LGTN - LGTN

EIF2D
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF2D, HCA56, LGTN, фактор инициации трансляции эукариот 2D
Внешние идентификаторы	OMIM: 613709 MGI: 109342 ГомолоГен: 38244 Генные карты: EIF2D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q32.1 Начинать 206,571,292 бп[1] Конец 206,612,465 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 E4 | 1 56,9 см Начинать 131,153,181 бп[2] Конец 131,187,658 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора инициации трансляции • Связывание РНК • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • цитоплазма • цитозольная малая рибосомная субъединица • цитозоль • ядерное тело Биологический процесс • трансляционная инициация • внутриклеточный транспорт белка • разборка рибосомы • биосинтез белка • формирование преинициативного комплекса трансляции • IRES-зависимая инициация трансляции вируса • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1939	16865
Ансамбль	ENSG00000143486	ENSMUSG00000026427
UniProt	P41214 Q5SY38	Q61211
RefSeq (мРНК)	NM_001201478 NM_006893	NM_001136070 NM_010709
RefSeq (белок)	NP_001188407 NP_008824	NP_001129542 NP_034839
Расположение (UCSC)	Chr 1: 206.57 - 206.61 Мб	Chr 1: 131.15 - 131.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лигатин, иначе известный как eIF2D, это белок что у людей кодируется LGTN ген.^[5][6] Этот белок не входит в состав гетеротримерного eIF2 сложны, но вместо этого функционируют разными путями эукариотический перевод.

Функция

Этот ген кодирует рецептор белка, который локализует фосфогликопротеины в эндосомы и на периферии клетки. Этот рецептор переноса фосфогликопротеинов может играть роль в нейропластичность путем модуляции межклеточных взаимодействий, внутриклеточной адгезии и связывания белков на поверхностях мембран. В гиппокамп нейронами, длительное подавление уровней мРНК лигирования происходит через посттранскрипционный процессинг РНК после рецептор глутамата активация. Этот белок содержит один PUA и SUI1 домены и эти домены могут функционировать в связывании РНК и инициации трансляции, соответственно.^[6]

Смотрите также

• Эукариотический перевод
• Фактор инициации эукариот

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143486 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026427 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джакои Э. Р., Браун А. Л., Хо Ю. С., Снайдерман Р. (июнь 1989 г.). «Молекулярное клонирование кДНК лигатина». Журнал клеточной науки. 93 (Pt 2) (2): 227–32. PMID  2482295.
6. "Entrez Gene: LGTN лигатин".

дальнейшее чтение

• Якои Э.Р., Росс П.Е., Пинг Тинг-Билл Х., Кауфман Б., Ванаман ТС (январь 1987 г.). «Лигатин: белок периферической мембраны с ковалентно связанной пальмитиновой кислотой». Журнал биологической химии. 262 (3): 1300–4. PMID  3805022.
• Гастон С.М., Марчез РБ, Якои Э.Р. (1982). «Лигатин мозга: мембранный лектин, связывающий ацетилхолинэстеразу». Журнал клеточной биохимии. 18 (4): 447–59. Дои:10.1002 / jcb.1982.240180406. PMID  7085778.
• Маршейз РБ, Коро Л.А., Келли С.М., МакКлей Д.Р. (1982). «Возможная роль лигатина и фосфогликопротеинов, которые он связывает в кальций-зависимой адгезии клеток сетчатки». Журнал клеточной биохимии. 18 (4): 461–8. Дои:10.1002 / jcb.1982.240180407. PMID  7085779.
• Якой Э. Р., Кемпе К., Гастон С. М. (1982). «Лигатин связывает остатки фосфогексозы с кислыми гидролазами». Журнал супрамолекулярной структуры и клеточной биохимии. 16 (2): 139–53. Дои:10.1002 / jsscb.1981.380160205. PMID  7299841.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ван И, Хан К.Дж., Пан XW, Воган Х.А., Ку В., Донг XY, Пэн JR, Чжао Х.Т., Руи Дж.А., Ленг XS, Себон Дж., Берджесс А.В., Чен В.Ф. (июль 2002 г.). «Крупномасштабная идентификация антигенов, связанных с гепатоцеллюлярной карциномой человека, с помощью аутоантител». Журнал иммунологии. 169 (2): 1102–9. Дои:10.4049 / jimmunol.169.2.1102. PMID  12097419.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.