V-АТФаза - V-ATPase

Эта статья о вакуолярном ЧАС+
 АТФаза. Для желудка ЧАС+
/ К+
 АТФаза, см. Водородная АТФаза калия. Для плазматической мембраны растений / грибов ЧАС+
 АТФаза, см. Протонная АТФаза.
V-АТФаза
VATPase-en.png
Схема V-АТФазы
Идентификаторы
СимволV-АТФаза
TCDB3.A.2
OPM суперсемейство5
Белок OPM2bl2
Мембранома226
V-АТФаза, субъединица c (Vo)
2bl2.png
Межмембранная область натрия V-типа АТФаза из Enterococcus hirae. Расчетные углеводородные границы липидный бислой показаны красными и синими точками
Идентификаторы
СимволATP-synt_C
PfamPF00137
ИнтерПроIPR002379
PROSITEPDOC00526
SCOP21aty / Объем / СУПФАМ
V-АТФаза, субъединица C (V1)
PDB 1u7l EBI.jpg
кристаллическая структура субъединицы C (vma5p) дрожжевой v-атпазы
Идентификаторы
СимволV-АТФаза_C
PfamPF03223
ИнтерПроIPR004907
SCOP21u7l / Объем / СУПФАМ
V-АТФаза, субъединица I / a
Идентификаторы
СимволV_ATPase_I
PfamPF01496
ИнтерПроIPR002490
SCOP23ррк / Объем / СУПФАМ
TCDB3.A.2
V-АТФаза, субъединица E
Идентификаторы
СимволvATP-synt_E
PfamPF01991
Pfam кланCL0255
ИнтерПроIPR002842
V-АТФаза, субъединица d / d2
PDB 1r5z EBI.jpg
кристаллическая структура субъединицы C (дрожжевой субъединицы d) v-атпазы
Идентификаторы
СимволvATP-synt_AC39
PfamPF01992
ИнтерПроIPR002843
SCOP21r5z / Объем / СУПФАМ
V-АТФаза, субъединица H, N-конец
PDB 1ho8 EBI.jpg
кристаллическая структура регуляторной субъединицы H атпазы v-типа saccharomyces cerevisiae
Идентификаторы
СимволV-АТФаза_H_N
PfamPF03224
Pfam кланCL0020
ИнтерПроIPR004908
SCOP21ho8 / Объем / СУПФАМ
V-АТФаза, субъединица G
Идентификаторы
СимволV-АТФаза_G
PfamPF03179
Pfam кланCL0255
ИнтерПроIPR005124

АТФаза вакуолярного типа (V-АТФаза) является высококонсервативным эволюционно древним фермент с удивительно разнообразными функциями в эукариотический организмы.[1] V-АТФазы подкисляют широкий спектр внутриклеточных органеллы и накачка протонов через плазматические мембраны из множества типов клеток. В-АТФазы связывают энергию Гидролиз АТФ протону транспорт через внутриклеточные и плазматические мембраны эукариотических клеток. Это обычно рассматривается как полная противоположность АТФ-синтаза потому что АТФ-синтаза - это протонный канал, который использует энергию протонного градиента для производства АТФ. Однако V-АТФаза - это протонный насос, который использует энергию гидролиза АТФ для создания протонного градиента.

В АТФаза архейного типа (А-АТФаза) представляет собой родственную группу АТФаз, обнаруженных у архей, которые часто работают как АТФ-синтаза. Он образует кладу В / А-АТФаза с V-АТФазой. Большинство членов обеих групп шаттл-протонов (ЧАС+
), но некоторые члены эволюционировали, чтобы использовать ионы натрия (Na+
) вместо.

Роли, которые играют V-ATPases

V-АТФазы обнаружены в мембранах многих органелл, таких как эндосомы, лизосомы, и секреторные пузырьки, где они играют множество ролей, критически важных для функции этих органелл. Например, градиент протонов через вакуолярную мембрану дрожжей, создаваемый V-АТФазами, стимулирует поглощение кальция в вакуоли через ЧАС+
/ Ca2+
 антипортерная система.[2] При синаптической передаче в нейрональных клетках V-АТФаза подкисляет синаптические везикулы.[3] Норэпинефрин проникает в пузырьки с помощью V-АТФазы.

V-АТФазы также обнаруживаются в плазматических мембранах самых разных клеток, таких как интеркалированные клетки из почка, остеокласты (клетки, резорбирующие костную ткань), макрофаги, нейтрофилы, сперма, средняя кишка ячейки насекомые, и некоторые опухоль клетки.[4] V-АТФазы плазматической мембраны участвуют в таких процессах, как pH гомеостаз, спаренный транспорт, и опухоль метастаз. V-АТФазы в акросомной мембране сперматозоидов подкисляют акросома. Это закисление активирует протеазы требуется для просверливания плазматической мембраны яйцо. V-АТФазы в плазматической мембране остеокластов перекачивают протоны на поверхность кости, что необходимо для резорбции кости. В интеркалированных клетках почек V-АТФазы перекачивают протоны в моча, что позволяет бикарбонат реабсорбция в кровь. Кроме того, другие разнообразные биологические процессы, такие как доставка токсина, проникновение вируса, нацеливание на мембрану, апоптоз, регуляция цитоплазматического pH, протеолитический процесс и подкисление внутриклеточных систем, играют важную роль V-ATPases.[5]

V-АТФазы также играют важную роль в развитии клеточного морфогенеза. Нарушение гена vma-1, который кодирует каталитическую субъединицу (A) фермента, серьезно снижает скорость роста, дифференциации и способность продуцировать жизнеспособные споры у гриба Neurospora crassa. [6]

Структура

В дрожжи Лучше всего охарактеризована V-АТФаза. Идентифицировано по крайней мере тринадцать субъединиц, образующих функциональный комплекс V-АТФазы, который состоит из двух доменов. Субъединицы принадлежат либо к Vо домен (связанные с мембраной субъединицы, строчные буквы на рисунке) или V1 домен (периферически связанные субъединицы, заглавные буквы на рисунке).

V1 включает восемь субъединиц, A-H, с тремя копиями каталитических субъединиц A и B, тремя копиями субъединиц E и G статора и одной копией регуляторных субъединиц C и H. Кроме того, V1 домен также содержит субъединицы D и F, которые образуют центральную ось ротора.[7] V1 домен содержит тканеспецифические изоформы субъединиц, включая B, C, E и G. Мутации в изоформе B1 приводят к заболеванию человека дистальных почечных канальцев. ацидоз и сенсоневральная глухота.

Vо домен содержит шесть различных субъединиц, a, d, c, c ', c "и e, при этом стехиометрия c-кольца все еще является предметом споров, поскольку декамер постулируется для табачного рогатого червя (Manduca sexta ) V-АТФаза. Млекопитающее Vо домен содержит тканеспецифические изоформы для субъединиц a и d, тогда как дрожжевая V-ATPase содержит две изоформы субъединиц, специфичных для органелл, а именно Vph1p и Stv1p. Мутации изоформы a3 приводят к развитию у человека злокачественного остеопетроз, а мутации в изоформе а4 приводят к ацидозу дистальных почечных канальцев, в некоторых случаях к нейросенсорной глухоте.

V1 отвечает за гидролиз АТФ, тогда как Vо домен отвечает за перемещение протонов. Гидролиз АТФ в каталитических сайтах связывания нуклеотидов на субъединице A приводит в движение центральный стержень, состоящий из субъединиц D и F, который, в свою очередь, приводит в движение цилиндр из субъединиц c относительно субъединицы a. Сложная структура V-АТФазы была выявлена ​​через структуру М. Секста и дрожжевые комплексы, которые были решены одночастичной крио-ЭМ и негативным окрашиванием соответственно.[8][9][10] Эти структуры показали, что V-АТФаза имеет сеть из 3 статоров, связанную плотным воротником, образованным субъединицами C, H и a, которые, разделяя V1 и Vо домены, не взаимодействуют с центральной осью ротора, образованной субъединицами F, D и d. Вращение этой центральной оси ротора, вызванное гидролизом АТФ в каталитических доменах AB, приводит к перемещению ствола субъединиц c мимо субъединицы α, которая управляет переносом протонов через мембрану. А стехиометрия двух протонов, перемещаемых на каждый гидролизованный АТФ, было предложено Джонсоном.[11]

В дополнение к структурным субъединицам дрожжевой V-ATPase были идентифицированы ассоциированные белки, которые необходимы для сборки. Эти ассоциированные белки необходимы для Vо сборки домена и называются Vma12p, Vma21p и Vma22p.[12][13][14][15] Два из трех белков, Vma12p и Vma22p, образуют комплекс, который временно связывается с Vph1p (субъединица а), чтобы способствовать его сборке и созреванию.[14][16][17][18] Vma21p координирует сборку Vо подразделений, а также сопровождение Vо домен в пузырьки для транспорта в Гольджи.[19]

V1

V1 домен V-АТФазы является сайтом гидролиза АТФ. В отличие от Vо, V1 домен является гидрофобным.[5] Этот растворимый домен состоит из гексамера чередующихся субъединиц A и B, центрального ротора D, периферических статоров G и E и регуляторных субъединиц C и H. Гидролиз АТФ вызывает конформационные изменения в шести интерфейсах A | B и, соответственно, их вращение. центрального ротора D. В отличие от АТФ-синтазы, V1 при диссоциации домен не является активной АТФазой.

V1 Подразделения[20]
ПодразделениеЧеловеческий генПримечание
А, БATP6V1A, ATP6V1B1, ATP6V1B2Каталитический гексамер.
CATP6V1C1, ATP6V1C2
DATP6V1DЦентральная ножка ротора, отвечающая за ионную специфичность.
E, GATP6V1E1, ATP6V1E2, ATP6V1G1, ATP6V1G2, ATP6V1G3
FATP6V1F
ЧАСATP6V1H

Субъединица C

V-АТФаза (Vacuolar-ATPase) C представляет собой Терминал C подразделение, входящее в состав Комплекс V1, и локализуется на границе между комплексами V1 и Vo.[21]

Функция субъединицы C

Субъединица C играет важную роль в контроле сборки V-АТФазы, действуя как гибкий статор, который удерживает вместе каталитический (V1) и мембрана (VO) секторы фермента.[22] Высвобождение субъединицы C из комплекса АТФазы приводит к диссоциация подкомплексов V1 и Vo, что является важным механизм в контроле активности V-АТФазы в клетки. По сути, создавая высокий электрохимический градиент и низкий pH, фермент вырабатывает больше АТФ.

Субъединицы E, G

Эти связанные субъединицы составляют основу (и) A / V-ATPase. Они важны при сборке и могут действовать как толкатели. E имеет крышку для подключения к A / B, а G - нет.[20] Вероятно, они произошли от одного белка дупликация гена.[23]

Субъединица H

Эта субъединица участвует только в деятельности, а не в сборке. Эта субъединица также действует как ингибитор свободных субъединиц V1; он останавливает гидролиз АТФ, когда V1 и Vo диссоциируют.[24]

Vо

Vо домен отвечает за перемещение протонов. В отличие от F-типа АТФ-синтаза, Vо домен обычно переносит протоны против их собственного градиента концентрации. Вращение Vо переносит протоны в движении, согласованном с V1 домен, отвечающий за гидролиз АТФ. Vо домен является гидрофильным и состоит из нескольких диссоциируемых субъединиц.[5] Эти субъединицы присутствуют в Vо домен, чтобы сделать его функциональной протонной транслоказой; они описаны ниже.

Vо Подразделения[20]
ПодразделениеЧеловеческий генПримечание
а / яATP6V0A1, ATP6V0A2, ATP6V0A4
cATP6V0B, ATP6V0CКольцо разного размера.
Округ КолумбияATP6V0D1, ATP6V0D2
еATP6V0E1, ATP6V0E29 кДа гидрофобный сборочный белок.
AC45 / S1ATP6AP1Дополнительный блок
S2ATP6AP2Дополнительный блок

Субъединица а / я

Субъединица 116 кДа (или субъединица а) и субъединица I обнаруживаются в Vo или Ao комплексе V- ​​или A-ATPases соответственно. Субблок 116 кДа представляет собой трансмембранный гликопротеин необходим для сборки и протонной транспортной активности комплекса АТФазы. Существует несколько изоформ субъединицы 116 кДа, обеспечивающих потенциальную роль в дифференциальном нацеливании и регуляции V-АТФазы для конкретных органелл.

Функция субъединицы 116 кДа не определена, но ее предсказанная структура состоит из 6-8 трансмембранозных секторов, предполагая, что она может функционировать аналогично субъединице а FO.

Субъединица d / C

Субъединица d в ​​V-ATPases, называемая субъединицей C в A-ATpases, является частью комплекса Vo. Они подходят к середине c-образного кольца, поэтому считаются ротором. У эукариот существует две версии этой субъединицы: d / d1 и d2.[25]

У млекопитающих d1 (ATP6V0D1 ) - это широко распространенная версия, а d2 (ATP6V0D2 ) экспрессируется только в определенных типах клеток.[25]

Субъединица c

Подобно АТФ-синтазе F-типа, трансмембранная область V-АТФазы включает кольцо пронизывающих мембрану субъединиц, которые в первую очередь ответственны за транслокацию протонов. Однако в отличие от АТФ-синтазы F-типа, V-АТФаза имеет несколько связанных субъединиц в с-кольце; У грибов, таких как дрожжи, есть три связанных субъединицы (различной стехиометрии), а у большинства других эукариот - две.

Сборка V-АТФазы

V-АТФазы дрожжей не могут собраться, когда какой-либо из генов, кодирующих субъединицы, удален, за исключением субъединиц H и c ".[26][27][28] Без субъединицы H собранная V-АТФаза неактивна,[13][29] и потеря субъединицы с "приводит к нарушению ферментативной активности.[27]

Точные механизмы, с помощью которых происходит сборка V-ATPases, все еще остаются спорными, с доказательствами, указывающими на две разные возможности. Мутационный анализ и in vitro тесты показали, что предварительно собранный Vо и V1 домены могут объединяться в один комплекс в процессе, называемом независимой сборкой. Поддержка самостоятельной сборки включает выводы, что собранный Vо домен можно найти в вакуоли в отсутствие V1 домен, тогда как бесплатный V1 домены можно найти в цитоплазма а не на вакуоль.[30][31] В отличие, in vivo Эксперименты по отслеживанию импульсов выявили ранние взаимодействия между Vо и V1 субъединицы, а именно субъединицы а и В, предполагая, что субъединицы добавляются поэтапно, чтобы сформировать единый комплекс в согласованном процессе сборки.[32]

Эволюция V-АТФазы

Относительно новая техника под названием воскрешение наследственного гена пролил новый свет на эволюционную историю V-АТФазы. Было показано, как структура V-АТФазы предковой формы, состоящей из двух разных белков, эволюционирует в грибную версию с тремя разными белками.[33][34][35] АТФаза V-типа похожа на архейную (так называемую) АТФ-синтаза A-типа, факт, подтверждающий архейное происхождение эукариот (например, Гипотеза эоцитов, смотрите также Lokiarchaeota ). Исключительная встречаемость некоторых линий архей с F-типом и некоторых линий бактерий с АТФазой A-типа, соответственно, рассматривается как результат горизонтальный перенос генов.[36]

Регулирование активности V-АТФазы

Известно, что V-АТФазы специфически ингибируются макролидными антибиотиками, такими как конканамицин (CCA) и балифомицин A.1.[37] В естественных условиях регуляция активности V-АТФазы осуществляется за счет обратимой диссоциации V1 домен из Vо домен. После первоначальной сборки оба насекомых Manduca sexta и дрожжевые V-ATPases могут обратимо разбираться на свободные Vо и V1 домены после 2-5-минутного лишения глюкозы.[30] Обратимая разборка может быть общим механизмом регуляции активности V-АТФазы, поскольку она существует у дрожжей и насекомых. Предлагается провести повторную сборку с помощью комплекса, называемого RAVE (регулятор ЧАС+
-АТФаза вакуолярной и эндосомальной мембран).[38] Разборка и повторная сборка V-АТФаз не требует синтеза нового белка, но требует неповрежденного микротрубчатый сеть.[39]

Болезни человека

Остеопетроз

Остеопетроз это родовое имя, которое представляет группу наследственных состояний, при которых имеется дефект в остеокластическая резорбция кости. У людей встречаются как доминантный, так и рецессивный остеопетроз.[40][41] Аутосомно-доминантный остеопетроз проявляется легкими симптомами у взрослых, которые часто испытывают переломы костей из-за хрупкости костей.[40] Более тяжелая форма остеопетроза называется аутосомно-рецессивным инфантильным злокачественным остеопетрозом.[41][42][43] Идентифицированы три гена, ответственных за рецессивный остеопетроз у человека. Все они непосредственно участвуют в путях генерации и секреции протонов, которые необходимы для резорбции кости. Один ген карбоангидраза II (CAII), который при мутации вызывает остеопетроз с почечный канальцевый ацидоз (тип 3).[44] Мутации гена ClC7 хлоридного канала также приводят как к доминантному, так и к рецессивному остеопетрозу.[40] Примерно у 50% пациентов с рецессивным инфантильным злокачественным остеопетрозом наблюдаются мутации изоформы субъединицы a3 V-АТФазы.[42] [45][46] У людей было идентифицировано 26 мутаций в изоформе а3 субъединицы V-АТФазы, обнаруженных в остеокластах, которые приводят к аутосомно-рецессивному остеопетрозу при заболевании костей.[42][41][45][47]

Дистальный почечный канальцевый ацидоз (dRTA)

Важность активности V-АТФазы в секреции протонов почками подчеркивается наследственным заболеванием дистального отдела. почечный канальцевый ацидоз. Во всех случаях почечный канальцевый ацидоз возникает в результате нарушения нормальной почечный механизмы, регулирующие системный pH. Существует четыре типа почечного канальцевого ацидоза. Тип 1 - это ацидоз дистальных почечных канальцев, возникающий в результате недостаточности кортикальный собирательный проток для подкисления мочи ниже pH 5.[48] Некоторые пациенты с аутосомно-рецессивный dRTA также имеют нейросенсорная тугоухость.[49] Наследование этого типа RTA является результатом либо мутаций изоформы B1 субъединицы V-АТФазы или изоформы a4, либо мутаций группа 3 (также называемый AE1), обменник Cl- / HCO3-.[49][50][51] Двенадцать различных мутаций изоформы B1 V-АТФазы[52] и двадцать четыре различных мутации в a4 приводят к dRTA.[52][49] Обратная транскрипция полимеразной цепной реакции исследования показали экспрессию субъединицы а4 в интеркалированной клетке почки и в улитка.[52] dRTA, вызванная мутациями в гене субъединицы а4, в некоторых случаях может быть связана с глухотой из-за неспособности нормально подкислять эндолимфа из внутреннее ухо.[51]

Х-сцепленная миопатия с чрезмерной аутофагией (XMEA)

Х-сцепленная миопатия с чрезмерной аутофагией это редкое генетическое заболевание, возникающее в результате мутации гена VMA21.[53] Заболевание возникает в детстве и приводит к медленно прогрессирующей мышечной слабости, обычно начинающейся в ногах, и некоторым пациентам в конечном итоге может потребоваться инвалидная коляска в пожилом возрасте. Белок Vma21 помогает в сборке V-АТФазы, а мутации, связанные с XMEA, приводят к снижению активности V-АТФазы и увеличению лизосомный pH.[53]

Номенклатура

Срок Vо имеет в нижнем индексе строчную букву «о» (а не цифру «ноль»). "O" означает олигомицин, который связывается с гомологичной областью в F-АТФаза. Стоит отметить, что в нотации генов человека в NCBI он обозначается как «ноль», а не как буква «о». Например, ген c-субъединицы Vo человека указан в базе данных генов NCBI как «ATP6V0C» (с нулем), а не как «ATP6VOC» (с «о»). Многие литературные источники также допускают эту ошибку.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Нельсон Н., Перзов Н., Коэн А., Хагай К., Падлер В., Нельсон Н. (январь 2000 г.). «Клеточная биология генерации протон-движущей силы V-АТФазами». Журнал экспериментальной биологии. 203 (Pt 1): 89–95. PMID  10600677.
  2. ^ Охя Й, Умемото Н., Танида I, Охта А, Иида Х, Анраку Й (июль 1991 г.). «Чувствительные к кальцию cls мутанты Saccharomyces cerevisiae, демонстрирующие Pet-фенотип, приписываются дефектам H (+) - АТФазной активности вакуолярной мембраны». Журнал биологической химии. 266 (21): 13971–7. PMID  1830311.
  3. ^ Wienisch M, Klingauf J (август 2006 г.). «Везикулярные белки, экзоцитозированные и впоследствии извлеченные с помощью компенсаторного эндоцитоза, не идентичны». Природа Неврология. 9 (8): 1019–27. Дои:10.1038 / nn1739. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-E436-F. PMID  16845386. S2CID  12808314.
  4. ^ Идзуми Х., Торигоэ Т., Исигучи Х., Урамото Х., Ёсида Й., Танабэ М., Исэ Т, Мураками Т., Йошида Т., Номото М., Коно К. (декабрь 2003 г.). «Клеточные регуляторы pH: потенциально многообещающие молекулярные мишени для химиотерапии рака». Отзывы о лечении рака. 29 (6): 541–9. Дои:10.1016 / S0305-7372 (03) 00106-3. PMID  14585264.
  5. ^ а б c Эмма Б., Форест О., Барри Б. (июнь 1997 г.). «Мутации pma-1, гена, кодирующего Н + АТФазу плазматической мембраны Neurospora crassa, подавляют ингибирование роста конканамицином А, специфическим ингибитором вакуолярных АТФаз». Журнал биологической химии. 272 (23): 14776–14786. Дои:10.1074 / jbc.272.23.14776. PMID  9169444. S2CID  29865381.
  6. ^ Боуман, Э. Дж., И Боуман, Б. Дж. (2000). Клеточная роль V-АТФазы в Neurospora crassa: анализ мутантов, устойчивых к конканамицину или лишенных каталитической субъединицы A. Журнал экспериментальной биологии, 203 (Pt 1), 97–106.
  7. ^ Китагава Н., Мазон Х, Хек А. Дж., Уилкенс С. (февраль 2008 г.). «Стехиометрия периферических субъединиц стебля E и G дрожжевой V1-АТФазы, определяемая масс-спектрометрией». Журнал биологической химии. 283 (6): 3329–37. Дои:10.1074 / jbc.M707924200. PMID  18055462. S2CID  27627066.
  8. ^ Muench SP, Huss M, Song CF, Phillips C, Wieczorek H, Trinick J, Harrison MA (март 2009 г.). «Криоэлектронная микроскопия вакуолярного двигателя АТФазы показывает его механическую и регуляторную сложность». Журнал молекулярной биологии. 386 (4): 989–99. Дои:10.1016 / j.jmb.2009.01.014. PMID  19244615.
  9. ^ Diepholz M, Börsch M, Böttcher B (октябрь 2008 г.). «Структурная организация V-АТФазы и ее значение для регулятивной сборки и разборки». Сделки Биохимического Общества. 36 (Pt 5): 1027–31. Дои:10.1042 / BST0361027. PMID  18793183. S2CID  23852611.
  10. ^ Zhang Z, Zheng Y, Mazon H, Milgrom E, Kitagawa N, Kish-Trier E, Heck AJ, Kane PM, Wilkens S (декабрь 2008 г.). «Структура дрожжевой вакуолярной АТФазы». Журнал биологической химии. 283 (51): 35983–95. Дои:10.1074 / jbc.M805345200. ЧВК  2602884. PMID  18955482.
  11. ^ Джонсон Р.Г., Бирс М.Ф., Скарпа А. (сентябрь 1982 г.). «Н + АТФаза хромаффинных гранул. Кинетика, регуляция и стехиометрия». Журнал биологической химии. 257 (18): 10701–7. PMID  6213624.
  12. ^ Хирата Р., Умемото Н., Хо М.Н., Охя Й., Стивенс Т.Х., Анраку Й. (январь 1993 г.). «VMA12 необходим для сборки субъединиц вакуолярной H (+) - АТФазы на вакуолярной мембране у Saccharomyces cerevisiae». Журнал биологической химии. 268 (2): 961–7. PMID  8419376.
  13. ^ а б Хо М.Н., Хирата Р., Умемото Н., Охя Ю., Такацуки А., Стивенс Т.Х., Анраку Ю. (август 1993 г.). «VMA13 кодирует 54-кДа вакуолярную субъединицу H (+) - АТФазы, необходимую для активности, но не сборки ферментного комплекса в Saccharomyces cerevisiae». Журнал биологической химии. 268 (24): 18286–92. PMID  8349704.
  14. ^ а б Хилл К.Дж., Стивенс Т.Х. (сентябрь 1994 г.). «Vma21p - это мембранный белок дрожжей, удерживаемый в эндоплазматическом ретикулуме дилизиновым мотивом и необходимый для сборки вакуолярного комплекса Н (+) - АТФаза». Молекулярная биология клетки. 5 (9): 1039–50. Дои:10.1091 / mbc.5.9.1039. ЧВК  301125. PMID  7841520.
  15. ^ Джексон DD, Стивенс TH (октябрь 1997 г.). «VMA12 кодирует белок эндоплазматического ретикулума дрожжей, необходимый для сборки вакуолярной Н + -АТФазы». Журнал биологической химии. 272 (41): 25928–34. Дои:10.1074 / jbc.272.41.25928. PMID  9325326. S2CID  38400074.
  16. ^ Хилл К.Дж., Стивенс Т.Х. (сентябрь 1995 г.). «Vma22p представляет собой новый белок, связанный с эндоплазматическим ретикулумом, необходимый для сборки дрожжевого вакуолярного H (+) - АТФазного комплекса». Журнал биологической химии. 270 (38): 22329–36. Дои:10.1074 / jbc.270.38.22329. PMID  7673216. S2CID  34639779.
  17. ^ Грэм Л.А., Хилл К.Дж., Стивенс Т.Х. (июль 1998 г.). «Сборка дрожжевой вакуолярной H + -АТФазы происходит в эндоплазматическом ретикулуме и требует сборочного комплекса Vma12p / Vma22p». Журнал клеточной биологии. 142 (1): 39–49. Дои:10.1083 / jcb.142.1.39. ЧВК  2133036. PMID  9660861.
  18. ^ Грэм Л.А., Фланнери А.Р., Стивенс Т.Х. (август 2003 г.). «Структура и сборка дрожжевой V-АТФазы». Журнал биоэнергетики и биомембран. 35 (4): 301–12. Дои:10.1023 / А: 1025772730586. PMID  14635776. S2CID  37806912.
  19. ^ Малкус П., Грэм Л.А., Стивенс Т.Х., Шекман Р. (ноябрь 2004 г.). «Роль Vma21p в сборке и транспорте дрожжевой вакуолярной АТФазы». Молекулярная биология клетки. 15 (11): 5075–91. Дои:10.1091 / mbc.E04-06-0514. ЧВК  524777. PMID  15356264.
  20. ^ а б c Стюарт АГ, Ламинг Э.М., Собти М., Сток Д. (апрель 2014 г.). «Ротационные АТФазы - динамические молекулярные машины». Текущее мнение в структурной биологии. 25: 40–8. Дои:10.1016 / j.sbi.2013.11.013. PMID  24878343.
  21. ^ Иноуэ Т., Форгак М. (июль 2005 г.). «Цистеин-опосредованное перекрестное связывание указывает, что субъединица C V-АТФазы находится в непосредственной близости от субъединиц E и G домена V1 и субъединицы a домена V0». Журнал биологической химии. 280 (30): 27896–903. Дои:10.1074 / jbc.M504890200. PMID  15951435. S2CID  23648833.
  22. ^ Дрори О., Фролов Ф., Нельсон Н. (декабрь 2004 г.). «Кристаллическая структура дрожжевой субъединицы C V-АТФазы раскрывает ее статорную функцию». EMBO отчеты. 5 (12): 1148–52. Дои:10.1038 / sj.embor.7400294. ЧВК  1299189. PMID  15540116.
  23. ^ Имада К., Минамино Т., Учида Ю., Киношита М., Намба К. (март 2016 г.). «Понимание экспорта жгутиков типа III, выявленного сложной структурой АТФазы типа III и ее регулятора». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (13): 3633–8. Дои:10.1073 / pnas.1524025113. ЧВК  4822572. PMID  26984495.
  24. ^ Jefferies KC, Forgac M (февраль 2008 г.). «Субъединица H вакуолярной (H +) АТФазы ингибирует гидролиз АТФ свободным доменом V1 путем взаимодействия с вращающейся субъединицей F». Журнал биологической химии. 283 (8): 4512–9. Дои:10.1074 / jbc.M707144200. ЧВК  2408380. PMID  18156183.
  25. ^ а б Той М., Саум Р., Форгак М. (июнь 2010 г.). «Регуляция и изоформная функция V-АТФаз». Биохимия. 49 (23): 4715–23. Дои:10.1021 / bi100397s. ЧВК  2907102. PMID  20450191.
  26. ^ Forgac M (январь 1999 г.). «Вакуолярная Н + -АТФаза везикул, покрытых клатрином, обратимо ингибируется S-нитрозоглутатионом». Журнал биологической химии. 274 (3): 1301–5. Дои:10.1074 / jbc.274.3.1301. PMID  9880499. S2CID  21784089.
  27. ^ а б Уайтсайд Дж., Гибсон Л., Скотт М., Финбоу М.Э. (июнь 2005 г.). «Сборка дрожжевой вакуолярной H + -АТФазы и гидролиз АТФ происходит в отсутствие субъединицы c"". Письма FEBS. 579 (14): 2981–5. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.04.049. PMID  15907326. S2CID  32086585.
  28. ^ Стивенс TH, Форгак М (1997). «Структура, функция и регуляция вакуолярной (H +) - АТФазы». Ежегодный обзор клеточной биологии и биологии развития. 13: 779–808. Дои:10.1146 / annurev.cellbio.13.1.779. PMID  9442887.
  29. ^ Парра К.Дж., Кинан К.Л., Кейн П.М. (июль 2000 г.). «Субъединица H (Vma13p) дрожжевой V-АТФазы ингибирует АТФазную активность цитозольных комплексов V1». Журнал биологической химии. 275 (28): 21761–7. Дои:10.1074 / jbc.M002305200. PMID  10781598. S2CID  46127337.
  30. ^ а б Кейн PM (июль 1995 г.). «Разборка и повторная сборка дрожжевой вакуолярной H (+) - АТФазы in vivo». Журнал биологической химии. 270 (28): 17025–32. Дои:10.1074 / jbc.270.28.17025 (неактивно 2020-10-05). PMID  7622524.CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на октябрь 2020 г. (связь)
  31. ^ Самнер Дж. П., Доу Дж. А., Эрли Ф. Г., Кляйн Ю., Джегер Д., Вичорек Х (март 1995 г.). «Регулирование активности V-АТФазы плазматической мембраны путем диссоциации периферических субъединиц». Журнал биологической химии. 270 (10): 5649–53. Дои:10.1074 / jbc.270.10.5649. PMID  7890686. S2CID  38963775.
  32. ^ Кейн П.М., Тарсио М., Лю Дж. (Июнь 1999 г.). «Первые шаги в сборке дрожжевой вакуолярной H + -АТФазы». Журнал биологической химии. 274 (24): 17275–83. Дои:10.1074 / jbc.274.24.17275. PMID  10358087. S2CID  42610386.
  33. ^ Пирсон Х (9 января 2012 г.). «Воскрешение вымерших белков показывает, как эволюционирует машина». Блог новостей Nature.com.
  34. ^ Финниган Г.К., Хэнсон-Смит В., Стивенс Т.Х., Торнтон Дж.В. (январь 2012 г.). «Эволюция повышенной сложности в молекулярной машине». Природа. 481 (7381): 360–4. Bibcode:2012Натура 481..360F. Дои:10.1038 / природа10724. ЧВК  3979732. PMID  22230956.
  35. ^ Снимок молекулярной машины V-АТФазы: животные против грибов, University of Oregon (дата обращения: 11 января 2012 г.)
  36. ^ Иларио Э., Гогартен Дж. П. (1993). «Горизонтальный перенос генов АТФазы - древо жизни становится сетью жизни» (PDF). Биосистемы. 31 (2–3): 111–9. Дои:10.1016 / 0303-2647 (93) 90038-Е. PMID  8155843.
  37. ^ Bowman EJ, О'Нил FJ, Bowman BJ (июнь 1997 г.). «Мутации pma-1, гена, кодирующего H + -АТФазу плазматической мембраны Neurospora crassa, подавляют ингибирование роста конканамицином А, специфическим ингибитором вакуолярных АТФаз». Журнал биологической химии. 272 (23): 14776–86. Дои:10.1074 / jbc.272.23.14776. PMID  9169444. S2CID  29865381.
  38. ^ Кейн PM, Смардон AM (август 2003 г.). «Сборка и регуляция дрожжевой вакуолярной H + -АТФазы». Журнал биоэнергетики и биомембран. 35 (4): 313–21. Дои:10.1023 / А: 1025724814656. PMID  14635777. S2CID  7535580.
  39. ^ Холлидей Л.С., Лу М., Ли Б.С., Нельсон Р.Д., Соливан С., Чжан Л., Глюк С.Л. (октябрь 2000 г.). «Аминоконцевой домен субъединицы В вакуолярной Н + -АТФазы содержит сайт связывания нитчатого актина». Журнал биологической химии. 275 (41): 32331–7. Дои:10.1074 / jbc.M004795200. PMID  10915794. S2CID  2601649.
  40. ^ а б c Мичигами Т., Кагеяма Т., Сатомура К., Шима М., Ямаока К., Накаяма М., Озоно К. (февраль 2002 г.). «Новые мутации в субъединице a3 вакуолярной H (+) - аденозинтрифосфатазы у японского пациента с инфантильным злокачественным остеопетрозом». Кость. 30 (2): 436–9. Дои:10.1016 / S8756-3282 (01) 00684-6. PMID  11856654.
  41. ^ а б c Frattini A, Orchard PJ, Sobacchi C, Giliani S, Abinun M, Mattsson JP, Keeling DJ, Andersson AK, Wallbrandt P, Zecca L, Notarangelo LD, Vezzoni P, Villa A (июль 2000 г.). «Дефекты в субъединице TCIRG1 вакуолярной протонной помпы ответственны за подмножество аутосомно-рецессивного остеопетроза человека». Природа Генетика. 25 (3): 343–6. Дои:10.1038/77131. PMID  10888887. S2CID  21316081.
  42. ^ а б c Sobacchi C, Frattini A, Orchard P, Porras O, Tezcan I, Andolina M и др. (Август 2001 г.). «Мутационный спектр злокачественного аутосомно-рецессивного остеопетроза человека». Молекулярная генетика человека. 10 (17): 1767–73. Дои:10,1093 / hmg / 10,17,1767. PMID  11532986.
  43. ^ Фаст А, Поррас О. (1999). «Злокачественный остеопетроз человека: патофизиология, лечение и роль трансплантации костного мозга». Детская трансплантация. 3 Дополнение 1 (Suppl 1): 102–7. Дои:10.1034 / j.1399-3046.1999.00063.x. PMID  10587979. S2CID  31745272.
  44. ^ Sly WS, Hewett-Emmett D, Whyte MP, Yu YS, Tashian RE (май 1983 г.). «Дефицит карбоангидразы II, идентифицированный как первичный дефект аутосомно-рецессивного синдрома остеопетроза с почечным канальцевым ацидозом и церебральной кальцификацией». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 80 (9): 2752–6. Bibcode:1983PNAS ... 80.2752S. Дои:10.1073 / pnas.80.9.2752. ЧВК  393906. PMID  6405388.
  45. ^ а б Корнак У., Шульц А., Фридрих В., Ульхас С., Кременс Б., Войт Т., Хасан С., Боде Ю., Йенч Т.Дж., Кубиш С. (август 2000 г.). «Мутации в субъединице а3 вакуолярной Н (+) - АТФазы вызывают детский злокачественный остеопетроз». Молекулярная генетика человека. 9 (13): 2059–63. Дои:10.1093 / hmg / 9.13.2059. PMID  10942435.
  46. ^ Frattini A, Pangrazio A, Susani L, Sobacchi C, Mirolo M, Abinun M, Andolina M, Flanagan A, Horwitz EM, Mihci E, Notarangelo LD, Ramenghi U, Teti A, Van Hove J, Vujic D, Young T, Albertini А, Орчард П.Дж., Веццони П., Вилла А (октябрь 2003 г.). «Мутации ClCN7 хлоридного канала ответственны за тяжелый рецессивный, доминантный и промежуточный остеопетроз». Журнал исследований костей и минералов. 18 (10): 1740–7. Дои:10.1359 / jbmr.2003.18.10.1740. PMID  14584882. S2CID  20966489.
  47. ^ Susani L, Pangrazio A, Sobacchi C, Taranta A, Mortier G, Savarirayan R, Villa A, Orchard P, Vezzoni P, Albertini A, Frattini A, Pagani F (сентябрь 2004 г.). «TCIRG1-зависимый рецессивный остеопетроз: анализ мутаций, функциональная идентификация дефектов сплайсинга и спасение in vitro с помощью мяРНК U1». Человеческая мутация. 24 (3): 225–35. Дои:10.1002 / humu.20076. PMID  15300850. S2CID  31788054.
  48. ^ Альпер С.Л. (2002). «Генетические болезни кислотно-основных переносчиков». Ежегодный обзор физиологии. 64: 899–923. Дои:10.1146 / annurev.physiol.64.092801.141759. PMID  11826292.
  49. ^ а б c Карет Ф. Е., Финберг К. Э., Нельсон Р. Д., Найир А., Мокан Х., Санжад С. А. и др. (Январь 1999 г.). «Мутации в гене, кодирующем субъединицу B1 Н + -АТФазы, вызывают почечный канальцевый ацидоз с нейросенсорной глухотой». Природа Генетика. 21 (1): 84–90. Дои:10.1038/5022. PMID  9916796. S2CID  34262548.
  50. ^ Карет Ф. Э., Гайнза Ф. Дж., Дьёри А. З., Анвин Р. Дж., Неправильный О, Таннер М. Дж. И др. (Май 1998 г.). «Мутации в гене хлорид-бикарбонатного обменника AE1 вызывают аутосомно-доминантный, но не аутосомно-рецессивный дистальный почечный канальцевый ацидоз». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (11): 6337–42. Bibcode:1998PNAS ... 95.6337K. Дои:10.1073 / пнас.95.11.6337. ЧВК  27686. PMID  9600966.
  51. ^ а б Stehberger PA, Schulz N, Finberg KE, Karet FE, Giebisch G, Lifton RP, Geibel JP, Wagner CA (декабрь 2003 г.). «Локализация и регуляция вакуолярной субъединицы Н + -АТФазы ATP6V0A4 (a4), дефектной при наследственной форме дистального почечного канальцевого ацидоза». Журнал Американского общества нефрологов. 14 (12): 3027–38. Дои:10.1097 / 01.ASN.0000099375.74789.AB. PMID  14638902.
  52. ^ а б c Стовер Э.Х., Бортвик К.Дж., Бавалия К., Иди Н., Фриц Д.М., Рунгрой Н. и др. (Ноябрь 2002 г.). «Новые мутации ATP6V1B1 и ATP6V0A4 при аутосомно-рецессивном дистальном почечном канальцевом ацидозе с новыми доказательствами потери слуха». Журнал медицинской генетики. 39 (11): 796–803. Дои:10.1136 / jmg.39.11.796. ЧВК  1735017. PMID  12414817.
  53. ^ а б Рамачандран Н., Мунтяну И., Ван П., Руджери А., Рилстон Дж. Дж., Исраэлян Н. и др. (Март 2013 г.). «Дефицит VMA21 предотвращает сборку вакуолярной АТФазы и вызывает аутофагическую вакуолярную миопатию». Acta Neuropathologica. 125 (3): 439–57. Дои:10.1007 / s00401-012-1073-6. PMID  23315026. S2CID  20528180.

внешняя ссылка