MRPL18 - MRPL18

MRPL18
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J7Y
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPL18, L18mt, MRP-L18, HSPC071, митохондриальный рибосомный белок L18
Внешние идентификаторы	OMIM: 611831 MGI: 1914931 ГомолоГен: 8566 Генные карты: MRPL18
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q25.3 Начинать 159,789,812 бп[1] Конец 159,798,436 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 A1 Начинать 12,911,349 бп[2] Конец 12,916,345 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • Связывание 5S рРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • митохондриальная рибосома • внутриклеточный • внеклеточный • митохондриальная большая рибосомная субъединица • митохондрия Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • импорт рРНК в митохондрии • биосинтез белка • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	29074	67681
Ансамбль	ENSG00000112110	ENSMUSG00000057388
UniProt	Q9H0U6	Q9CQL5
RefSeq (мРНК)	NM_014161 NM_001318817	NM_026310
RefSeq (белок)	NP_001305746 NP_054880	NP_080586
Расположение (UCSC)	Chr 6: 159,79 - 159,8 Мб	Chr 17: 12.91 - 12.92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

39S рибосомный белок L18, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPL18 ген.^[5][6][7]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. У них примерно 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 39S, который принадлежит к семейству рибосомных белков L18P. В этом гене существует три полиморфных сайта, один из которых имеет длину три нуклеотида, что приводит к появлению дополнительных аминокислотных остатков около N-конца.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112110 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057388 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
6. Koc EC, Burkhart W., Blackburn K, Moyer MB, Schlatzer DM, Moseley A, Spremulli LL (ноябрь 2001 г.). «Большая субъединица митохондриальной рибосомы млекопитающих. Анализ набора присутствующих рибосомных белков». J Biol Chem. 276 (47): 43958–69. Дои:10.1074 / jbc.M106510200. PMID  11551941.
7. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок MRPL18 L18».

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.