Коллаген, тип XXV, альфа 1 - Collagen, type XXV, alpha 1

COL25A1
Идентификаторы
Псевдонимы	COL25A1, AMY, CLAC, CLAC-P, CLACP, CFEOM5, коллаген, тип XXV, альфа 1, коллаген типа XXV альфа 1, коллаген типа XXV альфа 1 цепь
Внешние идентификаторы	OMIM: 610004 MGI: 1924268 ГомолоГен: 57111 Генные карты: COL25A1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q25 Начинать 108,808,725 бп[1] Конец 109,302,752 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 G3 Начинать 130,131,501 бп[2] Конец 130,599,877 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гепарина • связывание бета-амилоида • структурная составляющая внеклеточного матрикса • структурный компонент внеклеточного матрикса, придающий прочность на разрыв Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • внеклеточная область • клеточная мембрана • коллаген • просвет эндоплазматического ретикулума • мембрана • внеклеточный • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внеклеточный матрикс • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • аксоногенез участвует в иннервации • организация внеклеточного матрикса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84570	77018
Ансамбль	ENSG00000188517	ENSMUSG00000058897
UniProt	Q9BXS0	Q99MQ5
RefSeq (мРНК)	NM_001256074 NM_032518 NM_198721	NM_001244952 NM_029838 NM_198711
RefSeq (белок)	NP_001243003 NP_115907 NP_942014	NP_001231881 NP_084114 NP_942004
Расположение (UCSC)	Chr 4: 108,81 - 109,3 Мб	Chr 3: 130.13 - 130.6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цепь коллагена альфа-1 (XXV) это белок что у людей кодируется COL25A1 ген.^[5][6]

COL25A1 - это специфический для мозга мембраносвязанный коллаген. Протеолитический процессинг высвобождает CLAC, растворимую форму COL25A1, содержащую внеклеточные коллагеновые домены, которые ассоциируются со старческими бляшками при болезни Альцгеймера (AD; MIM 104300) головного мозга (Osada et al., 2005) [предоставлено OMIM].^[6]

Взаимодействия

Было показано, что коллаген типа XXV, альфа 1 взаимодействовать с Белок-предшественник амилоида.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000188517 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058897 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хашимото Т., Вакабаяси Т., Ватанабе А., Кова Х., Хосода Р., Накамура А., Канадзава И., Араи Т., Такио К., Манн Д.М., Ивацубо Т. (апрель 2002 г.). «CLAC: новый компонент амилоидной бляшки, образующийся при болезни Альцгеймера, полученный из трансмембранного предшественника, CLAC-P / коллаген типа XXV». EMBO J. 21 (7): 1524–34. Дои:10.1093 / emboj / 21.7.1524. ЧВК  125364. PMID  11927537.
6. «Энтрез Ген: коллаген COL25A1, тип XXV, альфа 1».

дальнейшее чтение

• Какуяма Х., Содерберг Л., Хоригоме К. и др. (2006). «CLAC связывается с агрегированными фрагментами Abeta и Abeta и ослабляет удлинение фибрилл». Биохимия. 44 (47): 15602–9. Дои:10.1021 / bi051263e. PMID  16300410.
• Седерберг Л., Дальквист С., Какуяма Х. и др. (2005). «Коллагеновый компонент амилоидной бляшки, образующийся при болезни Альцгеймера, собирает амилоидные фибриллы в агрегаты, устойчивые к протеазе». FEBS J. 272 (9): 2231–6. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.04647.x. HDL:10616/39314. PMID  15853808. S2CID  26505595.
• Osada Y, Hashimoto T., Nishimura A, et al. (2005). «CLAC связывается с бета-амилоидными пептидами через положительно заряженный аминокислотный кластер в коллагеновом домене 1 и ингибирует образование амилоидных фибрилл». J. Biol. Chem. 280 (9): 8596–605. Дои:10.1074 / jbc.M413340200. PMID  15615705.
• Содерберг Л., Какуяма Х., Мёллер А. и др. (2005). «Характеристика белка CLAC, ассоциированного с болезнью Альцгеймера, и идентификация сайта связывания амилоидного бета-пептида». J. Biol. Chem. 280 (2): 1007–15. Дои:10.1074 / jbc.M403628200. PMID  15522881.
• Кова Х., Сакакура Т., Мацуура Й. и др. (2004). «В основном отдельные распределения CLAC- по сравнению с Abeta40- или тиофлавином S-реактивностью в сенильных бляшках выявляют две отдельные субпопуляции отложений бета-амилоида». Являюсь. Дж. Патол. 165 (1): 273–81. Дои:10.1016 / с0002-9440 (10) 63295-6. ЧВК  1618534. PMID  15215182.
• Седерберг Л., Жукарева В., Богданович Н. и др. (2004). «Молекулярная идентификация AMY, амилоид-ассоциированного белка болезни Альцгеймера». J. Neuropathol. Exp. Neurol. 62 (11): 1108–17. Дои:10.1093 / jnen / 62.11.1108. PMID  14656069.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.