Коллаген, тип XIII, альфа 1 - Collagen, type XIII, alpha 1
Цепь коллагена альфа-1 (XIII) это белок что у людей кодируется COL13A1 ген.[5]
Этот ген кодирует альфа-цепь одного из нефибриллярных коллагенов. Функция этого генного продукта неизвестна, однако он был обнаружен на низких уровнях во всех клетках, продуцирующих соединительную ткань, поэтому он может выполнять общую функцию в соединительных тканях. В отличие от большинства коллагенов, которые секретируются во внеклеточный матрикс, коллаген XIII содержит трансмембранный домен, а белок локализован на плазматической мембране. Транскрипты этого гена подвергаются сложному и обширному сплайсингу с участием по крайней мере восьми экзонов. Как и другие коллагены, коллаген XIII представляет собой тример; неизвестно, состоит ли этот тример из одного или более чем одного изомера альфа-цепи. Номер альтернативно сращенный варианты транскриптов были описаны, но полная длина некоторых из них не была определена.[5] Коллаген XIII принадлежит к трансмембранному подсемейству коллагенов, например коллаген XVII, XXIII и XXV.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197467 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058806 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б "Ген Энтреза: коллаген COL13A1, тип XIII, альфа 1".
дальнейшее чтение
- Ювонен М., Пихлаяниеми Т. (1992). «Характеристика спектра альтернативного сплайсинга транскриптов коллагена альфа 1 (XIII) в клетках HT-1080 и ткани свода черепа привела к идентификации двух ранее не идентифицированных альтернативно сплайсированных последовательностей, одного ранее не идентифицированного экзона и девяти новых вариантов мРНК». J. Biol. Chem. 267 (34): 24693–9. PMID 1447209.
- Ювонен М., Сандберг М., Пихлаяниеми Т. (1992). «Паттерны экспрессии шести альтернативно сплайсированных экзонов, влияющих на структуры доменов COL1 и NC2 коллагеновой цепи альфа 1 (XIII) в тканях и клеточных линиях человека». J. Biol. Chem. 267 (34): 24700–7. PMID 1447210.
- Пихлаяниеми Т., Тамминен М. (1990). «Альфа-1 цепь коллагена типа XIII состоит из трех коллагеновых и четырех неколлагеновых доменов, и ее первичный транскрипт подвергается сложному альтернативному сплайсингу». J. Biol. Chem. 265 (28): 16922–8. PMID 1698771.
- Tikka L, Elomaa O, Pihlajaniemi T, Tryggvason K (1991). «Ген коллагена человека альфа 1 (XIII). Множественные формы транскриптов гена генерируются посредством сложного альтернативного сплайсинга нескольких коротких экзонов». J. Biol. Chem. 266 (26): 17713–9. PMID 1894651.
- Тикка Л., Пихлаяниеми Т., Хентту П. и др. (1988). «Структура гена альфа-1 цепи короткоцепочечного коллагена человека (тип XIII) с альтернативно сплайсированными транскриптами и кодоном терминации трансляции на 5'-конце последнего экзона». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 85 (20): 7491–5. Дои:10.1073 / pnas.85.20.7491. ЧВК 282217. PMID 2459707.
- Показывает TB, Tikka L, Byers MG, et al. (1989). «Отнесение гена цепи альфа 1 (XIII) человеческого коллагена (COL13A1) к области q22 хромосомы 10». Геномика. 5 (1): 128–33. Дои:10.1016/0888-7543(89)90096-7. PMID 2767682.
- Пихлаяниеми Т., Мюллюля Р., Сейер Дж. И др. (1987). «Частичная характеристика низкомолекулярного человеческого коллагена, который подвергается альтернативному сплайсингу». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (4): 940–4. Дои:10.1073 / пнас.84.4.940. ЧВК 304335. PMID 3547403.
- Ювонен М., Пихлаяниеми Т., Аутио-Хармайнен Х (1994). «Расположение и альтернативный сплайсинг РНК коллагена XIII типа в ранней плаценте человека». Лаборатория. Вкладывать деньги. 69 (5): 541–51. PMID 8246446.
- Хэгг П., Рен М., Хухтала П. и др. (1998). «Коллаген типа XIII идентифицируется как белок плазматической мембраны». J. Biol. Chem. 273 (25): 15590–7. Дои:10.1074 / jbc.273.25.15590. PMID 9624150.
- Квист А.П., Латванлехто А., Сунд М. и др. (1999). «Полная экзон-интронная организация и хромосомная локализация гена коллагена мыши типа XIII (col13a1) и сравнение с его гомологом человека». Матрикс Биол. 18 (3): 261–74. Дои:10.1016 / S0945-053X (99) 00018-9. PMID 10429945.
- Нюквист П., Ту Х., Иваска Дж. И др. (2000). «Четкое распознавание подтипов коллагена интегринами альфа (1) бета (1) и альфа (2) бета (1). Альфа (1) бета (1) опосредует адгезию клеток к коллагену типа XIII». J. Biol. Chem. 275 (11): 8255–61. Дои:10.1074 / jbc.275.11.8255. PMID 10713152.
- Sandberg-Lall M, Hägg PO, Wahlström I, Pihlajaniemi T (2000). «Коллаген типа XIII широко экспрессируется во взрослом и развивающемся человеческом глазу и выделяется в цилиарной мышце, зрительном нерве и нервной сетчатке». Exp. Глаз Res. 70 (4): 401–10. Дои:10.1006 / exer.1998.0826. PMID 10865988.
- Ту Х., Сасаки Т., Снельман А. и др. (2002). «Эктодомен коллагена типа XIII представляет собой стержень длиной 150 нм и способен связываться с фибронектином, нидогеном-2, перлеканом и гепарином». J. Biol. Chem. 277 (25): 23092–9. Дои:10.1074 / jbc.M107583200. PMID 11956183.
- Латванлехто А., Снельман А., Ту Х., Пихлаяниеми Т. (2003). «Коллаген типа XIII и некоторые другие трансмембранные коллагены содержат два отдельных спиральных мотива, которые могут функционировать как независимые домены олигомеризации». J. Biol. Chem. 278 (39): 37590–9. Дои:10.1074 / jbc.M305974200. PMID 12832406.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 10 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |