MRPL11 - MRPL11

MRPL11
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3J7Y, 3J9M
Идентификаторы
Псевдонимы	MRPL11, L11MT, MRP-L11, CGI-113, митохондриальный рибосомный белок L11
Внешние идентификаторы	OMIM: 611826 MGI: 2137215 ГомолоГен: 6768 Генные карты: MRPL11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.2 Начинать 66,435,075 бп[1] Конец 66,466,738 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начинать 4,962,147 бп[2] Конец 4,966,999 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рРНК • GO: 0001948 связывание с белками • структурная составляющая рибосомы • Связывание РНК • связывание большой рибосомной субъединицы рРНК Сотовый компонент • митохондриальная внутренняя мембрана • рибосома • митохондриальная рибосома • митохондрия • митохондриальная большая рибосомная субъединица • большая рибосомная субъединица Биологический процесс • трансляционное удлинение митохондрий • прекращение трансляции митохондрий • сборка большой субъединицы рибосомы • биосинтез белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	65003	66419
Ансамбль	ENSG00000174547	ENSMUSG00000024902
UniProt	Q9Y3B7	Q9CQF0
RefSeq (мРНК)	NM_016050 NM_170738 NM_170739	NM_025553
RefSeq (белок)	NP_057134 NP_733934 NP_733935	NP_079829
Расположение (UCSC)	Chr 11: 66.44 - 66.47 Мб	Chr 19: 4.96 - 4.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

39S рибосомный белок L11, митохондриальный это белок что у людей кодируется MRPL11 ген.^[5]

Млекопитающее митохондриальные рибосомы белки кодируются ядерные гены и помочь в синтез белка в пределах митохондрия. Митохондриальные рибосомы (миторибосомы) состоят из небольшой 28S-субъединицы и большой 39S-субъединицы. У них примерно 75% белок к рРНК состав по сравнению с прокариотическими рибосомами, где это соотношение обратное. Еще одно различие между миторибосомами млекопитающих и прокариотическими рибосомами состоит в том, что последние содержат 5S рРНК. У разных видов белки, составляющие миторибосому, сильно различаются по последовательности, а иногда и по биохимическим свойствам, что препятствует легкому распознаванию гомология последовательностей. Этот ген кодирует белок субъединицы 39S. Анализ последовательности выявил три варианты расшифровки которые кодируют разные изоформы. Псевдогены соответствующие этому гену обнаружены на хромосомах 5q и 12q.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000174547 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024902 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: митохондриальный рибосомный белок L11 MRPL11».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY и др. (2000). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Сузуки Т., Терасаки М., Такемото-Хори С. и др. (2001). «Структурная компенсация дефицита рРНК белками в митохондриальной рибосоме млекопитающих. Систематический анализ белковых компонентов большой рибосомной субъединицы из митохондрий млекопитающих». J. Biol. Chem. 276 (24): 21724–36. Дои:10.1074 / jbc.M100432200. PMID  11279069.
• Кенмоти Н., Сузуки Т., Уэчи Т. и др. (2001). «Гены митохондриальных рибосомных белков человека: отображение 54 генов на хромосомы и последствия для заболеваний человека». Геномика. 77 (1–2): 65–70. Дои:10.1006 / geno.2001.6622. PMID  11543634.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан З., Герштейн М (2003). «Идентификация и характеристика более 100 псевдогенов митохондриальных рибосомных белков в геноме человека». Геномика. 81 (5): 468–80. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00004-1. PMID  12706105.
• Воронина Е.Н., Колокольцова Т.Д., Нечаева Е.А., Филипенко М.Л. (2003). «[Структурный и функциональный анализ гена рибосомного белка L11 человека]». Мол. Биол. (Моск.). 37 (3): 425–35. PMID  12815950.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Вс XX, Дай МС, Лу Х (2007). «Активация р53 5-фторурацилом включает взаимодействие MDM2-рибосомного белка». J. Biol. Chem. 282 (11): 8052–9. Дои:10.1074 / jbc.M610621200. PMID  17242401.