RPS4X - RPS4X

RPS4X
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 3J7R, 3J7P
Идентификаторы
Псевдонимы	RPS4X, CCG2, DXS306, RPS4, S4, SCAR, SCR10, рибосомный белок S4, X-связанный, рибосомный белок S4, X-связанный
Внешние идентификаторы	OMIM: 312760 ГомолоГен: 90857 Генные карты: RPS4X
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq13.1 Начните 72,255,679 бп[1] Конец 72,277,248 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рРНК • структурная составляющая рибосомы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • полисом • цитозоль • рибосома • мембрана • очаговая адгезия • внутриклеточный • цитозольная малая рибосомная субъединица • малая рибосомная субъединица • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина • внеклеточная экзосома • внеклеточный матрикс • нуклеоплазма • рибонуклеопротеин • синапс Биологический процесс • вирусная транскрипция • положительное регулирование перевода • SRP-зависимый котрансляционный белок, нацеленный на мембрану • развитие многоклеточного организма • положительное регулирование пролиферации клеток • трансляционная инициация • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, нонсенс-опосредованный распад • обработка рРНК • биосинтез белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6191	н / д
Ансамбль	ENSG00000198034	н / д
UniProt	P62701	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001007	н / д
RefSeq (белок)	NP_000998	н / д
Расположение (UCSC)	Chr X: 72,26 - 72,28 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

40S рибосомный белок S4, X изоформа это белок что у людей кодируется RPS4X ген.^[3][4][5]

Рибосомы, органеллы это катализировать синтез белка, состоят из малая субъединица 40S и большая 60S субъединица. Вместе эти субъединицы состоят из 4 РНК видов и примерно 80 структурно различных белков. Этот ген кодирует рибосомальный белок S4, компонент субъединицы 40S. Рибосомный белок S4 является единственным рибосомным белком, который, как известно, кодируется более чем одним геном, а именно этим геном и рибосомным белком S4, Y-связанным (RPS4Y). 2 изоформы кодируемые этими генами не идентичны, но функционально эквивалентны. Рибосомный белок S4 принадлежит к семейству рибосомных белков S4E. Этот ген не подлежит X-инактивация. Было высказано предположение, что гаплонедостаточность генов рибосомного белка S4 играет роль в Синдром Тернера; однако эта гипотеза спорна. Как типично для генов, кодирующих рибосомные белки, существует множество процессинговых псевдогены этого гена рассредоточены по геному.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198034 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Ватанабэ М., Фуруно Н., Гёбл М., Го М., Мияути К., Секигучи Т., Базилико К., Нисимито Т. (апрель 1992 г.). «Молекулярное клонирование человеческого гена CCG2, который дополняет полученный из BHK мутант чувствительного к температуре клеточного цикла tsBN63: идентичность CCG2 с геном SCAR / RPS4X Х-хромосомы человека». J Cell Sci. 100 (1): 35–43. PMID  1795030.
4. Zinn AR, Alagappan RK, Brown LG, Wool I, Page DC (апрель 1994). «Структура и функция генов рибосомного белка S4 на половых хромосомах человека и мыши». Mol Cell Biol. 14 (4): 2485–92. Дои:10.1128 / mcb.14.4.2485. ЧВК  358616. PMID  8139551.
5. «Ген Entrez: рибосомный белок S4 RPS4X, Х-связанный».

дальнейшее чтение

• Шерсть И.Г., Чан Ю.Л., Глюк А. (1996). «Структура и эволюция рибосомных белков млекопитающих». Biochem. Cell Biol. 73 (11–12): 933–947. Дои:10.1139 / o95-101. PMID  8722009.
• Фишер Э.М., Бир-Ромеро П., Браун Л.Г. и др. (1991). «Гены гомологичных рибосомных белков на человеческих хромосомах X и Y: уход от инактивации X и возможные последствия для синдрома Тернера». Ячейка. 63 (6): 1205–1218. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90416-С. PMID  2124517.
• Уайлс М.В., Александр С.М., Гудфеллоу П.Н. (1988). «Выделение широко экспрессируемой последовательности из Х-хромосомы человека путем дифференциального скрининга». Сомат. Cell Mol. Genet. 14 (1): 31–39. Дои:10.1007 / BF01535047. PMID  2829364.
• Матоба Р., Окубо К., Хори Н. и др. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Ген. 146 (2): 199–207. Дои:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID  8076819.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Ватанабэ М., Зинн А.Р., Пейдж, округ Колумбия, Нишимото Т. (1993). «Функциональная эквивалентность человеческих X- и Y-кодируемых изоформ рибосомного белка S4 согласуется с ролью в синдроме Тернера». Nat. Genet. 4 (3): 268–271. Дои:10.1038 / ng0793-268. PMID  8358435.
• Geerkens C, Just W, Held KR, Vogel W (1996). «Синдром Ульриха-Тернера не вызван гаплонедостаточностью RPS4X». Гм. Genet. 97 (1): 39–44. Дои:10.1007 / bf00218830. PMID  8557258.
• Владимиров С.Н., Иванов А.В., Карпова Г.Г. и др. (1996). «Характеристика белков малых рибосомных субъединиц человека с помощью N-концевого и внутреннего секвенирования, а также масс-спектрометрии». Евро. J. Biochem. 239 (1): 144–149. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0144u.x. PMID  8706699.
• Омоэ К., Эндо А. (1996). «Взаимосвязь между фенотипом моносомии X и Y-связанным рибосомным белком S4 (Rps4) у нескольких видов млекопитающих: молекулярный эволюционный анализ гомологов Rps4». Геномика. 31 (1): 44–50. Дои:10.1006 / geno.1996.0007. PMID  8808278.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Кенмоти Н., Кавагути Т., Розен С. и др. (1998). «Карта 75 генов рибосомных белков человека». Genome Res. 8 (5): 509–23. Дои:10.1101 / гр. 8.5.509. PMID  9582194.
• Уэчи Т., Танака Т., Кенмоти Н. (2001). «Полная карта генов рибосомных белков человека: отнесение 80 генов к цитогенетической карте и последствия для заболеваний человека». Геномика. 72 (3): 223–230. Дои:10.1006 / geno.2000.6470. PMID  11401437.
• Робинсон Р.К., Турбедски К., Кайзер Д.А. и др. (2001). «Кристаллическая структура комплекса Arp2 / 3». Наука. 294 (5547): 1679–1684. Дои:10.1126 / science.1066333. PMID  11721045.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Агат Р.Дж., Чхве М., Арнольд А.П. (2004). «Половые различия в структуре и экспрессии генов половых хромосом CHD1Z и CHD1W у зебровых зябликов». Мол. Биол. Evol. 21 (2): 384–396. Дои:10.1093 / молбев / мш027. PMID  14660691.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.