ARHGEF1 - ARHGEF1

ARHGEF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1IAP, 1SHZ, 3AB3, 3ODO, 3ODW, 3ODX, 3П6А
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGEF1, GEF1, LBCL2, LSC, P115-RHOGEF, SUB1.5, фактор обмена нуклеотидов гуанина 1, IMD62
Внешние идентификаторы	OMIM: 601855 MGI: 1353510 ГомолоГен: 3454 Генные карты: ARHGEF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.2 Начните 41,883,161 бп[1] Конец 41,930,150 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 A3 Начните 24,902,912 бп[2] Конец 24,926,594 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • Связывание РНК • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком Сотовый компонент • клеточная мембрана • мембрана • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • клеточная пролиферация • регуляция передачи сигнала белка Rho • Передача сигнала белка Rho • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • регуляция молекулярной функции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9138	16801
Ансамбль	ENSG00000076928	ENSMUSG00000040940
UniProt	Q92888	Q61210
RefSeq (мРНК)	NM_004706 NM_198977 NM_199002	NM_001130150 NM_001130151 NM_001130152 NM_001130153 NM_008488
RefSeq (белок)	NP_004697 NP_945328 NP_945353	NP_001123622 NP_001123623 NP_001123624 NP_001123625 NP_032514
Расположение (UCSC)	Chr 19: 41,88 - 41,93 Мб	Chr 7: 24.9 - 24.93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 1 это белок что у людей кодируется ARHGEF1 ген.^[5][6][7] Этот белок также называют RhoGEF1 или p115-RhoGEF.

Функция

Фактор обмена нуклеотидов гуанина 1 равен фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (ГЭФ) для RhoA малая ГТФаза белок.^[8] Ро - это малая ГТФаза белок, который неактивен при связывании с гуанин нуклеотид ВВП. Но при воздействии на него белков Rho GEF, таких как RhoGEF1, этот GDP высвобождается и заменяется GTP, что приводит к активному состоянию Rho. В этой активной, GTP-связанной конформации Rho может связываться и активировать специфические эффектор белки и ферменты регулировать клеточные функции.^[9] В частности, активный Rho является основным регулятором клетки. актин цитоскелет.^[9]

RhoGEF1 является членом группы из четырех белков RhoGEF, которые, как известно, активируются G-белковые рецепторы в сочетании с г₁₂ и G₁₃ гетеротримерные G-белки.^[10][11] Остальные ARHGEF11 (также известный как PDZ-RhoGEF), ARHGEF12 (также известный как LARG) и AKAP13 (также известный как ARHGEF13 и Lbc). ^[12][13] GPCR-регулируемый RhoGEF1 (и эти родственные GEF белки) действует как эффектор для G₁₂ и G₁₃ G белки. Помимо активации G₁₂ или G₁₃ G, три из этих четырех белков RhoGEF (ARHGEF1 / 11/12) также функционируют как Семья РГО Белки, активирующие ГТФазу (GAP) для увеличения скорости гидролиза GTP G₁₂/Г₁₃ альфа-белки (которые сами являются белками GTPase). Это действие увеличивает скорость дезактивации G-белка, ограничивая время, в течение которого эти RhoGEF активируют Rho.^[14]

Для этого гена было идентифицировано множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но полноразмерная природа и функция некоторых вариантов не определены.^[7]

Взаимодействия

ARHGEF1 было показано взаимодействовать с участием:

• CD44^[15]
• GNA12^[15]
• GNA13^[11]
• P110α^[16]

Смотрите также

• Вторая система обмена сообщениями
• Рецептор, связанный с G-белком
• Гетеротримерный G-белок
• Малые GTPases
• Семейство Rho GTPases

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000076928 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040940 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Hart MJ, Sharma S, elMasry N, Qiu RG, McCabe P, Polakis P, Bollag G (октябрь 1996 г.). «Идентификация нового фактора обмена гуаниновых нуклеотидов для Rho GTPase». Журнал биологической химии. 271 (41): 25452–8. Дои:10.1074 / jbc.271.41.25452. PMID  8810315.
6. Aasheim HC, Pedeutour F, Smeland EB (апрель 1997 г.). «Характеристика, экспрессия и хромосомная локализация человеческого гена, гомологичного онкогену Lsc мыши, с самой сильной экспрессией в гематопоэтических тканях». Онкоген. 14 (14): 1747–52. Дои:10.1038 / sj.onc.1200994. PMID  9135076. S2CID  24528606.
7. "Ген Entrez: ARHGEF1 фактор обмена гуаниновых нуклеотидов (GEF) 1".
8. Hart MJ, Sharma S, elMasry N, Qiu RG, McCabe P, Polakis P, Bollag G (октябрь 1996 г.). «Идентификация нового фактора обмена гуаниновых нуклеотидов для Rho GTPase». Журнал биологической химии. 271 (41): 25452–8. Дои:10.1074 / jbc.271.41.25452. PMID  8810315.
9. Тумкео Д., Ватанабе С., Нарумия С. (октябрь – ноябрь 2013 г.). «Физиологические роли эффекторов Rho и Rho у млекопитающих». Европейский журнал клеточной биологии. 92 (10–11): 303–15. Дои:10.1016 / j.ejcb.2013.09.002. PMID  24183240.
10. Kozasa T, Jiang X, Hart MJ, Sternweis PM, Singer WD, Gilman AG и др. (Июнь 1998 г.). «p115 RhoGEF, белок, активирующий GTPase для Galpha12 и Galpha13». Наука. 280 (5372): 2109–11. Дои:10.1126 / science.280.5372.2109. PMID  9641915.
11. Харт MJ, Jiang X, Kozasa T., Roscoe W., Singer WD, Gilman AG и др. (Июнь 1998 г.). «Прямая стимуляция активности обмена гуаниновых нуклеотидов p115 RhoGEF с помощью Galpha13». Наука. 280 (5372): 2112–4. Дои:10.1126 / science.280.5372.2112. PMID  9641916.
12. Фукухара С., Чикуми Х., Гуткинд Дж. С. (март 2001 г.). «RGS-содержащие RhoGEF: недостающее звено между трансформирующими G-белками и Rho?». Онкоген. 20 (13): 1661–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1204182. PMID  11313914.
13. Дивиани Д., Содерлинг Дж., Скотт Дж. Д. (ноябрь 2001 г.). «AKAP-Lbc закрепляет протеинкиназу А и зародыширует Galpha 12-селективное Rho-опосредованное образование стрессовых волокон». Журнал биологической химии. 276 (47): 44247–57. Дои:10.1074 / jbc.M106629200. PMID  11546812.
14. Козаса Т. (апрель 2001 г.). «Регулирование опосредованной G-белком передачи сигнала белками RGS». Науки о жизни. 68 (19–20): 2309–17. Дои:10.1016 / S0024-3205 (01) 01020-7. PMID  11358341.
15. Johnson EN, Seasholtz TM, Waheed AA, Kreutz B, Suzuki N, Kozasa T. и др. (Декабрь 2003 г.). «RGS16 ингибирует передачу сигналов через ось G альфа 13-Rho». Природа клеточной биологии. 5 (12): 1095–103. Дои:10.1038 / ncb1065. PMID  14634662. S2CID  6798899.
16. Холинстат М., Мехта Д., Козаса Т., Миншалл Р.Д., Малик А.Б. (август 2003 г.). «Протеинкиназа Calpha-индуцированное фосфорилирование p115RhoGEF сигнализирует о перестройке эндотелиального цитоскелета». Журнал биологической химии. 278 (31): 28793–8. Дои:10.1074 / jbc.M303900200. PMID  12754211.

внешние ссылки

• Человек ARHGEF1 расположение генома и ARHGEF1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Bhattacharyya R, Wedegaertner PB (май 2000 г.). «Galpha 13 требует пальмитоилирования для локализации на плазматической мембране, Rho-зависимой передачи сигналов и стимулирования связывания p115-RhoGEF с мембраной». Журнал биологической химии. 275 (20): 14992–9. Дои:10.1074 / jbc.M000415200. PMID  10747909.
• Wells CD, Gutowski S, Bollag G, Sternweis PC (август 2001 г.). «Идентификация потенциальных механизмов регуляции p115 RhoGEF посредством анализа эндогенных и мутантных форм фактора обмена». Журнал биологической химии. 276 (31): 28897–905. Дои:10.1074 / jbc.M102913200. PMID  11384980.
• Chen Z, Wells CD, Sternweis PC, Sprang SR (сентябрь 2001 г.). «Структура домена rgRGS p115RhoGEF». Структурная биология природы. 8 (9): 805–9. Дои:10.1038 / nsb0901-805. PMID  11524686. S2CID  11040143.
• Chen Z, Singer WD, Wells CD, Sprang SR, Sternweis PC (март 2003 г.). «Картирование интерфейса связывания Galpha13 домена rgRGS p115RhoGEF». Журнал биологической химии. 278 (11): 9912–9. Дои:10.1074 / jbc.M212695200. PMID  12525488.
• Bhattacharyya R, Wedegaertner PB (май 2003 г.). «Характеристика G alpha 13-зависимого рекрутирования плазматической мембраны p115RhoGEF». Биохимический журнал. 371 (Pt 3): 709–20. Дои:10.1042 / BJ20021897. ЧВК  1223324. PMID  12534370.
• Bhattacharyya R, Wedegaertner PB (апрель 2003 г.). «Мутация N-концевой богатой кислотой области p115-RhoGEF диссоциирует связывание альфа13 и рекрутирование на плазматическую мембрану, стимулируемое альфа13». Письма FEBS. 540 (1–3): 211–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00267-9. PMID  12681510. S2CID  84132104.
• Бургиньон LY, Синглтон PA, Zhu H, Diedrich F (август 2003 г.). «Гиалуронан-опосредованное взаимодействие CD44 с RhoGEF и Rho-киназой способствует Grb2-ассоциированному фосфорилированию связующего-1 и передаче сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы, что приводит к выработке цитокинов (фактор, стимулирующий колонии макрофагов) и прогрессированию опухоли груди». Журнал биологической химии. 278 (32): 29420–34. Дои:10.1074 / jbc.M301885200. PMID  12748184.
• Холинстат М., Мехта Д., Козаса Т., Миншалл Р.Д., Малик А.Б. (август 2003 г.). «Протеинкиназа Calpha-индуцированное фосфорилирование p115RhoGEF сигнализирует о перестройке эндотелиального цитоскелета». Журнал биологической химии. 278 (31): 28793–8. Дои:10.1074 / jbc.M303900200. PMID  12754211.