GRB7 - GRB7

GRB7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3PQZ, 1MW4, 1WGR, 2L4K, 2QMS, 4WWQ, 4X6S, 5EEL, 5EEQ, 5D0J
Идентификаторы
Псевдонимы	GRB7, entrez: 2886, белок 7, связанный с рецептором фактора роста
Внешние идентификаторы	OMIM: 601522 MGI: 102683 ГомолоГен: 3881 Генные карты: GRB7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q12 Начинать 39,737,927 бп[1] Конец 39,747,291 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 61,75 см Начинать 98,446,394 бп[2] Конец 98,455,373 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозита • идентичное связывание с белками • Связывание РНК • связывание протеинкиназы • связывание липидов Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • проекция клетки • мембрана • очаговая адгезия • клеточная мембрана • соединение клеток • Гранула стресса Биологический процесс • отрицательное регулирование перевода • сигнальный путь рецептора эпидермального фактора роста • положительное регулирование миграции клеток • миграция лейкоцитов • преобразование сигнала • сборка гранул напряжения • Путь передачи сигналов ERBB2 • положительное регулирование передачи сигнала • управление аксоном • сигнальный путь рецептора инсулина • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора инсулина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2886	14786
Ансамбль	ENSG00000141738	ENSMUSG00000019312
UniProt	Q14451	Q03160
RefSeq (мРНК)	NM_001030002 NM_001242442 NM_001242443 NM_005310 NM_001330207	NM_010346
RefSeq (белок)	NP_001025173 NP_001229371 NP_001229372 NP_001317136 NP_005301	NP_034476
Расположение (UCSC)	Chr 17: 39.74 - 39.75 Мб	Chr 11: 98.45 - 98.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 7, связанный с рецептором фактора роста, также известный как GRB7, это белок что у людей кодируется GRB7 ген.^[5][6]

Функция

Продукт этого гена принадлежит небольшому семейству адаптерные белки которые, как известно, взаимодействуют с рядом рецепторные тирозинкиназы и сигнальные молекулы. Этот ген кодирует белок, связывающий рецептор фактора роста, который взаимодействует с рецептор эпидермального фактора роста (EGFR) и рецепторы эфрина. Белок играет роль в интегрин сигнальный путь и миграция клеток путем связывания с киназа фокальной адгезии (ФАК). Альтернативная сварка приводит к множеству вариантов транскрипции, кодирующих разные изоформы, хотя к настоящему времени определены полнометражные характеристики только двух вариантов.^[5]

Клиническое значение

GRB7 - это адаптер для домена SH2 белок это связано с рецепторные тирозинкиназы и обеспечивает прямую внутрисотовую связь с Рас протоонкоген Человеческий GRB7 расположен на длинной руке хромосома 17, рядом с ERBB2 (псевдоним HER2 / neu ) протоонкоген.

Эти два гена обычно коамплифицируются (присутствуют в избыточных копиях) в рак груди.GRB7, как предполагается, участвует в миграции^{[нужна цитата ]}, хорошо известно, чрезмерно экспрессируется в яичках. опухоли половых клеток, рак пищевода, и рак желудка.

Взаимодействия

GRB7 был показан взаимодействовать с:

• EPH рецептор B1,^[7]
• Рецептор инсулина,^[8]
• ПТК2,^[9]
• Протоонкоген RET,^[10] и
• Rnd1^[11]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при исследовании функции GRB7. Условный нокаутирующая мышь линия называется Grb7^{tm1b (EUCOMM) Wtsi} был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.^[12] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг^[13] для определения последствий удаления.^{[14][15][16][17]} Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование^[18]

Grb7 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Все данные доступны на сайте.[13][18]
Лейкоциты периферической крови 6 недель	Нормальный
Гематология 6 недель	Нормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14	Нормальный
Гомозиготная фертильность	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология 16 недель	Нормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недель	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный
Функция цитотоксических Т-клеток	Нормальный
Иммунофенотипирование селезенки	Нормальный
Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узлов	Нормальный
Иммунофенотипирование костного мозга	Нормальный
Состав эпидермального иммунитета	Нормальный
Тричурис вызов	Нормальный

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000141738 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019312 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок 7, связанный с рецептором фактора роста GRB7».
6. Танака С., Мори М., Акиёси Т., Танака Ю., Мафуне К., Жезлы Дж. Р., Сугимачи К. (август 1998 г.). «Новый вариант человеческого Grb7 связан с инвазивной карциномой пищевода». Журнал клинических исследований. 102 (4): 821–7. Дои:10.1172 / JCI2921. ЧВК  508945. PMID  9710451.
7. Хан, округ Колумбия, Шэнь Т.Л., Мяо Х, Ван Б., Гуань Д.Л. (ноябрь 2002 г.). «EphB1 связывается с Grb7 и регулирует миграцию клеток». Журнал биологической химии. 277 (47): 45655–61. Дои:10.1074 / jbc.M203165200. PMID  12223469.
8. Kasus-Jacobi A, Béréziat V, Perdereau D, Girard J, Burnol AF (апрель 2000 г.). «Доказательства взаимодействия между рецептором инсулина и Grb7. Роль двух из его связывающих доменов, PIR и SH2». Онкоген. 19 (16): 2052–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1203469. PMID  10803466.
9. Хан, округ Колумбия, Гуань Дж. Л. (август 1999 г.). «Ассоциация киназы фокальной адгезии с Grb7 и ее роль в миграции клеток». Журнал биологической химии. 274 (34): 24425–30. Дои:10.1074 / jbc.274.34.24425. PMID  10446223.
10. Панди А., Лю X, Диксон Дж. Э., Ди Фиоре П. П., Диксит В. М. (май 1996 г.). «Прямая связь между тирозинкиназой рецептора Ret и адаптерным белком Grb7, содержащим гомологию Src 2». Журнал биологической химии. 271 (18): 10607–10. Дои:10.1074 / jbc.271.18.10607. PMID  8631863.
11. Вайссьер Б., Залькман Дж., Маэ И., Мирей Дж., Лигенса Т., Вайднер К. М., Шарден П., Камонис Дж. (Февраль 2000 г.). «Взаимодействие адапторного белка Grb7 с Rnd1, новым членом семейства Rho». Письма FEBS. 467 (1): 91–6. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 01530-6. PMID  10664463. S2CID  4901644.
12. Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
13. «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
14. Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
15. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
16. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
17. Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
18. «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение

• Хан, округ Колумбия, Шэнь Т.Л., Гуань Д.Л. (октябрь 2001 г.). «Белки семейства Grb7: структура, взаимодействие с другими сигнальными молекулами и потенциальные клеточные функции». Онкоген. 20 (44): 6315–21. Дои:10.1038 / sj.onc.1204775. PMID  11607834.
• Марголис Б., Сильвеннойнен О., Комольо Ф., Рунпрапунт С., Сколник Е., Ульрих А., Шлессингер Дж. (Октябрь 1992 г.). «Высокоэффективная экспрессия / клонирование белков, связывающих рецептор эпидермального фактора роста с доменами 2 гомологии Src». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (19): 8894–8. Bibcode:1992ПНАС ... 89.8894М. Дои:10.1073 / пнас.89.19.8894. ЧВК  50030. PMID  1409582.
• Скотейм Р.И., Абелер В.М., Несланд Дж.М., Фосса С.Д., Холм Р., Вагнер У., Флоренес В.А., Аасс Н., Каллиониеми О.П., Лоте Р.А. (2003). «Гены-кандидаты на рак яичек, оцененные с помощью анализов экспрессии белка in situ на тканевых микроматрицах». Неоплазия. 5 (5): 397–404. Дои:10.1016 / с1476-5586 (03) 80042-8. ЧВК  1502610. PMID  14670177.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Панди А., Лю X, Диксон Дж. Э., Ди Фиоре П. П., Диксит В. М. (май 1996 г.). «Прямая связь между тирозинкиназой рецептора Ret и адаптерным белком Grb7, содержащим гомологию Src 2». Журнал биологической химии. 271 (18): 10607–10. Дои:10.1074 / jbc.271.18.10607. PMID  8631863.
• Йокоте К., Марголис Б., Хелдин С.Х., Клаессон-Уэлш Л. (ноябрь 1996 г.). «Grb7 является нижестоящим сигнальным компонентом альфа- и бета-рецепторов тромбоцитов фактора роста». Журнал биологической химии. 271 (48): 30942–9. Дои:10.1074 / jbc.271.48.30942. PMID  8940081.
• Танака С., Мори М., Акиёси Т., Танака Ю., Мафуне К., Жезлы Дж. Р., Сугимачи К. (январь 1997 г.). «Совместная экспрессия Grb7 с рецептором эпидермального фактора роста или Her2 / erbB2 при продвинутой карциноме пищевода человека». Исследования рака. 57 (1): 28–31. PMID  8988034.
• Джейн П. У., Лакманн М., Черч В. Б., Сандерсон Г. М., Сазерленд Р. Л., Дейли Р. Дж. (Март 1997 г.) «Структурные детерминанты взаимодействия между рецептором erbB2 и доменом гомологии Src 2 Grb7». Журнал биологической химии. 272 (13): 8490–7. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8490. PMID  9079677.
• Киши Т., Сасаки Х., Акияма Н., Исидзука Т., Сакамото Х., Айзава С., Сугимура Т., Терада М. (март 1997 г.). «Молекулярное клонирование человеческого GRB-7, коамплифицированного с CAB1 и c-ERBB-2 при первичном раке желудка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 232 (1): 5–9. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6218. PMID  9125150.
• Донг Л.К., Ду Х, Портер С.Г., Колаковски Л.Ф., Ли А.В., Мандарино Л.Дж., Фан Дж., Йи Д., Лю Ф., Мандарино Дж. (Ноябрь 1997 г.). «Клонирование, хромосомная локализация, экспрессия и характеристика Src-гомологии 2 и гомологии плекстрина-содержащего домена инсулинового рецептора связывающего белка hGrb10gamma». Журнал биологической химии. 272 (46): 29104–12. Дои:10.1074 / jbc.272.46.29104. PMID  9360986.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Фиддес Р.Дж., Кэмпбелл Д.Х., Джейн П.В., Сивертсен С.П., Сасаки Х., Уоллаш С., Дейли Р.Дж. (март 1998 г.). «Анализ рекрутирования Grb7 рецепторами erbB, активируемыми герегулином, показывает новую селективность мишени для erbB3». Журнал биологической химии. 273 (13): 7717–24. Дои:10.1074 / jbc.273.13.7717. PMID  9516479.
• Танака С., Мори М., Акиёси Т., Танака Ю., Мафуне К., Жезлы Дж. Р., Сугимачи К. (август 1998 г.). «Новый вариант человеческого Grb7 связан с инвазивной карциномой пищевода». Журнал клинических исследований. 102 (4): 821–7. Дои:10.1172 / JCI2921. ЧВК  508945. PMID  9710451.
• Тёммес К., Леннартссон Дж., Карлберг М., Рённстранд Л. (июль 1999 г.). «Идентификация Tyr-703 и Tyr-936 в качестве основных сайтов ассоциации для Grb2 и Grb7 в рецепторе фактора c-Kit / стволовых клеток». Биохимический журнал. 341 (1): 211–6. Дои:10.1042/0264-6021:3410211. ЧВК  1220349. PMID  10377264.
• Хан, округ Колумбия, Гуань Дж. Л. (август 1999 г.). «Ассоциация киназы фокальной адгезии с Grb7 и ее роль в миграции клеток». Журнал биологической химии. 274 (34): 24425–30. Дои:10.1074 / jbc.274.34.24425. PMID  10446223.
• Джонс Н., Мастер З., Джонс Дж., Бушар Д., Гунджи Ю., Сасаки Н., Дейли Р., Алитало К., Дюмон диджей (октябрь 1999 г.). «Идентификация партнеров связывания Tek / Tie2. Связывание с многофункциональным стыковочным участком опосредует выживание и миграцию клеток». Журнал биологической химии. 274 (43): 30896–905. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30896. PMID  10521483.
• Вайссьер Б., Залькман Дж., Маэ И., Мирей Дж., Лигенса Т., Вайднер К. М., Шарден П., Камонис Дж. (Февраль 2000 г.). «Взаимодействие адапторного белка Grb7 с Rnd1, новым членом семейства Rho». Письма FEBS. 467 (1): 91–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01530-6. PMID  10664463. S2CID  4901644.
• Kasus-Jacobi A, Béréziat V, Perdereau D, Girard J, Burnol AF (апрель 2000 г.). «Доказательства взаимодействия между рецептором инсулина и Grb7. Роль двух из его связывающих доменов, PIR и SH2». Онкоген. 19 (16): 2052–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1203469. PMID  10803466.
• Хан, округ Колумбия, Шэнь Т.Л., Гуань Д.Л. (сентябрь 2000 г.). «Роль нацеливания Grb7 на фокальные контакты и его фосфорилирование киназой фокальной адгезии в регуляции миграции клеток». Журнал биологической химии. 275 (37): 28911–7. Дои:10.1074 / jbc.M001997200. PMID  10893408.
• Ли Х., Волонте Д., Гальбиати Ф., Айенгар П., Люблин Д. М., Брегман Д. Б., Уилсон М. Т., Кампос-Гонсалес Р., Бузаза Б., Пестелл Р. Г., Шерер П. Э., Лисанти М. П. (ноябрь 2000 г.). «Конститутивное и регулируемое факторами роста фосфорилирование кавеолина-1 происходит в одном и том же сайте (Tyr-14) in vivo: идентификация сигнальной кассеты c-Src / Cav-1 / Grb7». Молекулярная эндокринология. 14 (11): 1750–75. Дои:10.1210 / мне.14.11.1750. PMID  11075810.
• Скотейм Р.И., Абелер В.М., Несланд Дж.М., Фосса С.Д., Холм Р., Вагнер У., Флоренес В.А., Аасс Н., Каллиониеми О.П., Лоте Р.А. (2003). «Гены-кандидаты на рак яичек, оцененные с помощью анализов экспрессии белка in situ на тканевых микроматрицах». Неоплазия. 5 (5): 397–404. Дои:10.1016 / с1476-5586 (03) 80042-8. ЧВК  1502610. PMID  14670177.

внешняя ссылка

• GRB7 + Адаптер + Белок в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)