TRAF3 - TRAF3

TRAF3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ФЛК, 1FLL, 1KZZ, 1L0A, 1RF3, 1ZMS, 2ECY, 2ГКВТ
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF3, CAP-1, CAP1, CD40bp, CRAF1, IIAE5, LAP1, фактор 3, связанный с рецептором TNF, RNF118
Внешние идентификаторы	OMIM: 601896 MGI: 108041 ГомолоГен: 7981 Генные карты: TRAF3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q32.32 Начинать 102,777,449 бп[1] Конец 102,911,500 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 F1 | 12 60,94 см Начинать 111,166,370 бп[2] Конец 111,267,153 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • активность преобразователя сигнала • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание тиоэстеразы • связывание протеинфосфатазы • связывание протеинкиназы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание рецептора фактора некроза опухоли Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • эндосома • митохондрия • цитоплазматическая сторона плазматической мембраны • CD40 рецепторный комплекс • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • Путь передачи сигналов Toll • иммунная система • TRIF-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов • убиквитинирование белков • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • регулирование протеолиза • апоптотический процесс • сигнальный путь толл-подобных рецепторов • регулирование выработки цитокинов • преобразование сигнала • регулирование выработки интерферона-бета • врожденная иммунная система • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • регуляция защитной реакции на вирус • деубиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7187	22031
Ансамбль	ENSG00000131323	ENSMUSG00000021277
UniProt	Q13114	Q60803
RefSeq (мРНК)	NM_001199427 NM_003300 NM_145725 NM_145726	NM_001048206 NM_001286122 NM_011632 NM_001364364
RefSeq (белок)	NP_001186356 NP_003291 NP_663777 NP_663778	NP_001273051 NP_035762 NP_001351293
Расположение (UCSC)	Chr 14: 102,78 - 102,91 Мб	Chr 12: 111.17 - 111.27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор, связанный с рецептором TNF (TRAF3) это белок что у человека кодируется TRAF3 ген. ^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков фактора, ассоциированного с рецептором TNF (TRAF). Белки TRAF связываются с членами суперсемейства рецепторов TNF (TNFR) и опосредуют передачу сигналов от них. Этот белок участвует в передаче сигнала CD40, члена семейства TNFR, важного для активации иммунного ответа. Было обнаружено, что этот белок является критическим компонентом сигнального комплекса рецептора лимфотоксина-бета (LTbetaR), который вызывает активацию NF-kappaB и гибель клеток, инициируемую лигированием LTbeta. Кодируемый вирусом Эпштейна-Барр мембранный белок-1 латентной инфекции (LMP1) может взаимодействовать с этим и некоторыми другими членами семейства TRAF, что может иметь важное значение для онкогенных эффектов LMP1. Сообщалось о трех альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта, кодирующих две различные изоформы.^[8]

Взаимодействия

TRAF3 был показан взаимодействовать с:

• CD27,^[9][10]
• CD40,^{[11][12][13][14]}
• Каспаза 3^[15][16]
• Бета-рецептор лимфотоксина,^[17][18][19]
• Нуклеопорин 62,^[20]
• КЛАССИФИЦИРОВАТЬ,^[21][22]
• БАК,^[23][24] и
• TNFSF14.^[25]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131323 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021277 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cheng G, Cleary AM, Ye ZS, Hong DI, Lederman S, Baltimore D (март 1995). «Участие CRAF1, родственника TRAF, в передаче сигналов CD40». Наука. 267 (5203): 1494–8. Дои:10.1126 / science.7533327. PMID  7533327.
6. Сато Т., Ирие С., Рид Дж.С. (январь 1995 г.). «Новый член семейства TRAF предполагаемых белков, передающих сигнал, связывается с цитозольным доменом CD40». Письма FEBS. 358 (2): 113–8. Дои:10.1016 / 0014-5793 (94) 01406-Q. PMID  7530216.
7. Мосиалос Г., Биркенбах М., Яламанчили Р., Ван Арсдейл Т., Уэр С., Кифф Е. (февраль 1995 г.). «Белок, трансформирующий вирус Эпштейна-Барра, LMP1, задействует сигнальные белки для семейства рецепторов фактора некроза опухоли». Клетка. 80 (3): 389–99. Дои:10.1016/0092-8674(95)90489-1. PMID  7859281.
8. «Ген Entrez: фактор 3, связанный с рецептором TRAF3 TNF».
9. Ямамото Х., Кисимото Т, Минамото С. (ноябрь 1998 г.). «Активация NF-kappaB в передаче сигналов CD27: участие факторов, связанных с рецептором TNF, в передаче сигналов и идентификации функциональной области CD27». Журнал иммунологии. 161 (9): 4753–9. PMID  9794406.
10. Акиба Х., Накано Х., Нишинака С., Шиндо М., Кобата Т., Ацута М., Моримото С., Уэр С.Ф., Малинин Н.Л., Уоллах Д., Ягита Х., Окумура К. (май 1998 г.). «CD27, член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухолей, активирует NF-kappaB и стресс-активируемую протеинкиназу / N-концевую киназу c-Jun через TRAF2, TRAF5 и киназу, индуцирующую NF-kappaB». Журнал биологической химии. 273 (21): 13353–8. Дои:10.1074 / jbc.273.21.13353. PMID  9582383.
11. Цукамото Н., Кобаяши Н., Адзума С., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Февраль 1999 г.). «Два по-разному регулируемые пути активации ядерного фактора kappaB, запускаемые цитоплазматическим хвостом CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (4): 1234–9. Дои:10.1073 / pnas.96.4.1234. ЧВК  15446. PMID  9990007.
12. Ху Х.М., О'Рурк К., Богуски М.С., Диксит В.М. (декабрь 1994 г.). «Новый белок пальца RING взаимодействует с цитоплазматическим доменом CD40». Журнал биологической химии. 269 (48): 30069–72. PMID  7527023.
13. Ni CZ, Welsh K, Leo E, Chiou CK, Wu H, Reed JC, Ely KR (сентябрь 2000 г.). «Молекулярная основа передачи сигналов CD40, опосредованная TRAF3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (19): 10395–9. Дои:10.1073 / пнас.97.19.10395. ЧВК  27035. PMID  10984535.
14. Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Сальвесен Г.С., Рид Дж.С. (декабрь 1997 г.). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами конкретных каспаз». Журнал EMBO. 16 (23): 6914–25. Дои:10.1093 / emboj / 16.23.6914. ЧВК  1170295. PMID  9384571.
15. Ли Чж, Ли С.Е., Квак К., Йео В., Ли Т.Х., Бэ СС, Сух П.Г., Ким Х.Х. (март 2001 г.). «Опосредованное каспазой расщепление TRAF3 в FasL-стимулированных клетках Jurkat-T». Журнал биологии лейкоцитов. 69 (3): 490–6. PMID  11261798.
16. Лео E, Deveraux QL, Buchholtz C, Welsh K, Matsuzawa S, Stennicke HR, Salvesen GS, Reed JC (март 2001 г.). «TRAF1 представляет собой субстрат каспаз, активируемых во время апоптоза, индуцированного рецептором фактора некроза опухоли-альфа». Журнал биологической химии. 276 (11): 8087–93. Дои:10.1074 / jbc.M009450200. PMID  11098060.
17. VanArsdale TL, VanArsdale SL, Force WR, Walter BN, Mosialos G, Kieff E, Reed JC, Ware CF (март 1997 г.). «Сигнальный комплекс рецептора лимфотоксина-бета: роль фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора каппаB». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (6): 2460–5. Дои:10.1073 / пнас.94.6.2460. ЧВК  20110. PMID  9122217.
18. Wu MY, Wang PY, Han SH, Hsieh SL (апрель 1999 г.). «Цитоплазматический домен рецептора лимфотоксина-бета опосредует гибель клеток в клетках HeLa». Журнал биологической химии. 274 (17): 11868–73. Дои:10.1074 / jbc.274.17.11868. PMID  10207006.
19. Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». Журнал биологической химии. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.
20. Gamper C, van Eyndhoven WG, Schweiger E, Mossbacher M, Koo B, Lederman S. «TRAF-3 взаимодействует с нуклеопорином p62, компонентом центральной пробки ядерной поры, который связывает классические NLS-содержащие импортные комплексы». Молекулярная иммунология. 37 (1–2): 73–84. Дои:10.1016 / s0161-5890 (00) 00015-8. PMID  10781837.
21. Галиберт Л., Томецко М.Е., Андерсон Д.М., Косман Д., Дугалл В.К. (декабрь 1998 г.). «Участие факторов, ассоциированных с множественными рецепторами фактора некроза опухоли (TNFR), в сигнальных механизмах активатора рецептора NF-kappaB, члена суперсемейства TNFR». Журнал биологической химии. 273 (51): 34120–7. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID  9852070.
22. Kim HH, Lee DE, Shin JN, Lee YS, Jeon YM, Chung CH, Ni J, Kwon BS, Lee ZH (январь 1999 г.). «Рецепторный активатор NF-kappaB набирает множество адаптеров семейства TRAF и активирует N-концевую киназу c-Jun». Письма FEBS. 443 (3): 297–302. Дои:10.1016 / s0014-5793 (98) 01731-1. PMID  10025951.
23. Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природа клеточной биологии. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216.
24. Rothe M, Xiong J, Shu HB, Williamson K, Goddard A, Goeddel DV (август 1996). «I-TRAF - это новый белок, взаимодействующий с TRAF, который регулирует передачу сигнала, опосредованную TRAF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (16): 8241–6. Дои:10.1073 / пнас.93.16.8241. ЧВК  38654. PMID  8710854.
25. Куай Дж, Никбарг Э, Вутерс Дж, Цю Й, Ван Дж, Лин Л.Л. (апрель 2003 г.). «Эндогенная ассоциация TRAF2, TRAF3, cIAP1 и Smac с рецептором лимфотоксина бета раскрывает новый механизм апоптоза». Журнал биологической химии. 278 (16): 14363–9. Дои:10.1074 / jbc.M208672200. PMID  12571250.

дальнейшее чтение

• Ваджант Х, Хенклер Ф, Шойрих П. (июнь 2001 г.). «Семейство факторов, связанных с рецептором TNF: скаффолдные молекулы для рецепторов цитокинов, киназ и их регуляторов». Сотовая связь. 13 (6): 389–400. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00160-7. PMID  11384837.
• Брэдли Дж. Р., Побер Дж. С. (октябрь 2001 г.). «Факторы, связанные с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF)». Онкоген. 20 (44): 6482–91. Дои:10.1038 / sj.onc.1204788. PMID  11607847.
• Саха СК, Ченг Джи (апрель 2006 г.). «TRAF3: новый регулятор интерферонов I типа». Клеточный цикл. 5 (8): 804–7. Дои:10.4161 / cc.5.8.2637. PMID  16582590.
• Ху Х.М., О'Рурк К., Богуски М.С., Диксит В.М. (декабрь 1994 г.). «Новый белок пальца RING взаимодействует с цитоплазматическим доменом CD40». Журнал биологической химии. 269 (48): 30069–72. PMID  7527023.
• Cheng G, Cleary AM, Ye ZS, Hong DI, Lederman S, Baltimore D (март 1995). «Участие CRAF1, родственника TRAF, в передаче сигналов CD40». Наука. 267 (5203): 1494–8. Дои:10.1126 / science.7533327. PMID  7533327.
• Сюй Х., Шу Х.Б., Пан М.Г., Геддел Д.В. (январь 1996 г.). «Взаимодействия TRADD-TRAF2 и TRADD-FADD определяют два различных пути передачи сигнала рецептора TNF 1». Клетка. 84 (2): 299–308. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80984-8. PMID  8565075.
• Сюй Х., Хуанг Дж., Шу Х.Б., Байчвал В., Геддел Д.В. (апрель 1996 г.). «TNF-зависимое привлечение протеинкиназы RIP к сигнальному комплексу рецептора TNF-1». Иммунитет. 4 (4): 387–96. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80252-6. PMID  8612133.
• Бутч ER, Гуань К.Л. (февраль 1996 г.). «Характеристика мутантов сайта активации ERK1 и влияние на распознавание MEK1 и MEK2». Журнал биологической химии. 271 (8): 4230–5. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4230. PMID  8626767.
• Gedrich RW, Gilfillan MC, Duckett CS, Van Dongen JL, Thompson CB (май 1996 г.). «CD30 содержит два сайта связывания с разной специфичностью для членов семейства сигнальных трансдуцирующих белков фактора некроза опухоли, ассоциированного с рецептором». Журнал биологической химии. 271 (22): 12852–8. Дои:10.1074 / jbc.271.22.12852. PMID  8662842.
• Накано Х., Осима Х., Чунг В., Уильямс-Эбботт Л., Уэр С.Ф., Ягита Х., Окумура К. (июнь 1996 г.). «TRAF5, активатор NF-kappaB и предполагаемый преобразователь сигнала для рецептора лимфотоксина-бета». Журнал биологической химии. 271 (25): 14661–4. Дои:10.1074 / jbc.271.25.14661. PMID  8663299.
• Rothe M, Xiong J, Shu HB, Williamson K, Goddard A, Goeddel DV (август 1996). «I-TRAF - это новый TRAF-взаимодействующий белок, который регулирует TRAF-опосредованную передачу сигнала». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (16): 8241–6. Дои:10.1073 / пнас.93.16.8241. ЧВК  38654. PMID  8710854.
• Хабберстей А., Ю. Г., Лоуит Р., Лакуста С., Янг Д. (июнь 1996 г.). «CAP млекопитающих взаимодействует с CAP, CAP2 и актином». Журнал клеточной биохимии. 61 (3): 459–66. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19960601) 61: 3 <459 :: AID-JCB13> 3.0.CO; 2-E. PMID  8761950.
• VanArsdale TL, VanArsdale SL, Force WR, Walter BN, Mosialos G, Kieff E, Reed JC, Ware CF (март 1997 г.). «Сигнальный комплекс рецептора лимфотоксина-бета: роль фактора 3, связанного с рецептором фактора некроза опухоли, в гибели клеток и активации ядерного фактора каппаB». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (6): 2460–5. Дои:10.1073 / пнас.94.6.2460. ЧВК  20110. PMID  9122217.
• Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». Журнал биологической химии. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.
• Boucher LM, Marengère LE, Lu Y, Thukral S, Mak TW (апрель 1997 г.). «Сайты связывания цитоплазматических эффекторов TRAF1, 2 и 3 на CD30 и других членах суперсемейства рецепторов TNF». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 233 (3): 592–600. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6509. PMID  9168896.
• Song HY, Régnier CH, Kirschning CJ, Goeddel DV, Rothe M (сентябрь 1997 г.). «Каскады киназ, опосредованных фактором некроза опухоли (TNF): бифуркация путей ядерного фактора-kappaB и c-jun N-концевой киназы (JNK / SAPK) в факторах 2, связанных с рецептором TNF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (18): 9792–6. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9792. ЧВК  23270. PMID  9275204.
• Force WR, Cheung TC, Ware CF (декабрь 1997 г.). «Доминантно-отрицательные мутанты TRAF3 показывают важную роль доменов спиральной спирали в передаче сигналов о гибели клеток рецептором лимфотоксина-бета». Журнал биологической химии. 272 (49): 30835–40. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30835. PMID  9388227.