ADAM9 - ADAM9

ADAM9
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1М1В
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAM9, CORD9, MCMP, MDC9, Mltng, домен металлопептидазы ADAM 9
Внешние идентификаторы	OMIM: 602713 MGI: 105376 ГомолоГен: 20824 Генные карты: ADAM9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p11.22 Начните 38,996,869 бп[1] Конец 39,105,261 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 A2 | 8 13,7 см Начните 24,949,611 бп[2] Конец 25,016,927 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание коллагена • Привязка домена SH3 • связывание ионов металлов • связывание интегрина • пептидазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • металлоэндопептидазная активность • связывание ламинина • гидролазная активность • металлопептидазная активность • связывание протеинкиназы C Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • очаговая адгезия • внутренний компонент внешней стороны плазматической мембраны • клеточная мембрана • внеклеточная область • внеклеточная экзосома • поверхность клетки • базолатеральная плазматическая мембрана • внеклеточный Биологический процесс • активация активности MAPKK • положительная регуляция протеолиза мембранного белка эктодомена • ответ на глюкокортикоиды • положительное регулирование слияния макрофагов • межклеточная адгезия, опосредованная интегрином • дифференцировка кератиноцитов • протеолиз • активация моноцитов • ответ на ион кальция • ответ на фактор некроза опухоли • положительное регулирование миграции кератиноцитов • клеточная адгезия • реакция на ион марганца • протеолиз эктодомена мембранного белка • положительное регулирование секреции белка • интегрин-опосредованный сигнальный путь • положительная регуляция клеточной адгезии, опосредованная интегрином • адгезия клеточного матрикса • клеточный ответ на липополисахарид • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • реакция на перекись водорода • миграция клеток • клеточная адгезия, опосредованная интегрином • реакция на ламинарное напряжение сдвига жидкости • ответ на противоопухолевый агент Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8754	11502
Ансамбль	ENSG00000168615 ENSG00000282230	ENSMUSG00000031555
UniProt	Q13443	Q61072
RefSeq (мРНК)	NM_001005845 NM_003816	NM_001270996 NM_007404
RefSeq (белок)	NP_003807	NP_001257925 NP_031430
Расположение (UCSC)	Chr 8: 39 - 39,11 Мб	Chr 8: 24.95 - 25.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дезинтегрин и белок, содержащий домен металлопротеиназы 9 является фермент что у людей кодируется ADAM9 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует член ADAM (дезинтегрин и металлопротеиназа домен) семья. Члены этого семейства представляют собой заякоренные в мембране белки, структурно связанные со змеиным ядом. дезинтегрины, и были вовлечены во множество биологических процессов, включающих межклеточные и межклеточные взаимодействия, включая оплодотворение, развитие мышц и нейрогенез. Белок, кодируемый этим геном, взаимодействует с SH3 домен -содержащий белок, связывает 2-бета-белок, дефицитный по остановке митоза, а также участвует в индуцированном ТРА эктодомен высвобождение закрепленного за мембраной гепарин-связывающего EGF-подобного фактора роста. Были идентифицированы два альтернативных варианта сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

ADAM9 был показан взаимодействовать с участием:

• MAD2L2,^[7]
• SH3GL2,^[8] и
• SNX9^[8]

использованная литература

1. ENSG00000282230 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168615, ENSG00000282230 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031555 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Weskamp G, Kratzschmar J, Reid MS, Blobel CP (июль 1996 г.). «MDC9, широко экспрессируемый клеточный дезинтегрин, содержащий цитоплазматические домены лиганда SH3». J Cell Biol. 132 (4): 717–26. Дои:10.1083 / jcb.132.4.717. ЧВК  2199860. PMID  8647900.
6. «Ген Entrez: ADAM9 ADAM металлопептидазный домен 9 (мелтрин гамма)».
7. Нельсон К.К., Шлендорф Дж., Блобель С.П. (ноябрь 1999 г.). «Доказательства взаимодействия металлопротеазы-дезинтегрина альфа-конвертазы фактора некроза опухоли (TACE) с митотической остановкой дефицита 2 (MAD2), а также металлопротеаза-дезинтегрина MDC9 с новым MAD2-родственным белком, MAD2beta». Biochem. J. 343 (Pt 3): 673–80. Дои:10.1042/0264-6021:3430673. ЧВК  1220601. PMID  10527948.
8. Ховард Л., Нельсон К.К., Мацевич Р.А., Блобель С.П. (октябрь 1999 г.). «Взаимодействие дезинтегринов металлопротеиназы MDC9 и MDC15 с двумя белками, содержащими домен SH3, эндофилином I и SH3PX1». J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. Дои:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID  10531379.

дальнейшее чтение

• Маццокка А., Коппари Р., Де Франко Р., Чо Дж.Й., Либерманн Т.А., Пинзани М., Токер А. (июнь 2005 г.). «Секретируемая форма ADAM9 способствует инвазии карциномы за счет взаимодействия опухоли со стромой». Рак Res. 65 (11): 4728–38. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-4449. PMID  15930291.
• Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), полученные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из незрелых миелоидных клеток человека линии KG-1». ДНК Res. 1 (1): 27–35. Дои:10.1093 / dnares / 1.1.27. PMID  7584026.
• Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), выведенные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из незрелых миелоидных клеток человека линии KG-1 (приложение)». ДНК Res. 1 (1): 47–56. Дои:10.1093 / днарес / 1.1.47. PMID  7584028.
• Маккай Н., Даллас Д. Д., Эдвардс Т. и др. (1996). «Клонирование новой мембраносвязанной металлопротеиназы из клеток миеломы человека». Biochem. J. 318 (2): 459–62. Дои:10.1042 / bj3180459. ЧВК  1217643. PMID  8809033.
• Маккай Н., Эдвардс Т., Даллас Д. Д. и др. (1997). «Экспрессия членов нового семейства мембранных металлопротеиназ (ADAM) в суставных хондроцитах человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 230 (2): 335–9. Дои:10.1006 / bbrc.1996.5957. PMID  9016778.
• Идзуми Ю., Хирата М., Хасува Х. и др. (1999). «Металлопротеаза-дезинтегрин, MDC9 / мелтрин-гамма / ADAM9 и PKCdelta участвуют в индуцированном TPA выделении эктодомена закрепленного на мембране гепарин-связывающего EGF-подобного фактора роста». EMBO J. 17 (24): 7260–72. Дои:10.1093 / emboj / 17.24.7260. ЧВК  1171072. PMID  9857183.
• Roghani M, Becherer JD, Moss ML и др. (1999). «Металлопротеаза-дезинтегрин MDC9: внутриклеточное созревание и каталитическая активность». J. Biol. Chem. 274 (6): 3531–40. Дои:10.1074 / jbc.274.6.3531. PMID  9920899.
• Нельсон KK, Schlöndorff J, Blobel CP (2000). «Доказательства взаимодействия металлопротеазы-дезинтегрина альфа-конвертазы фактора некроза опухоли (TACE) с митотической остановкой дефицита 2 (MAD2), а также металлопротеаза-дезинтегрина MDC9 с новым MAD2-родственным белком, MAD2beta». Biochem. J. 343 (3): 673–80. Дои:10.1042/0264-6021:3430673. ЧВК  1220601. PMID  10527948.
• Ховард Л., Нельсон К.К., Мацевич Р.А., Блобель С.П. (1999). «Взаимодействие дезинтегринов металлопротеиназы MDC9 и MDC15 с двумя белками, содержащими домен SH3, эндофилином I и SH3PX1». J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. Дои:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID  10531379.
• Чжоу М., Грэм Р., Рассел Дж., Краучер П.И. (2001). «MDC-9 (ADAM-9 / Meltrin гамма) функционирует как адгезионная молекула, связывая интегрин альфа (v) бета (5)». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 280 (2): 574–80. Дои:10.1006 / bbrc.2000.4155. PMID  11162558.
• Намба К., Нишио М., Мори К. и др. (2002). «Участие ADAM9 в образовании многоядерных гигантских клеток моноцитов крови». Cell. Иммунол. 213 (2): 104–13. Дои:10.1006 / cimm.2001.1873. PMID  11831872.
• Это К., Хуэт С., Таруи Т. и др. (2002). «Функциональная классификация ADAM на основе консервативного мотива связывания с интегрином альфа 9бета 1: значение для связывания сперматозоида и яйцеклетки и других клеточных взаимодействий». J. Biol. Chem. 277 (20): 17804–10. Дои:10.1074 / jbc.M200086200. PMID  11882657.
• Лим Дж. М., Ли Дж. Х., Ви В. Р., Джу К. К. (2002). «Снижение экспрессии ADAM9 в передней полярной катаракте». Журнал катарактальной и рефракционной хирургии. 28 (4): 697–702. Дои:10.1016 / S0886-3350 (01) 01236-6. PMID  11955914. S2CID  21982654.
• Hotoda N, Koike H, Sasagawa N, Ishiura S (2002). «Секретируемая форма человеческого ADAM9 обладает альфа-секретазной активностью для АРР». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 293 (2): 800–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00302-9. PMID  12054541.
• Амур А., Knight CG, английский WR и др. (2002). «Ферментативная активность ADAM8 и ADAM9 не регулируется TIMP». FEBS Lett. 524 (1–3): 154–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03047-8. PMID  12135759. S2CID  37423323.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мохан С., Томпсон Г.Р., Амаар Ю.Г. и др. (2003). «ADAM-9 представляет собой протеазу протеина-5, связывающую инсулиноподобный фактор роста, продуцируемую и секретируемую человеческими остеобластами». Биохимия. 41 (51): 15394–403. Дои:10.1021 / bi026458q. PMID  12484779.
• Асаи М., Хаттори С., Сабо Б. и др. (2003). «Предполагаемая функция ADAM9, ADAM10 и ADAM17 в качестве альфа-секретазы APP». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 301 (1): 231–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02999-6. PMID  12535668.
• О'Ши С., Маккай Н., Багги И. и др. (2003). «Экспрессия мРНК и белка ADAM-9 при раке груди человека». Int. J. Рак. 105 (6): 754–61. Дои:10.1002 / ijc.11161. PMID  12767059. S2CID  19284959.
• Грюцманн Р., Люттгес Дж., Сипос Б. и др. (2004). «Экспрессия ADAM9 при раке поджелудочной железы связана с типом опухоли и является прогностическим фактором при аденокарциноме протока». Br. J. Рак. 90 (5): 1053–8. Дои:10.1038 / sj.bjc.6601645. ЧВК  2409625. PMID  14997207.

внешние ссылки

• ADAM9 на Атлас генетики и онкологии
• Человек ADAM9 расположение генома и ADAM9 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.