TRAF1 - TRAF1

TRAF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3M0D
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF1, EBI6, MGC: 10353, фактор 1, связанный с рецептором TNF
Внешние идентификаторы	OMIM: 601711 MGI: 101836 ГомолоГен: 4138 Генные карты: TRAF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q33.2 Начинать 120,902,393 бп[1] Конец 120,929,173 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 млрд Начинать 34,941,750 бп[2] Конец 34,961,772 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание тиоэстеразы • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитин-протеин-лигазы • идентичное связывание с белками • связывание рецептора фактора некроза опухоли Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли • регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • преобразование сигнала • апоптотический процесс • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • сборка макромолекулярного комплекса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7185	22029
Ансамбль	ENSG00000056558	ENSMUSG00000026875
UniProt	Q13077	P39428
RefSeq (мРНК)	NM_005658 NM_001190945 NM_001190947	NM_009421 NM_001326601
RefSeq (белок)	NP_001177874 NP_001177876 NP_005649	NP_001313530 NP_033447
Расположение (UCSC)	Chr 9: 120.9 - 120.93 Мб	Chr 2: 34.94 - 34.96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор 1, связанный с рецептором TNF это белок что у людей кодируется TRAF1 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков фактора, ассоциированного с рецептором TNF (TNFR) (TRAF). Белки TRAF связываются и опосредуют передачу сигнала от различных рецепторов суперсемейства TNFR. Этот белок и TRAF2 образуют гетеродимерный комплекс, который необходим для TNF-альфа-опосредованной активации MAPK8 / JNK и NF-kappaB. Белковый комплекс, образованный этим белком и TRAF2, также взаимодействует с ИПД, и, таким образом, опосредует антиапоптотические сигналы от рецепторов TNF. Экспрессия этого белка может быть индуцирована вирусом Эпштейна-Барра (EBV). Обнаружено, что мембранный белок 1 инфекции EBV (LMP1) взаимодействует с этим и другими белками TRAF; Полагают, что это взаимодействие связывает опосредованную LMP1 трансформацию B-лимфоцитов с передачей сигнала от рецепторов семейства TNFR.^[6] TRAF1 также действует как негативный регулятор воспаления, вмешиваясь в линейное убиквитинирование NEMO ниже по ходу передачи сигналов TLR.^[7] Это объясняет, почему полиморфизмы TRAF1 вызывают повышенный риск ревматических заболеваний.^[8]

Взаимодействия

TRAF1 был показан взаимодействовать с:

• BIRC2,^[9][10][11]
• Бакуловирусный белок 3, содержащий повтор IAP,^[9][10]
• CFLAR,^[12][13]
• Каспаза 8,^[14][15]
• HIVEP3,^[16]
• КЛАССИФИЦИРОВАТЬ^[17][18]
• TNFAIP3,^[19][20]
• TRAF взаимодействующий белок,^[21] и
• TRAF2.^[22][23]
• RNF31.^[24]
• RBCK1.^[24]
• ШАРПИН.^[24]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000056558 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026875 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Роте М., Вонг С.К., Хензель В.Дж., Геддел Д.В. (сентябрь 1994 г.). «Новое семейство предполагаемых сигнальных преобразователей, связанных с цитоплазматическим доменом рецептора фактора некроза опухоли 75 кДа». Клетка. 78 (4): 681–92. Дои:10.1016/0092-8674(94)90532-0. PMID  8069916. S2CID  28055231.
6. «Ген Entrez: фактор 1, связанный с рецептором TNF TRAF1».
7. Абдул-Сатер, Али А.; Эдилова Мария I; Clouthier, Дерек Л; Мбанви, Ачире; Креммер, Элизабет; Уоттс, Таня Х (2017). «Адаптер передачи сигналов TRAF1 негативно регулирует передачу сигналов Toll-подобного рецептора, и это лежит в основе его роли при ревматическом заболевании». Иммунология природы. 18 (1): 26–35. Дои:10.1038 / ni.3618. PMID  27893701. S2CID  19487408.
8. Plenge, Роберт М .; Зайелстад, Марк; Падюков Леонид; Ли, Аннетт Т .; Реммерс, Элейн Ф .; Дин, Бо; Лью, Энтони; Халили, Хоуман; Чандрасекаран, Аламелу (20 сентября 2007 г.). «TRAF1 – C5 как локус риска ревматоидного артрита - исследование в масштабе всего генома». Медицинский журнал Новой Англии. 357 (12): 1199–1209. Дои:10.1056 / NEJMoa073491. ISSN  0028-4793. ЧВК  2636867. PMID  17804836.
9. Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Сальвесен Г.С., Рид Дж.С. (декабрь 1997 г.). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами конкретных каспаз». EMBO J. 16 (23): 6914–25. Дои:10.1093 / emboj / 16.23.6914. ЧВК  1170295. PMID  9384571.
10. Ли X, Ян Y, Эшвелл JD (март 2002). «TNF-RII и c-IAP1 опосредуют убиквитинирование и деградацию TRAF2». Природа. 416 (6878): 345–7. Дои:10.1038 / 416345a. PMID  11907583. S2CID  4325926.
11. Шу Х. Б., Такеучи М., Геддел Д. В. (ноябрь 1996 г.). «Сигнальные преобразователи рецептора 2 фактора некроза опухоли TRAF2 и c-IAP1 являются компонентами сигнального комплекса рецептора 1 фактора некроза опухоли». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (24): 13973–8. Дои:10.1073 / пнас.93.24.13973. ЧВК  19479. PMID  8943045.
12. Шу Х. Б., Халпин Д. Р., Геддел Д. В. (июнь 1997 г.). «Каспер является индуктором апоптоза, связанным с FADD и каспазой». Иммунитет. 6 (6): 751–63. Дои:10.1016 / с1074-7613 (00) 80450-1. PMID  9208847.
13. Катаока Т., Бадд Р.С., Холлер Н., Том М., Мартинон Ф., Ирмлер М., Бернс К., Хане М., Кеннеди Н., Ковачович М., Чопп Дж. (Июнь 2000 г.). «Ингибитор каспазы-8 FLIP способствует активации путей передачи сигналов NF-kappaB и Erk». Curr. Биол. 10 (11): 640–8. Дои:10.1016 / s0960-9822 (00) 00512-1. PMID  10837247. S2CID  14819939.
14. Мишо О., Чопп Дж. (Июль 2003 г.). «Индукция апоптоза, опосредованного рецептором TNF I, посредством двух последовательных сигнальных комплексов» (PDF). Клетка. 114 (2): 181–90. Дои:10.1016 / с0092-8674 (03) 00521-х. PMID  12887920. S2CID  17145731.
15. Лео E, Deveraux QL, Buchholtz C, Welsh K, Matsuzawa S, Stennicke HR, Salvesen GS, Reed JC (март 2001 г.). «TRAF1 представляет собой субстрат каспаз, активируемых во время апоптоза, индуцированного рецептором фактора некроза опухоли-альфа». J. Biol. Chem. 276 (11): 8087–93. Дои:10.1074 / jbc.M009450200. PMID  11098060.
16. Оукка М., Ким С.Т., Луго Дж., Сун Дж., Ву Л.С., Глимчер Л.Х. (январь 2002 г.). «Гомолог Drosophila schnurri у млекопитающих, KRC, регулирует ответы, управляемые рецептором TNF, и взаимодействует с TRAF2». Мол. Клетка. 9 (1): 121–31. Дои:10.1016 / с1097-2765 (01) 00434-8. PMID  11804591.
17. Галиберт Л., Томецко М.Е., Андерсон Д.М., Косман Д., Дугал В.К. (декабрь 1998 г.). «Участие факторов, ассоциированных с множественными рецепторами фактора некроза опухоли (TNFR), в сигнальных механизмах активатора рецептора NF-kappaB, члена суперсемейства TNFR». J. Biol. Chem. 273 (51): 34120–7. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID  9852070.
18. Kim HH, Lee DE, Shin JN, Lee YS, Jeon YM, Chung CH, Ni J, Kwon BS, Lee ZH (январь 1999 г.). «Рецепторный активатор NF-kappaB набирает множество адаптеров семейства TRAF и активирует N-концевую киназу c-Jun». FEBS Lett. 443 (3): 297–302. Дои:10.1016 / s0014-5793 (98) 01731-1. PMID  10025951. S2CID  46210019.
19. Песня HY, Rothe M, Goeddel DV (июнь 1996 г.). «Белок цинкового пальца A20, индуцируемый фактором некроза опухоли, взаимодействует с TRAF1 / TRAF2 и ингибирует активацию NF-kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (13): 6721–5. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6721. ЧВК  39093. PMID  8692885.
20. Heyninck K, Beyaert R (январь 1999 г.). «Цитокин-индуцируемый белок цинкового пальца А20 ингибирует индуцированную IL-1 активацию NF-kappaB на уровне TRAF6». FEBS Lett. 442 (2–3): 147–50. Дои:10.1016 / s0014-5793 (98) 01645-7. PMID  9928991. S2CID  19072203.
21. Ли С.Ю., Ли С.Ю., Чой Й. (апрель 1997). «TRAF-взаимодействующий белок (TRIP): новый компонент рецептора фактора некроза опухоли (TNFR) и сигнальных комплексов CD30-TRAF, который ингибирует TRAF2-опосредованную активацию NF-kappaB». J. Exp. Med. 185 (7): 1275–85. Дои:10.1084 / jem.185.7.1275. ЧВК  2196258. PMID  9104814.
22. Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
23. Такеучи М., Роте М., Геддел Д.В. (август 1996 г.). «Анатомия TRAF2. Отдельные домены для активации ядерного фактора-kappaB и ассоциации с сигнальными белками фактора некроза опухоли». J. Biol. Chem. 271 (33): 19935–42. Дои:10.1074 / jbc.271.33.19935. PMID  8702708.
24. Абдул-Сатер А.А., Эдилова М.И., Клутье Д.Л., Мбанви А., Креммер Э., Уоттс Т.Х. (ноябрь 2016 г.). «Адаптер передачи сигналов TRAF1 негативно регулирует передачу сигналов Toll-подобного рецептора, и это лежит в основе его роли при ревматическом заболевании». Nat. Иммунол. 18 (1): 26–35. Дои:10.1038 / ni.3618. PMID  27893701. S2CID  19487408.

дальнейшее чтение

• Ваджант Х, Хенклер Ф, Шойрих П. (2001). «Семейство факторов, связанных с рецептором TNF: скаффолдные молекулы для рецепторов цитокинов, киназ и их регуляторов». Клетка. Сигнал. 13 (6): 389–400. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00160-7. PMID  11384837.
• Брэдли Дж. Р., Побер Дж. С. (2001). «Факторы, ассоциированные с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF)». Онкоген. 20 (44): 6482–91. Дои:10.1038 / sj.onc.1204788. PMID  11607847.
• Ху Х.М., О'Рурк К., Богуски М.С., Диксит В.М. (1994). «Новый белок пальца RING взаимодействует с цитоплазматическим доменом CD40». J. Biol. Chem. 269 (48): 30069–72. PMID  7527023.
• Мосиалос Г., Биркенбах М., Яламанчили Р., Ван Арсдейл Т., Уэр С., Кифф Е. (1995). «Белок, трансформирующий вирус Эпштейна-Барра, LMP1, задействует сигнальные белки для семейства рецепторов фактора некроза опухоли». Клетка. 80 (3): 389–99. Дои:10.1016/0092-8674(95)90489-1. PMID  7859281. S2CID  17984027.
• Сюй Х, Шу ХБ, Пан М.Г., Геддел Д.В. (1996). «Взаимодействия TRADD-TRAF2 и TRADD-FADD определяют два различных пути передачи сигнала рецептора TNF 1». Клетка. 84 (2): 299–308. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80984-8. PMID  8565075. S2CID  13171355.
• Сюй Х, Хуанг Дж, Шу Х. Б., Байчвал В., Геддел Д. В. (1996). «TNF-зависимое привлечение протеинкиназы RIP к сигнальному комплексу рецептора TNF-1». Иммунитет. 4 (4): 387–96. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80252-6. PMID  8612133.
• Ли SY, Парк CG, Чой Y (1996). «Зависимая от Т-клеточного рецептора клеточная гибель Т-клеточных гибридом, опосредованная цитоплазматическим доменом CD30, в ассоциации с факторами, связанными с рецептором фактора некроза опухоли». J. Exp. Med. 183 (2): 669–74. Дои:10.1084 / jem.183.2.669. ЧВК  2192463. PMID  8627180.
• Gedrich RW, Gilfillan MC, Duckett CS, Van Dongen JL, Thompson CB (1996). «CD30 содержит два сайта связывания с различной специфичностью для членов семейства сигнальных трансдуцирующих белков факторов фактора некроза опухоли». J. Biol. Chem. 271 (22): 12852–8. Дои:10.1074 / jbc.271.22.12852. PMID  8662842.
• Песня HY, Rothe M, Goeddel DV (1996). «Белок цинкового пальца A20, индуцируемый фактором некроза опухоли, взаимодействует с TRAF1 / TRAF2 и ингибирует активацию NF-kappaB». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (13): 6721–5. Дои:10.1073 / пнас.93.13.6721. ЧВК  39093. PMID  8692885.
• Такеучи М., Роте М., Геддел Д.В. (1996). «Анатомия TRAF2. Отдельные домены для активации ядерного фактора-kappaB и ассоциации с сигнальными белками фактора некроза опухоли». J. Biol. Chem. 271 (33): 19935–42. Дои:10.1074 / jbc.271.33.19935. PMID  8702708.
• Rothe M, Xiong J, Shu HB, Williamson K, Goddard A, Goeddel DV (1996). «I-TRAF - это новый белок, взаимодействующий с TRAF, который регулирует передачу сигнала, опосредованную TRAF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (16): 8241–6. Дои:10.1073 / пнас.93.16.8241. ЧВК  38654. PMID  8710854.
• Шу HB, Takeuchi M, Goeddel DV (1997). «Сигнальные преобразователи рецептора 2 фактора некроза опухоли TRAF2 и c-IAP1 являются компонентами сигнального комплекса рецептора 1 фактора некроза опухоли». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (24): 13973–8. Дои:10.1073 / пнас.93.24.13973. ЧВК  19479. PMID  8943045.
• Ли С.Ю., Ли С.Ю., Чой Й. (1997). «TRAF-взаимодействующий белок (TRIP): новый компонент рецептора фактора некроза опухоли (TNFR) и сигнальных комплексов CD30-TRAF, который ингибирует TRAF2-опосредованную активацию NF-kappaB». J. Exp. Med. 185 (7): 1275–85. Дои:10.1084 / jem.185.7.1275. ЧВК  2196258. PMID  9104814.
• Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (1997). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». J. Biol. Chem. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.
• Boucher LM, Marengère LE, Lu Y, Thukral S, Mak TW (1997). «Сайты связывания цитоплазматических эффекторов TRAF1, 2 и 3 на CD30 и других членах суперсемейства рецепторов TNF». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 233 (3): 592–600. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6509. PMID  9168896.
• Шу HB, Halpin DR, Goeddel DV (1997). «Каспер является индуктором апоптоза, связанным с FADD и каспазой». Иммунитет. 6 (6): 751–63. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80450-1. PMID  9208847.
• Песня HY, Régnier CH, Kirschning CJ, Goeddel DV, Rothe M (1997). «Каскады киназ, опосредованных фактором некроза опухоли (TNF): бифуркация путей ядерного фактора-kappaB и c-jun N-концевой киназы (JNK / SAPK) в факторах 2, связанных с рецептором TNF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (18): 9792–6. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9792. ЧВК  23270. PMID  9275204.
• Семенски К., Петерс Н., Шойрих П., Ваджант Х (1997). «Организация гена фактора 1 фактора некроза опухоли человека, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF1), и картирование на хромосоме 9q33-34». Ген. 195 (1): 35–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00147-9. PMID  9300817.