ADAMTS9 - ADAMTS9

ADAMTS9
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAMTS9, Металлопептидаза ADAM с мотивом тромбоспондина 1 типа 9
Внешние идентификаторы	OMIM: 605421 MGI: 1916320 ГомолоГен: 18821 Генные карты: ADAMTS9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п14.1 Начинать 64,515,654 бп[1] Конец 64,688,000 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 D1 Начинать 92,772,699 бп[2] Конец 92,943,492 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • пептидазная активность • металлоэндопептидазная активность • эндопептидазная активность • гидролазная активность • металлопептидазная активность • связывание ионов металлов Сотовый компонент • внеклеточная область • поверхность клетки • внеклеточный • внеклеточный матрикс • эндоплазматический ретикулум • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • транспорт белка • регуляция пигментации развития • везикулярный транспорт • положительная регуляция дифференцировки меланоцитов • протеолиз • катаболический процесс гликопротеина • морфогенез сердечного клапана • развитие желудочковой сердечной мышцы • отрицательная регуляция миграции эндотелиальных клеток • организация внеклеточного матрикса • морфогенез аорты • адгезия эндотелиальных клеток к матрице • отрицательная регуляция прорастающего ангиогенеза • реакция на бактерии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	56999	101401
Ансамбль	ENSG00000163638	ENSMUSG00000030022
UniProt	Q9P2N4	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_182920 NM_001318781	NM_175314
RefSeq (белок)	NP_001305710 NP_891550	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 3: 64,52 - 64,69 Мб	Chr 6: 92,77 - 92,94 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами 9 является фермент что у людей кодируется ADAMTS9 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член семейства белков ADAMTS (дезинтегрин и металлопротеиназа с тромбоспондиновыми мотивами). Члены этого семейства имеют несколько общих белковых модулей, включая пропептидную область, домен металлопротеиназы, дезинтегрин-подобный домен и мотив тромбоспондина типа 1 (TS). Отдельные члены этого семейства различаются по количеству С-концевых TS мотивов, а некоторые имеют уникальные С-концевые домены. Члены семейства ADAMTS участвуют в расщеплении протеогликанов, контроле формы органов во время развития и ингибировании ангиогенеза. Этот ген локализован в хромосоме 3p14.3-p14.2, области, которая, как известно, теряется при наследственных опухолях почек.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163638 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030022 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кларк М.Э., Кельнер Г.С., Турбевиль, Лос-Анджелес, Бойер А., Арден К.С., Маки Р.А. (сентябрь 2000 г.). «ADAMTS9, новый член семейства генов ADAM-TS / металлоспондинов». Геномика. 67 (3): 343–50. Дои:10.1006 / geno.2000.6246. PMID  10936055.
6. «Ген Entrez: металлопептидаза ADAMTS9 ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 9».

дальнейшее чтение

• Тан Б.Л. (2001). «ADAMTS: новое семейство протеаз внеклеточного матрикса». Int. J. Biochem. Cell Biol. 33 (1): 33–44. Дои:10.1016 / S1357-2725 (00) 00061-3. PMID  11167130.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (1): 65–73. Дои:10.1093 / днарес / 7.1.65. PMID  10718198.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Somerville RP, Longpre JM, Jungers KA и др. (2003). «Характеристика ADAMTS-9 и ADAMTS-20 как отдельного подсемейства ADAMTS, связанного с Caenorhabditis elegans GON-1». J. Biol. Chem. 278 (11): 9503–13. Дои:10.1074 / jbc.M211009200. PMID  12514189.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Кросс Н.А., Чандрасекхаран С., Джоконья Н. и др. (2005). «Экспрессия и регуляция ADAMTS-1, -4, -5, -9 и -15 и TIMP-3 с помощью TGFbeta1 в клетках простаты: актуальность для накопления версикана». Предстательная железа. 63 (3): 269–75. Дои:10.1002 / pros.20182. PMID  15599946. S2CID  24137815.
• Зенг В., Коркоран С., Коллинз-Рэйси Л.А. и др. (2006). «Гликозаминогликан-связывающие свойства и агреканазная активность усеченных ADAMTS: сравнительный анализ с ADAMTS-5, -9, -16 и -18». Биохим. Биофиз. Acta. 1760 (3): 517–24. Дои:10.1016 / j.bbagen.2006.01.013. PMID  16507336.
• Ку Б.Х., Лонгпре Дж. М., Сомервилль Р. П. и др. (2006). «Обработка поверхности клеток pro-ADAMTS9 фурином». J. Biol. Chem. 281 (18): 12485–94. Дои:10.1074 / jbc.M511083200. PMID  16537537.
• Lo PH, Leung AC, Kwok CY, et al. (2007). «Идентификация картирования критической области, подавляющей опухоль, на 3p14.2 в плоскоклеточной карциноме пищевода и исследования гена-кандидата опухолевого супрессора, ADAMTS9». Онкоген. 26 (1): 148–57. Дои:10.1038 / sj.onc.1209767. PMID  16799631.

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: M12.021
• Человек ADAMTS9 расположение генома и ADAMTS9 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.