MRPL17 - MRPL17

MRPL17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CQM, 3J7Y, 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPL17, L17mt, LIP2, MRP-L17, MRP-L26, RPL17L, RPML26, митохондриальный рибосомный белок L17
Внешние идентификаторы	OMIM: 611830 MGI: 1351608 ГомолоГен: 32526 Генные карты: MRPL17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п15.4 Начинать 6,680,385 бп[1] Конец 6,683,340 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 E3 Начинать 105,803,206 бп[2] Конец 105,811,099 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая рибосомы • специфическое связывание белкового домена Сотовый компонент • рибосома • внутриклеточный • митохондрия • митохондриальная большая рибосомная субъединица • митохондриальная внутренняя мембрана Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • биосинтез белка • поддержание митохондриального генома Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	63875	27397
Ансамбль	ENSG00000158042	ENSMUSG00000030879
UniProt	Q9NRX2	Q9D8P4
RefSeq (мРНК)	NM_022061	NM_025301
RefSeq (белок)	NP_071344	NP_079577
Расположение (UCSC)	Chr 11: 6.68 - 6.68 Мб	Chr 7: 105,8 - 105,81 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

39S рибосомный белок L17, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPL17 ген.^[5]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. У них примерно 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 39S.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158042 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030879 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок L17 MRPL17».

дальнейшее чтение

• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чернев В.Т., Мэнсфилд Т.А., Гиот Л. и др. (2002). «Белок Чедиака-Хигаши взаимодействует с комплексом SNARE и белками сигнальной трансдукции». Мол. Med. 8 (1): 56–64. Дои:10.1007 / bf03402003. ЧВК  2039936. PMID  11984006.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• О'Брайен Т.В., Фислер С.Е., Денслоу Н.Д. и др. (2000). «Митохондриальные рибосомные белки млекопитающих (2). Аминокислотное секвенирование, характеристика и идентификация соответствующих последовательностей генов». J. Biol. Chem. 274 (51): 36043–51. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36043. PMID  10593885.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9NRX2 (39S рибосомный белок L17, митохондриальный) на PDBe-KB.