SLC22A5 - SLC22A5

SLC22A5
Идентификаторы
Псевдонимы	SLC22A5, CDSP, OCTN2, семейство переносчиков растворенных веществ 22, член 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 603377 MGI: 1329012 ГомолоГен: 68295 Генные карты: SLC22A5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q31.1 Начинать 132,369,752 бп[1] Конец 132,395,614 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B1.3 | 11 32.02 см Начинать 53,864,542 бп[2] Конец 53,891,660 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание домена PDZ • GO: 0022891 активность трансмембранного переносчика • транспортная деятельность • катион: антипортерная активность катионов • GO: 0001948 связывание с белками • активность трансмембранного переносчика четвертичных аммониевых групп • симпортерная активность • Связывание АТФ • GO: 0015238 Активность переносчика ксенобиотиков • активность трансмембранного переносчика органических анионов • активность трансмембранного переносчика карнитина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • щеточная мембрана • апикальная плазматическая мембрана • внеклеточная экзосома Биологический процесс • транспорт ионов натрия • транспорт группы четвертичного аммония • ионный транспорт • транспортировка наркотиков • натрийзависимый перенос органических катионов • положительная регуляция поддержания структуры эпителия кишечника • карнитин транспорт • метаболический процесс карнитина • трансмембранный транспорт лекарств • трансмембранный транспорт • перенос органических анионов • трансмембранный транспорт карнитина • транспорт • ксенобиотический транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6584	20520
Ансамбль	ENSG00000197375	ENSMUSG00000018900
UniProt	O76082	Q9Z0E8
RefSeq (мРНК)	NM_001308122 NM_003060	NM_011396 NM_001362711 NM_001362712
RefSeq (белок)	NP_001295051 NP_003051	NP_035526 NP_001349640 NP_001349641
Расположение (UCSC)	Chr 5: 132,37 - 132,4 Мб	Chr 11: 53,86 - 53,89 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SLC22A5 это мембранный транспортный белок связана с первичный дефицит карнитина. Этот белок участвует в активном поглощении клетками карнитин. Он действует как сторонник, перемещение натрия ионы и другие органические катионы через мембрану вместе с карнитином. Такой полиспецифический переносчики органических катионов в печени, почках, кишечнике и других органах имеют решающее значение для удаления многих эндогенных малых органических катионов, а также широкого спектра лекарств и токсинов окружающей среды.^[5] Мутации в SLC22A5 генная причина системный первичный дефицит карнитина, что может привести к сердечная недостаточность.^[6]

Структура

В SLC22A5 ген, содержащий 10 экзонов,^[7] расположен на q плече хромосома 5 в позиции 31.1 и охватывает 25 910 пар оснований.^[5] Ген производит белок 63 кДа, состоящий из 557 аминокислоты.^[8][9] Белок имеет 12 предполагаемых трансмембранные домены с длинной внеклеточной петлей из 107 аминокислот между первыми двумя трансмембранными доменами и внутриклеточной петлей между четвертым и пятым трансмембранными доменами. Эта длинная внеклеточная петля имеет три потенциальных сайта для N-гликозилирование, а внутриклеточная петля имеет Мотив связывания АТФ / ГТФ. В предполагаемых внутриклеточных доменах есть пять потенциальных сайтов для протеинкиназа С-зависимая фосфорилирование и один для протеинкиназа А-зависимое фосфорилирование.^[10]

Функция

В SLC22A5 генные коды для плазмы интегральный мембранный белок который функционирует как переносчик органических катионов и натрий-зависимое высокое сродство карнитин транспортер.^[5] Кодируемый белок участвует в активном поглощении клетками карнитина, транспортируя его. ион натрия с одной молекулой карнитина. Органические катионы, переносимые этим белком, включают: тетраэтиламмоний (TEA) без участия натрия. Относительное отношение активности поглощения карнитина к TEA составляет 11,3.^[11]

Клиническое значение

Главный фенотипический эффект аутосомно-рецессивных мутаций, либо составной гетерозиготный или же гомозиготный,^[6] в SLC22A5 ген системный первичный дефицит карнитина,^[7] характеризуется нарушением транспорта карнитина, истощением карнитина в моче, низким уровнем карнитина в сыворотке, сниженным внутриклеточным накоплением карнитина, нарушением бета-окисление, и цитозольный жирная кислота накопление.^[6] У пациентов часто наблюдается метаболическая декомпенсация, гипокетотическая гипогликемия, печеночная энцефалопатия, Синдром Рейе, и внезапная смерть младенца в первый год, с последующим наступлением кардиомиопатия или же скелетный миопатия, аритмии, мышечная слабость и сердечная недостаточность в раннем детстве.^[6][12][13] Пациенты могут быть бессимптомный, около 70% бессимптомных пациентов имеют миссенс-мутация или же удаление в кадре; бессмысленная мутация частота увеличивается у симптомных пациентов.^[14] Симптомы и исход заболевания можно значительно улучшить с помощью заместительной терапии L-карнитином.^[15] По оценкам, частота первичного дефицита карнитина у новорожденных составляет около 1 на 40 000.^[16]

Взаимодействия

SLC22A5 взаимодействует с ПДЗК1.^[11]

Смотрите также

• Семейство носителей растворенных веществ

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197375 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018900 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: семейство 22 переносчиков растворенных веществ SLC22A5 (переносчик органических катионов), член 5». Получено 2018-07-25.
6. Lahrouchi N, Lodder EM, Mansouri M, Tadros R, Zniber L, Adadi N, Clur SB, van Spaendonck-Zwarts KY, Postma AV, Sefiani A, Ratbi I, Bezzina CR (июнь 2017 г.). «Секвенирование экзома выявляет первичный дефицит карнитина в семье с кардиомиопатией и внезапной смертью». Европейский журнал генетики человека. 25 (6): 783–787. Дои:10.1038 / ejhg.2017.22. ЧВК  5477358. PMID  28295041.
7. Интернет-Менделирующее наследование в человеке, OMIM®. Университет Джона Хопкинса, Балтимор, Мэриленд. Номер MIM: {603377}: {29.04.2015}:. URL-адрес в Интернете: https://omim.org/
8. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
9. "SLC22A5 - Семейство 22 носителей растворенного вещества, член 5". Атлас кардиоорганических белков (COPaKB).
10. Ву X, Прасад П.Д., Лейбах Ф.Х., Ганапати V (май 1998 г.). «Последовательность кДНК, транспортная функция и геномная организация человеческого OCTN2, нового члена семейства органических переносчиков катионов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 246 (3): 589–95. Дои:10.1006 / bbrc.1998.8669. PMID  9618255.
11. "SLC22A5 - член 5 семейства 22 носителей растворенного вещества - Homo sapiens (человек) - ген и белок SLC22A5". www.uniprot.org. Получено 2018-07-25.
12. Йилмаз Т.Ф., Атай М., Топрак Х., Гюлер С., Араласмак А., Алкан А. (10.03.2014). «Результаты МРТ при энцефалопатии с первичным дефицитом карнитина: отчет о болезни». Журнал нейровизуализации. 25 (2): 325–328. Дои:10.1111 / jon.12102. PMID  24612242. S2CID  35640542.
13. Мадзини М., Тадрос Т., Сивик Д., Джозеф Л., Бристоу М., Цинь Ф., Коэн Р., Монахан К., Кляйн М., Колуччи В. (2011). «Первичный дефицит карнитина и внезапная смерть: доказательства in vivo перекисного окисления липидов миокарда и сульфонилирования кальциевой АТФазы 2 саркоэндоплазматического ретикулума». Кардиология. 120 (1): 52–8. Дои:10.1159/000333127. PMID  22116472. S2CID  207687571.
14. Юн Я., Ли DH, Ки С.С., Ли С.И., Ким Дж.В., Ли Ю.В., Пак HD (2012). «Мутации SLC22A5 у пациента с системным первичным дефицитом карнитина: первый случай в Корее, подтвержденный биохимическими и молекулярными исследованиями». Анналы клинической и лабораторной науки. 42 (4): 424–8. PMID  23090741.
15. Агнетти А., Биттон Л., Чана Б., Раймонд А., Карано Н. (январь 2013 г.). «Первичная карнитиновая недостаточность дилатационной кардиомиопатии: наблюдение через 28 лет». Международный журнал кардиологии. 162 (2): e34–5. Дои:10.1016 / j.ijcard.2012.05.038. PMID  22658351.
16. Коидзуми А., Нодзаки Дж., Охура Т., Кайо Т., Вада Й, Незу Дж., Охаши Р., Тамай И., Сёдзи И., Такада Дж., Кибира С., Мацуиси Т., Цудзи А. (ноябрь 1999 г.). «Генетическая эпидемиология гена транспортера карнитина OCTN2 в японской популяции и фенотипическая характеристика в японских родословных с первичным системным дефицитом карнитина». Молекулярная генетика человека. 8 (12): 2247–54. Дои:10.1093 / hmg / 8.12.2247. PMID  10545605.

дальнейшее чтение

• Ascunce RR, Nayar AC, Phoon CK, Srichai MB (2013). «Результаты магнитного резонанса сердца при дефиците карнитина». Журнал Техасского института сердца. 40 (1): 104–5. ЧВК  3568278. PMID  23468586.
• Erguven M, Yilmaz O, Koc S, Caki S, Ayhan Y, Donmez M, Dolunay G (2007). «Случай ранней диагностики дефицита карнитина с респираторными симптомами». Анналы питания и метаболизма. 51 (4): 331–4. Дои:10.1159/000107675. PMID  17726310. S2CID  40574037.
• Hwu WL, Chien YH, Tang NL, Law LK, Lin CY, Lee NC (октябрь 2007 г.). «Дефицит переносчика карнитина (OCTN2) с частичным дефицитом N-ацетилглутаматсинтазы (NAGS)». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 30 (5): 816. Дои:10.1007 / s10545-007-0594-у. PMID  17703373. S2CID  2764651.
• Makhseed N, Vallance HD, Potter M, Waters PJ, Wong LT, Lillquist Y, Pasquali M, Amat di San Filippo C, Longo N (2004). «Дефект транспортера карнитина из-за новой мутации в гене SLC22A5, проявляющейся периферической невропатией». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 27 (6): 778–80. Дои:10.1023 / B: BOLI.0000045837.23328.f4. PMID  15617188. S2CID  24144621.
• Kinali M, Olpin SE, Clayton PT, Daubeney PE, Mercuri E, Manzur AY, Tein I, Leonard J, Muntoni F (2004). «Диагностические трудности в случае первичной системной недостаточности карнитина с идиопатической дилатационной кардиомиопатией». Европейский журнал детской неврологии. 8 (4): 217–9. Дои:10.1016 / j.ejpn.2004.03.007. PMID  15261886.
• Kinali M, Olpin SE, Clayton PT, Daubeney PE, Mercuri E, Manzur AY, Tein I, Leonard J, Muntoni F (2004). «Диагностические трудности в случае первичной системной недостаточности карнитина с идиопатической дилатационной кардиомиопатией». Европейский журнал детской неврологии. 8 (4): 217–9. Дои:10.1016 / j.ejpn.2004.03.007. PMID  15261886.
• Сильверберг М.С. (июнь 2006 г.). «OCTNs: пожалуйста, встанет ли настоящий ген IBD5?». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 12 (23): 3678–81. Дои:10.3748 / wjg.v12.i23.3678. ЧВК  4087460. PMID  16773684.
• Мацуиси Т., Хирата К., Терасава К., Като Х., Ёсино М., Отаки Э., Хиросе Ф., Нонака И., Сугияма Н., Охта К. (февраль 1985 г.). «Успешное лечение карнитином двух братьев и сестер с миопатией накопления липидов с гипертрофической кардиомиопатией». Нейропедиатрия. 16 (1): 6–12. Дои:10.1055 / с-2008-1052536. PMID  3974805.
• Ву X, Прасад П.Д., Лейбах Ф.Х., Ганапати V (май 1998 г.). «Последовательность кДНК, транспортная функция и геномная организация человеческого OCTN2, нового члена семейства органических переносчиков катионов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 246 (3): 589–95. Дои:10.1006 / bbrc.1998.8669. PMID  9618255.
• Сёдзи Ю., Коидзуми А., Кайо Т., Охата Т., Такахаши Т., Харада К., Такада Г. (июль 1998 г.). «Доказательства связи первичной системной недостаточности карнитина у человека с D5S436: новым локусом гена на хромосоме 5q». Американский журнал генетики человека. 63 (1): 101–8. Дои:10.1086/301911. ЧВК  1377235. PMID  9634512.
• Тамай И., Охаши Р., Нэдзу Дж., Ябуучи Х., Оку А., Симанэ М., Сай Й., Цудзи А. (август 1998 г.). «Молекулярная и функциональная идентификация натрий-зависимого высокоаффинного переносчика карнитина человека OCTN2». Журнал биологической химии. 273 (32): 20378–82. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20378. PMID  9685390.
• Nezu J, Tamai I, Oku A, Ohashi R, Yabuuchi H, Hashimoto N, Nikaido H, Sai Y, Koizumi A, Shoji Y, Takada G, Matsuishi T, Yoshino M, Kato H, Ohura T, Tsujimoto G, Hayakawa J , Симанэ М., Цудзи А. (январь 1999 г.). «Первичный системный дефицит карнитина вызван мутациями в гене, кодирующем зависимый от ионов натрия переносчик карнитина». Природа Генетика. 21 (1): 91–4. Дои:10.1038/5030. PMID  9916797. S2CID  20723174.
• Тан Н.Л., Ганапати В., Ву Х, Хуэй Дж., Сет П., Юэн П.М., Вандерс Р.Дж., Фок Т.Ф., Хьелм Н.М. (апрель 1999 г.). «Мутации OCTN2, органического переносчика катионов / карнитина, приводят к недостаточному поглощению клеточного карнитина при первичном дефиците карнитина». Молекулярная генетика человека. 8 (4): 655–60. Дои:10,1093 / hmg / 8.4.655. PMID  10072434.
• Бурвинкель Б., Кройдер Дж., Швейцер С., Воргерд М., Гемпель К., Гербиц К.Д., Килиманн М.В. (август 1999 г.). «Мутации переносчика карнитина OCTN2 при системном первичном дефиците карнитина: новая мутация Arg169Gln и повторяющаяся мутация Arg282ter, связанная с нетрадиционной аномалией сплайсинга». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 261 (2): 484–7. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1060. PMID  10425211.
• Ву X, Хуанг В., Прасад П.Д., Сет П., Раджан Д.П., Лейбах Ф.Х., Чен Дж., Конвей С.Дж., Ганапати V (сентябрь 1999 г.). «Функциональные характеристики и характер распределения в тканях переносчика органических катионов 2 (OCTN2), переносчика органических катионов / карнитина». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 290 (3): 1482–92. PMID  10454528.
• Vaz FM, Scholte HR, Ruiter J, Hussaarts-Odijk LM, Pereira RR, Schweitzer S, de Klerk JB, Waterham HR, Wanders RJ (1999). «Идентификация двух новых мутаций в OCTN2 у трех пациентов с системным дефицитом карнитина». Генетика человека. 105 (1–2): 157–61. Дои:10.1007 / s004390051079. PMID  10480371.
• Коидзуми А., Нодзаки Дж., Охура Т., Кайо Т., Вада Й, Незу Дж., Охаши Р., Тамай И., Сёдзи И., Такада Дж., Кибира С., Мацуиси Т., Цудзи А. (ноябрь 1999 г.). «Генетическая эпидемиология гена транспортера карнитина OCTN2 в японской популяции и фенотипическая характеристика в японских родословных с первичным системным дефицитом карнитина». Молекулярная генетика человека. 8 (12): 2247–54. Дои:10.1093 / hmg / 8.12.2247. PMID  10545605.
• Сет П., Ву X, Хуанг В., Лейбах Ф. Х., Ганапати V (ноябрь 1999 г.). «Мутации в новом переносчике органических катионов (OCTN2), переносчике органических катионов / карнитина, с различными эффектами на функцию транспорта органических катионов и функцию транспорта карнитина». Журнал биологической химии. 274 (47): 33388–92. Дои:10.1074 / jbc.274.47.33388. PMID  10559218.
• Маятепек Э., Незу Дж., Тамай И., Оку А., Кацура М., Симанэ М., Цудзи А. (январь 2000 г.). «Две новые миссенс-мутации гена OCTN2 (W283R и V446F) у пациента с первичным системным дефицитом карнитина». Человеческая мутация. 15 (1): 118. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200001) 15: 1 <118 :: AID-HUMU28> 3.0.CO; 2-8. PMID  10612840.
• Ван И, Келли М.А., Коуэн TM, Лонго Н. (2000). «Миссенс-мутация в гене OCTN2, связанная с остаточной транспортной активностью карнитина». Человеческая мутация. 15 (3): 238–45. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200003) 15: 3 <238 :: AID-HUMU4> 3.0.CO; 2-3. PMID  10679939.
• Охаши Р., Тамай И., Инано А., Кацура М., Сай Й., Незу Дж., Цудзи А. (сентябрь 2002 г.). «Исследования функциональных сайтов органического переносчика катионов / карнитина OCTN2 (SLC22A5) с использованием мутантного белка Ser467Cys». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 302 (3): 1286–94. Дои:10.1124 / jpet.102.036004. PMID  12183691. S2CID  1944987.
• Rahbeeni Z, Vaz FM, Al-Hussein K, Bucknall MP, Ruiter J, Wanders RJ, Rashed MS (сентябрь 2002 г.). «Идентификация двух новых мутаций в OCTN2 от двух саудовских пациентов с системным дефицитом карнитина». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 25 (5): 363–9. Дои:10.1023 / А: 1020143632011. PMID  12408185. S2CID  25824831.
• Элимрани И., Ладжоджи К., Сейдман Э., Рой М.Дж., Митчелл Г.А., Куреши И. (май 2003 г.). «Экспрессия и локализация органического переносчика катионов / карнитина OCTN2 в клетках Caco-2». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени. 284 (5): G863–71. Дои:10.1152 / ajpgi.00220.2002. PMID  12684216.
• Karlic H, Lohninger A, Laschan C, Lapin A, Böhmer F, Huemer M, Guthann E, Rappold E, Pfeilstöcker M (июль 2003 г.). «Подавление карнитин-ацилтрансфераз и переносчика органических катионов OCTN2 в мононуклеарных клетках у здоровых пожилых людей и пациентов с миелодиспластическими синдромами». Журнал молекулярной медицины. 81 (7): 435–42. Дои:10.1007 / s00109-003-0447-6. PMID  12802501. S2CID  10992930.
• Амат ди Сан Филиппо С., Ван И, Лонго Н. (ноябрь 2003 г.). «Функциональные домены в транспортере карнитина OCTN2, дефектные по первичной недостаточности карнитина». Журнал биологической химии. 278 (48): 47776–84. Дои:10.1074 / jbc.M307911200. PMID  14506273.

внешняя ссылка

• SLC22A5 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Первичный дефицит карнитина (база данных OCTN2)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.