Надсемейство факторов некроза опухолей - Tumor necrosis factor superfamily
Надсемейство факторов некроза опухолей | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Тримерная структура TNF альфа, производимая Mus musculus, на основе PDB структуры 2TNF (разрешение 1,4 Å). Разные цвета представляют разные мономеры. Baeyens, KJ et al. (1999).[1] Рисунок создан с использованием FirstGlance Jmol. | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Символ | TNF | ||||||||
Pfam | PF00229 | ||||||||
ИнтерПро | IPR006052 | ||||||||
PROSITE | PDOC00224 | ||||||||
SCOP2 | 1тнф / Объем / СУПФАМ | ||||||||
OPM суперсемейство | 292 | ||||||||
Белок OPM | 2hew | ||||||||
Мембранома | 80 | ||||||||
|
TNF | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура trail-sdr5 | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Символ | TNF | ||||||||
Pfam | PF00229 | ||||||||
Pfam клан | CL0100 | ||||||||
ИнтерПро | IPR006052 | ||||||||
PROSITE | PDOC00561 | ||||||||
SCOP2 | 1тнр / Объем / СУПФАМ | ||||||||
|
В фактор некроза опухоли (TNF) надсемейство это белковое суперсемейство из трансмембранные белки типа II содержащие домен гомологии TNF и образующие тримеры. Члены этого суперсемейства могут быть освобождены от клеточная мембрана внеклеточным протеолитическое расщепление и функционировать как цитокин. Эти белки экспрессируются преимущественно иммунными клетками и регулируют различные клеточные функции, включая иммунный ответ и воспаление, а также пролиферацию, дифференцировку, апоптоз и эмбриогенез.[2][3]
Суперсемейство состоит из 19 членов, которые связаны с 29 членами Суперсемейство рецепторов TNF.[4] Возникновение ортологи у беспозвоночных намекает на древнее происхождение этого надсемейства в эволюции.[2]
В PROSITE паттерн этого суперсемейства расположен в бета-лист в центральной части белка, который сохраняется у всех членов.
Члены
Существует 19 членов семьи, численно классифицируемых как TNFSF #, где # обозначает номер члена, иногда за которым следует буква.[4][2]
TNFSF № | Имя | Синонимы | Ген | Функция |
---|---|---|---|---|
1 | Лимфотоксин альфа | TNFβ, TNFSF1B | LTA | Индукция воспаление и противовирусный ответ, развитие вторичные лимфоидные органы, роль в туморогенез |
2 | Фактор некроза опухоли | TNFα, Dif, некрозин, TNFSF1A, ... | TNF | Регулирование иммунных клеток, индукция высокая температура, кахексия, воспаление и апоптоз, ингибирование туморогенез и вирусная репликация и ответ на сепсис |
3 | Лимфотоксин бета | TNFγ | LTB | Индукция воспаление и противовирусный ответ, развитие вторичные лимфоидные органы, роль в туморогенез |
4 | Лиганд OX40 | CD252, Gp34, CD134L | TNFSF4 | Активация Т-клетка иммунный ответ Т-клетка костимуляция |
5 | Лиганд CD40 | CD154, TRAP, Gp39, Т-БАМ | CD40LG | Регулирование адаптивный иммунный ответ путем активации антигенпрезентирующая клетка |
6 | Fas лиганд | CD178, APTL, CD95L | FASLG | Регулирование Т-клетка гомеостаз за счет индукции апоптоз |
7 | Лиганд CD27 | CD70 | CD70 | Регулирование В клетка активация и Т-клетка гомеостаз |
8 | Лиганд CD30 | CD153 | TNFSF8 | Индукция апоптоз из Т-клетки и В-клетки, предотвращение аутоиммунитет |
9 | CD137 лиганд | 4-1 баррелей | TNFSF9 | |
10 | Связанный с TNF лиганд, индуцирующий апоптоз | CD253, APO-2L | TNFSF10 | Подавление туморогенез, индукция апоптоз |
11 | Рецепторный активатор ядерного фактора каппа-лиганд | CD254, OPGL, TRANCE, ODF | TNFSF11 | Рост тканей (особенно регенерация и ремоделирование костей), дендритная клетка созревание |
12 | TNF-связанный слабый индуктор апоптоза | АПО-3Л, ДР3Л | TNFSF12 | Регулирование ангиогенез, индукция апоптоз |
13 | Лиганд, индуцирующий пролиферацию | CD256, TALL-2, TRDL1 | TNFSF13 | Регулирование В клетка развитие и плазматическая ячейка выживание |
13B | Фактор активации В-клеток | CD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ... | TNFSF13B | Стимуляция В клетка распространение и дифференциация |
14 | СВЕТ | CD258, HVEML | TNFSF14 | Стимуляция Т-клетка распространение апоптоз регулирование |
15 | Ингибитор роста эндотелия сосудов | TL1, TL-1A | TNFSF15 | Подавление ангиогенез |
18 | Член суперсемейства TNF 18 | ДЕВУШКА, АИТРЛ, ТЛ-6 | TNFSF18 | Регулирование Т-клетка выживание |
19 | Эктодисплазин А | ED1-A1, ED1-A2 | EDA | Развитие эктодермальные ткани |
Рекомендации
- ^ Байенс К.Дж., Де Бондт Х.Л., Реймакерс А., Фирс В., Де Рантер С.Дж. (апрель 1999 г.). «Структура фактора некроза опухолей мыши с разрешением 1,4 A: в сторону модуляции его селективности и тримеризации». Acta Crystallographica Раздел D. 55 (Pt 4): 772–8. Дои:10.1107 / s0907444998018435. PMID 10089307.
- ^ а б c Эволюция иммунной системы: сохранение и разнообразие. Амстердам: Эльзевир. 2016 г. ISBN 978-0-12-801975-7. OCLC 950694824.
- ^ Аббас А.К., Лихтман А.Х., Пиллаи С. Клеточная и молекулярная иммунология (Девятое изд.). Филадельфия, Пенсильвания. ISBN 978-0-323-47978-3. OCLC 973917896.
- ^ а б Аггарвал ББ, Гупта СК, Ким Дж.Х. (январь 2012 г.). «Исторические взгляды на фактор некроза опухоли и его суперсемейство: 25 лет спустя, золотое путешествие». Кровь. 119 (3): 651–65. Дои:10.1182 / кровь-2011-04-325225. ЧВК 3265196. PMID 22053109.
внешняя ссылка
- Опухоль + некроз + факторы в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- ген фактора некроза опухоли pex1