EIF5B - EIF5B

EIF5B
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF5B, IF2, фактор инициации трансляции эукариот 5B
Внешние идентификаторы	OMIM: 606086 MGI: 2441772 ГомолоГен: 134613 Генные карты: EIF5B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q11.2 Начинать 99,337,371 бп[1] Конец 99,401,326 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 млрд Начинать 37,998,010 бп[2] Конец 38,055,579 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • Связывание GTP • гидролазная активность • активность фактора инициации трансляции • Связывание РНК • ГТФазная активность Сотовый компонент • цитозоль • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • регулирование инициации трансляции • трансляционная инициация • биосинтез белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9669	226982
Ансамбль	ENSG00000158417	ENSMUSG00000026083
UniProt	O60841	Q05D44
RefSeq (мРНК)	NM_015904	NM_198303
RefSeq (белок)	NP_056988	NP_938045
Расположение (UCSC)	Chr 2: 99,34 - 99,4 Мб	Chr 1: 38 - 38.06 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор инициации трансляции эукариот 5B это белок что у людей кодируется EIF5B ген.^[5][6][7]

Точное начало перевода в эукариоты сложен и требует множества факторов, некоторые из которых состоят из нескольких субъединиц. Процесс проще в бактерии у которых есть только три факторы инициирования (IF1, IF2, IF3). Два из этих факторов законсервированы у эукариот: гомолог IF1 - eIF1A, а гомолог IF2 - eIF5B. Этот ген кодирует eIF5B. Факторы eIF1A и eIF5B взаимодействуют на рибосома вместе с другими факторами инициации и GTP для позиционирования инициирующей тРНК метионина на старте кодон из мРНК так что перевод инициируется точно.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158417 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026083 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли Дж. Х., Чой С. К., Ролл-Мекак А., Берли С. К., Девер Т. Е. (май 1999 г.). «Универсальная консервация в инициации трансляции, выявленная человеческими и археологическими гомологами бактериального фактора инициации трансляции IF2». Proc Natl Acad Sci U S A. 96 (8): 4342–7. Дои:10.1073 / пнас.96.8.4342. ЧВК  16334. PMID  10200264.
6. Уилсон С.А., Сииро-Васкес К., Эдвардс Н.Дж., Юрин О., Байлс Э.Д., Котсопулу Э., Адамсон С.С., Кингсман С.М., Кингсман А.Дж., Мартин-Рендон Э. (октябрь 1999 г.). «Клонирование и характеристика hIF2, человеческого гомолога бактериального фактора инициации трансляции 2, и его взаимодействие с матрицей ВИЧ-1». Biochem J. 342. (Чт 1): 97–103. Дои:10.1042 / bj3420097. ЧВК  1220441. PMID  10432305.
7. «Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции EIF5B 5B».

дальнейшее чтение

• Унбехаун А., Маринчев А., Ломакин И.Б. и др. (2007). «Положение эукариотического фактора инициации eIF5B на 80S рибосоме, картированное с помощью направленного исследования гидроксильных радикалов». EMBO J. 26 (13): 3109–23. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601751. ЧВК  1914099. PMID  17568775.
• Хаяси Р., Уэда Т., Фарвелл М.А., Такеучи Н. (2007). «Ядерный респираторный фактор 2 активирует транскрипцию гена фактора инициации трансляции митохондрий 2 человека». Митохондрия. 7 (3): 195–203. Дои:10.1016 / j.mito.2006.10.005. PMID  17161026.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Геваерт К., Стаес А., Ван Дамм Дж. И др. (2006). «Глобальный анализ фосфопротеома гепатоцитов человека HepG2 с использованием обращенно-фазовой диагональной ЖК». Протеомика. 5 (14): 3589–99. Дои:10.1002 / pmic.200401217. PMID  16097034. S2CID  895879.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Маринчев А, Колупаева В.Г., Пестова Т.В., Вагнер Г (2003). «Картирование интерфейса связывания между факторами инициации эукариот человека 1A и 5B: новое взаимодействие между старыми партнерами». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 1535–40. Дои:10.1073 / pnas.0437845100. ЧВК  149867. PMID  12569173.
• Олсен Д.С., Савнер Э.М., Мэтью А. и др. (2003). «Домены eIF1A, которые опосредуют связывание с eIF2, eIF3 и eIF5B и способствуют рекрутированию тройных комплексов in vivo». EMBO J. 22 (2): 193–204. Дои:10.1093 / emboj / cdg030. ЧВК  140105. PMID  12514125.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Соренсен Х.П., Хедегаард Дж., Сперлинг-Петерсен Х.У., Мортенсен К.К. (2002). «Замечательная сохранность факторов инициации трансляции: IF1 / eIF1A и IF2 / eIF5B - универсально распределенные филогенетические маркеры». IUBMB Life. 51 (5): 321–7. Дои:10.1080/152165401317190842. PMID  11699879. S2CID  45654480.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.