IL36G - IL36G

IL36G
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4 РАЗМЕР, 4P0J, 4P0K, 4P0L
Идентификаторы
Псевдонимы	IL36G, интерлейкин 36, гамма, IL-1F9, IL-1H1, IL-1RP2, IL1E, IL1H1, IL1RP2, IL1F9, интерлейкин 36 гамма
Внешние идентификаторы	OMIM: 605542 MGI: 2449929 ГомолоГен: 49595 Генные карты: IL36G
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q14.1 Начните 112,973,203 бп[1] Конец 112,985,658 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 A3 | 2 16,24 см Начните 24,186,476 бп[2] Конец 24,193,568 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • связывание рецептора интерлейкина-1 Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • передача сигналов от клетки к клетке • врожденная иммунная система • воспалительная реакция • иммунная система • иммунная реакция • регуляция рецепторной активности • цитокин-опосредованный сигнальный путь • хемотаксис нейтрофилов • положительное регулирование продукции интерлейкина-6 • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • отрицательная регуляция дифференцировки миобластов • положительное регулирование каскада JNK • клеточный ответ на липополисахарид • отрицательная регуляция слияния миобластов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	56300	215257
Ансамбль	ENSG00000136688	ENSMUSG00000044103
UniProt	Q9NZH8	Q8R460 Q3U0P4
RefSeq (мРНК)	NM_001278568 NM_019618	NM_153511
RefSeq (белок)	NP_001265497 NP_062564	NP_705731
Расположение (UCSC)	Chr 2: 112.97 - 112.99 Мб	Chr 2: 24.19 - 24.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интерлейкин-36 гамма ранее известный как член семьи интерлейкина-1 9 (IL1F9) это белок что у людей кодируется IL36G ген.^[5][6][7][8]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом интерлейкин-1 цитокин семья. Этот ген и восемь других генов семейства интерлейкинов-1 образуют кластер генов цитокинов на хромосоме 2.^[9] Активность этого цитокина опосредуется рецептором интерлейкина-1, подобным 2 (IL1RL2 / IL1R-rp2 / рецептор IL-36) и специфически ингибируется антагонистом рецептора интерлейкина-36, (Ил-36РА / IL1F5 / IL-1 дельта). Интерферон-гамма, фактор некроза опухоли альфа и интерлейкин-1 β (ИЛ-1β ), как сообщается, стимулируют экспрессию этого цитокина в кератиноциты. Экспрессия этого цитокина в кератиноцитах также может быть индуцирована множественными молекулярными паттернами, связанными с патогенами (PAMPs ).^[10] Как мРНК, так и белок IL-36γ были связаны с поражениями при псориазе и использовались в качестве биомаркера для дифференциации экземы и псориаза.^[11][12] Как и многие другие цитокины семейства интерлейкина-1, IL-36γ требует протеолитического расщепления своего N-конца для полной биологической активности.^[13] Однако, в отличие от IL-1β, активация IL-36γ происходит воспаление -независимый и специфически расщепляется протеазой катепсин S.^[14]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136688 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044103 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Busfield SJ, Comrack CA, Yu G, Chickering TW, Smutko JS, Zhou H, Leiby KR, Holmgren LM, Gearing DP, Pan Y (июнь 2000 г.). «Идентификация и генная организация трех новых членов семейства IL-1 на хромосоме 2 человека». Геномика. 66 (2): 213–6. Дои:10.1006 / geno.2000.6184. PMID  10860666.
6. Кумар С., Макдоннелл П.К., Лер Р., Тирни Л., Цимас М.Н., Грисволд Д.Е., Каппер Е.А., Тал-Сингер Р., Уэллс Г.И., Дойл М.Л., Молодой PR (апрель 2000 г.). «Идентификация и начальная характеристика четырех новых членов семейства интерлейкинов-1». Журнал биологической химии. 275 (14): 10308–14. Дои:10.1074 / jbc.275.14.10308. PMID  10744718.
7. Никлин М.Дж., Бартон Дж. Л., Нгуен М., Фицджеральд М. Г., Дафф Г. В., Корнман К. (май 2002 г.). «Последовательная карта девяти генов кластера человеческого интерлейкина-1». Геномика. 79 (5): 718–25. Дои:10.1006 / geno.2002.6751. PMID  11991722.
8. Тейлор С.Л., Реншоу Б.Р., Гарка К.Э., Смит Д.Е., Симс Дж. Э. (май 2002 г.). «Геномная организация локуса интерлейкина-1». Геномика. 79 (5): 726–33. Дои:10.1006 / geno.2002.6752. PMID  11991723.
9. Гарланда С., Динарелло, Калифорния, Мантовани А. (декабрь 2013 г.). «Семейство интерлейкинов-1: назад в будущее». Иммунитет. 39 (6): 1003–18. Дои:10.1016 / j.immuni.2013.11.010. ЧВК  3933951. PMID  24332029.
10. Габай, К; Таун, Дж. Э. (апрель 2015 г.). «Регуляция и функция цитокинов интерлейкина-36 в гомеостазе и патологических состояниях». Журнал биологии лейкоцитов. 97 (4): 645–52. Дои:10.1189 / jlb.3RI1014-495R. PMID  25673295. S2CID  36594830.
11. Berekméri, A; Лацко, А; Алас, А; Macleod, T; Ainscough, JS; Законы, P; Гудфилд, М; Райт, А; Helliwell, P; Эдвард, S; Браун, GD; Рид, DM; Венцель, Дж; Стейси, М; Виттманн, М. (18 мая 2018 г.). «Обнаружение IL-36y с помощью неинвазивной очистки ленты надежно отличает псориаз от атопической экземы» (PDF). Журнал аллергии и клинической иммунологии. 142 (3): 988–991.e4. Дои:10.1016 / j.jaci.2018.04.031. HDL:2164/10849. ЧВК  6127028. PMID  29782895.
12. D'Erme AM, Wilsmann-Theis D, Wagenpfeil J, Hölzel M, Ferring-Schmitt S, Sternberg S, Wittmann M, Peters B, Bosio A, Bieber T., Wenzel J (апрель 2015 г.). «IL-36γ (IL-1F9) является биомаркером кожных поражений псориаза». Журнал следственной дерматологии. 135 (4): 1025–32. Дои:10.1038 / jid.2014.532. PMID  25525775.
13. Таун Дж. Э., Реншоу Б. Р., Дуангпанья Дж., Липски Б. П., Шен М., Габель К. А., Симс Дж. Э. (декабрь 2011 г.). «Лиганды интерлейкина-36 (IL-36) требуют процессинга для полной агонистической (IL-36α, IL-36β и IL-36γ) или антагонистической (IL-36Ra) активности». Журнал биологической химии. 286 (49): 42594–602. Дои:10.1074 / jbc.M111.267922. ЧВК  3234937. PMID  21965679.
14. Ainscough JS, Macleod T, McGonagle D, Brakefield R, Baron JM, Alase A, Wittmann M, Stacey M (март 2017 г.). «Катепсин S является основным активатором связанного с псориазом провоспалительного цитокина IL-36γ». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 114 (13): E2748 – E2757. Дои:10.1073 / pnas.1620954114. ЧВК  5380102. PMID  28289191.

дальнейшее чтение

• Никлин М.Дж., Вейт А., Дафф Г.В. (январь 1994 г.). «Физическая карта области, охватывающей гены человеческого интерлейкина-1 альфа, интерлейкина-1 бета и гены антагонистов рецепторов интерлейкина-1». Геномика. 19 (2): 382–4. Дои:10.1006 / geno.1994.1076. PMID  8188271.
• Нотванг Х.Г., Страм Б., Денич Д., Кюблер М., Швабе Дж., Гингрич Дж. К., Джауч А., Кокс А., Никлин М. Дж., Курнит Д. М., Хильдебрандт Ф. (май 1997 г.). «Молекулярное клонирование кластера генов интерлейкина-1: построение интегрированного контига YAC / PAC и частичной транскрипционной карты в области хромосомы 2q13». Геномика. 41 (3): 370–8. Дои:10.1006 / geno.1997.4654. PMID  9169134.
• Mulero JJ, Pace AM, Nelken ST, Loeb DB, Correa TR, Drmanac R, Ford JE (октябрь 1999 г.). «IL1HY1: новый ген антагониста рецептора интерлейкина-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 263 (3): 702–6. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1440. PMID  10512743.
• Смит Д.Е., Реншоу Б.Р., Кетчем Р.Р., Кубин М., Гарка К.Е., Симс Д.Е. (январь 2000 г.). «Четыре новых члена расширяют суперсемейство интерлейкина-1». Журнал биологической химии. 275 (2): 1169–75. Дои:10.1074 / jbc.275.2.1169. PMID  10625660.
• Бартон Дж. Л., Хербст Р., Бозисио Д., Хиггинс Л., Никлин М. Дж. (Ноябрь 2000 г.). «Гомолог тканеспецифического антагониста рецептора IL-1 из кластера IL-1 не обладает активностью антагониста IL-1, IL-1ra, IL-18 и IL-18». Европейский журнал иммунологии. 30 (11): 3299–308. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200011) 30:11 <3299 :: AID-IMMU3299> 3.0.CO; 2-S. PMID  11093146.
• Пан Дж., Риссер П., Мао В., Болдуин Д. Т., Чжун А. В., Филварофф Е., Янсура Д., Льюис Л., Эйгенброт С., Хензель В. Дж., Вандлен Р. (январь 2001 г.). «IL-1H, белок, родственный интерлейкину 1, который связывает рецептор IL-18 / IL-1Rrp». Цитокин. 13 (1): 1–7. Дои:10.1006 / cyto.2000.0799. PMID  11145836.
• Лин Х, Хо А.С., Хейли-Висенте Д., Чжан Дж., Бернал-Фасселл Дж., Пейс А.М., Хансен Д., Швайгхофер К., Мизе Н.К., Форд Дж. Э. (июнь 2001 г.). «Клонирование и характеристика IL-1HY2, нового члена семейства интерлейкинов-1». Журнал биологической химии. 276 (23): 20597–602. Дои:10.1074 / jbc.M010095200. PMID  11278614.
• Дебец Р., Тиманс Дж. С., Хоми Б., Зуравски С., Сана Т. Р., Ло С., Вагнер Дж., Эдвардс Дж., Клиффорд Т., Менон С., Базан Дж. Ф., Кастелейн Р. А. (август 2001 г.). «Два новых члена семейства IL-1, IL-1 дельта и IL-1 эпсилон, действуют как антагонист и агонист активации NF-каппа B через сиротский белок 2, связанный с рецептором IL-1». Журнал иммунологии. 167 (3): 1440–6. Дои:10.4049 / jimmunol.167.3.1440. PMID  11466363.
• Симс Дж. Э., Никлин М. Дж., Базан Дж. Ф., Бартон Дж. Л., Басфилд С. Дж., Форд Дж. Э., Кастелейн Р. А., Кумар С., Лин Х., Мулеро Дж. Дж., Пан Дж., Пан Й., Смит Д. Е., Молодой ПР (октябрь 2001 г.). «Новая номенклатура генов семейства IL-1». Тенденции в иммунологии. 22 (10): 536–7. Дои:10.1016 / S1471-4906 (01) 02040-3. PMID  11574262.
• Таун Дж. Э., Гарка К. Э., Реншоу Б. Р., Вирка Г. Д., Симс Д. Е. (апрель 2004 г.). «Интерлейкин (IL) -1F6, IL-1F8 и IL-1F9 передает сигнал через IL-1Rrp2 и IL-1RAcP для активации пути, ведущего к NF-kappaB и MAPK». Журнал биологической химии. 279 (14): 13677–88. Дои:10.1074 / jbc.M400117200. PMID  14734551.
• Деннис Р.А., Трапп Т.А., Симпсон П., Кэрролл С., Хуанг Б.Э., Нагараджан Р., Берден Е., Герли С., Дафф Г.В., Эванс В.Дж., Корнман К., Петерсон, Калифорния (ноябрь 2004 г.). «Полиморфизм интерлейкина-1 связан с воспалительной реакцией в мышцах человека на упражнения с острым сопротивлением». Журнал физиологии. 560 (Пт 3): 617–26. Дои:10.1113 / jphysiol.2004.067876. ЧВК  1665272. PMID  15331687.
• Вос Дж. Б., ван Стеркенбург М. А., Рабе К. Ф., Шалквейк Дж., Хиемстра П. С., Датсон Н. А. (май 2005 г.). «Транскрипционный ответ бронхиальных эпителиальных клеток на синегнойную палочку: идентификация ранних медиаторов защиты хозяина». Физиологическая геномика. 21 (3): 324–36. Дои:10.1152 / физиолгеномика.00289.2004. PMID  15701729.