ATP2B4 - ATP2B4

ATP2B4
PDB 1cff EBI.jpg
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыATP2B4, ATP2B2, MXRA1, PMCA4, PMCA4b, PMCA4x, АТФаза плазматической мембраны Ca2 + транспорт 4
Внешние идентификаторыOMIM: 108732 MGI: 88111 ГомолоГен: 48034 Генные карты: ATP2B4
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение ATP2B4
Геномное расположение ATP2B4
Группа1q32.1Начните203,626,561 бп[1]
Конец203,744,081 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ATP2B4 212135 s в формате fs.png

PBB GE ATP2B4 205410 s в формате fs.png

PBB GE ATP2B4 212136 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001684
NM_001001396
NM_001365783
NM_001365784

NM_001167949
NM_213616

RefSeq (белок)

NP_001001396
NP_001675
NP_001352712
NP_001352713

NP_001161421
NP_998781

Расположение (UCSC)Chr 1: 203,63 - 203,74 МбChr 1: 133,7 - 133,8 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кальций-транспортная АТФаза 4 плазматической мембраны является фермент что у людей кодируется ATP2B4 ген.[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству АТФаз первичного ионного транспорта P-типа, характеризующимся образованием промежуточного соединения аспартилфосфата во время цикла реакции. Эти ферменты удаляют ионы двухвалентного кальция из эукариотических клеток при очень больших градиентах концентрации и играют важную роль во внутриклеточном гомеостазе кальция. Изоформы кальциевой АТФазы плазматической мембраны млекопитающих кодируются по крайней мере четырьмя отдельными генами, и разнообразие этих ферментов дополнительно увеличивается за счет альтернативное сращивание стенограмм. Экспрессия различных изоформ и вариантов сплайсинга регулируется в зависимости от развития, тканевого и клеточного типа, предполагая, что эти насосы функционально адаптированы к физиологическим потребностям конкретных клеток и тканей. Этот ген кодирует изоформу 4 кальциевой АТФазы плазматической мембраны. Идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.[6]

Взаимодействия

Было показано, что ATP2B4 взаимодействовать с участием КАСКА.[7]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000058668 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026463 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Олсон С., Ван М.Г., Карафоли Е., Стрелер Е. Е., Макбрайд О. В. (апрель 1991 г.). «Локализация двух генов, кодирующих Ca2 (+) - транспортирующих АТФаз плазматической мембраны к хромосомам человека 1q25-32 и 12q21-23». Геномика. 9 (4): 629–41. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90356-J. PMID  1674727.
  6. ^ а б «Ген Entrez: ATP2B4, АТФаза, перенос Са ++, плазматическая мембрана 4».
  7. ^ Schuh K, Uldrijan S, Gambaryan S, Roethlein N, Neyses L (март 2003 г.). «Взаимодействие Ca2 + -помпы 4b / CI плазматической мембраны с Ca2 + / кальмодулин-зависимой мембрано-ассоциированной киназой CASK». Журнал биологической химии. 278 (11): 9778–83. Дои:10.1074 / jbc.M212507200. PMID  12511555.

дальнейшее чтение

внешние ссылки