Субъединица III цитохром с оксидазы - Cytochrome c oxidase subunit III

«COX3» перенаправляется сюда. Для изофермента циклооксигеназы см. СОХ-3.

COX3
Идентификаторы
Псевдонимы	COX3, COIII, MTCO3, субъединица III цитохром с оксидазы, цитохром с оксидаза III
Внешние идентификаторы	OMIM: 516050 MGI: 102502 ГомолоГен: 5014 Генные карты: COX3
Расположение гена (Мышь) Chr. Митохондриальная ДНК (мышь)[1] Группа н / д Начните 8,607 бп[1] Конец 9,390 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • цитохром-с оксидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • гем-медная терминальная оксидазная активность • активность электронного переноса • активная активность трансмембранного переносчика, управляемая оксидоредукцией Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • митохондриальная внутренняя мембрана • комплекс дыхательной цепи IV • мембрана • митохондрия • митохондриальный комплекс дыхательной цепи IV Биологический процесс • трансмембранный перенос ионов водорода • цепь аэробного транспорта электронов • комплекс IV дыхательной цепи • дыхательная цепь переноса электронов • транспорт электронов в митохондриях, цитохром с в кислород • аэробного дыхания • трансмембранный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4514	17710
Ансамбль	ENSG00000198938	ENSMUSG00000064358
UniProt	P00414	P00416
RefSeq (мРНК)	н / д	н / д
RefSeq (белок)	н / д	NP_904334
Расположение (UCSC)	н / д	Chr M: 0,01 - 0,01 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Расположение MT-CO3 ген в митохондриальном геноме человека. MT-CO3 является одним из трех митохондриальных генов субъединицы цитохром с оксидазы (оранжевые прямоугольники).

Субъединица III цитохром с оксидазы
Структура 13-субъединичной окисленной цитохром с оксидазы.[4]
Идентификаторы
Символ	COX3
Pfam	PF00510
ИнтерПро	IPR000298
PROSITE	PDOC50253
SCOP2	1occ / Объем / СУПФАМ
TCDB	3.D.4
OPM суперсемейство	4
Белок OPM	1v55
CDD	cd01665
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Субъединица III цитохром с оксидазы (COX3) является фермент что у людей кодируется MT-CO3 ген.^[5] Это один из главных трансмембранный подразделения цитохром с оксидаза. Субъединица III цитохром с оксидазы также является одной из трех митохондриальная ДНК (мтДНК) субъединицы (MT-CO1, MT-CO2, Т-CO3) из респираторный комплекс IV. Варианты MT-CO3 были связаны с изолированными миопатия, серьезный энцефаломиопатия, Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса IV и рецидивирующий миоглобинурия .^[6][7][8]

Структура

В MT-CO3 ген продуцирует белок 30 кДа, состоящий из 261 аминокислоты.^[9][10] COX3, белок, кодируемый этим геном, является членом цитохром с оксидаза субъединица 3 семейства. Этот белок расположен на внутренняя митохондриальная мембрана. COX3 - многопроходный трансмембранный белок: у человека он содержит 7 трансмембранные домены на позициях 15-35, 42-59, 81-101, 127-147, 159-179, 197-217 и 239-259.^[7][8]

Функция

Цитохром с оксидаза (EC 1.9.3.1 ) - конечный фермент дыхательной цепи митохондрии и многие аэробные бактерии. Он катализирует перенос электронов от восстановленного цитохрома с к молекулярному кислороду:

4 цитохром с⁺² + 4 часа⁺ + O₂ ${displaystyle ightleftharpoons }$ 4 цитохром с⁺³ + 2 часа₂О

Эта реакция связана с перекачкой четырех дополнительных протонов через митохондриальную или бактериальную мембрану.^[11][12]

Цитохром с оксидаза представляет собой олигомерный ферментный комплекс, расположенный во внутренней митохондриальной мембране эукариот и в плазматической мембране аэробных прокариот. Основная структура прокариотической и эукариотической цитохром с оксидазы содержит три общие субъединицы: я, II и III. У прокариот субъединицы I и III могут быть слиты, и иногда обнаруживается четвертая субъединица, тогда как у эукариот имеется различное количество дополнительных малых субъединиц.^[13]

Поскольку дыхательные системы бактерий разветвлены, они имеют ряд отдельных терминальных оксидаз, а не единственную цитохром с оксидазу, присутствующую в митохондриальных системах эукариот. Хотя цитохром ооксидазы не катализируют цитохром с, а катализируют окисление хинола (убихинола), они принадлежат к тому же суперсемейству гем-медь оксидаз, что и цитохром с оксидазы. Члены этого семейства имеют сходство последовательностей во всех трех основных субъединицах: субъединица I является наиболее консервативной субъединицей, тогда как субъединица II наименее сохранен.^[14][15][16]

Клиническое значение

Мутации в генах субъединиц цитохром с оксидазы, кодируемых мтДНК, были связаны с изолированными миопатия, серьезный энцефаломиопатия, Наследственная оптическая нейропатия Лебера, дефицит митохондриального комплекса IV и рецидивирующий миоглобинурия .^[6][7][8]

Наследственная оптическая нейропатия Лебера (LHON)

LHON - это наследственное заболевание по материнской линии, которое приводит к острой или подострой потере центрального зрения из-за оптический нерв дисфункция. У некоторых пациентов также были описаны дефекты сердечной проводимости и неврологические нарушения. LHON является результатом первичных мутаций митохондриальной ДНК, влияющих на комплексы дыхательной цепи. Мутации в позициях 9438 и 9804, которые приводят к глицин От -78 до серин и аланин От -200 до треонин аминокислота изменения, связанные с этим заболеванием.^[17][7][8]

Дефицит митохондриального комплекса IV (MT-C4D)

Дефицит комплекса IV (дефицит ЦОГ) - это нарушение митохондриальной дыхательной цепи с гетерогенными клиническими проявлениями, от изолированной миопатии до тяжелого мультисистемного заболевания, поражающего несколько тканей и органов. Особенности включают гипертрофическая кардиомиопатия, гепатомегалия и нарушение функции печени, гипотония, мышечная слабость, непереносимость упражнений, отставание в развитии, задержка моторного развития, умственная отсталость, молочная ацидемия, энцефалопатия, атаксия, и аритмия сердца. У некоторых пораженных людей наблюдается фатальная гипертрофическая кардиомиопатия, приводящая к неонатальной смерти, а у части пациентов проявляется Синдром Ли. Мутации G7970T и G9952A были связаны с этим заболеванием.^{[6][18][7][8]}

Рецидивирующая митохондриальная миоглобинурия (РМ-МТ)

Рецидивирующая миоглобинурия характеризуется повторяющимися приступами рабдомиолиз (некроз или распад скелетных мышц), связанный с мышечной болью и слабостью, с последующим выделением миоглобин в моче. Это было связано с дефицитом митохондриального комплекса IV.^[19][7][8]

Подсемейства

• Цитохром оубихинолоксидаза, субъединица III ИнтерПро: IPR014206
• Цитохром aa3 хинолоксидаза, субъединица III ИнтерПро: IPR014246

Взаимодействия

COX3 имеет 15 двоичных белок-белковые взаимодействия включая 8 ко-комплексных взаимодействий. COX3, по-видимому, взаимодействует с SNCA, KRAS, RAC1, и HSPB2.^[20]

использованная литература

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064358 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Мики К., Согабе С., Уно А., Эзоэ Т., Касаи Н., Саеда М., Мацуура Ю., Мики М. (май 1994 г.). «Применение автоматической процедуры молекулярного замещения для анализа кристаллической структуры цитохрома с2 из Rhodopseudomonas viridis». Acta Crystallographica Раздел D. 50 (Pt 3): 271–5. Дои:10.1107 / S0907444993013952. PMID  15299438.
5. «Ген Entrez: субъединица III цитохром с оксидазы COX3». Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
6. Horváth R, Schoser BG, Müller-Höcker J, Völpel M, Jaksch M, Lochmüller H (декабрь 2005 г.). «Мутации в генах субъединиц цитохром с оксидазы, кодируемых мтДНК, вызывающие изолированную миопатию или тяжелую энцефаломиопатию». Нервно-мышечные расстройства. 15 (12): 851–7. Дои:10.1016 / j.nmd.2005.09.005. PMID  16288875. S2CID  11683931.
7. «MT-CO3 - субъединица 3 цитохром с оксидазы - Homo sapiens (Человек) - ген и белок MT-CO3». www.uniprot.org. Получено 2018-08-21. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
8. «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК  5210571. PMID  27899622.
9. Яо, Даниэль. "Атлас кардиоорганических белков" База знаний (COPaKB) - Информация о белках ". amino.heartproteome.org. Архивировано из оригинал на 2018-08-22. Получено 2018-08-21.
10. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
11. Мишель Х (ноябрь 1999 г.). «Цитохром с оксидаза: каталитический цикл и механизмы протонной перекачки - обсуждение». Биохимия. 38 (46): 15129–40. Дои:10.1021 / bi9910934. PMID  10563795.
12. Белевич I, Верховский М.И., Викстрём М. (апрель 2006 г.). «Связанный с протонами перенос электронов приводит в действие протонный насос цитохром с оксидазы». Природа. 440 (7085): 829–32. Bibcode:2006Натура.440..829Б. Дои:10.1038 / природа04619. PMID  16598262. S2CID  4312050.
13. Mather MW, Springer P, Hensel S, Buse G, Fee JA (март 1993 г.). «Гены цитохромоксидазы из Thermus thermophilus. Нуклеотидная последовательность слитого гена и анализ выведенных первичных структур для субъединиц I и III цитохрома caa3». Журнал биологической химии. 268 (8): 5395–408. PMID  8383670.
14. Сантана М., Кунст Ф., Хулло М.Ф., Рапопорт Дж., Данчин А., Глейзер П. (май 1992 г.). «Молекулярное клонирование, секвенирование и физиологическая характеристика оперона qox из Bacillus subtilis, кодирующего хинолоксидазу аа3-600». Журнал биологической химии. 267 (15): 10225–31. PMID  1316894.
15. Chepuri V, Lemieux L, Au DC, Gennis RB (июль 1990 г.). «Последовательность цио-оперона указывает на существенное структурное сходство между цитохром-о-убихинолоксидазой Escherichia coli и семейством цитохром-с-оксидаз семейства аа3-типа». Журнал биологической химии. 265 (19): 11185–92. PMID  2162835.
16. Гарсия-Хорсман Дж. А., Баркера Б., Рамбли Дж., Ма Дж., Геннис Р. Б. (сентябрь 1994 г.). «Надсемейство респираторных оксидаз гем-медь». Журнал бактериологии. 176 (18): 5587–600. Дои:10.1128 / jb.176.18.5587-5600.1994. ЧВК  196760. PMID  8083153.
17. Johns DR, Neufeld MJ (октябрь 1993 г.). «Мутации цитохромоксидазы при наследственной оптической нейропатии Лебера». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 196 (2): 810–5. Дои:10.1006 / bbrc.1993.2321. PMID  8240356.
18. Ханна М.Г., Нельсон И.П., Рахман С., Лейн Р.Дж., Лэнд Дж., Хилес С., Купер М.Дж., Шапира А.Х., Морган-Хьюз Дж.А., Вуд Н.В. (июль 1998 г.). «Дефицит цитохром с оксидазы, связанный с первой точечной мутацией стоп-кодона в мтДНК человека». Американский журнал генетики человека. 63 (1): 29–36. Дои:10.1086/301910. ЧВК  1377234. PMID  9634511.
19. Кейтли Дж. А., Хоффбур К. К., Бертон, М. Д., Салас В. М., Джонстон В. С., Пенн А. М., Буист Н. Р., Кеннауэй Н. Г. (апрель 1996 г.). «Микроделеция в субъединице III цитохром с оксидазы (ЦОГ), связанная с дефицитом ЦОГ и рецидивирующей миоглобинурией». Природа Генетика. 12 (4): 410–6. Дои:10.1038 / ng0496-410. PMID  8630495. S2CID  13314201.
20. «По поисковому запросу COX3 найдено 2 бинарных взаимодействия». База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-21.

дальнейшее чтение

• Мораес С.Т., Андреетта Ф., Бонилла Э., Шанске С., ДиМауро С., Шон Э.А. (март 1991 г.). «Компетентная к репликации митохондриальная ДНК человека без промоторной области тяжелой цепи». Молекулярная и клеточная биология. 11 (3): 1631–7. Дои:10.1128 / MCB.11.3.1631. ЧВК  369459. PMID  1996112.
• Чомин А., Клитер М.В., Раган К.И., Райли М., Дулиттл Р.Ф., Аттарди Дж. (Октябрь 1986 г.). «URF6, последняя неопознанная рамка считывания мтДНК человека, кодирует субъединицу НАДН-дегидрогеназы». Наука. 234 (4776): 614–8. Bibcode:1986Наука ... 234..614C. Дои:10.1126 / science.3764430. PMID  3764430.
• Чомин А., Мариоттини П., Клитер М.В., Раган К.И., Мацуно-Яги А., Хатефи Ю., Дулиттл Р.Ф., Аттарди Г. (1985). «Шесть неопознанных рамок считывания митохондриальной ДНК человека кодируют компоненты НАДН-дегидрогеназы дыхательной цепи». Природа. 314 (6012): 592–7. Bibcode:1985Натура.314..592С. Дои:10.1038 / 314592a0. PMID  3921850. S2CID  32964006.
• Андерсон С., Банкир А.Т., Баррелл Б.Г., де Брейн М.Х., Коулсон А.Р., Друин Дж., Эперон И.К., Нирлих Д.П., Роу Б.А., Сэнгер Ф., Шрайер П.Х., Смит А.Дж., Стаден Р., Янг И.Г. (апрель 1981 г.). «Последовательность и организация митохондриального генома человека». Природа. 290 (5806): 457–65. Bibcode:1981Натура.290..457A. Дои:10.1038 / 290457a0. PMID  7219534. S2CID  4355527.
• Монтойя Дж., Охала Д., Аттарди Дж. (Апрель 1981 г.). «Отличительные особенности 5'-концевых последовательностей митохондриальных мРНК человека». Природа. 290 (5806): 465–70. Bibcode:1981Натура.290..465М. Дои:10.1038 / 290465a0. PMID  7219535. S2CID  4358928.
• Эндрюс Р.М., Кубака И., Чиннери П.Ф., Лайтаулерс Р.Н., Тернбулл Д.М., Хауэлл Н. (октябрь 1999 г.). «Повторный анализ и пересмотр кембриджской эталонной последовательности митохондриальной ДНК человека». Природа Генетика. 23 (2): 147. Дои:10.1038/13779. PMID  10508508. S2CID  32212178.
• Ingman M, Kaessmann H, Pääbo S, Gyllensten U (декабрь 2000 г.). «Вариации митохондриального генома и происхождение современного человека». Природа. 408 (6813): 708–13. Bibcode:2000Натура 408..708И. Дои:10.1038/35047064. PMID  11130070. S2CID  52850476.
• Мака-Мейер Н., Гонсалес А. М., Ларруга Дж. М., Флорес С., Кабрера В. М. (2003). «Основные геномные митохондриальные линии определяют раннюю экспансию человека». BMC Genetics. 2: 13. Дои:10.1186/1471-2156-2-13. ЧВК  55343. PMID  11553319.
• Херрнштадт С., Элсон Дж. Л., Фахи Е., Престон Дж., Тернбулл Д. М., Андерсон С., Гош С. С., Олефски Дж. М., Бил М. Ф., Дэвис Р. Е., Хауэлл Н. (май 2002 г.). «Анализ методом редуцированной медианной сети полных последовательностей кодирующей области митохондриальной ДНК для основных африканских, азиатских и европейских гаплогрупп». Американский журнал генетики человека. 70 (5): 1152–71. Дои:10.1086/339933. ЧВК  447592. PMID  11938495.
• Silva WA, Bonatto SL, Holanda AJ, Ribeiro-Dos-Santos AK, Paixão BM, Goldman GH, Abe-Sandes K, Rodriguez-Delfin L, Barbosa M, Paçó-Larson ML, Petzl-Erler ML, Valente V, Santos SE , Заго М.А. (июль 2002 г.). «Разнообразие митохондриального генома коренных американцев поддерживает единственное раннее проникновение популяций основателей в Америку». Американский журнал генетики человека. 71 (1): 187–92. Дои:10.1086/341358. ЧВК  384978. PMID  12022039.
• Элкон Х, Дон Дж, Меламед Э, Зив И, Ширван А, Оффен Д. (июнь 2002 г.). «Мутантный альфа-синуклеин и альфа-синуклеин дикого типа взаимодействуют с митохондриальной цитохром С-оксидазой». Журнал молекулярной неврологии. 18 (3): 229–38. Дои:10.1385 / JMN: 18: 3: 229. PMID  12059041. S2CID  42265181.
• Мишмар Д., Руис-Песини Е., Голик П., Маколей В., Кларк А.Г., Хоссейни С., Брэндон М., Исли К., Чен Е., Браун М.Д., Сукерник Р.И., Олкерс А., Уоллес, округ Колумбия (январь 2003 г.). «Естественный отбор сформировал региональные вариации мтДНК у людей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (1): 171–6. Bibcode:2003ПНАС..100..171М. Дои:10.1073 / pnas.0136972100. ЧВК  140917. PMID  12509511.
• Ingman M, Gyllensten U (июль 2003 г.). «Вариации митохондриального генома и история эволюции аборигенов Австралии и Новой Гвинеи». Геномные исследования. 13 (7): 1600–6. Дои:10.1101 / гр.686603. ЧВК  403733. PMID  12840039.
• Kong QP, Yao YG, Sun C, Bandelt HJ, Zhu CL, Zhang YP (сентябрь 2003 г.). «Филогения линий митохондриальной ДНК Восточной Азии, выведенная из полных последовательностей». Американский журнал генетики человека. 73 (3): 671–6. Дои:10.1086/377718. ЧВК  1180693. PMID  12870132.
• Temperley RJ, Seneca SH, Tonska K, Bartnik E, Bindoff LA, Lightowlers RN, Chrzanowska-Lightowlers ZM (сентябрь 2003 г.). «Исследование микроделеции патогенной мтДНК показывает трансляционно-зависимый путь распада деаденилирования в митохондриях человека». Молекулярная генетика человека. 12 (18): 2341–8. Дои:10.1093 / hmg / ddg238. PMID  12915481.
• Мака-Мейер Н., Гонсалес А.М., Пестано Дж., Флорес С., Ларруга Дж. М., Кабрера В.М. (октябрь 2003 г.). «Транзит митохондриальной ДНК между Западной Азией и Северной Африкой, выведенный из филогеографии U6». BMC Genetics. 4: 15. Дои:10.1186/1471-2156-4-15. ЧВК  270091. PMID  14563219.
• Coble MD, Just RS, O'Callaghan JE, Letmanyi IH, Peterson CT, Irwin JA, Parsons TJ (июнь 2004 г.). «Однонуклеотидные полиморфизмы по всему геному мтДНК, повышающие эффективность судебно-медицинских исследований у кавказцев». Международный журнал судебной медицины. 118 (3): 137–46. Дои:10.1007 / s00414-004-0427-6. PMID  14760490. S2CID  8413730.
• Palanichamy MG, Sun C, Agrawal S, Bandelt HJ, Kong QP, Khan F, Wang CY, Chaudhuri TK, Palla V, Zhang YP (декабрь 2004 г.). «Филогения макрогаплогруппы N митохондриальной ДНК в Индии, основанная на полном секвенировании: значение для населения Южной Азии». Американский журнал генетики человека. 75 (6): 966–78. Дои:10.1086/425871. ЧВК  1182158. PMID  15467980.
• Стариковская Е.Б., Сукерник Р.И., Дербенева О.А., Володко Н.В., Руис-Песини Э., Торрони А., Браун М.Д., Лотт М.Т., Хоссейни С.Х., Хуопонен К., Уоллес, округ Колумбия (январь 2005 г.). «Разнообразие митохондриальной ДНК в коренных популяциях южной части Сибири и происхождение гаплогрупп коренных американцев». Анналы генетики человека. 69 (Pt 1): 67–89. Дои:10.1046 / j.1529-8817.2003.00127.x. ЧВК  3905771. PMID  15638829.
• Раджкумар Р., Банерджи Дж., Гунтури Х.Б., Триведи Р., Кашьяп В.К. (апрель 2005 г.). «Филогения и древность макрогаплогруппы М, выведенная из полной последовательности ДНК mt индийских конкретных линий». BMC Эволюционная биология. 5: 26. Дои:10.1186/1471-2148-5-26. ЧВК  1079809. PMID  15804362.

внешние ссылки

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о митохондриальном ДНК-ассоциированном синдроме Ли и NARP

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.