EEF1A2 - EEF1A2

EEF1A2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4C0S, 3C5J
Идентификаторы
Псевдонимы	EEF1A2, EEF1AL, EF-1-альфа-2, EF1A, HS1, STN, STNL, EIEE33, MRD38, фактор элонгации трансляции эукариот 1 альфа 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602959 MGI: 1096317 ГомолоГен: 121568 Генные карты: EEF1A2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.33 Начните 63,488,014 бп[1] Конец 63,499,185 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • активность фактора трансляции, связывание РНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • ГТФазная активность • активность фактора удлинения трансляции Сотовый компонент • миелин • тело нейрональной клетки • цитоплазматическая сторона лизосомальной мембраны • ядро клетки • эукариотический комплекс фактора элонгации трансляции 1 • цитоплазма • синапс Биологический процесс • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция шаперон-опосредованной аутофагии • поступательное удлинение • положительная регуляция активности липидкиназы • ответ на электрический раздражитель • биосинтез белка • реакция на неорганическое вещество Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1917	13628
Ансамбль	ENSG00000101210	ENSMUSG00000016349
UniProt	Q05639	P62631
RefSeq (мРНК)	NM_001958	NM_007906
RefSeq (белок)	NP_001949	NP_031932
Расположение (UCSC)	Chr 20: 63,49 - 63,5 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коэффициент удлинения 1-альфа 2 это белок что у людей кодируется EEF1A2 ген.^[4][5][6]

Функция

Этот ген кодирует изоформу альфа-субъединицы коэффициент удлинения-1 комплекс, который отвечает за ферментативную доставку аминоацил тРНК к рибосома. Эта изоформа (альфа 2) экспрессируется в головном мозге, сердце и скелетных мышцах, а другая изоформа (альфа 1 ) экспрессируется в головном мозге, плаценте, легких, печени, почках и поджелудочной железе.

Клиническое значение

Этот ген может иметь решающее значение в развитии рак яичников.^[6]

Регулирование

EEF1A2 - прямая цель miRNA-663 и miRNA-744.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101210 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Кнудсен С.М., Фриденберг Дж., Кларк Б.Ф., Лефферс Х. (сентябрь 1993 г.). «Зависимые от ткани вариации в экспрессии изоформ фактора элонгации 1 альфа: выделение и характеристика кДНК, кодирующей новый вариант фактора удлинения 1 альфа человека». Eur J Biochem. 215 (3): 549–54. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18064.x. PMID  8354261.
5. Лунд А., Кнудсен С.М., Виссинг Х., Кларк Б., Томмеруп Н. (январь 1997 г.). «Присвоение генов фактора элонгации 1alpha человека: EEF1A отображается на хромосоме 6q14, а EEF1A2 - на 20q13.3». Геномика. 36 (2): 359–61. Дои:10.1006 / geno.1996.0475. PMID  8812466.
6. «Ген Entrez: EEF1A2 фактор элонгации трансляции эукариот 1 альфа 2».
7. Висловух А., Кратасюк Г., Порто Е., Гралиевская Н., Бельдиман С., Пинна Г., Эльская А., Харель-Беллан А., Негруцкий Б., Гройсман И. (11 июня 2013 г.). «Протоонкогенная изоформа A2 эукариотического фактора элонгации трансляции eEF1 является мишенью для miR-663 и miR-744». Британский журнал рака. 108 (11): 2304–11. Дои:10.1038 / bjc.2013.243. ЧВК  3681015. PMID  23695020.

дальнейшее чтение

• Ли Дж. М. (2004). «Роль фактора удлинения белка eEF1A2 при раке яичников». Репрод. Биол. Эндокринол. 1: 69. Дои:10.1186/1477-7827-1-69. ЧВК  239897. PMID  14588074.
• Бех К.Дж. (1976). «Специфичность класса иммуноглобулинов неагглютинирующих антител, продуцируемых у крупного рогатого скота после вакцинации против Brucella abortus 45/20». Aust. Вет. J. 51 (10): 481–3. Дои:10.1111 / j.1751-0813.1975.tb02385.x. PMID  812466.
• Ли С., Энн Д.К., Ван Э. (1994). «Клонирование кДНК мозга человека и мыши, кодирующих S1, второй член семейства генов фактора элонгации-1 альфа: анализ возможного эволюционного пути». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 203 (3): 1371–7. Дои:10.1006 / bbrc.1994.2336. PMID  7945283.
• Wu-Baer F, Lane WS, Gaynor RB (1996). «Идентификация группы клеточных кофакторов, которые стимулируют связывание РНК-полимеразы II и TRP-185 с TAR-РНК вируса иммунодефицита человека 1». J. Biol. Chem. 271 (8): 4201–8. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4201. PMID  8626763.
• Bischoff C, Kahns S, Lund A, Jørgensen HF, Praestegaard M, Clark BF, Leffers H (2001). «Ген фактора элонгации 1 A-2 человека (EEF1A2): полная последовательность и характеристика структуры гена и активности промотора». Геномика. 68 (1): 63–70. Дои:10.1006 / geno.2000.6271. PMID  10950927.
• McClatchy DB, Knudsen CR, Clark BF, Kahn RA, Hall RA, Levey AI (2002). «Новое взаимодействие между мускариновым рецептором ацетилхолина М4 и фактором элонгации 1А2». J. Biol. Chem. 277 (32): 29268–74. Дои:10.1074 / jbc.M203081200. PMID  12048193.
• Ананд Н., Мурти С., Аманн Дж., Верник М., Портер Л. А., Цукье И. Х., Коллинз С., Грей Дж. В., Диболд Дж., Деметрик Д. Д., Ли Дж. М. (2002). «Фактор удлинения белка EEF1A2 - предполагаемый онкоген при раке яичников». Nat. Genet. 31 (3): 301–5. Дои:10,1038 / ng904. PMID  12053177. S2CID  37997742.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Штейн М.А., Бауэр А., Касари Дж., Дрюс Дж., Гэвин А.С., Джексон Д. Б., Джоберти Дж., Нойбауэр Дж., Рик Дж., Кустер Б., Суперти-Фурга Г. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Раш Дж, Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С. Е., Лион CE, Ламонд А. И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Byun HM, Suh D, Jeong Y, Wee HS, Kim JM, Kim WK, Ko JJ, Kim JS, Lee YB, Oh YK (2005). «Плазмидные векторы, несущие клеточные промоторы, могут индуцировать пролонгированную экспрессию генов в гематопоэтических и мезенхимальных клетках-предшественниках». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 332 (2): 518–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.04.155. PMID  15893736.
• Ахмед М., Форсберг Дж., Бергстен П. (2005). «Профилирование белков островков поджелудочной железы человека с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». J. Proteome Res. 4 (3): 931–40. Дои:10.1021 / pr050024a. PMID  15952740.
• Томлинсон В.А., Ньюбери Х.Дж., Рэй Н.Р., Джексон Дж., Ларионов А., Миллер В.Р., Диксон Дж. М., Эбботт К.М. (2006). «Фактор удлинения трансляции eEF1A2 является потенциальным онкопротеином, который сверхэкспрессируется в двух третях опухолей молочной железы». BMC Рак. 5: 113. Дои:10.1186/1471-2407-5-113. ЧВК  1236916. PMID  16156888.
• Ли Р., Ван Х., Бекеле Б.Н., Инь З., Карауэй Н.П., Кац Р.Л., Стасс С.А., Цзян Ф. (2006). «Идентификация предполагаемых онкогенов в аденокарциноме легких с помощью комплексного функционального геномного подхода». Онкоген. 25 (18): 2628–35. Дои:10.1038 / sj.onc.1209289. PMID  16369491.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q05639 (Коэффициент удлинения 1-альфа 2) на PDBe-KB.