека: очистка ламинина-3 из плаценты». Экспериментальные исследования клеток. 259 (2): 326–35. Дои:10.1006 / excr.2000.4980. PMID  10964500.
• Libby RT, Champliaud MF, Claudepierre T., Xu Y, Gibbons EP, Koch M, Burgeson RE, Hunter DD, Brunken WJ (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия ламинина во взрослой и развивающейся сетчатке: данные о двух новых ламининах ЦНС». Журнал неврологии. 20 (17): 6517–28. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-17-06517.2000. ЧВК  2924637. PMID  10964957.
• Пирс Р.А., Гриффин Г.Л., Майнер Дж. Х., старший RM (декабрь 2000 г.). «Образцы экспрессии ламинина альфа1 и альфа5 в легких человека во время развития». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 23 (6): 742–7. Дои:10.1165 / ajrcmb.23.6.4202. PMID  11104726.
• Парсонс С.Ф., Ли Джи, Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж. А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Энсти Д.И., Часис Д.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий альфа5-цепь, с высоким сродством». Кровь. 97 (1): 312–20. Дои:10.1182 / blood.V97.1.312. PMID  11133776.
• Сагизаде М., Браун Д. Дж., Кастельон Р., Чва М., Хуанг Г. Х., Любимова Ю. Ю., Розенберг С., Спирин К. С., Столитенко Р. Б., Адачи В., Киношита С., Мерфи Г., Виндзор Л. Дж., Кенни М. С., Любимов А. В. (февраль 2001 г.). «Сверхэкспрессия матричной металлопротеиназы-10 и матриксной металлопротеиназы-3 в роговице человека с диабетом: возможный механизм изменений базальной мембраны и интегрина». Американский журнал патологии. 158 (2): 723–34. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 64015-1. ЧВК  1850323. PMID  11159210.
• McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнных желез человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии. 46 (6): 545–55. Дои:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID  11311202.
• Gagnoux-Palacios L, Allegra M, Spirito F, Pommeret O, Romero C, Ortonne JP, Meneguzzi G (май 2001 г.). «Короткое плечо цепи ламинина гамма2 играет ключевую роль во включении ламинина 5 во внеклеточный матрикс и в клеточной адгезии». Журнал клеточной биологии. 153 (4): 835–50. Дои:10.1083 / jcb.153.4.835. ЧВК  2192378. PMID  11352943.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О. (август 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XXI. Полные последовательности 60 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки». ДНК исследования. 8 (4): 179–87. Дои:10.1093 / dnares / 8.4.179. PMID  11572484.
• Дои М., Тиболл Дж., Кортесмаа Дж., Янссон К., Иванайнен А., Парварде М., Тимпл Р., Хедин Ю., Сведенборг Дж., Трюггвасон К. (апрель 2002 г.). «Рекомбинантный человеческий ламинин-10 (alpha5beta1gamma1). Продукция, очистка и активность, способствующая миграции в отношении эндотелиальных клеток сосудов». Журнал биологической химии. 277 (15): 12741–8. Дои:10.1074 / jbc.M111228200. PMID  11821406.