Сфингозинкиназа 1 - Sphingosine kinase 1

СПХК1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3VZB, 3VZC, 3VZD, 4L02, 4V24
Идентификаторы
Псевдонимы	СПХК1, SPHK, сфингозинкиназа 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603730 MGI: 1316649 ГомолоГен: 39748 Генные карты: СПХК1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q25.1 Начните 76,376,584 бп[1] Конец 76,387,860 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E2 Начните 116,530,925 бп[2] Конец 116,536,674 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность рецептора сфингозин-1-фосфата • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • Связывание ДНК • связывание кальмодулина • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинфосфатазы 2А • Связывание АТФ • связывание ионов магния • активность сфинганинкиназы • Активность D-эритро-сфингозинкиназы • НАД + киназная активность • связывание липидов • активность ацетилтрансферазы Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • клеточная мембрана • ядро клетки • цитозоль • яма, покрытая клатрином • эндоцитарный пузырек • мембрана ранней эндосомы • пресинапс • эндосома • эндосомная мембрана • соединение клеток • синапс Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • положительное регулирование пролиферации фибробластов • метаболический процесс сфингозина • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • процесс биосинтеза сфингозина • положительная регуляция митотического клеточного цикла • процесс биосинтеза сфинголипидов • положительная регуляция ангиогенеза • положительное регулирование роста клеток • развитие мозга • развитие кровеносных сосудов • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • сворачивание белка • положительное регулирование пролиферации клеток • регуляция выработки интерлейкина-1 бета • воспалительная реакция • сфингоидный катаболический процесс • положительная регуляция убиквитинирования белков • положительное регулирование сокращения гладких мышц • кальций-опосредованная передача сигналов • преобразование сигнала • сигнальный путь сфингозин-1-фосфата • фосфорилирование липидов • положительное регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция апоптотического процесса • фосфорилирование • метаболизм • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • положительная регуляция митотического деления ядра • клеточный ответ на перекись водорода • Процесс биосинтеза ДНК • сигнальный путь, опосредованный сфинголипидом • ацетилирование белков • регуляция эндоцитоза • положительная регуляция продукции интерлейкина-17 • ответ на фактор некроза опухоли • клеточный ответ на стимул фактора роста эндотелия сосудов • регуляция фагоцитоза • регуляция нейровоспалительного ответа • отрицательная регуляция процесса биосинтеза церамидов • положительная регуляция каскада p38MAPK • регуляция активации микроглиальных клеток • регуляция слияния эндосомных пузырьков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8877	20698
Ансамбль	ENSG00000176170	ENSMUSG00000061878
UniProt	Q9NYA1	Q8CI15
RefSeq (мРНК)	NM_001142601 NM_001142602 NM_021972 NM_182965 NM_001355139	NM_001172472 NM_001172473 NM_001172475 NM_011451 NM_025367 NM_001372484 NM_001372485 NM_001372486 NM_001372487 NM_001372488 NM_001372489
RefSeq (белок)	NP_001136073 NP_001136074 NP_068807 NP_892010 NP_001342068	NP_001165943 NP_001165944 NP_001165946 NP_035581 NP_079643 NP_001359413 NP_001359414 NP_001359415 NP_001359416 NP_001359417 NP_001359418
Расположение (UCSC)	Chr 17: 76.38 - 76.39 Мб	Chr 11: 116,53 - 116,54 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сфингозинкиназа 1 является фермент что у людей кодируется СПХК1 ген.^[5][6]

Сфингозинкиназа 1 фосфорилаты сфингозин к сфингозин-1-фосфат (S1P) SK1 обычно цитозольный протеин, но попадает в мембраны, богатые фосфатидат (PA), продукт Фосфолипаза D (PLD)

Сфингозин-1-фосфат (S1P) - это роман липидный посланник как с внутриклеточными, так и с внеклеточными функциями. Внутриклеточно регулирует распространение и выживания, и внеклеточно, это лиганд для EDG1. Различные стимулы повышают клеточные уровни S1P за счет активации сфингозинкиназа (SPHK), фермент, который катализирует фосфорилирование из сфингозин. Конкурентные ингибиторы SPHK блокируют образование S1P и селективно ингибируют клеточную пролиферацию, вызванную множеством факторов, включая фактор роста тромбоцитов и сыворотка.^[6]

Взаимодействия

SPHK1 был показан взаимодействовать с TRAF2.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000176170 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061878 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кохама Т., Оливера А., Эдсалл Л., Нагек М.М., Диксон Р., Шпигель С. (сентябрь 1998 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика мышиной сфингозинкиназы». Журнал биологической химии. 273 (37): 23722–8. Дои:10.1074 / jbc.273.37.23722. PMID  9726979.
6. «Энтрез Ген: сфингозинкиназа 1 SPHK1».
7. Ся П, Ван Л., Моретти П. А., Альбанезе Н., Чай Ф., Питсон С. М., Д'Андреа Р. Дж., Гэмбл Дж. Р., Вадас М. А. (март 2002 г.). «Сфингозинкиназа взаимодействует с TRAF2 и расщепляет передачу сигналов фактора некроза опухоли альфа». Журнал биологической химии. 277 (10): 7996–8003. Дои:10.1074 / jbc.M111423200. PMID  11777919.

дальнейшее чтение

• Цукахара Т., Мизуно Х., Игараси Ю. (март 2002 г.). «[Молекулярное разнообразие сфингозинкиназы]». Tanpakushitsu Kakusan Koso. Белок, нуклеиновая кислота, фермент. 47 (4 Suppl): 509–13. PMID  11915350.
• Судо К., Чинен К., Накамура И. (ноябрь 1994 г.). «2058 экспрессированных тегов последовательности (EST) из библиотеки кДНК легкого плода человека». Геномика. 24 (2): 276–9. Дои:10.1006 / geno.1994.1616. PMID  7698749.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Е., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра M (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Геномные исследования. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Лю Х., Сугиура М., Нава В.Е., Эдсалл Л.К., Коно К., Поултон С., Мильстиен С., Кохама Т., Шпигель С. (июнь 2000 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика новой изоформы сфингозинкиназы млекопитающих типа 2». Журнал биологической химии. 275 (26): 19513–20. Дои:10.1074 / jbc.M002759200. PMID  10751414.
• Nava VE, Lacana E, Poulton S, Liu H, Sugiura M, Kono K, Milstien S, Kohama T, Spiegel S (май 2000 г.). «Функциональная характеристика сфингозинкиназы-1 человека». Письма FEBS. 473 (1): 81–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01510-6. PMID  10802064. S2CID  41144799.
• Мелендес А.Дж., Карлос-Диас Э., Госинк М., Аллен Дж. М., Такач Л. (июнь 2000 г.). «Сфингозинкиназа человека: молекулярное клонирование, функциональная характеристика и распределение в тканях». Ген. 251 (1): 19–26. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00205-5. PMID  10863092.
• Питсон С. М., Д'андреа Р. Дж., Ванделер Л., Моретти П. А., Ся П., Гэмбл Дж. Р., Вадас М. А., Ваттенберг Б. В. (сентябрь 2000 г.). «Сфингозинкиназа человека: очистка, молекулярное клонирование и характеристика нативных и рекомбинантных ферментов». Биохимический журнал. 350 Pt 2 (2): 429–41. Дои:10.1042/0264-6021:3500429. ЧВК  1221270. PMID  10947957.
• Ся П, Ван Л., Моретти П. А., Альбанезе Н., Чай Ф., Питсон С. М., Д'Андреа Р. Дж., Гэмбл Дж. Р., Вадас М. А. (март 2002 г.). «Сфингозинкиназа взаимодействует с TRAF2 и расщепляет передачу сигналов фактора некроза опухоли альфа». Журнал биологической химии. 277 (10): 7996–8003. Дои:10.1074 / jbc.M111423200. PMID  11777919.
• Мелендез А.Дж., Хоу А.К. (май 2002 г.). «Дихотомия сигналов Ca2 +, запускаемых различными фосфолипидными путями при стимуляции антигеном тучных клеток человека». Журнал биологической химии. 277 (19): 17255–62. Дои:10.1074 / jbc.M110944200. PMID  11856736.
• Хаяси С., Окада Т., Игараси Н., Фудзита Т., Джахангир С., Накамура С. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация и характеристика RPK118, нового белка, связывающего сфингозинкиназу-1». Журнал биологической химии. 277 (36): 33319–24. Дои:10.1074 / jbc.M201442200. PMID  12077123.
• Лакана Э., Масейка М., Милштин С., Шпигель С. (сентябрь 2002 г.). «Клонирование и характеристика белка, связанного с заякоренным белком протеинкиназы А (AKAP), который взаимодействует и регулирует активность сфингозинкиназы 1». Журнал биологической химии. 277 (36): 32947–53. Дои:10.1074 / jbc.M202841200. PMID  12080051.
• Джонсон К. Р., Беккер К. П., Факкинетти М. М., Ханнун Ю. А., Обейд Л. М. (сентябрь 2002 г.). «PKC-зависимая активация сфингозинкиназы 1 и транслокация к плазматической мембране. Внеклеточное высвобождение сфингозин-1-фосфата, индуцированное форбол 12-миристат 13-ацетатом (PMA)». Журнал биологической химии. 277 (38): 35257–62. Дои:10.1074 / jbc.M203033200. PMID  12124383.
• Питсон С.М., Моретти П.А., Зебол Дж. Р., Зарей Р., Дериан С. К., Дэрроу А. Л., Ци Дж., Д'Андреа Р. Дж., Бэгли С. Дж., Вадас М. А., Ваттенберг Б. В. (декабрь 2002 г.). «Нуклеотид-связывающий сайт сфингозинкиназы 1 человека». Журнал биологической химии. 277 (51): 49545–53. Дои:10.1074 / jbc.M206687200. PMID  12393916.
• Нава В.Е., Хобсон Дж. П., Мурти С., Мильстиен С., Шпигель С. (ноябрь 2002 г.). «Сфингозинкиназа типа 1 способствует эстроген-зависимому онкогенезу клеток MCF-7 рака груди». Экспериментальные исследования клеток. 281 (1): 115–27. Дои:10.1006 / excr.2002.5658. PMID  12441135.
• MacKinnon AC, Бакли A, Chilvers ER, Rossi AG, Haslett C, Sethi T (декабрь 2002 г.). «Сфингозинкиназа: точка схода в действии различных прайминговых агентов нейтрофилов». Журнал иммунологии. 169 (11): 6394–400. Дои:10.4049 / jimmunol.169.11.6394. PMID  12444147.

внешняя ссылка

• Поуг С.В., Капитонов Д., Шпигель С. (2007-11-08). «Сфингозинкиназа 1». UCSD-Nature Molecule Pages. Сигнальный шлюз: Калифорнийский университет в Сан-Диего (UCSD) и Nature Publishing Group. Дои:10.1038 / mp.a002219.01. Получено 2008-09-15.