ADAMTS4 - ADAMTS4

ADAMTS4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2RJP, 3B2Z, 4WK7, 4WKE, 4WKI
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAMTS4, ADAMTS-2, ADAMTS-4, ADMP-1, ADAM-металлопептидаза с мотивом тромбоспондина 1 типа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 603876 MGI: 1339949 ГомолоГен: 36169 Генные карты: ADAMTS4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.3 Начинать 161,184,302 бп[1] Конец 161,199,054 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание протеазы • пептидазная активность • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • металлопептидазная активность • связывание ионов металлов • активность металлоэндопептидазы Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный • ядерное пятнышко • внеклеточный матрикс • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • развитие скелетной системы • разборка внеклеточного матрикса • протеолиз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9507	240913
Ансамбль	ENSG00000158859	ENSMUSG00000006403
UniProt	O75173	Q8BNJ2
RefSeq (мРНК)	NM_005099 NM_001320336	NM_172845
RefSeq (белок)	NP_001307265 NP_005090	NP_766433
Расположение (UCSC)	Chr 1: 161.18 - 161,2 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами 4 является фермент что у людей кодируется ADAMTS4 ген.^[4]

Этот ген кодирует член АДАМТС (дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами) семейство белков. Члены семейства имеют несколько общих белковых модулей, в том числе пропептидную область, металлопротеиназа домен, а дезинтегрин -подобный домен и тромбоспондин тип 1 (TS) мотив. Отдельные члены этой семьи различаются количеством C-терминал Мотивы TS, а некоторые имеют уникальные C-концевые домены. В фермент кодируемый этим геном не имеет С-концевого мотива TS. Это может ухудшить Аггрекан, основной протеогликан хряща, бревикан, специфический для мозга внеклеточный матрикс белок нейрокан и Versican. Расщепление аггрекана и бревикана предполагает ключевую роль этого фермента в лечении артритов и Центральная нервная система, потенциально, в прогрессии глиома.^[5]

Структура

ADAMTS4 - самый короткий из известных АДАМТС, лишенный C-концевого домена и являющийся единственным негликозилированным АДАМТС.^[6] Также есть только один тромбоспондин мотив типа 1 (TSR), тогда как все остальные ADAMTS имеют два или более TSR. TSR важен для связывания фермента с внеклеточный матрикс и, следовательно, его субстратная специфичность. Рядом с C-терминалом TSR находится дезинтегрин -подобный домен, a цистеин -богатый регион, который складывается против активного сайта фермент когда в его окончательно сложенной третичной структуре.^[7]

Функция

ADAMTS4 способен раскалывать все большие сульфат хондроитина гиалуронан переплет протеогликаны (CSPG), в том числе Аггрекан, бревикан, нейрокан и Versican. Нравиться ADAMTS5, его можно эффективно ингибировать тканевым ингибитором металлопротеиназа -3 (TIMP3 )^[8] и это ингибирование может быть усилено в присутствии Аггрекан.^[9] В добавление к TIMP3, он также может подавляться кальцием пентозан полисульфат.^[10]

ADAMTS4 выражается в яичник, спинной мозг, кора надпочечников, ресничный узел, тройничный узел, мозг, сетчатка, поджелудочная железа (островки), плодный легкое, грудь миоэпителиальные клетки, сухожилие и хрящ.^[6]

Клиническое значение

ADAMTS4 (и ADAMTS5 ) являются основными протеиназы несет ответственность за деградацию протеогликаны в суставной хрящ в остеоартроз.^[11] Какой из этих агреканаз важнее? хрящ деградация, по-видимому, видоспецифична, при этом ADAMTS4 более важен при заболеваниях человека (но ADAMTS5 более важно в мышь модели остеоартроз ).

Альтернативные названия

• Аггреканаза-1 (первоначальное название отражает его способность раскалывать Аггрекан )

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000158859 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Тан Б.Л., Хонг В. (февраль 1999 г.). «ADAMTS: новое семейство протеаз с доменом протеазы ADAM и повторами тромбоспондина 1». Письма FEBS. 445 (2–3): 223–5. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00119-2. PMID  10094461.
5. «Ген Entrez: металлопептидаза ADAMTS4 ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 4».
6. Келвик Р., Десанлис И., Уилер Г. Н., Эдвардс Д. Р. (2015). «Семейство ADAMTS (Дезинтегрин и металлопротеиназа с мотивами тромбоспондина)». Геном Биол. 16 (1): 113. Дои:10.1186 / s13059-015-0676-3. ЧВК  4448532. PMID  26025392.
7. Мосяк Л., Георгиадис К., Шейн Т., Свенсон К., Хеберт Т., МакДона Т., Маки С., Олланд С., Лин Л., Чжун Х, Криз Р., Райфенберг Е.Л., Коллинз-Рэйси Л.А., Коркоран К., Фриман Б., Цолльнер Р., Марвелл Т., Вера М., Сумма ПЭ, Лавалли Э.Р., Шталь М., Сомерс В. (2008). «Кристаллические структуры двух основных ферментов, разлагающих аггрекан, ADAMTS4 и ADAMTS5». Белковая наука. 17 (1): 16–21. Дои:10.1110 / пс. 073287008. ЧВК  2144589. PMID  18042673.
8. Троеберг Л., Фушими К., Сцилабра С.Д., Накамура Х., Погружение V, Тёгерсен И.Б., Энгильд Дж.Дж., Нагасе Х. (2009). «С-концевые домены ADAMTS-4 и ADAMTS-5 способствуют ассоциации с N-TIMP-3». Матрикс Биол. 28 (8): 463–9. Дои:10.1016 / j.matbio.2009.07.005. ЧВК  2835468. PMID  19643179.
9. Уэйн Дж. Дж., Дэн С. Дж., Амур А., Борман С., Матико Р., Картер Г. Л., Мерфи Дж. (2007). «Ингибирование TIMP-3 ADAMTS-4 (аггреканазы-1) модулируется взаимодействиями между аггреканом и С-концевым доменом ADAMTS-4». J. Biol. Chem. 282 (29): 20991–8. Дои:10.1074 / jbc.M610721200. PMID  17470431.
10. Такидзава М., Ятабэ Т., Окада А., Чидзива М., Мотидзуки С., Гош П., Окада Ю. (2008). «Полисульфат пентозана кальция напрямую ингибирует ферментативную активность ADAMTS4 (аггреканаза-1) в хондроцитах, страдающих остеоартритом». FEBS Lett. 582 (19): 2945–9. Дои:10.1016 / j.febslet.2008.07.036. PMID  18671975.
11. Бондесон Дж., Уэйнрайт С., Хьюз С., Катерсон Б. (2008). «Регулирование аггреканаз ADAMTS4 и ADAMTS5 при остеоартрите: обзор». Clin. Exp. Ревматол. 26 (1): 139–45. PMID  18328163.

дальнейшее чтение

• Тан Б.Л. (январь 2001 г.). «ADAMTS: новое семейство протеаз внеклеточного матрикса». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 33 (1): 33–44. Дои:10.1016 / S1357-2725 (00) 00061-3. PMID  11167130.
• Hirohata S (ноябрь 2001 г.). «[Семейство ADAMTS - новый фермент, разрушающий внеклеточный матрикс]». Сэйкагаку. Журнал Японского биохимического общества. 73 (11): 1333–7. PMID  11831030.
• Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
• Tortorella MD, Burn TC, Pratta MA, Abbaszade I, Hollis JM, Liu R, Rosenfeld SA, Copeland RA, Decicco CP, Wynn R, Rockwell A, Yang F, Duke JL, Solomon K, George H, Bruckner R, Nagase H , Ито Й., Эллис Д.М., Росс Х., Висвалл Б.Х., Мерфи К., Хиллман М.С., Холлис Г.Ф., Ньютон Р.С., Магольда Р.Л., Трзаскос Дж. М., Арнер ЕС (июнь 1999 г.). «Очистка и клонирование аггреканазы-1: члена семейства белков ADAMTS». Наука. 284 (5420): 1664–6. Дои:10.1126 / наука.284.5420.1664. PMID  10356395.
• Аббасзаде И., Лю Р.К., Ян Ф., Розенфельд С.А., Росс О.А., Линк-младший, Эллис Д.М., Торторелла, доктор медицины, Пратта М.А., Холлис Дж. М., Винн Р., Дюк Дж. Л., Джордж Х. Дж., Хиллман М.С., Мерфи К., Висвалл Б. Х., Коупленд Р. А. , Decicco CP, Bruckner R, Nagase H, Itoh Y, Newton RC, Magolda RL, Trzaskos JM, Burn TC (август 1999 г.). «Клонирование и характеристика ADAMTS11, агреканазы из семейства ADAMTS». Журнал биологической химии. 274 (33): 23443–50. Дои:10.1074 / jbc.274.33.23443. PMID  10438522.
• Хурскайнен Т.Л., Хирохата С., Селдин М.Ф., Апте СС (сентябрь 1999 г.). «ADAM-TS5, ADAM-TS6 и ADAM-TS7, новые члены нового семейства металлопротеаз цинка. Общие характеристики и геномное распределение семейства ADAM-TS». Журнал биологической химии. 274 (36): 25555–63. Дои:10.1074 / jbc.274.36.25555. PMID  10464288.
• Tortorella MD, Pratta M, Liu RQ, Austin J, Ross OH, Abbaszade I, Burn T, Arner E (июнь 2000 г.). «Сайты расщепления аггрекана рекомбинантной аггреканазой-1 человека (ADAMTS-4)». Журнал биологической химии. 275 (24): 18566–73. Дои:10.1074 / jbc.M909383199. PMID  10751421.
• Мэтьюз Р. Т., Гэри С. К., Церилло С., Пратта М., Соломон К., Арнер Е. К., Хокфилд С. (июль 2000 г.). «Связывание обогащенного головным мозгом гиалуронана (BEHAB) / расщепление бревикана в клеточной линии глиомы опосредуется членом семейства дезинтегрин и металлопротеиназ с тромбоспондиновыми мотивами (ADAMTS)». Журнал биологической химии. 275 (30): 22695–703. Дои:10.1074 / jbc.M909764199. PMID  10801887.
• Торторелла М., Пратта М., Лю Р. К., Аббасзаде И., Росс Х., Берн Т., Арнер Э. (август 2000 г.). «Тромбоспондиновый мотив аггреканазы-1 (ADAMTS-4) имеет решающее значение для распознавания и расщепления аггреканского субстрата». Журнал биологической химии. 275 (33): 25791–7. Дои:10.1074 / jbc.M001065200. PMID  10827174.
• Накамура Х, Фудзи Й, Иноки И., Сугимото К., Танзава К., Мацуки Х, Миура Р., Ямагути Й, Окада Y (декабрь 2000 г.). «Бревикан расщепляется матриксными металлопротеиназами и аггреканазой-1 (ADAMTS4) на разных участках». Журнал биологической химии. 275 (49): 38885–90. Дои:10.1074 / jbc.M003875200. PMID  10986281.
• Mizui Y, Yamazaki K, Kuboi Y, Sagane K, Tanaka I. (сентябрь 2000 г.). «Характеристика 5'-фланкирующей области гена аггреканазы-1 (ADAMTS4) человека». Отчеты по молекулярной биологии. 27 (3): 167–73. Дои:10.1023 / А: 1007253930568. PMID  11254106.
• Сэнди Дж. Д., Вестлинг Дж., Кенаги Р. Д., Ируэла-Ариспе М. Л., Вершарен С., Родригес-Мазанеке Дж. К., Циммерманн Д. Р., Лемир Дж. М., Фишер Дж. В., Уайт Т. Н., Клоуз А. В. (апрель 2001 г.). «Протеолиз Versican V1 в аорте человека in vivo происходит по связи Glu441-Ala442, сайту, который расщепляется рекомбинантными ADAMTS-1 и ADAMTS-4». Журнал биологической химии. 276 (16): 13372–8. Дои:10.1074 / jbc.M009737200. PMID  11278559.
• Гао Дж., Вестлинг Дж., Томпсон В.П., Хауэлл Т.Д., Готтшалл П.Е., Сэнди Дж. Д. (март 2002 г.). «Активация протеолитической активности ADAMTS4 (аггреканазы-1) путем усечения С-конца». Журнал биологической химии. 277 (13): 11034–41. Дои:10.1074 / jbc.M107443200. PMID  11796708.
• Яманиши Ю., Бойл Д.Л., Кларк М., Маки Р.А., Торторелла М.Д., Арнер Е.К., Файрестейн Г.С. (февраль 2002 г.). «Экспрессия и регуляция аггреканазы при артрите: роль TGF-бета». Журнал иммунологии. 168 (3): 1405–12. Дои:10.4049 / jimmunol.168.3.1405. PMID  11801682.
• Вестлинг Дж., Фосанг А.Дж., Ласт К., Томпсон В.П., Томкинсон К.Н., Хеберт Т., МакДонах Т., Коллинз-Рэйси Л.А., ЛаВалли Э.Р., Моррис Е.А., Сэнди Д.Д. (май 2002 г.). «ADAMTS4 расщепляется по сайту аггреканазы (Glu373-Ala374) и вторично по сайту матриксной металлопротеиназы (Asn341-Phe342) в межглобулярном домене аггрекана». Журнал биологической химии. 277 (18): 16059–66. Дои:10.1074 / jbc.M108607200. PMID  11854269.
• Мальфаит А.М., Лю Р.К., Иджири К., Комия С., Торторелла, доктор медицины (июнь 2002 г.). «Ингибирование ADAM-TS4 и ADAM-TS5 предотвращает деградацию аггрекана в остеоартрозном хряще». Журнал биологической химии. 277 (25): 22201–8. Дои:10.1074 / jbc.M200431200. PMID  11956193.

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: M12.221
• Человек ADAMTS4 расположение генома и ADAMTS4 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.