Надсемейство факторов некроза опухолей - Tumor necrosis factor superfamily

Надсемейство факторов некроза опухолей
Фактор некроза опухоли мыши Alpha.png
Тримерная структура TNF альфа, производимая Mus musculus, на основе PDB структуры 2TNF (разрешение 1,4 Å). Разные цвета представляют разные мономеры. Baeyens, KJ et al. (1999).[1] Рисунок создан с использованием FirstGlance Jmol.
Идентификаторы
СимволTNF
PfamPF00229
ИнтерПроIPR006052
PROSITEPDOC00224
SCOP21тнф / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство292
Белок OPM2hew
Мембранома80
TNF
PDB 1du3 EBI.jpg
кристаллическая структура trail-sdr5
Идентификаторы
СимволTNF
PfamPF00229
Pfam кланCL0100
ИнтерПроIPR006052
PROSITEPDOC00561
SCOP21тнр / Объем / СУПФАМ

В фактор некроза опухоли (TNF) надсемейство это белковое суперсемейство из трансмембранные белки типа II содержащие домен гомологии TNF и образующие тримеры. Члены этого суперсемейства могут быть освобождены от клеточная мембрана внеклеточным протеолитическое расщепление и функционировать как цитокин. Эти белки экспрессируются преимущественно иммунными клетками и регулируют различные клеточные функции, включая иммунный ответ и воспаление, а также пролиферацию, дифференцировку, апоптоз и эмбриогенез.[2][3]

Суперсемейство состоит из 19 членов, которые связаны с 29 членами Суперсемейство рецепторов TNF.[4] Возникновение ортологи у беспозвоночных намекает на древнее происхождение этого надсемейства в эволюции.[2]

В PROSITE паттерн этого суперсемейства расположен в бета-лист в центральной части белка, который сохраняется у всех членов.

Члены

Существует 19 членов семьи, численно классифицируемых как TNFSF #, где # обозначает номер члена, иногда за которым следует буква.[4][2]

TNFSF №ИмяСинонимыГенФункция
1Лимфотоксин альфаTNFβ, TNFSF1BLTAИндукция воспаление и противовирусный ответ, развитие вторичные лимфоидные органы, роль в туморогенез
2Фактор некроза опухолиTNFα, Dif, некрозин, TNFSF1A, ...TNFРегулирование иммунных клеток, индукция высокая температура, кахексия, воспаление и апоптоз, ингибирование туморогенез и вирусная репликация и ответ на сепсис
3Лимфотоксин бетаTNFγLTBИндукция воспаление и противовирусный ответ, развитие вторичные лимфоидные органы, роль в туморогенез
4Лиганд OX40CD252, Gp34, CD134LTNFSF4Активация Т-клетка иммунный ответ Т-клетка костимуляция
5Лиганд CD40CD154, TRAP, Gp39, Т-БАМCD40LGРегулирование адаптивный иммунный ответ путем активации антигенпрезентирующая клетка
6Fas лигандCD178, APTL, CD95LFASLGРегулирование Т-клетка гомеостаз за счет индукции апоптоз
7Лиганд CD27CD70CD70Регулирование В клетка активация и Т-клетка гомеостаз
8Лиганд CD30CD153TNFSF8Индукция апоптоз из Т-клетки и В-клетки, предотвращение аутоиммунитет
9CD137 лиганд4-1 баррелейTNFSF9
10Связанный с TNF лиганд, индуцирующий апоптозCD253, APO-2LTNFSF10Подавление туморогенез, индукция апоптоз
11Рецепторный активатор ядерного фактора каппа-лигандCD254, OPGL, TRANCE, ODFTNFSF11Рост тканей (особенно регенерация и ремоделирование костей), дендритная клетка созревание
12TNF-связанный слабый индуктор апоптозаАПО-3Л, ДР3ЛTNFSF12Регулирование ангиогенез, индукция апоптоз
13Лиганд, индуцирующий пролиферациюCD256, TALL-2, TRDL1TNFSF13Регулирование В клетка развитие и плазматическая ячейка выживание
13BФактор активации В-клетокCD257, BLyS, TALL-1, TNFSF20, ...TNFSF13BСтимуляция В клетка распространение и дифференциация
14СВЕТCD258, HVEMLTNFSF14Стимуляция Т-клетка распространение апоптоз регулирование
15Ингибитор роста эндотелия сосудовTL1, TL-1ATNFSF15Подавление ангиогенез
18Член суперсемейства TNF 18ДЕВУШКА, АИТРЛ, ТЛ-6TNFSF18Регулирование Т-клетка выживание
19Эктодисплазин АED1-A1, ED1-A2EDAРазвитие эктодермальные ткани

Рекомендации

  1. ^ Байенс К.Дж., Де Бондт Х.Л., Реймакерс А., Фирс В., Де Рантер С.Дж. (апрель 1999 г.). «Структура фактора некроза опухолей мыши с разрешением 1,4 A: в сторону модуляции его селективности и тримеризации». Acta Crystallographica Раздел D. 55 (Pt 4): 772–8. Дои:10.1107 / s0907444998018435. PMID  10089307.
  2. ^ а б c Эволюция иммунной системы: сохранение и разнообразие. Амстердам: Эльзевир. 2016 г. ISBN  978-0-12-801975-7. OCLC  950694824.
  3. ^ Аббас А.К., Лихтман А.Х., Пиллаи С. Клеточная и молекулярная иммунология (Девятое изд.). Филадельфия, Пенсильвания. ISBN  978-0-323-47978-3. OCLC  973917896.
  4. ^ а б Аггарвал ББ, Гупта СК, Ким Дж.Х. (январь 2012 г.). «Исторические взгляды на фактор некроза опухоли и его суперсемейство: 25 лет спустя, золотое путешествие». Кровь. 119 (3): 651–65. Дои:10.1182 / кровь-2011-04-325225. ЧВК  3265196. PMID  22053109.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR006052

внешняя ссылка