LIMK1 - LIMK1

LIMK1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3С95, 5L6W, 5ХВК, 5HVJ
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMK1, LIMK, LIMK-1, киназа 1 домена LIM
Внешние идентификаторы	OMIM: 601329 MGI: 104572 ГомолоГен: 1738 Генные карты: LIMK1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q11.23 Начинать 74,082,933 бп[1] Конец 74,122,525 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 74,73 см | 5 G2 Начинать 134,656,039 бп[2] Конец 134,688,598 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • связывание с белками теплового шока • связывание ионов металлов • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • Связывание АТФ • активность протеинкиназы • активность протеин-серин / треонинкиназы • активность преобразователя сигнала Сотовый компонент • мембрана • очаговая адгезия • цитоплазма • ядро клетки • аппарат Гольджи • цитозоль • ядерное пятнышко • проекция нейрона • ламеллиподиум • проекция клетки Биологический процесс • Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе • фосфорилирование • развитие нервной системы • отрицательная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы • Передача сигнала белка Rho • положительная регуляция сборки пучка актиновых филаментов • организация актинового цитоскелета • преобразование сигнала • положительная регуляция удлинения аксона • фосфорилирование белков • положительное регулирование сборки напряженного волокна Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3984	16885
Ансамбль	ENSG00000106683	ENSMUSG00000029674
UniProt	P53667	P53668
RefSeq (мРНК)	NM_016735 NM_001204426 NM_002314	NM_010717 NM_001305875
RefSeq (белок)	NP_001191355 NP_002305	NP_001292804 NP_034847
Расположение (UCSC)	Chr 7: 74.08 - 74.12 Мб	Chr 5: 134.66 - 134.69 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LIM доменная киназа 1 является фермент что у людей кодируется LIMK1 ген.^[5][6]

Функция

Существует около 40 известных эукариотических белков LIM, названных так в честь LIM домены в них содержатся. LIM домены высоко консервативны цистеин -богатые структуры, содержащие 2 цинковые пальцы. Хотя цинковые пальцы обычно действуют, связываясь с ДНК или же РНК, мотив LIM, вероятно, опосредует белок-белковые взаимодействия. LIM киназа-1 и LIM киназа-2 принадлежат к небольшому подсемейству с уникальной комбинацией 2 N-концевой Мотивы LIM, центральный PDZ домен, а C-терминал протеинкиназа домен. LIMK1, вероятно, является компонентом внутриклеточного сигнального пути и может участвовать в развитии мозга.^[7]

Клиническое значение

LIMK1 гемизиготность участвует в нарушении зрительно-пространственного конструктивного познания Синдром Вильямса.^[7]

Взаимодействия

LIMK1 был показан взаимодействовать с:

• CFL1,^[8][9]
• CDKN1C,^[10]
• NRG1,^[11]
• PAK1,^[12]
• PAK4,^[13] и
• YWHAZ.^[14]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106683 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029674 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Tassabehji M, Metcalfe K, Fergusson WD, Carette MJ, Dore JK, Donnai D, Read AP, Pröschel C, Gutowski NJ, Mao X, Sheer D (август 1996). «LIM-киназа удалена при синдроме Вильямса». Nat. Genet. 13 (3): 272–3. Дои:10.1038 / ng0796-272. PMID  8673124. S2CID  138698.
6. Осборн Л.Р., Мартиндейл Д., Шерер С.В., Ши Х.М., Хьюзенга Дж., Хенг Х.Х., Коста Т., Побер Б., Лью Л., Бринкман Дж., Ромменс Дж., Куп Б., Цуй Л.С. (январь 1997 г.). «Идентификация генов из области размером 500 т.п.н. в 7q11.23, которая обычно удаляется у пациентов с синдромом Вильямса». Геномика. 36 (2): 328–36. Дои:10.1006 / geno.1996.0469. PMID  8812460.
7. «Ген Entrez: LIMK1 киназа 1 домена LIM».
8. Фолетта В.К., Лим М.А., Сусайраджа Дж., Келли А.П., Стэнли Э.Г., Шеннон М., Хе В., Дас С., Массагу Дж., Бернард О., Сусайрайя Дж. (Сентябрь 2003). «Прямая передача сигналов рецептором BMP типа II через регулятор цитоскелета LIMK1». J. Cell Biol. 162 (6): 1089–98. Дои:10.1083 / jcb.200212060. ЧВК  2172847. PMID  12963706.
9. Маэкава М., Ишизаки Т., Боку С., Ватанабэ Н., Фудзита А., Ивамацу А., Обината Т., Охаши К., Мидзуно К., Нарумия С. (август 1999 г.). «Передача сигналов от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназы». Наука. 285 (5429): 895–8. Дои:10.1126 / science.285.5429.895. PMID  10436159.
10. Yokoo T, Toyoshima H, Miura M, Wang Y, Iida KT, Suzuki H, Sone H, Shimano H, Gotoda T, Nishimori S, Tanaka K, Yamada N (декабрь 2003 г.). «p57Kip2 регулирует динамику актина, связывая и перемещая LIM-киназу 1 в ядро». J. Biol. Chem. 278 (52): 52919–23. Дои:10.1074 / jbc.M309334200. PMID  14530263.
11. Ван Дж.Й., Френзель К.Э., Вен Д., Фоллс Д.Л. (август 1998 г.). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с LIM киназой 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания». J. Biol. Chem. 273 (32): 20525–34. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20525. PMID  9685409.
12. Эдвардс, округ Колумбия, Сандерс Л.С., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (сентябрь 1999 г.). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 связывает передачу сигналов Rac / Cdc42 GTPase с актиновой динамикой цитоскелета». Nat. Cell Biol. 1 (5): 253–9. Дои:10.1038/12963. PMID  10559936. S2CID  25250183.
13. Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (август 2001 г.). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин / треонинкиназой PAK4, опосредуются LIM киназой 1 и кофилином». J. Biol. Chem. 276 (34): 32115–21. Дои:10.1074 / jbc.M100871200. PMID  11413130.
14. Биркенфельд Дж, Бец Х, Рот Д. (январь 2003 г.). «Идентификация кофилина и протеинкиназы 1, содержащей LIM-домен, в качестве новых партнеров по взаимодействию 14-3-3 дзета». Biochem. J. 369 (Pt 1): 45–54. Дои:10.1042 / BJ20021152. ЧВК  1223062. PMID  12323073.

дальнейшее чтение

• Скотт Р.В., Олсон М.Ф. (2007). «Киназы LIM: функция, регуляция и связь с заболеванием человека». J. Mol. Med. 85 (6): 555–68. Дои:10.1007 / s00109-007-0165-6. PMID  17294230. S2CID  8881246.
• Мизуно К., Окано И., Охаши К., Нуноуэ К., Кума К., Мията Т., Накамура Т. (1994). «Идентификация кДНК человека, кодирующей новую протеинкиназу с двумя повторами мотива LIM / двойной цинковый палец». Онкоген. 9 (6): 1605–12. PMID  8183554.
• Окано И., Хираока Дж., Отера Х, Нуноуэ К., Охаши К., Ивашита С., Хираи М., Мизуно К. (1995). «Идентификация и характеристика нового семейства серин / треониновых киназ, содержащих два N-концевых мотива LIM». J. Biol. Chem. 270 (52): 31321–30. Дои:10.1074 / jbc.270.52.31321. PMID  8537403.
• Франгискакис Дж. М., Юарт А. К., Моррис К. А., Мервис С. Б., Бертран Дж., Робинсон Б. Ф., Кляйн Б. П., Энсинг Г. Дж., Эверетт Л. А., Грин Э. Д., Прёшель С., Гутовски Н. Дж., Нобл М., Аткинсон Д. Л., Одельберг С. Дж., Китинг М. . «Гемизиготность LIM-киназы 1 связана с нарушением зрительно-пространственного конструктивного познания». Клетка. 86 (1): 59–69. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80077-X. PMID  8689688. S2CID  17786888.
• Nebl G, Meuer SC, Samstag Y (1996). «Дефосфорилирование серина 3 регулирует ядерную транслокацию кофилина». J. Biol. Chem. 271 (42): 26276–80. Дои:10.1074 / jbc.271.42.26276. PMID  8824278.
• Хираока Дж., Окано И., Хигучи О, Ян Н., Мидзуно К. (1996). «Самоассоциация LIM-киназы 1, опосредованная взаимодействием между N-концевым доменом LIM и C-концевым доменом киназы». FEBS Lett. 399 (1–2): 117–21. Дои:10.1016 / S0014-5793 (96) 01303-8. PMID  8980133. S2CID  2815035.
• Ян Н, Хигучи О, Охаши К., Нагата К., Вада А., Кангава К., Нисида Э, Мидзуно К. (1998). «Фосфорилирование кофилина с помощью LIM-киназы 1 и его роль в Rac-опосредованной реорганизации актина». Природа. 393 (6687): 809–12. Дои:10.1038/31735. PMID  9655398. S2CID  4326365.
• Ван Дж. Ю., Френзель К. Э., Вэнь Д., Фоллс Д. Л. (1998). «Трансмембранные нейрегулины взаимодействуют с LIM киназой 1, цитоплазматической протеинкиназой, участвующей в развитии зрительно-пространственного познания». J. Biol. Chem. 273 (32): 20525–34. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20525. PMID  9685409.
• Эдвардс, округ Колумбия, Джилл Г.Н. (1999). «Структурные особенности LIM-киназы, которые контролируют действие на актиновый цитоскелет». J. Biol. Chem. 274 (16): 11352–61. Дои:10.1074 / jbc.274.16.11352. PMID  10196227.
• Сотиропулос А., Гинеитис D, Коупленд Дж., Трейсман Р. (1999). «Регулируемая сигналом активация сывороточного фактора ответа опосредуется изменениями в динамике актина». Клетка. 98 (2): 159–69. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81011-9. PMID  10428028. S2CID  15781260.
• Бах I, Родригес-Эстебан С., Каррьер С., Бхушан А., Кронес А., Роуз Д. В., Гласс С. К., Андерсен Б., Изписуа Бельмонте Дж. К., Розенфельд М. Г. (1999). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Nat. Genet. 22 (4): 394–9. Дои:10.1038/11970. PMID  10431247. S2CID  22326394.
• Маэкава М., Ишизаки Т., Боку С., Ватанабэ Н., Фудзита А., Ивамацу А., Обината Т., Охаши К., Мизуно К., Нарумия С. (1999). «Передача сигналов от Rho к актиновому цитоскелету через протеинкиназы ROCK и LIM-киназы». Наука. 285 (5429): 895–8. Дои:10.1126 / наука.285.5429.895. PMID  10436159.
• Эдвардс, округ Колумбия, Сандерс Л.С., Бокоч Г.М., Гилл Г.Н. (1999). «Активация LIM-киназы с помощью Pak1 связывает передачу сигналов Rac / Cdc42 GTPase с актиновой динамикой цитоскелета». Nat. Cell Biol. 1 (5): 253–9. Дои:10.1038/12963. PMID  10559936. S2CID  25250183.
• Охаши К., Нагата К., Маэкава М., Ишизаки Т., Нарумия С., Мидзуно К. (2000). «Rho-ассоциированная киназа ROCK активирует LIM-киназу 1 путем фосфорилирования по треонину 508 в петле активации». J. Biol. Chem. 275 (5): 3577–82. Дои:10.1074 / jbc.275.5.3577. PMID  10652353.
• Мартиндейл Д.В., Уилсон, доктор медицины, Ван Д., Берк Р.Д., Чен X, Дуронио В., Куп Б.Ф. (2000). «Сравнительный анализ геномной последовательности области синдрома Вильямса (LIMK1-RFC2) хромосомы 7q11.23 человека». Мамм. Геном. 11 (10): 890–8. Дои:10.1007 / s003350010166. PMID  11003705. S2CID  8575994.
• Суми Т., Мацумото К., Сибуя А., Накамура Т. (2001). «Активация киназ LIM киназой миотонической дистрофии, связанной с Cdc42-связывающей киназой альфа». J. Biol. Chem. 276 (25): 23092–6. Дои:10.1074 / jbc.C100196200. PMID  11340065.
• Дэн С., Келли А., Бернард О., Минден А. (2001). «Изменения цитоскелета, регулируемые серин / треонинкиназой PAK4, опосредуются LIM киназой 1 и кофилином». J. Biol. Chem. 276 (34): 32115–21. Дои:10.1074 / jbc.M100871200. PMID  11413130.
• Тосима Дж., Тосима Дж. Ю., Такеучи К., Мори Р., Мизуно К. (2001). «Активность фосфорилирования кофилина и реорганизации актина тестикулярной протеинкиназы 2 и ее преобладающая экспрессия в клетках Сертоли яичек». J. Biol. Chem. 276 (33): 31449–58. Дои:10.1074 / jbc.M102988200. PMID  11418599.

внешняя ссылка

• LIMK1 Информация со ссылками в Шлюз миграции ячеек