EIF3B - EIF3B

EIF3B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2KRB, 2NLW, 5K1H
Идентификаторы
Псевдонимы	EIF3B, EIF3-ETA, EIF3-P110, EIF3-P116, EIF3S9, PRT1, субъединица B эукариотического фактора инициации трансляции 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 603917 MGI: 106478 ГомолоГен: 2780 Генные карты: EIF3B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p22.3 Начинать 2,354,086 бп[1] Конец 2,380,745 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 G2 | 5 78,97 см Начинать 140,419,328 бп[2] Конец 140,443,360 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера • связывание фактора инициации трансляции • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора инициации трансляции • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • цитозоль • фактор инициации трансляции эукариот 3 • комплекс фактора инициации трансляции 3 эукариот, eIF3m • внеклеточная экзосома • цитоплазма • эукариотический преинициативный комплекс 43S • эукариотический 48S преинициативный комплекс • синапс Биологический процесс • трансляционная инициация • IRES-зависимая инициация трансляции вируса • биосинтез белка • прекращение трансляции вируса - повторная инициация • регулирование инициации трансляции • образование комплекса инициации цитоплазматической трансляции • инициация цитоплазматической трансляции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8662	27979
Ансамбль	ENSG00000106263	ENSMUSG00000056076
UniProt	P55884	Q8JZQ9
RefSeq (мРНК)	NM_001037283 NM_003751 NM_001362791 NM_001362792 NM_001362793	NM_133916
RefSeq (белок)	NP_001032360 NP_003742 NP_001349720 NP_001349721 NP_001349722	NP_598677
Расположение (UCSC)	Chr 7: 2.35 - 2.38 Мб	Chr 5: 140,42 - 140,44 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эукариотический фактор инициации трансляции 3 субъединица B (eIF3b) это белок что у людей кодируется EIF3B ген.^[5][6]

Взаимодействия

EIF3B был показан взаимодействовать с P70-S6 Киназа 1^[7] и EIF3A.^{[5][8][9][10]}

Смотрите также

• Фактор инициации эукариот 3 (eIF3)

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106263 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056076 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Méthot N, Rom E, Olsen H, Sonenberg N (февраль 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого белка Prt1 является неотъемлемой частью комплекса эукариотического фактора инициации 3 и взаимодействует с p170». J. Biol. Chem. 272 (2): 1110–6. Дои:10.1074 / jbc.272.2.1110. PMID  8995410.
6. «Ген Entrez: фактор инициации эукариотической трансляции 3 EIF3S9, субъединица 9 эта, 116 кДа».
7. Хольц М.К., Баллиф Б.А., Гиги С.П., Бленис Дж. (Ноябрь 2005 г.). «mTOR и S6K1 опосредуют сборку комплекса преинициации трансляции посредством динамического обмена белками и событий упорядоченного фосфорилирования». Клетка. 123 (4): 569–80. Дои:10.1016 / j.cell.2005.10.024. PMID  16286006. S2CID  11118504.
8. Mayeur GL, Fraser CS, Peiretti F, Block KL, Hershey JW (октябрь 2003 г.). «Характеристика eIF3k: недавно обнаруженная субъединица фактора инициации трансляции млекопитающих elF3». Евро. J. Biochem. 270 (20): 4133–9. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2003.03807.x. PMID  14519125.
9. Харрис Т.Э., Чи А., Шабановиц Дж., Хант Д.Ф., Роадс Р.Э., Лоуренс Дж.С. (апрель 2006 г.). «mTOR-зависимая стимуляция ассоциации eIF4G и eIF3 инсулином». EMBO J. 25 (8): 1659–68. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601047. ЧВК  1440840. PMID  16541103.
10. Block KL, Vornlocher HP, Hershey JW (ноябрь 1998 г.). «Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3». J. Biol. Chem. 273 (48): 31901–8. Дои:10.1074 / jbc.273.48.31901. PMID  9822659.

дальнейшее чтение

• Киркен Р.А., Руи Х., Эванс Г.А., Фаррар В.Л. (1993). «Характеристика индуцированного интерлейкином-2 (ИЛ-2) тирозина фосфорилированного белка массой 116 кДа, связанного с бета-субъединицей рецептора ИЛ-2». J. Biol. Chem. 268 (30): 22765–70. PMID  7693677.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Асано К., Кинзи Т. Г., Меррик В. К., Херши Дж. В. (1997). «Сохранение и разнообразие фактора инициации трансляции эукариот eIF3». J. Biol. Chem. 272 (2): 1101–9. Дои:10.1074 / jbc.272.2.1101. PMID  8995409.
• Чаудхури Дж, Чакрабарти А, Майтра У (1997). «Биохимическая характеристика фактора инициации трансляции 3 (eIF3) млекопитающих. Молекулярное клонирование показывает, что субъединица p110 является гомологом белка Prt1 Saccharomyces cerevisiae у млекопитающих». J. Biol. Chem. 272 (49): 30975–83. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30975. PMID  9388245.
• Блок KL, Форнлохер HP, Херши JW (1998). «Характеристика кДНК, кодирующих субъединицы p44 и p35 человеческого фактора инициации трансляции eIF3». J. Biol. Chem. 273 (48): 31901–8. Дои:10.1074 / jbc.273.48.31901. PMID  9822659.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1998). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Линь Л., Холбро Т., Алонсо Дж., Героса Д., Бургер М.М. (2001). «Молекулярное взаимодействие между белком-маркером опухоли человека p150, крупнейшей субъединицей eIF3, и белком промежуточного филамента K7». J. Cell. Биохим. 80 (4): 483–90. Дои:10.1002 / 1097-4644 (20010315) 80: 4 <483 :: AID-JCB1002> 3.0.CO; 2-B. PMID  11169732.
• Асано К., Шалев А., Фан Л., Нильсен К., Клейтон Дж., Валасек Л., Донахью Т.Ф., Hinnebusch AG (2001). «Множественные роли C-концевого домена eIF5 в сборке комплекса инициации трансляции и активации GTPase». EMBO J. 20 (9): 2326–37. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2326. ЧВК  125443. PMID  11331597.
• Mayeur GL, Fraser CS, Peiretti F, Block KL, Hershey JW (2003). «Характеристика eIF3k: недавно обнаруженная субъединица фактора инициации трансляции млекопитающих elF3». Евро. J. Biochem. 270 (20): 4133–9. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2003.03807.x. PMID  14519125.
• Фрейзер С.С., Ли Дж.Й., Майер Г.Л., Бушелл М., Дудна Дж. А., Херши Дж. В. (2004). «J-субъединица человеческого фактора инициации трансляции eIF3 необходима для стабильного связывания eIF3 и его субкомплексов с 40 S субъединицами рибосомы in vitro». J. Biol. Chem. 279 (10): 8946–56. Дои:10.1074 / jbc.M312745200. PMID  14688252.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Раш Дж, Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Д., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• ЭлАнтак Л., Цакос А.Г., Локер Н., Лукавский П.Дж. (2007). «Структура мотива распознавания РНК eIF3b и его взаимодействие с eIF3j: структурные сведения о рекрутировании eIF3b в 40 S субъединицу рибосомы» (PDF). J. Biol. Chem. 282 (11): 8165–74. Дои:10.1074 / jbc.M610860200. PMID  17190833. S2CID  2313046.