ARHGEF12 - ARHGEF12

ARHGEF12
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1TXD, 1X86, 2OMJ, 2OS6
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF12, LARG, PRO2792, Фактор обмена нуклеотидов гуанина 12
Внешние идентификаторы	OMIM: 604763 MGI: 1916882 ГомолоГен: 9088 Генные карты: ARHGEF12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q23.3 Начинать 120,336,413 бп[1] Конец 120,489,937 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A5.1 Начинать 42,963,842 бп[2] Конец 43,107,239 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • внеклеточная экзосома • мембрана Биологический процесс • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • регуляция передачи сигнала белка Rho • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • положительная регуляция апоптотического процесса • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • регуляция молекулярной функции • Передача сигнала белка Rho Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23365	69632
Ансамбль	ENSG00000196914	ENSMUSG00000059495
UniProt	Q9NZN5	Q8R4H2
RefSeq (мРНК)	NM_001198665 NM_001301084 NM_015313	NM_027144 NM_001359232
RefSeq (белок)	NP_001185594 NP_001288013 NP_056128	NP_081420 NP_001346161
Расположение (UCSC)	Chr 11: 120.34 - 120.49 Мб	Chr 9: 42.96 - 43.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 12 это белок что у людей кодируется ARHGEF12 ген.^[5][6][7] Этот белок также называется RhoGEF12 или ассоциированный с лейкемией фактор обмена нуклеотидов гуанина (LARG).

Функция

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 12 равен фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (ГЭФ) для RhoA малая ГТФаза белок. ^[5] Ро - это малая ГТФаза белок, который неактивен при связывании с гуанин нуклеотид ВВП. Но при воздействии на него белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP, что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться и активировать специфические эффектор белки и ферменты регулировать клеточные функции.^[8] В частности, активный Rho является основным регулятором клетки. актин цитоскелет.^[8]

RhoGEF12 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются G-белковые рецепторы в сочетании с грамм₁₂ и G₁₃ гетеротримерные G-белки.^[9] Остальные ARHGEF1 (также известный как p115-RhoGEF), ARHGEF11 (также известный как PDZ-RhoGEF) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). ^[10][11] GPCR-регулируемый RhoGEF12 (и эти родственные GEF белки) действует как эффектор для G₁₂ и G₁₃ G белки. Помимо активации G₁₂ или G₁₃ G, три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) также функционируют как Семья РГО Белки, активирующие ГТФазу (GAP) для увеличения скорости гидролиза GTP G₁₂/ГРАММ₁₃ альфа-белки (которые сами являются белками GTPase). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho.^[12]

Клиническое значение

Наблюдается, что этот белок образует партнера слияния миелоида и лимфоида в острый миелоидный лейкоз.^[7]

Взаимодействия

ARHGEF12 было показано взаимодействовать с:

• GNA12,^[13][14]
• GNA13,^[13][14]
• IGF1R,^[15]
• PLXNB1,^[16]
• RHOA,^[14][17] и
• TEC.^[14]

Смотрите также

• Вторая система обмена сообщениями
• Рецептор, связанный с G-белком
• Гетеротримерный G-белок
• Малые GTPases
• Семейство Rho GTPases

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196914 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000059495 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Курлас П.Дж., Страут М.П., ​​Бекнелл Б., Веронезе М.Л., Кроче С.М., Тейл К.С. и др. (Февраль 2000 г.). «Идентификация гена в 11q23, кодирующего фактор обмена гуаниновых нуклеотидов: доказательства его слияния с MLL при остром миелоидном лейкозе». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (5): 2145–50. Дои:10.1073 / pnas.040569197. ЧВК  15768. PMID  10681437.
6. Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д., Охира М., Секи Н., Миядзима Н. и др. (Апрель 1997 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID  9205841.
7. "Ген Entrez: ARHGEF12 Фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 12".
8. Тумкео Д., Ватанабе С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологические роли эффекторов Rho и Rho у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии. 92 (10–11): 303–15. Дои:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID  24183240.
9. Боден М.А., Сидеровски Д.П., Der CJ (июнь 2002 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена генов гуаниновых нуклеотидов способствует G-альфа-q-связанной активации RhoA». Молекулярная и клеточная биология. 22 (12): 4053–61. Дои:10.1128 / mcb.22.12.4053-4061.2002. ЧВК  133844. PMID  12024019.
10. Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Онкоген. 20 (13): 1661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID  11313914.
11. Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж. Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зародыширует Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон». Журнал биологической химии. 276 (47): 44247–57. Дои:10.1074 / jbc.M106629200. PMID  11546812.
12. Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регулирование опосредованной G-белком передачи сигнала белками RGS». Науки о жизни. 68 (19–20): 2309–17. Дои:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID  11358341.
13. Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2000 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (LARG) связывает гетеротримерные G-белки семейства G (12) с Rho». Письма FEBS. 485 (2–3): 183–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID  11094164. S2CID  7300556.
14. Сузуки Н., Накамура С., Мано Х., Козаса Т. (январь 2003 г.). «Galpha 12 активирует Rho GTPase через тирозин-фосфорилированный лейкоз, связанный с RhoGEF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (2): 733–8. Дои:10.1073 / pnas.0234057100. ЧВК  141065. PMID  12515866.
15. Тая С., Инагаки Н., Сенгику Х., Макино Х., Ивамацу А., Уракава И. и др. (Ноябрь 2001 г.). «Прямое взаимодействие рецептора инсулиноподобного фактора роста-1 с лейкемией RhoGEF». Журнал клеточной биологии. 155 (5): 809–20. Дои:10.1083 / jcb.200106139. ЧВК  2150867. PMID  11724822.
16. Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М. и др. (Сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с PDZ-доменом, содержащим факторы обмена генов гуаниновых нуклеотидов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (1): 32–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID  12220504.
17. Ройтер Г.В., Ламберт К.Т., Боден М.А., Веннерберг К., Бекнелл Б., Маркуччи Г. и др. (Июль 2001 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена нуклеотидов ро-гуанина, белок семейства Dbl, обнаруженный с мутацией при лейкемии, вызывает трансформацию путем активации RhoA». Журнал биологической химии. 276 (29): 27145–51. Дои:10.1074 / jbc.M103565200. PMID  11373293.

дальнейшее чтение

• Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2000 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (LARG) связывает гетеротримерные G-белки семейства G (12) с Rho». Письма FEBS. 485 (2–3): 183–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02224-9. PMID  11094164. S2CID  7300556.
• Ройтер Г.В., Ламберт К.Т., Боден М.А., Веннерберг К., Бекнелл Б., Маркуччи Г. и др. (Июль 2001 г.). «Связанный с лейкемией фактор обмена нуклеотидов гуанина Rho, белок семейства Dbl, обнаруженный с мутацией при лейкемии, вызывает трансформацию путем активации RhoA». Журнал биологической химии. 276 (29): 27145–51. Дои:10.1074 / jbc.M103565200. PMID  11373293.
• Тая С., Инагаки Н., Сенгику Х., Макино Х., Ивамацу А., Уракава И. и др. (Ноябрь 2001 г.). «Прямое взаимодействие рецептора инсулиноподобного фактора роста-1 с лейкемией RhoGEF». Журнал клеточной биологии. 155 (5): 809–20. Дои:10.1083 / jcb.200106139. ЧВК  2150867. PMID  11724822.
• Чикуми Х., Фукухара С., Гуткинд Дж. С. (апрель 2002 г.). «Регулирование факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с G-белком, для Rho, PDZ-RhoGEF и LARG путем фосфорилирования тирозина: свидетельство роли киназы фокальной адгезии». Журнал биологической химии. 277 (14): 12463–73. Дои:10.1074 / jbc.M108504200. PMID  11799111.
• Перро В., Васкес-Прадо Дж, Гуткинд Дж. С. (ноябрь 2002 г.). «Плексин B регулирует Rho посредством факторов обмена гуаниновых нуклеотидов, связанных с лейкемией, Rho GEF (LARG) и PDZ-RhoGEF». Журнал биологической химии. 277 (45): 43115–20. Дои:10.1074 / jbc.M206005200. PMID  12183458.
• Аурандт Дж., Викис Х.Г., Гуткинд Дж. С., Ан Н., Гуан К. Л. (сентябрь 2002 г.). «Рецептор семафорина плексин-B1 передает сигналы посредством прямого взаимодействия с Rho-специфическим фактором обмена нуклеотидов, LARG». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (19): 12085–90. Дои:10.1073 / pnas.142433199. ЧВК  129402. PMID  12196628.
• Хиротани М., Охока Ю., Ямамото Т., Нирасава Х., Фуруяма Т., Кого М. и др. (Сентябрь 2002 г.). «Взаимодействие плексина-B1 с PDZ-доменом, содержащим факторы обмена генов гуаниновых нуклеотидов». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (1): 32–7. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02122-8. PMID  12220504.
• Driessens MH, Olivo C, Nagata K, Inagaki M, Collard JG (октябрь 2002 г.). «B-плексины активируют Rho через PDZ-RhoGEF». Письма FEBS. 529 (2–3): 168–72. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03323-9. PMID  12372594. S2CID  26525009.
• Веннерберг К., Эллербрук С.М., Лю Р.Й., Карноуб А.Е., Берридж К., Дер СиДжей (декабрь 2002 г.). «Сигналы RhoG параллельно с Rac1 и Cdc42». Журнал биологической химии. 277 (49): 47810–7. Дои:10.1074 / jbc.M203816200. PMID  12376551.
• Сузуки Н., Накамура С., Мано Х., Козаса Т. (январь 2003 г.). «Galpha 12 активирует Rho GTPase через тирозин-фосфорилированный лейкоз, связанный с RhoGEF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (2): 733–8. Дои:10.1073 / pnas.0234057100. ЧВК  141065. PMID  12515866.
• Чикуми Х., Барак А., Бехбахани Б., Гао Ю., Терамото Х., Чжэн Ю., Гуткинд Дж. С. (январь 2004 г.). «Гомо- и гетероолигомеризация PDZ-RhoGEF, LARG и p115RhoGEF с помощью их С-концевой области регулирует их активность и трансформирующий потенциал Rho GEF in vivo». Онкоген. 23 (1): 233–40. Дои:10.1038 / sj.onc.1207012. PMID  14712228.
• Ван Кью, Лю М., Козаса Т., Ротштейн Д.Д., Стернвейс П.С., Нойбиг Р.Р. (июль 2004 г.). «Рецепторы тромбина и лизофосфатидной кислоты используют различные rhoGEF в клетках рака простаты». Журнал биологической химии. 279 (28): 28831–4. Дои:10.1074 / jbc.C400105200. PMID  15143072.
• Кристелли Р., Гао Дж., Тесмер Дж. Дж. (Ноябрь 2004 г.). «Структурные детерминанты связывания RhoA и обмена нуклеотидов в лейкозно-связанном факторе обмена Rho-гуанин-нуклеотид». Журнал биологической химии. 279 (45): 47352–62. Дои:10.1074 / jbc.M406056200. PMID  15331592.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А., Шварц Д., Гиги С.П. (ноябрь 2004 г.). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Молекулярная и клеточная протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.
• Окухира К., Фицджеральд М.Л., Саррачино Д.А., Мэннинг Дж.Дж., Белл С.А., Госс Дж.Л., Фриман М.В. (ноябрь 2005 г.). «Очистка АТФ-связывающего кассетного транспортера А1 и связанных связывающих белков показывает важность бета1-синтрофина в оттоке холестерина». Журнал биологической химии. 280 (47): 39653–64. Дои:10.1074 / jbc.M510187200. PMID  16192269.
• Гото М., Мурамацу Х., Михара Х., Курихара Т., Эсаки Н., Оми Р. и др. (Декабрь 2005 г.). «Кристаллические структуры Delta1-пиперидин-2-карбоксилат / Delta1-пирролин-2-карбоксилатредуктазы, принадлежащих к новому семейству НАД (P) H-зависимых оксидоредуктаз: конформационные изменения, распознавание субстрата и стереохимия реакции». Журнал биологической химии. 280 (49): 40875–84. Дои:10.1074 / jbc.M507399200. PMID  16192274.
• Бургиньон Л.Ю., Гилад Е., Брайтман А., Дидрих Ф., Синглтон П. (май 2006 г.). «Взаимодействие гиалуронана-CD44 с ассоциированным с лейкемией RhoGEF и рецептором эпидермального фактора роста способствует совместной активации Rho / Ras, передаче сигналов фосфолипазы C-эпсилон-Ca2 + и модификации цитоскелета в клетках плоскоклеточной карциномы головы и шеи». Журнал биологической химии. 281 (20): 14026–40. Дои:10.1074 / jbc.M507734200. PMID  16565089.

внешняя ссылка

• Человек ARHGEF12 расположение генома и ARHGEF12 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.