Терпенсинтаза N-концевой домен - Terpene synthase N terminal domain
| Terpene_synth | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 (+) - борнилдифосфатсинтаза: комплекс с мг и продуктом | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Terpene_synth | ||||||||
| Pfam | PF01397 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001906 | ||||||||
| SCOP2 | 5eau / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии это белковый домен принадлежит терпену синтаза семья (ТПС). Его роль - синтезировать терпены которые являются частью первичной метаболизм, Такие как стеролы икаротин а также часть вторичного метаболизма. В этой записи основное внимание будет уделено N терминал домен белка TPS.
Функция
Терпенсинтазы играют роль в производстве важных для метаболизма молекул, эти молекулы являются частью большой группы, называемой терпеноиды . В частности, N-концевой домен имеет свойство активного сайта копалилдифосфатсинтазы (CPS).[1]
Структура
N-концевой домен образует альфа-ствол, подобный таковому у сесквитерпенциклазы и эпиаристолохенсинтазы.[2]
Сохранение
Последовательности содержащий это белковый домен принадлежат терпену синтаза семья. Было высказано предположение, что это генная семья обозначается tps (для терпен-синтазы). Последовательность сравнения показывают сходство между монотерпеном (C10) синтазы, сесквитерпен (C15) синтазы и дитерпен (C20) синтазы. Он был разделен на шесть подгрупп на основе филогении, названных Tpsa-Tpsf.[3]
- Tpsa включает ветиспиридиен-синтаза.[4]
- Tpsb включает (-) - лимонен-синтаза.[5]
- Tpsc включает копалилдифосфатсинтаза (кауренсинтаза А ).[6]
- Tpsd включает таксадиен-синтаза,[7] пинен-синтаза,[8] и мирценсинтаза.[9]
- Tpse включает энт-кауренсинтаза B.[10]
- Tpsf включает S-линалоол синтаза.[11] в грибок Phaeosphaeria sp. (штамм L487) синтезу энт-каурена из геранилгеранил дофосфата способствует единственный бифункциональный белок.[12]
Смотрите также
Терпенсинтаза C-концевой домен
Рекомендации
- ^ Чен Ф, Толл Д., Больманн Дж, Пичерский Э. (2011). «Семейство терпен-синтаз в растениях: семейство генов среднего размера для специализированного метаболизма, которое очень разнообразно по всему королевству». Завод J. 66 (1): 212–29. Дои:10.1111 / j.1365-313X.2011.04520.x. PMID 21443633.
- ^ Whittington DA, Wise ML, Urbansky M, Coates RM, Croteau RB, Christianson DW (2002). «Борнилдифосфатсинтаза: структура и стратегия манипуляции карбокатионом с помощью терпеноидциклазы». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (24): 15375–80. Дои:10.1073 / pnas.232591099. ЧВК 137724. PMID 12432096.
- ^ Больманн Дж., Стил К.Л., Крото Р. (август 1997 г.). «Монотерпенсинтазы из пихты большой (Abies grandis). Выделение кДНК, характеристика и функциональная экспрессия мирценсинтазы, (-) - (4S) -лимонен-синтазы и (-) - (1S, 5S) -пинен-синтазы». J. Biol. Chem. 272 (35): 21784–92. Дои:10.1074 / jbc.272.35.21784. PMID 9268308.
- ^ [1], 5-эпиаристолохенсинтаза, [2] и (+) - дельта-кадиненсинтаза SWISSPROT
- ^ Hyatt, D.C .; Юн, Б .; Zhao, Y .; Santhamma, B .; Coates, R.M .; Croteau, R. B .; Канг, К. (2007). «Предшественник 4S-лимонен-синтазы - Mentha spicata (Мята колосистая)». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. Uniprot.org. 104 (13): 5360–5. Дои:10.1073 / pnas.0700915104. ЧВК 1838495. PMID 17372193. Получено 2012-08-02.
- ^ Айт-Али, Т .; Swain, S.M .; Reid, J. B .; Вс, Т .; Камия, Ю. (1997). «Энт-копалилдифосфатсинтаза, предшественник хлоропластов - Pisum sativum (Горох садовый)». Журнал растений: для клеточной и молекулярной биологии. Uniprot.org. 11 (3): 443–54. Дои:10.1046 / j.1365-313X.1997.11030443.x. PMID 9107034. Получено 2012-08-02.
- ^ Wildung, M. R .; Крото, Р. (1996). «Таксадиен-синтаза - Taxus brevifolia (тис тихоокеанский)». Журнал биологической химии. Uniprot.org. 271 (16): 9201–4. Дои:10.1074 / jbc.271.16.9201. PMID 8621577. S2CID 3191132. Получено 2012-08-02.
- ^ «Пинен-синтаза, предшественник хлоропластов - Abies grandis (пихта Гранд)». Uniprot.org. Получено 2012-08-02.
- ^ «Мирценсинтаза, предшественник хлоропластов - Abies grandis (пихта большая)». Uniprot.org. Получено 2012-08-02.
- ^ Yamaguchi, S .; Сайто, Т .; Abe, H .; Yamane, H .; Мурофуши, Н .; Камия, Ю. (1996). «Энт-каур-16-енсинтаза, хлоропластный предшественник - Cucurbita maxima (Тыква)». Журнал растений: для клеточной и молекулярной биологии. Uniprot.org. 10 (2): 203–13. Дои:10.1046 / j.1365-313X.1996.10020203.x. PMID 8771778. Получено 2012-08-02.
- ^ «Линалоолсинтаза - Clarkia concinna (Красные ленты)». Uniprot.org. Получено 2012-08-02.
- ^ Кавайде Х., Имаи Р., Сасса Т., Камия Й. (август 1997 г.). «Энт-кауренсинтаза из гриба Phaeosphaeria sp. L487. Выделение кДНК, характеристика и бактериальная экспрессия бифункциональной дитерпенциклазы в грибковом биосинтезе гиббереллина». J. Biol. Chem. 272 (35): 21706–12. Дои:10.1074 / jbc.272.35.21706. PMID 9268298.