Гаплогруппа L-M20 - Haplogroup L-M20

Эта статья о гаплогруппе Y-ДНК человека. Для гаплогруппы мтДНК человека см. Макро-гаплогруппа L (мтДНК).
Гаплогруппа L-M20
Распространение гаплогруппы L Y-DNA.svg
Возможное время происхождения25 000–30 000 лет назад[нужна цитата ]
Возможное место происхожденияСредний Восток, Западная Азия, Южная Азия или же Памирские горы
ПредокLT
Определение мутацийМ11, М20, М61, М185, L656, L863, L878, L879[Интернет 1]
Самые высокие частотыСирия Ракка, Белуджистан, Северная Афганистан, Южная Индия, Каллар, Джатс, Калаш, Нуристанцы, Burusho, Пуштуны, Лазы, Село Афшар, Фасция, Венето, Южный Тироль

Гаплогруппа L-M20 это гаплогруппа Y-ДНК человека, который определяется SNP M11, M20, M61 и M185. Как вторичный потомок гаплогруппы K и основной филиал гаплогруппа LT, гаплогруппа L в настоящее время имеет альтернативу филогенетическое название из K1a, и является братом гаплогруппы Т (он же K1b).

Присутствие L-M20 наблюдалось на разных уровнях на всем протяжении Южная Азия, достигая пика среди коренных жителей Белуджистан (28%),[1] Северный Афганистан (25%)[2] и Южная Индия (19%).[3] Клада также встречается в Таджикистан и Анатолия, а также на более низких частотах в Иран. Он также присутствует на протяжении тысячелетий на очень низких уровнях в Кавказ, Европа и Центральная Азия. Субклад L2 (L-L595) был обнаружен в Европе и Западной Азии, но встречается крайне редко.

Филогенетическое дерево

Есть несколько подтвержденных и предложенных филогенетических деревьев, доступных для гаплогруппы L-M20. Научно принятый - это консорциум Y-хромосомы (YCC), опубликованный в Karafet 2008 и впоследствии обновленный. Черновик дерева, который показывает развивающуюся науку, предоставлен Томасом Краном из Центра геномных исследований в г. Хьюстон, Техас.[Интернет 1] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) также предоставляет любительское дерево.

Это Томас Кран из Черновика предложенного дерева для гаплогруппы L-M20 Центра геномных исследований:[Интернет 1]

  • L-M20 М11, М20, М61, М185, L656, L863, L878, L879
    • L-M22 (L1) M22, M295, PAGES00121
      • L-M317 (L1b) M317, L655
        • L-M349 (L1b1) M349
        • L-M274 M274
        • L-L1310 L1310
      • L-L1304 L1304
        • L-M27 (L1a1) M27, M76, P329.1, L1318, L1319, L1320, L1321
        • L-M357 (L1a2) M357
          • L-PK3 PK3
          • L-L1305 L1305, L1306, L1307
    • L-L595 (L2) L595
      • L-L864 L864, L865, L866, L867, L868, L869, L870, L877

Происхождение

L-M20 является потомком Гаплогруппа LT,[4][5] который является потомком гаплогруппа К-М9.[6][5] По словам доктора Спенсер Уэллс, Предположили, что L-M20 возник в Средний Восток или же Индия ок. 30 000 лет назад.[7] Другие исследования предложили Западная Азия происхождение L-M20 и связанное с этим расширение в Долина Инда к неолит фермеры.[8][9][10][11][12][13] Макэлриви и Кинтана-Мурси, писавшие на Цивилизация долины Инда, утверждать, что

Одна гаплогруппа Y-хромосомы (L-M20) имеет высокую среднюю частоту в 14% в Пакистане и поэтому отличается от всех других гаплогрупп своим частотным распределением. L-M20 также наблюдается, хотя и с меньшей частотой, в соседних странах, таких как Индия, Таджикистан, Узбекистан и Россия. Как частотное распределение, так и предполагаемое время распространения (~ 7000 лет назад) этой линии позволяют предположить, что ее распространение в долине Инда может быть связано с расширением местных фермерских групп в период неолита.[14]

Sengupta et al. (2006) наблюдали три ответвления гаплогруппы L: L1-M76 (L1a1), L2-M317 (L1b) и L3-M357 (L1a2), с отчетливой географической принадлежностью.[15] Почти все индийские члены гаплогруппы L происходят от L1, а L3-M357 встречаются только спорадически (0,4%).[16][17] Напротив, в Пакистане субклад L3-M357 составляет 86% хромосом L-M20 и достигает промежуточной частоты в 6,8% в целом.[18] L1-M76 встречается с частотой 7,5% в Индии и 5,1% в Пакистане, демонстрируя максимальное распределение дисперсии в районе Махараштры в прибрежной западной Индии.[19]

Географическое распределение

В Индии L-M20 имеет более высокую частоту среди Дравидийский каст, но несколько реже в Индоарийский касты.[15] В Пакистане наиболее часто встречается в Белуджистан.[20]

Он также был обнаружен с низкой частотой среди популяций Центральная Азия и Юго-Западная Азия (включая Аравия, Ирак, Сирия, индюк, Ливан, Египет, и Йемен ) а также в Южная Европа (особенно области, прилегающие к Средиземное море ).[нужна цитата ]

Предварительные данные получены из ненаучных источников, таких как люди, у которых были проверены Y-хромосомы в коммерческих лабораториях,[веб 2] предполагает, что большинство европейских примеров гаплогруппы L-M20 могут принадлежать к субклад L2-M317, который среди населения Южной Азии обычно является самым редким из субкладов гаплогруппы L.[веб 2]

Южная Азия

Индия

Он встречается чаще среди Дравидийский каст (примерно 17-19%), но несколько реже в Индоарийский касты (около 5-6%).[15] В некоторых племенах и кастах она достигает 68%. Карнатака,[21] 38% в некоторых кастах в Гуджарат,[21] 48% в некоторых кастах в Тамил Наду и общая частота 12% в Пенджаб.[15][21][22] Более ранние исследования (например, Wells 2001) сообщают об очень высокой частоте (приближающейся к 80%) гаплогруппы L-M20 в Тамил Наду по всей видимости, произошло из-за экстраполяции данных, полученных из выборки из 84 Калларс, а Тамильский -говоря о высшей касте правителей Тамил Наду, среди которых 40 (примерно 48%) имели мутацию M20, которая определяет гаплогруппу L. Присутствие гаплогруппы L-M20 редко среди племенных групп (примерно 5,6-7%) (Кордо 2004, Сенгупта 2006, и Тамсим 2006 ).

L-M20 был обнаружен на 68% в племени Корова из Карнатака, 38% в Бхарвад каста из Джунагархский район в Гуджарат, 21% в Чаран каста из Джунагархский район в Гуджарат и 17% в племени каре воккал из Уттара каннада в Карнатака.(Шах 2011 ) Также встречается с низкой частотой в других популяциях из Джунагархский район и Уттара каннада. L-M20 - самая крупная мужская линия (36,8%) среди Джат люди из Северная Индия и находится на уровне 16,33% среди Гуджара из Джамму и Кашмир.[23][24] Это также встречается у 18,6% среди Конканастха-брамины из Конкан область, край[22] и 15% среди Маратхи из Махараштра.[25] L-M20 также содержится в 32,35% Воккалигаз и 17,82% в Лингаяты Карнатаки.[26] L-M20 также встречается на уровне 20,7% среди Амбалакарар, 16,7% среди Айенгар и 17,2% среди Айер касты Тамил Наду.[25] L-M11 встречается на частотах 8-16% среди Индийские евреи.[27] 2% от Сиддис также сообщалось о L-M11. (Шах 2011 ) Гаплогруппа L-M20 в настоящее время присутствует у населения Индии с общей частотой ок. 7-15%.[Сноска 1]

Пакистан

Наибольшая концентрация гаплогруппы L-M20 находится вдоль Река Инд в Пакистан где Цивилизация долины Инда процветал в 3300–1300 гг. до н.э., а зрелый период - между 2600–1900 гг. до н.э. Самая высокая частота и разнообразие L-M357 обнаруживаются в Белуджистан провинция на 28%[20] с умеренным распределением среди населения Пакистана в целом - 11,6% (Firasat 2007 )). Он также встречается в Афганистан этническими аналогами, такими как Пуштуны и Белуджи. L-M357 часто встречается среди Burusho (примерно 12% (Firasat 2007 )) и Пуштуны (примерно 7% (Firasat 2007 )),

L1a и L1c-M357 встречаются у 24% белуджей, L1a и L1c встречаются у 8% среди белуджей. Дравидийский -Говорящий Брахуи, L1c находится в 25% среди Калаш, L1c находится на уровне 15% среди Burusho, L1a-M76 и L1b-M317 находятся на уровне 2% среди Макранис и L1c находится в 3,6% Синдхи согласно Джули ди Кристофаро и др. 2013.[28] L-M20 встречается на 17,78% среди Парсы.[29] L3a встречается у 23% среди Нуристанцы в обоих Пакистан и Афганистан.[30]

L-PK3 содержится примерно в 23% Калаш на северо-западе Пакистан (Firasat 2007 ).

Афганистан

Исследование по Пуштун мужские линии в Афганистане, обнаружено, что гаплогруппа L-M20 с общей частотой 9,5% является второй по численности мужской линией среди них.[31] Он демонстрирует существенное неравенство в своем распределении по обе стороны хребта Гиндукуш: 25% северных афганских пуштунов принадлежат к этой линии, по сравнению с только 4,8% мужчин с юга.[31] В частности, парагруппа L3 * -M357 составляет большинство хромосом L-M20 среди афганских пуштунов как на севере (20,5%), так и на юге (4,1%).[31] Более раннее исследование с меньшим количеством образцов показало, что L1c составляет 12,24% афганской Пуштун мужские линии.[32] L1c-M357 значительно встречается в Burusho и Калаш (15% и 25%), а также.[33] L1c также встречается на уровне 7,69% среди Белуджи Афганистана.[32] Однако L1a-M76 встречается гораздо чаще среди Белуджи (20[33] до 61,54%),[33] и встречается на более низких уровнях у кыргызского, таджикского, узбекского и туркменского населения.[33]

Ближний Восток и Анатолия

L-M20 был обнаружен в 51% Сирийцы из Ракка, северный сирийский город, предыдущие жители которого были уничтожены Монгол геноциды и заселены в последнее время местными Бедуин населения и Беженцы из Чечни из России (Эль-Сибай 2009 ). В небольшой выборке Израильские друзы гаплогруппа L-M20 обнаружена у 7 из 20 (35%). Однако исследования, проведенные на более крупных образцах, показали, что L-M20 составляет в среднем 5% в Израильские друзы,[Сноска 2] 8% в Ливанские друзы,[Сноска 3] и не обнаружен в выборке из 59 Сирийские друзы. Гаплогруппа L-M20 была обнаружена в 2,0% (1/50) (Уэллс 2001 ) до 5,25% (48/914) от Ливанский (Заллуа 2008 ).

НаселенияРаспределениеИсточник
индюк57% в Село Афшар, 12% (10/83) в Черноморский регион, 6,6% (7/106) из Турки в Турции - 4,2% (1/523 L-M349 и 21/523 L-M11 (xM27, M349))Cinnioğlu 2004, Gokcumen 2008 и Карафет 2016
Иран54.9% (42/71) L в Зороастрийском жреце Парсы
22,2% L1b и L1c в Южный Иран (2/9)
От 8% до 16% L2-L595, L1a, L1b и L1c курдов в Кордестан (2-4/25)
9,1% L-M20 (7/77) персов в Восточном Иране
3,4% L-M76 (4/117) и 2,6% L-M317 (3/117)
всего 6,0% (7/117) гаплогруппы L-M20 в Южном Иране
3,0% (1/33) L-M357 в Северном Иране
4,2% L1c-M357 азербайджанцев в Восточные азербайджанцы (1/21)
4,8% L1a и L1b персов в Исфахан (2/42)		Регейро 2006, Кристофаро 2013, Малярчук 2013 и Лопес 2017
Сирия51,0% (33/65) из Сирийцы в Ракка, 31,0% восточной СирийцыЭль-Сибай 2009
Лаз41,7% (15/36) L1b-M317О. Балановский 2017
Саудовцы15,6% (4/32 L-M76 и 1/32 L-317) 1,91% (2/157 = 1,27% L-M76 и 1/157 = 0,64% L-M357)Карафет 2016 и АбуАмеро 2009
Курды3,2% курдов в юго-восточной ТурцииФлорес 2005
Ирак3,1% (2/64) L-M22Санчес 2005
АрмянеОт 1,63% (12/734) до 4,3% (2/47)Weale 2001 и Уэллс 2001
Оманцы1% L-M11Луис 2004
Катарцы2,8% (2/72 L-M76)Кадены 2008
ОАЭ арабы3,0% (4/164 L-M76 и 1/164 L-M357)Кадены 2008

Центральная Азия

НаселенияРаспределениеИсточник
Таджики22,5% (9/40), 11,1% (6/54) L1a и L1c в Балхская область, 9,0% (7/78), 6,3% (1/16) L1c в Саманганская область, 5,4% (2/37) L1c в Провинция БадахшанМалярчук 2013Уэллс 2001
Узбеки20% (1/5) L1c дюйма Балхская область, 14,3% (4/28) L1a и L1c в Провинция Сар-э-Поль, 7,5% (7/94) L1a, L1b и L1c в Провинция Джаузджан, От 3,0% (11/366) до 3,7% (2/54)Уэллс 2001, Карафет 2001 и Кристофаро 2013
Уйгуры16,7% (1/6) L1c-M357 дюйма КыргызстанКристофаро 2013
Памир16% (7/44) из Шугнанис, 12% 3/25 от Ишкашимис, 0/30 БартангисУэллс 2001
Хазарейцы12,5% (1/8) L1a в Балхская область, 1,9% (2/69) L1a в Провинция БамианКристофаро 2013
Ягноби9.7% (3/31)Уэллс 2001
Бухарские арабы9.5% (4/42)Уэллс 2001
Пуштуны9,4% (5/53) L1a и L1b в Провинция Кундуз, 2,9% (1/34) L1c в Провинция БагланКристофаро 2013
Дунгане8,3% (1/12) L1c дюйм КыргызстанКристофаро 2013
Уйгуры (Лопликс)7,8% (5/64) L-M357 в деревне Карчуга, Лопнурский уезд, Синьцзян[34]Лю 2018
Каракалпаки4.5% (2/44)Уэллс 2001
Уйгуры4.4% (3/68)Карафет 2001 и Молот 2005[Сноска 4]
Туркмены4,1% (3/74) L1a в Провинция ДжаузджанКристофаро 2013
Челканцы4.0% (1/25)Дулик 2012 и Дулик 2012
Киргизы2,7% (1/37) L1c на северо-западе Кыргызстан и 2,5% (1/40) L1a в Центральной КыргызстанКристофаро 2013
Казанские татары2.6% (1/38)Уэллс 2001
Хуэй1.9% (1/54)Карафет 2001
Башкиры0.64% (3/471)Лобов 2009

Восточная Азия

Исследователи, изучающие образцы Y-ДНК из популяций Восточной Азии, редко тестировали свои образцы на наличие каких-либо мутаций, которые определяют гаплогруппу L. Однако мутации для гаплогруппы L были протестированы и обнаружены в образцах Балийский (13/641 = 2,0% L-M20), ханьские китайцы (1/57 = 1,8%),[35] Долганы из Саха и Таймыр (1/67 = 1,5% L-M20) и корейцы (3/506 = 0,6% L-M20).[36][37][38]

Европа

Статья О. Семино и другие. опубликовано в журнале Наука (Том 290, 10 ноября 2000 г.) сообщил об обнаружении мутации M11-G, которая является одной из мутаций, определяющих гаплогруппу L, примерно в 1–3% образцов из Грузия, Греция, Венгрия, Калабрия (Италия) и Андалусия (Испания). Размеры образцов, проанализированных в этом исследовании, в целом были довольно небольшими, поэтому вполне возможно, что фактическая частота гаплогруппы L-M20 среди средиземноморских европейских популяций может быть немного ниже или выше, чем та, о которой сообщает Semino. и другие., но, похоже, на сегодняшний день не существует исследования, которое бы более точно описало распространение гаплогруппы L-M20 в Юго-Западной Азии и Европе.

НаселенияРаспределениеИсточник
Фасция, Италия19,2% от Фаши L-M20Валентина Коя 2013
Несталь. Италия10% от Nonesi L-M20Ф. ди Джакомо 2003
Самний, Италия10% от Аквиланис L-M20Алессио Боаттини 2013
Виченца, Италия10% от Венецианцы L-M20Алессио Боаттини 2013
Южный Тироль, Италия8,9% от Ладин спикеры из Валь Бадиа, 8,3% Валь Бадиа, 2,9% Пустер-Вэлли, 2,2% Немецкий спикеры из Валь Бадиа, 2% говорящих по-немецки из Верхнего Виншгау, 1,9% говорящих на немецком языке из Нижнего Виншгау и 1,7% Итальянский спикеры из БольцаноПихлер 2006 и Томас 2007.
Грузины20% (2/10) грузин в Гали, 14,3% (2/14) грузин в Чохатаури, 12,5% (2/16) грузин в Мартвили, 11,8% (2/17) грузин в Абаша, 11,1% (2/18) грузин в Багдати, 10% (1/10) грузин в Гардабани, 9,1% (1/11) грузин в Адигени, 6,9% (2/29) грузин в Омало, 5,9% (1/17) грузин в Гурджаани, 5,9% (1/17) грузин в Лентехи и от 1,5% (1/66) L-M357 (xPK3) до 1,6% (1/63) L-M11Батталья 2008, Семино 2000 и Тархнишвили 2014
Дагестан, Россия10% от Чеченцы в Дагестане, 9,5% (4/42) из Аварцы, 8,3% (2/24) Таты, 3,7% (1/27) ChamalinsЮнусбаев 2006 г., Caciagli 2009 и Карафет 2016
Архангельская область, Россия5,9% от Россияне L1c-M357Хунъян Сюй 2014
ЭстонияL2-L595 и L1-M22 встречаются в 5,3%, 3,5%, 1,4% и 0,8% ЭстонцыСкоццари 2001 и Лаппалайнен 2007
Балкарцы, Россия5,3% (2/38) L-M317Батталья 2008
Португалия5,0% от КоимбраБелеза 2006
Болгария3,9% от БолгарыКарафет 2016
ФландрияL1a *: 3,17% от Мехелен 2,4% от Turnhout и 1,3% Кемпен. L1b *: 0,74% от Западная Фландрия и Восточная ФландрияЛармюзо 2010 и Larmuseau 2011
Анциферово, Новгород2,3% от РоссиянеБалановская 2017
Восточный Тироль, АвстрияL-M20 содержится в 1,9% Тирольцы в регионе B (Исель, Нижний Драу, Defereggen, Virgen, и Долина кальс )Х.Нидерштеттер 2012
Гипускоа, Страна БасковL1b встречается в 1,7% ГипузкоанцыМолодой 2011
Северный Тироль, АвстрияL-M20 содержится в 0,8% Тирольцы в РойттеД.Эрхарт 2012

Распределение субкладов

L1 (M295)

L-M295 находится из западная Европа к Южная Азия.[Сноска 5]

Субклад L1 также встречается на низких частотах на Коморские острова.[39]

L1a1 (M27)

L-M27 содержится в 14,5% Индейцы и 15% Шриланкийцы, с умеренным распространением в других популяциях Пакистан, южный Иран и Европа, но немного выше Ближнего Востока Араб население[нужна цитата ] (Карафет 2016). Очень незначительное присутствие среди Сидди (2%),[40] также.

L1a2 (M357)

L-M357 часто встречается среди Бурушос, Калаши, и Пуштуны, с умеренным распространением среди других популяций в Пакистан, Грузия,[41] Чеченцы,[42] Ингуши,[42] северный Иран, Индия, то ОАЭ, и Саудовская Аравия.[нужна цитата ]

Китайское исследование, опубликованное в 2018 году, обнаружило L-M357 / L1307 в 7,8% (5/64) образца Лоплика. Уйгуры из села Карчуга, Лопнурский уезд, Синьцзян.[34]

L-PK3

L-PK3, который находится после L-M357,[43] часто встречается среди Калаш.[нужна цитата ]

L1b (M317)

L-M317 находится на низкой частоте в Центральная Азия, Юго-Западная Азия, и Европа.[нужна цитата ]

В Европе L-M317 был обнаружен на северо-востоке. Итальянцы (3/67 = 4.5%)[41] и Греки (1/92 = 1.1%).[41]

На Кавказе L-M317 был обнаружен в Горские евреи (2/10 = 20%[44]), Аварцы (4/42 = 9.5%,[44] 3%[42]), Балкарцы (2/38 = 5.3%),[41] Абхазский (8/162 = 4.9%,[44] 2/58 = 3.4%[42]), Chamalals (1/27 = 3.7%[44]), Абазины (2/88 = 2.3%[44]), Адыги (3/154 = 1.9%[44]), Чеченцы (3/165 = 1.8%[44]), Армяне (1/57 = 1.8%[44]), Лезгины (1/81 = 1.2%[42]), и Осетины (1/132 = 0.76% Северные осетины,[44] 2/230 = 0,9% железа[42]).

L-M317 был найден в Макранис (2/20 = 10%) в Пакистане, Иранцы (3/186 = 1,6%), пуштуны в Афганистане (1/87 = 1,1%) и Узбеки в Афганистане (1/127 = 0,79%).[45]

L1b1 (M349)

L-M349 в основном встречается в Европе.[нужна цитата ]

L2 (L595)

L2-L595 встречается крайне редко и был идентифицирован частным тестированием на лицах из Европы и Западной Азии.

Возможные, но неподтвержденные случаи L2 включают 4% (1/25) L-M11 (xM76, M27, M317, M357) в выборке иранцев в Кордестан[45] и 2% (2/100) L-M20 (xM27, M317, M357) в образце Шапсуги,[42] среди других редких зарегистрированных случаев L, которые не попадают в общие ветви.

Древняя ДНК

Гаплогруппа L была обнаружена в BMAC сайты в Центральная Азия и в останках захоронения V века в г. Паннония, Венгрия, приписываемый элитному представителю Гунны.[46]

Три человека, которые жили в Энеолит эпоха (ок. 5700–6250 гг. BP ), найденный в пещере Арени-1 («Птичий глаз») в г. Южный Кавказ горы (современные Область Вайоц Дзор, Армения ), также были идентифицированы как принадлежащие к гаплогруппе L1a. Геном одного человека показал, что у него были рыжие волосы и голубые глаза.

Бактрийско-Маргианский археологический комплекс

Нарасимхан и др. (2018) проанализировали скелеты из BMAC сайты в Узбекистан и идентифицировал 2 человека как принадлежащих к гаплогруппе L1a. Один из этих экземпляров был найден в Бустане, а другой - в Саппали-Тепе; как установлено, что они Бронзовый век места.[47]

Могила элитных гуннов

Останки, найденные в могиле в Паннонии (приписываемые элите гуннов)
Я БЫ
Y ДНКL-M20
численность населенияГунны
Языкнеизвестный; возможно Гуннский
Культура
Дата (YBP)1540–1500 лн
Захоронение / МестоположениеВенгрия
Члены / размер выборки1/1
Процент
мтДНКD4j12
Изотоп Sr
Цвет глаз (система HIrisPlex)
Цвет волос (система HIrisPlex)
Пигментация кожи
Группа крови ABO
Диета (d13C% 0 / d15N% 0)
Деятельность FADS
Стойкость лактазы
Оазе-1 Общая ДНК
Ostuni1 Общая ДНК
Неандерталец Vi33.26 Общая ДНК
Неандерталец Vi33.25 Общая ДНК
Неандерталец Vi33.16 Общая ДНК
Родовой компонент (AC)
puntDNAL K12 Древний
Dodecad [dv3]
Еврогены [K = 36]
Dodecad [Globe13]
Генетическая дистанция
Родительское родство
Возраст на момент смерти
Позиция смерти
SNP
Читать пары
Образец
ИсточникЛаборатория популяционной генетики Казахстана
Примечания

Энеолит Южный Кавказ

Пещера Арени-1
СвойствоАрени-IАрени-IIАрени-III
Я БЫAR1 / 44 I1634AR1 / 46 I1632ARE12 I1407
Y ДНКL1aL1a1-M27L1a
численность населенияЭнеолит (горизонт III)Энеолит (горизонт III)Энеолит (Горизонт II)
Язык
КультураПоздний энеолитПоздний энеолитПоздний энеолит
Дата (YBP)6161 ± 896086 ± 726025 ± 325
Захоронение / МестоположениеМогильник 2 / Пещера Арени-1Могильник 3 / Пещера Арени-1Траншея 2А, Блок 7, Площадь S33 / T33, Локус 9, Стрелка 23 / Пещера Арени-1
Члены / размер выборки1/31/31/3
Процент33.3%33.3%33.3%
мтДНКH2a1K1a8ЧАС*
Изотоп Sr
Цвет глаз (система HIrisPlex)Вероятно, синий
Цвет волос (система HIrisPlex)Вероятно, красный
Пигментация кожиВероятно, легкий
Группа крови ABOСкорее всего O или B
Диета (d13C% 0 / d15N% 0)
Деятельность FADS
Стойкость лактазыВероятная непереносимость лактозы
Оазе-1 Общая ДНК
Ostuni1 Общая ДНК
Неандерталец Vi33.26 Общая ДНК
Неандерталец Vi33.25 Общая ДНК
Неандерталец Vi33.16 Общая ДНК
Наследственный компонент (AC)
puntDNAL K12 Древний
Dodecad [dv3]
Еврогены [K = 36]
Dodecad [Globe13]
Генетическая дистанция
Родительское родство
Возраст на момент смерти11 ± 2.515 ± 2.5
Позиция смерти
SNP
Читать пары
Образец
Источник[48]
ПримечанияСамые ранние в мире свидетельства изготовления обуви и виноделия

Алалах Аморитский город-государство

Skourtanioti et al. (2020) проанализировали скелеты из Алалах сайты в Сирия и идентифицировал одного человека как принадлежащего к гаплогруппе L-L595, и он был датирован, скорее всего, 1941–1883 ​​гг. до н.э.[49]

Номенклатура

Основная статья: Таблица преобразования гаплогрупп Y-хромосомы

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
L-M2028VIII1U27Eu17H5FL *LLL-------
L-M2728VIII1U27Eu17H5FL1L1L1L1-------
Дерево Консорциума Y-хромосомы

Это официальное научное дерево, созданное Консорциумом Y-хромосомы (YCC). Последнее крупное обновление было в 2008 г. (Карафет 2008 ). Последующие обновления производились ежеквартально и раз в два года. Текущая версия является переработкой обновления 2010 года.[50]

Оригинальные научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

Смотрите также

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр

Сноски

  1. ^ видеть Басу 2003, Кордо 2004, Сенгупта 2006, и Тамсим 2006.
  2. ^ 12/222 Shlush et al. 2008 г.
  3. ^ 1/25 Shlush et al. 2008 г.
  4. ^ В Hammer 2005 см. Дополнительные материалы.
  5. ^ Результаты лаборатории FTDNA, май 2011 г.

Рекомендации

  1. ^ Махал, Дэвид Дж .; Мацукас, Янис Г. (23 января 2018 г.). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: изучение древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК». Границы генетики. 9: 4. Дои:10.3389 / fgene.2018.00004. ISSN  1664-8021. ЧВК  5787057. PMID  29410676.
  2. ^ Лакау, Харлетт; Гайден, Тензин; Регейро, Мария; Ченнакришнаия, Шилпа; Бухари, Аридж; Андерхилл, Питер А; Гарсия-Бертран, Ральф Л; Эррера, Рене Дж (18 апреля 2012 г.). «Афганистан с точки зрения Y-хромосомы». Европейский журнал генетики человека. 20 (10): 1063–1070. Дои:10.1038 / ejhg.2012.59. ISSN  1018-4813. ЧВК  3449065. PMID  22510847.
  3. ^ Сенгупта, Сангхамитра; Животовский, Лев А .; Кинг, Рой; Mehdi, S. Q .; Эдмондс, Кристофер А .; Чоу, Шерил-Эмилиан Т .; Лин, Алиса А .; Митра, Миташри; Sil, Samir K .; Рамеш, А .; Usha Rani, M. V .; Thakur, Chitra M .; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Majumder, Partha P .; Андерхилл, Питер А. (2006). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как коренное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–221. Дои:10.1086/499411. ISSN  0002-9297. ЧВК  1380230. PMID  16400607.
  4. ^ Международное общество генетической генеалогии, 2015, Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015 (30 мая 2015 г.).
  5. ^ а б Chiaroni, J .; Андерхилл, П. А .; Кавалли-Сфорца, Л. Л. (декабрь 2009 г.). «Разнообразие Y-хромосомы, человеческое развитие, дрейф и культурная эволюция». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 106 (48): 20174–49. Bibcode:2009PNAS..10620174C. Дои:10.1073 / pnas.0910803106. JSTOR  25593348. ЧВК  2787129. PMID  19920170.
  6. ^ Международное общество генетической генеалогии, 2015 Y-ДНК Гаплогруппа K и ее субклады - 2015 (5 апреля 2015 г.).
  7. ^ Уэллс, Спенсер (2007). Глубокое происхождение: внутри генографического проекта. Вашингтон, округ Колумбия: National Geographic. п. 103. ISBN  978-1426201189.
  8. ^ Камар, Рахил; Аюб, Касим; Мохьюддин, Аиша; Хельгасон, Агнар; Мажар, Кекашан; Мансур, Атика; Зерджаль, Татьяна; Тайлер-Смит, Крис; Мехди, С. Касим (2002). «Вариация Y-хромосомной ДНК в Пакистане». Американский журнал генетики человека. 70 (5): 1107–1124. Дои:10.1086/339929. ISSN  0002-9297. ЧВК  447589. PMID  11898125.
  9. ^ Чжао, Чжунмин; Хан, Фейсал; Боркар, Минал; Эррера, Рене; Агравал, Суракша (2009). «Наличие трех разных отцовских линий среди северных индейцев: исследование 560 Y-хромосом». Анналы биологии человека. 36 (1): 46–59. Дои:10.1080/03014460802558522. ISSN  0301-4460. ЧВК  2755252. PMID  19058044.
  10. ^ Тансим, Исмаил; Тангарадж, Кумарасами; Чаубей, Гианешвер; Сингх, Виджай Кумар; Бхаскар, Лаккакула В.КС .; Редди, Б. Мохан; Редди, Алла Г; Сингх, Лалджи (7 августа 2006 г.). «Генетическое родство среди низших каст и племенных групп Индии: вывод из Y-хромосомы и митохондриальной ДНК». BMC Genetics. 7: 42. Дои:10.1186/1471-2156-7-42. ISSN  1471-2156. ЧВК  1569435. PMID  16893451.
  11. ^ Кордо, Ричард; Аунгер, Роберт; Бентли, Джиллиан; Насидзе, Иване; Sirajuddin, S.M .; Стоункинг, Марк (3 февраля 2004 г.). «Независимое происхождение индейской касты и племенных отцовских линий». Текущая биология. 14 (3): 231–235. Дои:10.1016 / j.cub.2004.01.024. ISSN  0960-9822. PMID  14761656. S2CID  5721248.
  12. ^ McElreavey, K .; Кинтана-Мурси, Л. (2005). «Перспектива популяционной генетики долины Инда с помощью маркеров, унаследованных от одного родителя». Анналы биологии человека. 32 (2): 154–162. Дои:10.1080/03014460500076223. ISSN  0301-4460. PMID  16096211. S2CID  109014.
  13. ^ Тангарадж, Кумарасами; Найду, Б. Пратап; Кривелларо, Федерика; Таманг, Ракеш; Упадхьяй, Шашанк; Шарма, Варун Кумар; Редди, Алла Г .; Walimbe, S. R .; Чаубей, Гианешвер; Кивисилд, Тоомас; Сингх, Лалджи (20 декабря 2010 г.). «Влияние естественных барьеров на формирование генетической структуры популяций Махараштры». PLOS ONE. 5 (12): e15283. Bibcode:2010PLoSO ... 515283T. Дои:10.1371 / journal.pone.0015283. ISSN  1932-6203. ЧВК  3004917. PMID  21187967.
  14. ^ К. МакЭлриви и Л. Кинтана-Мурси (2005 г.), Перспектива популяционной генетики долины Инда с помощью маркеров, унаследованных от одного родителя. В архиве 2017-01-16 в Wayback Machine
  15. ^ а б c d Сенгупта 2006.
  16. ^ Сенгупта 2006, п. 218.
  17. ^ Кивисилд, Т .; Rootsi, S .; Мецпалу, М .; Mastana, S .; Kaldma, K .; Parik, J .; Мецпалу, Э .; Adojaan, M .; Tolk, H.-V .; Степанов, В .; Gölge, M .; Usanga, E .; Papiha, S. S .; Cinniolu, C .; King, R .; Cavalli-Sforza, L .; Андерхилл, П. А .; Виллемс Р. (2003). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индейских племенах, так и в кастах». Американский журнал генетики человека. 72 (2): 313–332. Дои:10.1086/346068. ISSN  0002-9297. ЧВК  379225. PMID  12536373.
  18. ^ Сенгупта 2006, п. 219.
  19. ^ Сенгупта 2006, п. 220.
  20. ^ а б Камар 2002.
  21. ^ а б c Шах 2011.
  22. ^ а б Кивисилд, Т; Рутси, S; Мецпалу, М; и другие. (Февраль 2003 г.). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индейских племенах, так и в кастах». Являюсь. J. Hum. Genet. 72 (2): 313–32. Дои:10.1086/346068. ЧВК  379225. PMID  12536373.
  23. ^ Махал, Дэвид Дж .; Мацукас, Янис Г. (20 сентября 2017 г.). «Разнообразие гаплогрупп Y-STR в популяции джат свидетельствует о нескольких различных древних источниках». Границы генетики. 8: 121. Дои:10.3389 / fgene.2017.00121. ISSN  1664-8021. ЧВК  5611447. PMID  28979290.
  24. ^ Шарма, S; Рай, Э; Шарма, П; и другие. (Январь 2009 г.). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1 * подтверждает автохтонное происхождение браминов и кастовой системы». Журнал генетики человека. 54 (1): 47–55. Дои:10.1038 / jhg.2008.2. PMID  19158816.
  25. ^ а б Сенгупта, S; Животовский, Л.А.; King, R; и другие. (Февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как коренное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Являюсь. J. Hum. Genet. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК  1380230. PMID  16400607.
  26. ^ «Анализ разнообразия Y-хромосомы в популяциях лингаятов и воккалига в Южной Индии». 2011 г. CiteSeerX  10.1.1.425.9132. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  27. ^ Чаубей, Гианешвер (2016). «Генетическая близость еврейского населения Индии». Научные отчеты. 6: 19166. Bibcode:2016НатСР ... 619166C. Дои:10.1038 / srep19166. ЧВК  4725824. PMID  26759184.
  28. ^ Ди Кристофаро, Джули; Пеннарун, Эрван; Мазьер, Стефан; Майрес, Натали М .; Лин, Алиса А .; Темори, Шах Ага; Мецпалу, Майт; Мецпалу, Эне; Витцель, Майкл; Кинг, Рой Дж .; Андерхилл, Питер А .; Виллемс, Ричард; Кьярони, Жак (2013). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. Дои:10.1371 / journal.pone.0076748. ЧВК  3799995. PMID  24204668.
  29. ^ Камар, Р; Аюб, Q; Мохьюддин, А; и другие. (Май 2002 г.). «Вариация Y-хромосомной ДНК в Пакистане». Являюсь. J. Hum. Genet. 70 (5): 1107–24. Дои:10.1086/339929. ЧВК  447589. PMID  11898125.
  30. ^ Firasat, S; Халик, S; Мохьюддин, А; и другие. (Январь 2007 г.). «Доказательства Y-хромосомы ограниченного вклада Греции в популяцию патанов в Пакистане». Евро. J. Hum. Genet. 15 (1): 121–26. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201726. ЧВК  2588664. PMID  17047675.
  31. ^ а б c Lacau, H; Гайден, Т; Регейро, М; Ченнакришнайя, S; Бухари, А; Андерхилл, Пенсильвания; Гарсия-Бертран, Р.Л .; Эррера, RJ (октябрь 2012 г.). «Афганистан с точки зрения Y-хромосомы». Европейский журнал генетики человека. 20 (10): 1063–70. Дои:10.1038 / ejhg.2012.59. ЧВК  3449065. PMID  22510847.
  32. ^ а б Габер, М; Platt, DE; Ашрафиан Бонаб, М; и другие. (2012). «Этнические группы Афганистана разделяют наследие Y-хромосомы, структурированное историческими событиями». PLOS ONE. 7 (3): e34288. Bibcode:2012PLoSO ... 734288H. Дои:10.1371 / journal.pone.0034288. ЧВК  3314501. PMID  22470552.
  33. ^ а б c d Ди Кристофаро, Дж; Pennarun, E; Mazières, S; Майрес, Нью-Мексико; Линь А.А.; Temori, SA; Мецпалу, М; Мецпалу, Э; Witzel, M; King, RJ; Андерхилл, Пенсильвания; Виллемс, Р. Кьярони, Дж (2013). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. Дои:10.1371 / journal.pone.0076748. ЧВК  3799995. PMID  24204668.
  34. ^ а б Лю SH, N, Yilihamu, R Bake, и другие. (2018), «Исследование генетического разнообразия трех изолированных популяций в Синьцзяне с использованием Y-SNP». Acta Anthropologica Sinica, 2018, 37(1): 146-156.
  35. ^ Чжун 2010.
  36. ^ Федорова 2013.
  37. ^ Карафет 2010.
  38. ^ Ким 2011.
  39. ^ Мсаиди, Саид; и другие. (2011). «Генетическое разнообразие на Коморских островах показывает, что раннее мореплавание является основным фактором биокультурной эволюции человека в западной части Индийского океана» (PDF). Европейский журнал генетики человека. 19 (1): 89–94. Дои:10.1038 / ejhg.2010.128. ЧВК  3039498. PMID  20700146.
  40. ^ Шах, AM; Tamang, R; Moorjani, P; Рани, DS; Govindaraj, P; Кулкарни, G; Бхаттачарья, Т; Мустак, М.С.; Bhaskar, LV; Редди, АГ; Гадви, Д; Гай, ПБ; Чауби, G; Паттерсон, Н. Райх, Д; Тайлер-Смит, К; Сингх, L; Тангарадж, К. (2011). "Индийские сидди: потомки африканцев с индийской примесью". Являюсь. J. Hum. Genet. 89 (1): 154–61. Дои:10.1016 / j.ajhg.2011.05.030. ЧВК  3135801. PMID  21741027.
  41. ^ а б c d Винченца Батталья, Симона Форнарино, Надя Аль-Захери, и другие. (2009), «Y-хромосомные свидетельства культурного распространения сельского хозяйства в Юго-Восточной Европе». Европейский журнал генетики человека (2009) 17, 820–830; DOI: 10.1038 / ejhg.2008.249; опубликовано в сети 24 декабря 2008 г.
  42. ^ а б c d е ж грамм Балановский, Олег; Дибирова, Хадижат; Дыбо, Анна; и другие. (Октябрь 2011 г.). «Параллельная эволюция генов и языков в Кавказском регионе». Молекулярная биология и эволюция. 28 (10): 2905–2920. Дои:10.1093 / molbev / msr126. ЧВК  3355373. PMID  21571925.
  43. ^ ISOGG 2016.
  44. ^ а б c d е ж грамм час я Юнусбаев, Баязит; Мецпалу, Майт; Ярве, Мари; и другие. (2012). «Кавказ как асимметричный полупроницаемый барьер для древних миграций людей». Молекулярная биология и эволюция. 29 (1): 359–365. Дои:10.1093 / molbev / msr221. PMID  21917723.
  45. ^ а б Ди Кристофаро, Дж; Pennarun, E; Mazières, S; Майрес, Нью-Мексико; Линь А.А.; и другие. (2013). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. Дои:10.1371 / journal.pone.0076748. ЧВК  3799995. PMID  24204668.
  46. ^ Уали, Мурат (25 ноября 2016 г.). "Казахстанский ДНК-проект" [Проект ДНК Казахстана]. Np.kz (на русском). Архивировано из оригинал 26 ноября 2016 г.. Получено 10 января 2016.
  47. ^ «Геномная формация Южной и Центральной Азии». bioRxiv: 292581.31 марта 2018 г. Дои:10.1101/292581.
  48. ^ Лазаридис, Иосиф; и другие. (25 июля 2016 г.). «Геномное понимание происхождения земледелия на древнем Ближнем Востоке». Природа. 536 (7617): 419–24. Bibcode:2016Натура.536..419L. bioRxiv  10.1101/059311. Дои:10.1038 / природа19310. ЧВК  5003663. PMID  27459054.
  49. ^ Скуртаниоти, Эйрини; Erdal, Yilmaz S .; Франжипане, Марселла; Балосси Рестелли, Франческа; Йенер, К. Аслыхан; Пиннок, Фрэнсис; Маттиа, Паоло; Озбал, Рана; Шуп, Ульф-Дитрих; Гулиев, Фархад; Ахундов, Туфан; Lyonnet, Bertille; Хаммер, Эмили Л .; Nugent, Selin E .; Бурри, Марта; Neumann, Gunnar U .; Пенске, Сандра; Ингман, Тара; Акар, Мурат; Шафик, Рула; Палумби, Джулио; Айзенманн, Стефани; д'Андреа, Марта; Рорлах, Адам Б .; Уорнер, Кристина; Чон, Чунгвон; Stockhammer, Philipp W .; Хаак, Вольфганг; Краузе, Йоханнес (2020). «Геномная история от неолита до бронзового века Анатолии, Северного Леванта и Южного Кавказа». Клетка. 181 (5): 1158–1175.e28. Дои:10.1016 / j.cell.2020.04.044. PMID  32470401. S2CID  219105572.
  50. ^ "Y-ДНК Haplotree". Family Tree DNA использует дерево Y-хромосомы Консорциума и размещает его на своем веб-сайте.

Источники

Журналы

Интернет-источники

  1. ^ а б c Krahn, T .; FTDNA. "Проект Y-ДНК дерева FTDNA (AKA YTree)". Семейное древо ДНК. Архивировано из оригинал на 2015-08-15. Получено 2013-01-01.CS1 maint: ref = harv (связь)
  2. ^ а б Henson, G .; Гречдакян, П .; FTDNA (2013). "L - Проект Y-гаплогруппы L". Получено 2013-01-01.CS1 maint: ref = harv (связь)

внешняя ссылка