Трансмембранный домен - Transmembrane domain
 | эта статья нужны дополнительные цитаты для проверка. (Сентябрь 2014 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
Трансмембранный домен обычно обозначает трансмембранный сегмент одиночного альфа-спираль из трансмембранный белок.[1] В более широком смысле трансмембранный домен - это любой мембранный домен. белковый домен.
Идентификация трансмембранных спиралей
Трансмембранные спирали видны в структурах мембранных белков, определяемых дифракция рентгеновских лучей. Их также можно предсказать на основе шкалы гидрофобности. Потому что интерьер двухслойный а внутренняя часть большинства белков известной структуры гидрофобный предполагается, что аминокислоты, покрывающие мембрану, должны быть также гидрофобными. Однако, мембранные насосы и ионные каналы также содержат многочисленные заряженные и полярные остатки в неполярных трансмембранных сегментах.
С помощью анализ гидрофобности прогнозирование трансмембранных спиралей позволяет прогнозировать, в свою очередь, «трансмембранная топология» протеина; то есть предсказание того, какие ее части выступают в клетку, какие выступают наружу и сколько раз белковая цепь пересекает мембрану.
Примеры
- Тетраспанины имеют 4 консервативных трансмембранных домена.
использованная литература
- ^ Хейли Дж. Шарп; Тим Дж. Стивенс; Шон Манро (9 июля 2010 г.). «Комплексное сравнение трансмембранных доменов раскрывает специфические свойства органелл». Ячейка. 142 (1): 158–169. Дои:10.1016 / j.cell.2010.05.037. ЧВК 2928124. PMID 20603021.