Катепсин S - Cathepsin S

CTSS
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1GLO, 1MS6, 1НПЗ, 1NQC, 2C0Y, 2F1G, 2FQ9, 2FRA, 2FRQ, 2FT2, 2FUD, 2FYE, 2Г6Д, 2G7Y, 2H7J, 2HH5, 2HHN, 2HXZ, 2OP3, 2R9M, 2R9N, 2R9O, 3IEJ, 3КВН, 3МП, 3MPF, 3N3G, 3N4C, 3OVX, 4П6Э, 4П6Г
Идентификаторы
Псевдонимы	CTSS, entrez: 1520, катепсин S
Внешние идентификаторы	OMIM: 116845 MGI: 107341 ГомолоГен: 20867 Генные карты: CTSS
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начинать 150,730,188 бп[1] Конец 150,765,792 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F2.1 | 3 40,74 см Начинать 95,526,786 бп[2] Конец 95,556,403 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фибронектина • активность пептидазы цистеинового типа • связывание коллагена • пептидазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа • связывание ламинина • гидролазная активность • связывание протеогликана • активность эндопептидазы серинового типа Сотовый компонент • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • внеклеточная область • просвет эндолизосом • просвет лизосомы • лизосома • внеклеточный • просвет третичной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс • поздняя эндосома Биологический процесс • положительная регуляция активности катионных каналов • процессинг и представление антигена • адаптивный иммунный ответ • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • переработка белка • разборка внеклеточного матрикса • протеолиз • сигнальный путь толл-подобных рецепторов • процессинг антигена и презентация пептидного антигена • иммунная реакция • клеточный ответ на стимул гормона щитовидной железы • катаболический процесс коллагена • протеолиз, участвующий в катаболическом процессе клеточного белка • демонтаж базальной мембраны • реакция на кислый pH • дегрануляция нейтрофилов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1520	13040
Ансамбль	ENSG00000163131	ENSMUSG00000038642
UniProt	P25774	O70370
RefSeq (мРНК)	NM_004079 NM_001199739	NM_001267695 NM_021281
RefSeq (белок)	NP_001186668 NP_004070	NP_001254624 NP_067256
Расположение (UCSC)	Chr 1: 150.73 - 150.77 Мб	Chr 3: 95,53 - 95,56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Катепсин S это белок что у людей кодируется CTSS ген.^[5] Для этого гена существуют варианты транскриптов, использующие альтернативные сигналы полиаденилирования.^[5]

Катепсин S является членом семейства пептидаз C1 и лизосомный цистеиновая протеаза которые могут участвовать в деградации антигенных белков до пептидов для презентации MHC класс II. Катепсин S может функционировать как эластаза в широком диапазоне pH в альвеолярный макрофаги.

Функция

Катепсин S - это лизосомальный фермент, принадлежащий к папаин семья цистеиновые протеазы. Хотя роль в презентации антигена давно признана, теперь понятно, что катепсин S играет роль в зуде и боли или ноцицепции. Ноцицептивная активность является результатом функционирования катепсина S в качестве сигнальной молекулы через активацию протеазо-активируемых рецепторов 2 и 4 членов семейства рецепторов, связанных с G-белком.^[6]

Катепсин S экспрессируется антигенпрезентирующими клетками, включая макрофаги, В-лимфоциты, дендритные клетки и микроглия. Катепсин S экспрессируется некоторыми эпителиальный клетки. Его экспрессия заметно увеличивается в кератиноцитах человека после стимуляции интерфероном-гамма, а его экспрессия повышается в псориатический кератиноциты за счет стимуляции провоспалительными факторами. Напротив, кортикальные эпителиальные клетки тимуса не экспрессируют катепсин S.

Хотя оптимумы pH многих лизосомальных протеаз являются кислыми, катепсин S является исключением. Этот фермент остается каталитически активным при нейтральном pH и имеет оптимальное значение pH между 6,0 и 7,5. Многие лизосомные протеазы задерживаются внутри лизосомы из-за проблемы с их стабильностью. Напротив, катепсин S остается стабильным и играет физиологическую роль вне лизосомы. Иммунные клетки, включая макрофаги и микроглию, секретируют катепсин S в ответ на воспалительные медиаторы, включая липополисахариды, провоспалительные цитокины и нейтрофилы. In vitro катепсин S сохраняет некоторую ферментативную активность в присутствии 3M мочевины. Катепсин S продуцируется как зимоген и активируется при обработке.

Активность катепсина S жестко регулируется его эндогенным ингибитором, цистатином С, который также играет роль в презентации антигена. Цистатин А и B обладают меньшей активностью по сравнению с цистатином С.

Предполагается, что активные сайты расщепления - (- Val-Val-Arg -) - катепсина S имеют по крайней мере две аминокислоты, окружающие его с каждой стороны.

В то время как лизосомные протеазы окончательно разрушают белки в лизосомах, катепсин S играет особую физиологическую роль.

Роль в презентации антигена

Этот фермент играет важную роль в презентация антигена. Молекулы класса II главного комплекса гистосовместимости взаимодействуют с небольшими пептидными фрагментами для презентации на поверхности антигенпрезентирующих иммунных клеток. Катепсин S участвует в деградации инварианта или цепи Ii, что предотвращает загрузку антигена в комплекс. Это разложение происходит в лизосомах. Хронологически действие катепсина S следует за двумя расщеплениями, выполняемыми аспартил протеазы. Катепсин S расщепляет оставшийся фрагмент Ii (IiP1) и оставляет небольшую часть Ii, известную как CLIP, которая остается непосредственно связанной с комплексом.

Протеолитическая деградация Ii важна, поскольку она облегчает диссоциацию CLIP от MHC II, и затем комплекс может загружать выбранный антиген. После загрузки антигена молекула MHC II перемещается на поверхность клетки. Таким образом, мы можем предположить, что избыточная экспрессия катепсина S может приводить к преждевременной деградации Ii, случайной загрузке MHC II и аутоиммунной атаке. Напротив, ингибирование катепсина S приведет к задержке деградации Ii и загрузки антигена в MHC II, а также к неадекватному присутствию нерасщепленных Li-фрагментов в MHC II на поверхности клетки. Это ухудшит и ослабит иммунный ответ. Например, этот вид MHC II не будет очень эффективным для индукции пролиферации Т-клеток.

В макрофагах катепсин S можно заменить на катепсин F.

Роль в деградации ECM

Секретируемый катепсин S расщепляет некоторые внеклеточный матрикс (ЕСМ) белки. Катепсин S можно считать наиболее сильнодействующей из известных эластаз. Список предлагаемых субстратов катепсина S включает: ламинин, фибронектин эластин, остеокальцин и немного коллагены. Он также раскалывает сульфат хондроитина, гепарансульфат и протеогликаны из базальная мембрана. Катепсин S играет активную роль в проницаемости кровеносных сосудов и ангиогенез из-за его эластолитической и коллагенолитической активности. Например, расщепление ламинина-5 катепсином S приводит к образованию проангиогенных пептидов. Экспрессия катепсина S может быть вызвана провоспалительными факторами, секретируемыми опухолевыми клетками.

В онкогенез, катепсин S способствует росту опухоли.

Роль в регуляции цитокинов

Также было показано, что экспрессия и активность катепсина S повышается в коже псориаз пациенты. Имеет ли он определяющую роль в возникновении патологии псориаза, пока неизвестно, однако в том же исследовании было показано, что он специально расщепляет и активирует связанный с псориазом провоспалительный цитокин. ИЛ-36γ^[7]

Ноцицепция

Катепсин S играет роль в ноцицепция, в том числе зуд и желудочно-кишечные боли. Механизм, с помощью которого катепсин S вызывает зуд и боль, согласуется со способностью этой цистеиновой протеазы активировать рецепторы 2 и 4, активируемые протеазой.^[8][6]

Ингибиторы катепсина S

Синтетические ингибиторы катепсина S участвовали в многочисленных доклинических исследованиях иммунных нарушений, включая ревматоидный артрит. В настоящее время по крайней мере один из них участвует в клинических испытаниях на псориаз. LHVS (морфолинмочевина-лейцин-гомофенилаланин-винилсульфон-фенил) является наиболее изученным синтетическим ингибитором катепсина S. IC50 LHVS составляет около 5 нМ. Было показано, что ингибирование катепсина S с помощью LHVS оказывает нейрозащитное действие после черепно-мозговой травмы.^[9] В список коммерческих ингибиторов также входит пэцилопептин (ацетил-Leu-Val-CHO) и некоторые другие.

Клиническое значение

Катепсин S является значительным прогностическим фактором для пациентов с типом IV. астроцитомы (мультиформная глиобластома), и его ингибирование показало улучшение времени выживания в среднем в 5 месяцев. Это связано с тем, что фермент цистеин больше не может действовать вместе с другими протеазами, разрушая внеклеточный матрикс мозга. Таким образом, распространение опухоли остановлено. Ученые только что объявили, что этот фермент предсказывает смерть, поскольку было показано, что он связан как с сердечными заболеваниями, так и с раком. (цитата?)

Смотрите также

• Катепсин

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163131 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038642 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: CTSS катепсин S".
6. Редди В.Б., Сан С., Азими Э., Эльмария С.Б., Донг Х, Лернер Е.А. (июль 2015 г.). «Новое определение рецепторов, активируемых протеазой: катепсин S вызывает зуд через активацию Mrgprs». Nature Communications. 6: 7864. Дои:10.1038 / ncomms8864. ЧВК  4520244. PMID  26216096.
7. Ainscough JS, Macleod T, McGonagle D, Brakefield R, Baron JM, Alase A, Wittmann M, Stacey M (март 2017 г.). «Катепсин S является основным активатором связанного с псориазом провоспалительного цитокина IL-36γ». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 114 (13): E2748 – E2757. Дои:10.1073 / pnas.1620954114. ЧВК  5380102. PMID  28289191.
8. Эльмария С.Б., Редди В.Б., Лернер Е.А. (25 июня 2014 г.). «Катепсин S передает сигналы через PAR2 и генерирует новый агонист рецептора привязанного лиганда». PLOS ONE. 9 (6): e99702. Дои:10.1371 / journal.pone.0099702. ЧВК  4070910. PMID  24964046.
9. Сюй Дж, Ван Х, Дин К., Лю Х, Ли Т, Ван Дж, Ван С, Ван Дж (24 октября 2013 г.). «Ингибирование катепсина S вызывает нейрозащитные эффекты после черепно-мозговой травмы у мышей». Медиаторы воспаления. 2013 (2013): 187873. Дои:10.1155/2013/187873. ЧВК  3824312. PMID  24282339.

дальнейшее чтение

• Ши Г. П., Мангер Дж. С., Меара Дж. П., Рич Д.Х., Чепмен Х.А. (апрель 1992 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия катепсина S альвеолярных макрофагов человека, эластинолитической цистеиновой протеазы». Журнал биологической химии. 267 (11): 7258–62. PMID  1373132.
• Ван Дж, Цирка С.Е. (2005). «Вклад внеклеточного протеолиза и микроглии во внутримозговое кровоизлияние». Neurocrit Care. 3 (1): 77–85. Дои:10.1385 / NCC: 3: 1: 077. PMID  16159103.
• Видерандерс Б., Бремме Д., Киршке Х., фон Фигура К., Шмидт Б., Петерс С. (июль 1992 г.). «Филогенетическая консервация цистеиновых протеиназ. Клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей катепсин S человека». Журнал биологической химии. 267 (19): 13708–13. PMID  1377692.
• Ритонья А., Колич А., Доленц И., Огринц Т., Подобник М., Тюрк V (июнь 1991 г.). «Полная аминокислотная последовательность бычьего катепсина S и частичная последовательность бычьего катепсина L». Письма FEBS. 283 (2): 329–31. Дои:10.1016 / 0014-5793 (91) 80620-I. PMID  2044774.
• Munger JS, Haass C, Lemere CA, Shi GP, Wong WS, Teplow DB, Selkoe DJ, Chapman HA (октябрь 1995 г.). «Лизосомный процессинг белка-предшественника амилоида в пептиды А бета: особая роль катепсина S». Биохимический журнал. 311 (1): 299–305. Дои:10.1042 / bj3110299. ЧВК  1136152. PMID  7575468.
• Lemere CA, Munger JS, Shi GP, Natkin L, Haass C, Chapman HA, Selkoe DJ (апрель 1995 г.). «Лизосомальная цистеиновая протеаза, катепсин S, повышена в мозге при болезни Альцгеймера и синдроме Дауна. Иммуноцитохимическое исследование». Американский журнал патологии. 146 (4): 848–60. ЧВК  1869262. PMID  7717452.
• Холл A, Хоканссон К., Мейсон Р.В., Грабб А., Абрахамсон М. (март 1995 г.). «Структурная основа для биологической специфичности цистатина С. Идентификация лейцина 9 в N-концевой области связывания в качестве придающего селективность остатка при ингибировании цистеиновых пептидаз млекопитающих». Журнал биологической химии. 270 (10): 5115–21. Дои:10.1074 / jbc.270.10.5115. PMID  7890620.
• Бальбин М., Холл А, Грабб А., Мейсон Р. В., Лопес-Отин С., Абрахамсон М. (сентябрь 1994 г.). «Структурная и функциональная характеристика двух аллельных вариантов человеческого цистатина D, разделяющих характерный спектр ингибирования против цистеиновых протеиназ млекопитающих». Журнал биологической химии. 269 (37): 23156–62. PMID  8083219.
• Ши Г.П., Уэбб А.С., Фостер К.Э., Нолл Дж. Х., Лемер, Калифорния, Мангер Дж. С., Чапман Н. «Катепсин S человека: хромосомная локализация, структура гена и распределение в тканях». Журнал биологической химии. 269 (15): 11530–6. PMID  8157683.
• Турок Б., Сток В., Турок В., Йоханссон Г., Каццуло Дж. Дж., Бьорк И. (август 1996 г.). «Высокомолекулярный кининоген связывает две молекулы цистеиновых протеиназ с разными константами скорости». Письма FEBS. 391 (1–2): 109–12. Дои:10.1016/0014-5793(96)00611-4. PMID  8706894.
• Баумграсс Р., Уильямсон М.К., Прайс ПА (март 1997 г.). «Идентификация пептидных фрагментов, образованных при переваривании остеокальцина крупного рогатого скота и человека лизосомными протеиназами катепсина B, D, L, H и S». Журнал исследований костей и минералов. 12 (3): 447–55. Дои:10.1359 / jbmr.1997.12.3.447. PMID  9076588.
• Вюрл П., Тауберт Х., Мей А., Дансранджавин Т., Вебер Э., Гюнтер Д., Бергер Д., Шмидт Х., Дралле Х., Рат Ф. В. (март 1997 г.). «Иммуногистохимическая и клиническая оценка экспрессии катепсина в саркомах мягких тканей». Вирховский архив. 430 (3): 221–5. Дои:10.1007 / BF01324805. PMID  9099979.
• Гелб Б.Д., Ши Г.П., Хеллер М., Веремович С., Мортон С., Десник Р.Дж., Чепмен Х.А. (апрель 1997 г.). «Структура и хромосомная принадлежность гена катепсина К человека». Геномика. 41 (2): 258–62. Дои:10.1006 / geno.1997.4631. PMID  9143502.
• Бальдассар Дж. Дж., Хендерсон П. А., Тарвер А., Фишер Дж. Дж. (Май 1997 г.). «Активация тромбина тромбоцитов человека диссоциирует комплекс, содержащий гельсолин и актин, от фосфатидилинозитид-специфической фосфолипазы Cgamma1». Биохимический журнал. 324 (1): 283–7. Дои:10.1042 / bj3240283. ЧВК  1218428. PMID  9164868.
• Нисслер К., Креуш С., Роммерскирх В., Штрубель В., Вебер Е., Видерандерс Б. (февраль 1998 г.). «Сортировка негликозилированного человеческого прокатепсина S в клетках млекопитающих». Биологическая химия. 379 (2): 219–24. Дои:10.1515 / bchm.1998.379.2.219. PMID  9524075.
• Клаус В., Джараус А., Тьелле Т., Берг Т., Киршке Х., Фолстих Х., Гриффитс Г. (апрель 1998 г.). «Перенос лизосомальных ферментов между фагосомами, эндосомами и лизосомами в макрофагах J774. Обогащение катепсина H в ранних эндосомах». Журнал биологической химии. 273 (16): 9842–51. Дои:10.1074 / jbc.273.16.9842. PMID  9545324.
• Шик С., Пембертон П.А., Ши Г.П., Камачи Ю., Каталтепе С., Бартуски А.Дж., Горнштейн Е.Р., Бремме Д., Чапман Н.А., Сильверман Г.А. (апрель 1998 г.). "Межклассовое ингибирование цистеиновых протеиназ катепсинов K, L и S антигеном 1 серпиновой плоскоклеточной карциномы: кинетический анализ". Биохимия. 37 (15): 5258–66. Дои:10.1021 / bi972521d. PMID  9548757.
• Фенглер А., Брандт В. (ноябрь 1998 г.). «Трехмерные структуры цистеиновых протеаз катепсинов K и S, полученные путем моделирования на основе знаний и характеристик активных центров». Белковая инженерия. 11 (11): 1007–13. Дои:10.1093 / протеин / 11.11.1007. PMID  9876921.
• Седерстрём М., Салминен Х., Глумофф В., Киршке Х., Аро Х., Вуорио Э. (июль 1999 г.). «Экспрессия катепсина во время развития скелета». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1446 (1–2): 35–46. Дои:10.1016 / S0167-4781 (99) 00068-8. PMID  10395917.
• Цао Х., Хегеле РА (2000). "Полиморфизм -25G / A промотора гена катепсина S человека (CTSS)". Журнал генетики человека. 45 (2): 94–5. Дои:10.1007 / с100380050019. PMID  10721671.
• Люк С., Шик С., Цу С., Виссток Дж. К., Ирвинг Дж. А., Бремме Д., Джулиано Л., Ши Г. П., Чапман Н. А., Сильверман Г. А. (июнь 2000 г.). «Простые модификации петли реактивного сайта серпина превращают SCCA2 в ингибитор цистеиновой протеиназы: критическая роль пролина P3 'в облегчении расщепления RSL». Биохимия. 39 (24): 7081–91. Дои:10.1021 / bi000050g. PMID  10852705.

внешняя ссылка

• В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: C01.034
• БРЕНДА онлайн-база данных по ферментам: 3.4.22.27
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P25774 (Катепсин S) в PDBe-KB.