Семейство гликозид гидролаз 18 - Glycoside hydrolase family 18

Семейство гликозилгидролаз 18
PDB 1wno EBI.jpg
кристаллическая структура нативной хитиназы из aspergillus fumigatus yj-407
Идентификаторы
СимволGlyco_hydro_18
PfamPF00704
Pfam кланCL0058
ИнтерПроIPR001223
SCOP21ctn / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство117
Белок OPM1nh6
CDDcd00598
Мембранома1385

В молекулярной биологии Семейство гликозид гидролаз 18 это семья из гликозидгидролазы.

Гликозид гидролазы EC 3.2.1. представляют собой широко распространенную группу ферментов, которые гидролизовать в гликозидная связь между двумя или более углеводами или между углеводной и неуглеводной составляющей. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств.[1][2][3] Эта классификация доступна на CAZy интернет сайт,[4][5] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов.[6][7]

Некоторые члены этой семьи, КАЗИ GH_18, принадлежат к хитиназа группа класса II, которая включает хитиназу, хитодекстриназу и токсин-киллер Kluyveromyces lactis. Хитиназы гидролизуются хитин олигосахариды. Другой член хитиназы II - новый ген Белок 1, содержащий хитиназный домен. В семью также входят различные гликопротеины из млекопитающие; хрящ гликопротеин и яйцевод -специфические гликопротеины являются двумя примерами.

Рекомендации

  1. ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервированный каталитический аппарат и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (15): 7090–4. Bibcode:1995PNAS ... 92.7090H. Дои:10.1073 / пнас.92.15.7090. ЧВК  41477. PMID  7624375.
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз». Структура. 3 (9): 853–9. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9. PMID  8535779.
  3. ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей». Биохимический журнал. 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. Дои:10.1042 / bj3160695. ЧВК  1217404. PMID  8687420.
  4. ^ "Дома". CAZy.org. Получено 2018-03-06.
  5. ^ Ломбард V, Голаконда Рамулу Х, Друла Э, Коутиньо П.М., Хенриссат Б (январь 2014 г.). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год». Исследования нуклеиновых кислот. 42 (Проблема с базой данных): D490-5. Дои:10.1093 / нар / gkt1178. ЧВК  3965031. PMID  24270786.
  6. ^ «Семейство гликозид гидролаз 18». CAZypedia.org. Получено 2018-03-06.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF). Гликобиология. 28 (1): 3–8. Дои:10.1093 / glycob / cwx089. HDL:21.11116 / 0000-0003-B7EB-6. PMID  29040563.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001223