IFNAR2 - IFNAR2

IFNAR2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Н6У, 1Н6В, 2HYM, 2KZ1, 2LAG, 3S8W, 3S9D, 3SE3, 3SE4
Идентификаторы
Псевдонимы	IFNAR2, IFN-R, IFN-альфа-REC, IFNABR, IFNARB, IMD45, интерферон альфа и бета субъединица рецептора 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602376 MGI: 1098243 ГомолоГен: 49242 Генные карты: IFNAR2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.11 Начинать 33,229,901 бп[1] Конец 33,265,675 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 C3.3 | 16 52,82 см Начинать 91,372,783 бп[2] Конец 91,405,589 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание интерферона I типа • связывание протеинкиназы • активность рецепторов интерферона I типа • активность рецепторов цитокинов Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • внеклеточная область • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • мембрана • внутриклеточный • внеклеточный Биологический процесс • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • ответ на вирус • Каскад JAK-STAT • регуляция опосредованного интерфероном сигнального пути I типа • сигнальный путь интерферона I типа • ответ на интерферон-альфа • ответ на интерферон-бета • защитный ответ на вирус • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3455	15976
Ансамбль	ENSG00000159110	ENSMUSG00000022971
UniProt	P48551	O35664
RefSeq (мРНК)	NM_207585 NM_000874 NM_001289125 NM_001289126 NM_001289128 NM_207584	NM_001110498 NM_010509 NM_001347258
RefSeq (белок)	NP_000865 NP_001276054 NP_001276055 NP_001276057 NP_997467 NP_997468	NP_001103968 NP_001334187 NP_034639
Расположение (UCSC)	Chr 21: 33,23 - 33,27 Мб	Chr 16: 91.37 - 91.41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-цепь рецептора интерферона-альфа / бета это белок что у людей кодируется IFNAR2 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой мембранный белок типа I, который образует одну из двух цепей рецептора интерферонов альфа и бета. Связывание и активация рецептора стимулирует протеинкиназы Janus, которые, в свою очередь, фосфорилируют несколько белков, включая STAT1 и STAT2. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих по крайней мере две разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

IFNAR2 был показан взаимодействовать с:

• GNB2L1,^[7][8]
• IFNA2,^[9]
• STAT1,^[7][10] и
• STAT2.^[10][11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000159110 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022971 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Новик Д., Коэн Б., Рубинштейн М. (июнь 1994 г.). «Рецептор альфа / бета интерферона человека: характеристика и молекулярное клонирование». Клетка. 77 (3): 391–400. Дои:10.1016/0092-8674(94)90154-6. PMID  8181059. S2CID  140206806.
6. «Ген Энтреза: рецептор интерферона 2 IFNAR2 (альфа, бета и омега)».
7. Усачева А., Смит Р., Миншалл Р., Байда Г., Сенг С., Кроз Е., Коламоничи О. (июнь 2001 г.). «Белковый рецептор, содержащий мотив WD для активированной протеинкиназы C (RACK1), необходим для набора и активации сигнального преобразователя и активатора транскрипции 1 через рецептор интерферона I типа». J. Biol. Chem. 276 (25): 22948–53. Дои:10.1074 / jbc.M100087200. PMID  11301323.
8. Кроуз Э., Усачева А., Асарнов Д., Миншалл Р.Д., Перес Х.Д., Коламоничи О. (ноябрь 2000 г.). «Рецептор для активированной C-киназы (RACK-1), белка, содержащего мотив WD, специфически связывается с рецептором IFN типа I человека». J. Immunol. 165 (9): 5127–32. Дои:10.4049 / jimmunol.165.9.5127. PMID  11046044.
9. Пилер Дж, Шрайбер Дж (май 1999 г.). «Биофизический анализ взаимодействия человеческого ifnar2, экспрессированного в E. coli, с IFNalpha2». J. Mol. Биол. 289 (1): 57–67. Дои:10.1006 / jmbi.1999.2726. PMID  10339405.
10. Ли X, Леунг С., Керр И.М., Старк Г.Р. (апрель 1997 г.). «Функциональные субдомены STAT2, необходимые для преассоциации с рецептором альфа-интерферона и для передачи сигналов». Мол. Клетка. Биол. 17 (4): 2048–56. Дои:10.1128 / mcb.17.4.2048. ЧВК  232052. PMID  9121453.
11. Нгуен В.П., Салех А.З., Арч А.Е., Ян Х., Пьяцца Ф., Ким Дж., Кролевски Дж. Дж. (Март 2002 г.). «Связывание Stat2 с субъединицей 2 рецептора интерферона-альфа не требуется для передачи сигналов интерферона-альфа». J. Biol. Chem. 277 (12): 9713–21. Дои:10.1074 / jbc.M111161200. PMID  11786546.

дальнейшее чтение

• Каралья М., Марра М., Пелаиа Дж., Маселли Р., Капути М., Марсико С.А., Аббруззезе А. (2005). «Альфа-интерферон и его влияние на пути передачи сигнала». J. Cell. Физиол. 202 (2): 323–35. Дои:10.1002 / jcp.20137. PMID  15389589. S2CID  4833543.
• Раз Р., Чунг К., Линг Л., Леви Д.Е. (1995). «Три различных локуса на хромосоме 21 человека способствуют реакции на интерферон-альфа / бета». Сомат. Cell Mol. Genet. 21 (2): 139–45. Дои:10.1007 / BF02255789. PMID  7570186. S2CID  972314.
• Lutfalla G, Holland SJ, Cinato E, Monneron D, Reboul J, Rogers NC, Smith JM, Stark GR, Gardiner K, Mogensen KE (1995). «Мутантные клетки U5A дополняются субъединицей рецептора интерферона-альфа бета, генерируемой альтернативным процессингом нового члена кластера генов рецепторов цитокинов». EMBO J. 14 (20): 5100–8. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00192.x. ЧВК  394613. PMID  7588638.
• Domanski P, Witte M, Kellum M, Rubinstein M, Hackett R, Pitha P, Colamonici OR (1995). «Клонирование и экспрессия длинной формы бета-субъединицы бета-рецептора интерферона альфа, которая необходима для передачи сигналов». J. Biol. Chem. 270 (37): 21606–11. Дои:10.1074 / jbc.270.37.21606. PMID  7665574.
• Новик Д., Коэн Б., Таль Н., Рубинштейн М. (1995). «Растворимые и заякоренные в мембране формы человеческого рецептора IFN-альфа / бета». J. Leukoc. Биол. 57 (5): 712–8. Дои:10.1002 / jlb.57.5.712. PMID  7759950.
• Platanias LC, Uddin S, Domanski P, Colamonici OR (1996). «Различия в передаче сигналов интерферона альфа и бета. Бета интерферона избирательно индуцирует взаимодействие субъединиц альфа и бетаL рецептора интерферона типа I.». J. Biol. Chem. 271 (39): 23630–3. Дои:10.1074 / jbc.271.39.23630. PMID  8798579.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Croze E, Russell-Harde D, Wagner TC, Pu H, Pfeffer LM, Perez HD (1996). "Рецептор интерферона человека типа I. Идентификация фосфопротеина, связанного с рецептором интерферона бета". J. Biol. Chem. 271 (52): 33165–8. Дои:10.1074 / jbc.271.52.33165. PMID  8969169.
• Ли X, Леунг С., Керр И.М., Старк Г.Р. (1997). «Функциональные субдомены STAT2, необходимые для преассоциации с рецептором альфа-интерферона и для передачи сигналов». Мол. Клетка. Биол. 17 (4): 2048–56. Дои:10.1128 / mcb.17.4.2048. ЧВК  232052. PMID  9121453.
• Пилер Дж, Шрайбер Дж (1999). «Биофизический анализ взаимодействия человеческого ifnar2, экспрессированного в E. coli, с IFNalpha2». J. Mol. Биол. 289 (1): 57–67. Дои:10.1006 / jmbi.1999.2726. PMID  10339405.
• Чунтарапай А., Гиббс В., Лу Дж., Ой А., Марстерс С., Ашкенази А., Де Вос А., Джин Ким К. (1999). «Определение остатков, участвующих в связывании лиганда и передаче сигнала в человеческом IFN-альфа рецепторе 2». J. Immunol. 163 (2): 766–73. PMID  10395669.
• Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д., Ватанабэ Х., Яда Т., Парк Х.С., Тойода А., Исии К., Тотоки Ю., Чой Д.К., Гронер И., Соеда Э, Оки М., Такаги Т., Сакаки Ю., Таудиен С., Блехшмидт К. , Polley A, Menzel U, Delabar J, Kumpf K, Lehmann R, Patterson D, Reichwald K, Rump A, Schillhabel M, Schudy A, Zimmermann W, Rosenthal A, Kudoh J, Schibuya K, Kawasaki K, Asakawa S, Shintani A, Sasaki T, Nagamine K, Mitsuyama S, Antonarakis SE, Minoshima S, Shimizu N, Nordsiek G, Hornischer K, Brant P, Scharfe M, Schon O, Desario A, Reichelt J, Kauer G, Blocker H, Ramser J, Бек А., Клагес С., Хенниг С., Риссельманн Л., Даганд Э, Хааф Т., Вермейер С., Борзим К., Гардинер К., Низетик Д., Фрэнсис Ф., Лехрах Х., Райнхардт Р., Яспо М.Л. (2000). «Последовательность ДНК хромосомы 21 человека». Природа. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Натура.405..311H. Дои:10.1038/35012518. PMID  10830953.
• Кроз Э., Усачева А., Асарнов Д., Миншалл Р.Д., Перес Х.Д., Коламоничи О. (2000). «Рецептор для активированной С-киназы (RACK-1), белка, содержащего мотив WD, специфически связывается с рецептором IFN типа I человека». J. Immunol. 165 (9): 5127–32. Дои:10.4049 / jimmunol.165.9.5127. PMID  11046044.
• Усачева А., Смит Р., Миншалл Р., Байда Г., Сенг С., Кроз Е., Коламоничи О. (2001). «Белковый рецептор, содержащий мотив WD для активированной протеинкиназы C (RACK1), необходим для набора и активации сигнального преобразователя и активатора транскрипции 1 через рецептор интерферона I типа». J. Biol. Chem. 276 (25): 22948–53. Дои:10.1074 / jbc.M100087200. PMID  11301323.
• Нгуен В.П., Салех А.З., Арч А.Е., Ян Х., Пьяцца Ф., Ким Дж., Кролевски Дж. Дж. (2002). «Связывание Stat2 с субъединицей 2 рецептора интерферона-альфа не требуется для передачи сигналов интерферона-альфа». J. Biol. Chem. 277 (12): 9713–21. Дои:10.1074 / jbc.M111161200. PMID  11786546.
• Холод Дж. Х., Ниваш Р., Леви Р., Олбек С., Шрайбер Г., Англистер Дж. (2002). «Рецептор интерферона человека: моделирование на основе ЯМР, картирование сайта связывания IFN-альфа 2 и наблюдаемое лиганд-индуцированное затягивание». Биохимия. 41 (11): 3575–85. Дои:10.1021 / bi011778f. PMID  11888273.
• Величко С., Вагнер Т.С., Турксон Дж., Джов Р., Кроз Е. (2002). «Активация STAT3 интерферонами типа I зависит от конкретных тирозинов, расположенных в цитоплазматическом домене цепи рецептора интерферона 2c. Активация нескольких STATS происходит за счет избыточного использования двух остатков тирозина». J. Biol. Chem. 277 (38): 35635–41. Дои:10.1074 / jbc.M204578200. PMID  12105218.
• Усачева А, Котенко С., Витте М.М., Коламоничи О.Р. (2002). «Два отдельных домена в N-концевой области киназы Janus 1 взаимодействуют с рецепторами цитокинов». J. Immunol. 169 (3): 1302–8. Дои:10.4049 / jimmunol.169.3.1302. PMID  12133952.
• Gauzzi MC, Canini I, Eid P, Belardelli F, Gessani S (2002). «Потеря рецепторов IFN типа I и нарушение чувствительности к IFN во время конечного созревания дендритных клеток человека, происходящих из моноцитов». J. Immunol. 169 (6): 3038–45. Дои:10.4049 / jimmunol.169.6.3038. PMID  12218119.