EIF3M - EIF3M

EIF3M
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J8B, 3J8C, 5A5T
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF3M, B5, PCID1, TANGO7, hfl-B5, GA17, эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица M
Внешние идентификаторы	OMIM: 609641 MGI: 1351744 ГомолоГен: 4639 Генные карты: EIF3M
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p13 Начинать 32,583,798 бп[1] Конец 32,606,264 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 E2 | 2 55,06 см Начинать 104,999,656 бп[2] Конец 105,017,080 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора инициации трансляции • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора инициации трансляции Сотовый компонент • цитоплазма • фактор инициации трансляции эукариот 3 • цитозоль • комплекс фактора инициации трансляции 3 эукариот, eIF3m • эукариотический преинициативный комплекс 43S • эукариотический 48S преинициативный комплекс Биологический процесс • трансляционная инициация • инициация цитоплазматической трансляции • биосинтез белка • образование комплекса инициации цитоплазматической трансляции Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10480	98221
Ансамбль	ENSG00000149100	ENSMUSG00000027170
UniProt	Q7L2H7	Q99JX4
RefSeq (мРНК)	NM_001307929 NM_006360	NM_145380
RefSeq (белок)	NP_001294858 NP_006351	NP_663355
Расположение (UCSC)	Chr 11: 32,58 - 32,61 Мб	Chr 2: 105 - 105,02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор инициации трансляции эукариот 3, субъединица M (eIF3m) также известный как Домен PCI, содержащий 1 (медиатор входа герпеса) (PCID1), это белок что у человека кодируется EIF3M ген.^[5][6]

HFLB5 кодирует широко экспрессируемый белок, содержащий предполагаемые домены слияния мембран, который действует как рецептор или корецептор для проникновения Вирус простого герпеса (HSV).^[5][7]

Смотрите также

• Фактор инициации эукариот 3 (eIF3)

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000149100 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027170 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Entrez Gene: PCID1 PCI-домен, содержащий 1 (медиатор входа герпесвируса)».
6. Гавин Б., Нидерфюр А., Шумахер Н., Хаммерих Н., Литтл П. Ф., Гесслер М. (ноябрь 1999 г.). «Готовая к последовательности 7,5 МБ карта контига PAC и экспрессии генов хромосомы человека 11p13-p14.1». Genome Res. 9 (11): 1074–86. Дои:10.1101 / гр.9.11.1074. ЧВК  310838. PMID  10568747.
7. Перес А., Ли QX, Перес-Ромеро П., Делассус Дж., Лопес С.Р., Саттер С., Макларен Н., Фуллер А.О. (июнь 2005 г.). «Новый класс рецепторов вируса простого герпеса имеет мотивы гептадных повторов, которые являются общими для белков слияния мембран». Дж. Вирол. 79 (12): 7419–30. Дои:10.1128 / JVI.79.12.7419-7430.2005. ЧВК  1143644. PMID  15919898.

дальнейшее чтение

• Кобаяши К., Синь И, Имер С.И. и др. (2007). «Скрининг субтрактивной гибридизации выявляет гены, регулируемые депривацией глюкозы в клетках нейробластомы человека». Brain Res. 1170: 129–39. Дои:10.1016 / j.brainres.2007.07.042. PMID  17719568. S2CID  31320196.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Перес-Ромеро П., Фуллер А.О. (2005). «С-конец рецептора В5 вируса простого герпеса содержит функциональную область, важную для инфекции». Дж. Вирол. 79 (12): 7431–7. Дои:10.1128 / JVI.79.12.7431-7437.2005. ЧВК  1143627. PMID  15919899.
• Перес А., Ли QX, Перес-Ромеро П. и др. (2005). «Новый класс рецепторов вируса простого герпеса имеет мотивы гептадных повторов, которые являются общими для белков слияния мембран». Дж. Вирол. 79 (12): 7419–30. Дои:10.1128 / JVI.79.12.7419-7430.2005. ЧВК  1143644. PMID  15919898.
• Ленер Б, Сандерсон CM (2004). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека». Genome Res. 14 (7): 1315–23. Дои:10.1101 / gr.2122004. ЧВК  442147. PMID  15231747.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q7L2H7 (Субъединица M фактора инициации трансляции 3 эукариот) на PDBe-KB.