GNA13 - GNA13

GNA13
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1SHZ, 1ZCB, 3AB3, 3CX6, 3CX7, 3CX8
Идентификаторы
Псевдонимы	GNA13, G13, G-белковая субъединица альфа 13
Внешние идентификаторы	OMIM: 604406 MGI: 95768 ГомолоГен: 55976 Генные карты: GNA13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q24.1 Начинать 65,009,289 бп[1] Конец 65,056,740 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 E1 | 11 71,88 см Начинать 109,362,831 бп[2] Конец 109,401,369 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание комплекса бета / гамма-субъединица G-белка • связывание рецептора ангиотензина 1 типа • Связывание GTP • Связывание с дофаминовым рецептором D5 • активность преобразователя сигнала • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание гуаниловых нуклеотидов • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho • ГТФазная активность Сотовый компонент • мембрана • очаговая адгезия • меланосома • щеточная мембрана • гетеротримерный G-белковый комплекс • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • клеточная мембрана Биологический процесс • дифференциация клеток • движение клетки или субклеточного компонента • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регулирование миграции клеток • Путь передачи сигналов рецептора, активирующего аденилатциклазу, сопряженного с G-белком • положительная регуляция концентрации ионов кальция в цитозоле • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • внутриутробное эмбриональное развитие • активация тромбоцитов • активация активности фосфолипазы D • Передача сигнала белка Rho • ангиогенез • регулировка формы клеток • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • преобразование сигнала • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • Аденилатциклаза-модулирующий путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10672	14674
Ансамбль	ENSG00000120063	ENSMUSG00000020611
UniProt	Q14344	P27601
RefSeq (мРНК)	NM_001282425 NM_006572	NM_010303 NM_001359034
RefSeq (белок)	NP_001269354 NP_006563	NP_034433 NP_001345963
Расположение (UCSC)	Chr 17: 65.01 - 65.06 Мб	Chr 11: 109,36 - 109,4 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица альфа-13 гуанин-нуклеотид-связывающего белка это белок что у людей кодируется GNA13 ген.^[5][6]

Взаимодействия и функции

Ген GNA13 кодирует G₁₃ Альфа-субъединица G-белка. Вместе с GNA12, эти два белка составляют один из четырех классов гетеротримерный G-белок альфа-субъединицы.^[7] Гетеротримерные G-белки участвуют в трансдукции гормон и нейротрансмиттер сигналы, обнаруживаемые поверхностью клетки G-белковые рецепторы к внутриклеточные сигнальные пути модулировать функции клеток. Альфа-субъединицы G-белка связываются с нуклеотидами гуанина и функционируют в регуляторном цикле, а также активны при связывании с GTP но неактивен и связан с G бета-гамма комплекс когда привязан к ВВП.^[8][9]

Активный GTP-связанный G₁₂ альфа-субъединица взаимодействует с и активирует ARHGEF1,^[10][11][12] ARHGEF11,^[13][14] и ARHGEF12.^[15][16] Эти белки ARHGEF функционируют как факторы обмена гуаниновых нуклеотидов для Ро малые GTPases регулировать актин цитоскелет.^[17]

Было показано, что GNA13 взаимодействовать с участием AKAP3,^[18] RIC8A,^{[19] [20]} и Радиксин.^[21]

Клиническое значение

Рецидивирующие мутации в этом гене были связаны со случаями диффузная В-клеточная лимфома большого размера.^[22][23]

Смотрите также

• Альфа-субъединицы G12 / G13
• Рецептор, связанный с G-белком
• Гетеротримерный белок G
• Семейство Rho GTPases

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120063 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020611 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кабуридис PS, Waters ST, Escobar S, Stanners J, Tsoukas CD (март 1995 г.). «Экспрессия альфа-субъединиц GTP-связывающего белка в тимоцитах человека». Молекулярная и клеточная биохимия. 144 (1): 45–51. Дои:10.1007 / BF00926739. PMID  7791744. S2CID  8911988.
6. «Ген Entrez: GNA13, связывающий гуанин-нуклеотидный белок (G-белок), альфа 13».
7. Стратманн М.П., ​​Саймон М.И. (1991). «Субъединицы G альфа 12 и G альфа 13 определяют четвертый класс альфа-субъединиц G белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (13): 5582–6. Дои:10.1073 / pnas.88.13.5582. ЧВК  51921. PMID  1905812.
8. Гилман, AG (1987). «G-белки: преобразователи сигналов, генерируемых рецепторами». Ежегодный обзор биохимии. 56: 615–649. Дои:10.1146 / annurev.bi.56.070187.003151. PMID  3113327.
9. Родбелл, М. (1995). «Нобелевская лекция: преобразование сигналов: эволюция идеи». Отчеты по бионауке. 15 (3): 117–133. Дои:10.1007 / bf01207453. PMID  7579038. S2CID  11025853.
10. Johnson EN, Seasholtz TM, Waheed AA, Kreutz B, Suzuki N, Kozasa T., Jones TL, Brown JH, Druey KM (декабрь 2003 г.). «RGS16 ингибирует передачу сигналов через ось G альфа 13-Rho». Природа клеточной биологии. 5 (12): 1095–103. Дои:10.1038 / ncb1065. PMID  14634662. S2CID  6798899.
11. Bhattacharyya R, Wedegaertner PB (апрель 2003 г.). «Мутация N-концевой богатой кислотой области p115-RhoGEF диссоциирует связывание альфа13 и рекрутирование на плазматическую мембрану, стимулируемое альфа13». Письма FEBS. 540 (1–3): 211–6. Дои:10.1016 / s0014-5793 (03) 00267-9. PMID  12681510. S2CID  84132104.
12. Hart MJ, Jiang X, Kozasa T., Roscoe W., Singer WD, Gilman AG, Sternweis PC, Bollag G (июнь 1998 г.). «Прямая стимуляция активности обмена гуаниновых нуклеотидов p115 RhoGEF с помощью Galpha13». Наука. 280 (5372): 2112–4. Дои:10.1126 / science.280.5372.2112. PMID  9641916.
13. Фукухара, S; Мурга, С; Зоар, М; Игиши, Т; Гуткинд, JS (1999-02-26). «Новый PDZ-домен, содержащий фактор обмена гуаниновых нуклеотидов, связывает гетеротримерные G-белки с Rho». Журнал биологической химии. 274 (9): 5868–5879. Дои:10.1074 / jbc.274.9.5868. PMID  10026210.
14. Rümenapp, U; Бломквист, А; Schwörer, G; Шабловски, H; Псома, А; Якобс, К. Х. (1999-10-15). "Rho-специфическое связывание и катализ обмена гуаниновых нуклеотидов с помощью KIAA0380, члена семейства dbl". Письма FEBS. 459 (3): 313–318. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 01270-3. PMID  10526156. S2CID  8529412.
15. Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2000 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (LARG) связывает гетеротримерные G-белки семейства G (12) с Rho». Письма FEBS. 485 (2–3): 183–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID  11094164. S2CID  7300556.
16. Сузуки Н., Накамура С., Мано Х., Козаса Т. (январь 2003 г.). «Galpha 12 активирует Rho GTPase через тирозин-фосфорилированный лейкоз, связанный с RhoGEF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (2): 733–8. Дои:10.1073 / pnas.0234057100. ЧВК  141065. PMID  12515866.
17. Дханасекаран Н., Дермотт Дж. М. (1996). «Передача сигналов G12 класса белков G». Клетка. Сигнал. 8 (4): 235–45. Дои:10.1016/0898-6568(96)00048-4. PMID  8842523.
18. Ниу Дж., Вайскунайте Р., Сузуки Н., Козаса Т., Карр Д.В., Дулин Н., Войно-Ясенецкая Т.А. (октябрь 2001 г.). «Взаимодействие гетеротримерного белка G13 с заякоренным белком 110 А-киназы (AKAP110) опосредует цАМФ-независимую активацию PKA». Текущая биология. 11 (21): 1686–90. Дои:10.1016 / s0960-9822 (01) 00530-9. PMID  11696326. S2CID  19027128.
19. Tall GG, Krumins AM, Gilman AG (март 2003 г.). «Ric-8A (синембрин) млекопитающих представляет собой гетеротримерный фактор обмена гуаниновых нуклеотидов белка Galpha». Журнал биологической химии. 278 (10): 8356–62. Дои:10.1074 / jbc.M211862200. PMID  12509430.
20. Ван Л., Го Д., Син Би, Чжан Дж. Дж., Шу Х. Б., Го Л., Хуан Си (сентябрь 2011 г.). «Устойчивость к ингибиторам холинэстеразы-8A (Ric-8A) имеет решающее значение для реорганизации цитоскелета актина, вызванной рецептором фактора роста». Журнал биологической химии. 286 (35): 31055–61. Дои:10.1074 / jbc.M111.253427. ЧВК  3162464. PMID  21771786.
21. Вайскунайте Р., Адаричев В., Фуртмайр Х., Козаса Т., Гудков А., Войно-Ясенецкая Т.А. (август 2000 г.). «Конформационная активация радиксина альфа-субъединицей белка G13». Журнал биологической химии. 275 (34): 26206–12. Дои:10.1074 / jbc.M001863200. PMID  10816569.
22. Морин Р.Д., Мендес-Лаго М., Мунгалл А.Д., Гойя Р., Мунгалл К.Л., Корбетт Р.Д., Джонсон Н.А., Северсон Т.М., Чиу Р., Филд М., Джекман С., Кшивински М., Скотт Д.В., Трин Д.Л., Тамура-Уэллс Дж., Ли S, Firme MR, Rogic S, Griffith M, Chan S, Yakovenko O, Meyer IM, Zhao EY, Smailus D, Moksa M, Chittaranjan S, Rimsza L, Brooks-Wilson A, Spinelli JJ, Ben-Neriah S, Meissner B , Woolcock B, Boyle M, McDonald H, Tam A, Zhao Y, Delaney A, Zeng T, Tse K, Butterfield Y, Birol I, Holt R, Schein J, Horsman DE, Moore R, Jones SJ, Connors JM, Hirst М., Гаскойн Р.Д., Марра Массачусетс (август 2011 г.). «Частая мутация генов, модифицирующих гистоны, при неходжкинской лимфоме». Природа. 476 (7360): 298–303. Дои:10.1038 / природа10351. ЧВК  3210554. PMID  21796119.
23. Лор Дж. Г., Стоянов П., Лоуренс М. С., Оклер Д., Чапуи Б., Сугнез К., Круз-Гордилло П., Кнечел Б., Асманн Ю. В., Слэджер С. Л., Новак А. Дж., Доган А., Анселл С. М., Линк Б. К., Зоу Л., Гулд Дж., Saksena G, Stransky N, Rangel-Escareño C, Fernandez-Lopez JC, Hidalgo-Miranda A, Melendez-Zajgla J, Hernández-Lemus E, Schwarz-Cruz y Celis A, Imaz-Rosshandler I, Ojesina AI, Jung J, Pedamallu CS, Lander ES, Habermann TM, Cerhan JR, Shipp MA, Getz G, Golub TR (март 2012 г.). «Обнаружение и определение приоритетности соматических мутаций в диффузной крупноклеточной B-лимфоме (DLBCL) путем секвенирования всего экзома». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (10): 3879–84. Дои:10.1073 / pnas.1121343109. ЧВК  3309757. PMID  22343534.

дальнейшее чтение

• Руппель К.М., Уиллисон Д., Катаока Х., Ван А., Чжэн Ю.В., Корнелиссен И., Инь Л., Сюй С.М., Кафлин С.Р. (июнь 2005 г.). «Важная роль Galpha13 в эндотелиальных клетках во время эмбрионального развития». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (23): 8281–8286. Дои:10.1073 / pnas.0503326102. ЧВК  1149452. PMID  15919816.
• Доунс Г.Б., Гаутам Н. (декабрь 1999 г.). «Семейства генов субъединиц G-белка». Геномика. 62 (3): 544–52. Дои:10.1006 / geno.1999.5992. PMID  10644457.
• Offermanns S, Laugwitz KL, Spicher K, Schultz G (январь 1994 г.). «G-белки семейства G12 активируются через тромбоксан A2 и рецепторы тромбина в тромбоцитах человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (2): 504–8. Дои:10.1073 / пнас.91.2.504. ЧВК  42977. PMID  8290554.
• Laugwitz KL, Allgeier A, Offermanns S, Spicher K, Van Sande J, Dumont JE, Schultz G (январь 1996 г.). «Рецептор тиреотропина человека: гепталический рецептор, способный стимулировать членов всех четырех семейств G-белков». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (1): 116–20. Дои:10.1073 / пнас.93.1.116. ЧВК  40189. PMID  8552586.
• Offermanns S, Hu YH, Simon MI (октябрь 1996 г.). «Galpha12 и galpha13 фосфорилируются во время активации тромбоцитов». Журнал биологической химии. 271 (42): 26044–8. Дои:10.1074 / jbc.271.42.26044. PMID  8824244.
• Offermanns S, Mancino V, Revel JP, Саймон М.И. (январь 1997 г.). «Дефекты сосудистой системы и нарушение хемокинеза клеток в результате дефицита Galpha13». Наука. 275 (5299): 533–6. Дои:10.1126 / science.275.5299.533. PMID  8999798. S2CID  32210248.
• Macrez-Leprêtre N, Kalkbrenner F, Morel JL, Schultz G, Mironneau J (апрель 1997 г.). «Гетеротример G-белка Galpha13beta1gamma3 связывает рецептор ангиотензина AT1A с увеличением цитоплазматического Ca2 + в миоцитах воротной вены крысы». Журнал биологической химии. 272 (15): 10095–102. Дои:10.1074 / jbc.272.15.10095. PMID  9092554.
• Hart MJ, Jiang X, Kozasa T., Roscoe W., Singer WD, Gilman AG, Sternweis PC, Bollag G (июнь 1998 г.). «Прямая стимуляция активности обмена гуаниновых нуклеотидов p115 RhoGEF с помощью Galpha13». Наука. 280 (5372): 2112–4. Дои:10.1126 / science.280.5372.2112. PMID  9641916.
• Беккер К.П., Гарновская М., Геттис Т., Галушка П.В. (июль 1999 г.). «Сцепление изоформ рецептора тромбоксана А2 с Galpha13: влияние на связывание лиганда и передачу сигналов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1450 (3): 288–96. Дои:10.1016 / S0167-4889 (99) 00068-3. PMID  10395940.
• Windh RT, Lee MJ, Hla T, An S, Barr AJ, Manning DR (сентябрь 1999 г.). «Дифференциальное связывание сфингозин-1-фосфатных рецепторов Edg-1, Edg-3 и H218 / Edg-5 с семействами G (i), G (q) и G (12) гетеротримерных G белков». Журнал биологической химии. 274 (39): 27351–8. Дои:10.1074 / jbc.274.39.27351. PMID  10488065.
• Брайдон Л., Рока Ф., Пети Л., де Коппе П., Тиссо М., Барретт П., Морган П. Дж., Нанофф К., Стросберг А. Д., Джокерс Р. (декабрь 1999 г.). «Двойная передача сигналов рецепторов мелатонина Mel1a человека через белки G (i2), G (i3) и G (q / 11)». Молекулярная эндокринология (Балтимор, Мэриленд). 13 (12): 2025–38. Дои:10.1210 / me.13.12.2025. PMID  10598579.
• Bhattacharyya R, Wedegaertner PB (май 2000 г.). «Galpha 13 требует пальмитоилирования для локализации на плазматической мембране, Rho-зависимой передачи сигналов и стимуляции связывания p115-RhoGEF с мембраной». Журнал биологической химии. 275 (20): 14992–9. Дои:10.1074 / jbc.M000415200. PMID  10747909.
• Вайскунайте Р., Адаричев В., Фуртмайр Х., Козаса Т., Гудков А., Войно-Ясенецкая Т.А. (август 2000 г.). «Конформационная активация радиксина альфа-субъединицей белка G13». Журнал биологической химии. 275 (34): 26206–12. Дои:10.1074 / jbc.M001863200. PMID  10816569.
• Ши С.С., Синнараджа С., Чо Х., Козаса Т., Керл Дж. Х. (август 2000 г.). «G13alpha-опосредованная активация PYK2. PYK2 является медиатором G13alpha-индуцированной транскрипции, зависимой от элемента ответа сыворотки». Журнал биологической химии. 275 (32): 24470–6. Дои:10.1074 / jbc.M908449199. PMID  10821841.
• Понимаскин Э., Бен Х., Адаричев В., Войно-Ясенецкая Т.А., Офферманнс С., Шмидт М.Ф. (июль 2000 г.). «Ацилирование Galpha (13) важно для его взаимодействия с рецептором тромбина, трансформирующей активности и образования актиновых стрессовых волокон». Письма FEBS. 478 (1–2): 173–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01845-7. PMID  10922491. S2CID  31417083.
• Джин С., Экстон Дж. Х. (ноябрь 2000 г.). «Активация RhoA ассоциацией Galpha (13) с Dbl». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 277 (3): 718–21. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3744. PMID  11062019.
• Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2000 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (LARG) связывает гетеротримерные G-белки семейства G (12) с Rho». Письма FEBS. 485 (2–3): 183–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID  11094164. S2CID  7300556.
• Meigs TE, Fields TA, McKee DD, Casey PJ (январь 2001 г.). «Взаимодействие Galpha 12 и Galpha 13 с цитоплазматическим доменом кадгерина обеспечивает механизм высвобождения бета-катенина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (2): 519–24. Дои:10.1073 / pnas.021350998. ЧВК  14619. PMID  11136230.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P27601 (Субъединица альфа-13 мышиного нуклеотид-связывающего белка гуанина) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.