Микробная генетика - Microbial genetics

Микробная генетика предметная область внутри микробиология и генная инженерия. Микробная генетика изучает микроорганизмы для разных целей. Наблюдаемые микроорганизмы - это бактерии и археи. Некоторые грибы и простейшие также являются объектами изучения в этой области. Исследования микроорганизмов включают изучение генотипа и системы экспрессии. Генотипы - это унаследованные составы организма. (Остин, «Генотип», без даты) Генная инженерия - это область работы и исследований в области микробной генетики.[1] Использование технологии рекомбинантной ДНК - это процесс этой работы.[1] Процесс включает создание рекомбинантных молекул ДНК путем манипулирования последовательностью ДНК.[1] Созданная ДНК затем контактирует с организмом-хозяином. Клонирование также является примером генной инженерии.[1]

С момента открытия микроорганизмов Робертом Гуком и Антони ван Левенгук в период 1665-1885 гг.[2] они использовались для изучения многих процессов и нашли применение в различных областях генетики. Например: быстрые темпы роста и короткое время генерации микроорганизмов используются учеными для изучения эволюции. Открытия Роберта Гука и Антони ван Левенгука включали изображения, наблюдения и описания микроорганизмов.[3] Мукор - это микрогриб, который представил и описал Гук.[4] Его вклад - Мукор как первый проиллюстрированный микроорганизм. Вклад Антони ван Левенгука в развитие микроскопических простейших и микроскопических бактерий стал предметом научных наблюдений и описаний.[4] Эти вклады были сделаны с помощью простого микроскопа, который привел к пониманию микробов сегодня и продолжает развивать понимание ученых.[5]Микробная генетика также может использоваться для изучения процессов и путей, которые аналогичны тем, которые обнаруживаются у людей, например, метаболизм лекарств.[6]

Роль в понимании эволюции

Микробная генетика может сосредоточиться на работе Чарльза Дарвина, и ученые продолжили изучать его работу и теории с помощью микробов.[7] В частности, использовалась теория естественного отбора Дарвина. Изучение эволюции с помощью микробной генетики вовлекает ученых в эволюционный баланс.[1] Примером того, как они могут это сделать, является изучение естественного отбора или дрейфа микробов.[7] Применение этих знаний происходит из поиска наличия или отсутствия различными способами.[7] Способы включают определение определенных путей, генов и функций. После наблюдения за субъектом ученый может сравнить его с последовательностью консервативного гена.[1] В процессе изучения эволюции микробов таким образом отсутствует возможность указать временную шкалу, когда происходила эволюция.[7] Однако, проверяя эволюцию таким образом, ученый может узнать скорость и результаты эволюции. Изучение взаимосвязи между микробами и окружающей средой - ключевой компонент эволюции микробной генетики.[8]

Микроорганизмы, изучение которых связано с микробной генетикой

Бактерии

Бактерии классифицируются по форме.

Бактерии существуют на этой планете примерно 3,5 миллиарда лет и классифицируются по форме.[9] Бактериальная генетика изучает механизмы их наследственной информации, их хромосомы, плазмиды, транспозоны, и фаги.[10]

Системы переноса генов, которые были широко изучены у бактерий, включают: генетическая трансформация, спряжение и трансдукция. Естественная трансформация представляет собой бактериальную адаптацию для переноса ДНК между двумя клетками через промежуточную среду. Захват донорской ДНК и ее рекомбинационное включение в хромосому реципиента зависит от экспрессии многочисленных бактериальных генов, продукты которых направляют этот процесс.[11][12] В общем, трансформация - это сложный, требующий энергии процесс развития, который кажется адаптацией для восстановления повреждений ДНК.[13]

Бактериальная конъюгация передача генетического материала между бактериальные клетки за счет прямого межклеточного контакта или мостикового соединения между двумя сотами. Бактериальная конъюгация широко изучалась в кишечная палочка, но также встречается у других бактерий, таких как Микобактерии смегматис. Конъюгация требует стабильного и продолжительного контакта между штаммом донора и реципиента. ДНКаза устойчивы, и перенесенная ДНК включается в хромосому реципиента посредством гомологичная рекомбинация. Кишечная палочка конъюгация опосредуется выражением плазмида гены, тогда как конъюгация микобактерий опосредуется генами бактериальной хромосомы.[14]

Трансдукция это процесс, посредством которого иностранные ДНК вводится в клетку вирус или же вирусный вектор. Трансдукция - это распространенный инструмент, используемый молекулярными биологами для стабильного введения чужеродного гена в клетки-хозяева. геном.

Археи

Археи это область организмов, которые прокариотический, одноклеточные, и считается, что они появились 4 миллиарда лет назад. «У них нет клеточного ядра или каких-либо других органелл внутри своих клеток». Археи размножаются бесполым путем в процессе, известном как бинарное деление. Цикл клеточного деления включает репликацию хромосом дочерних клеток. Поскольку археи имеют особую структуру хромосомы, две дочерние клетки разделяются и клетка делится. У архей подвижность включает жгутики, которые представляют собой хвостообразную структуру. Хромосомы архей реплицируются из разных источников репликации, производя две гаплоидные дочерние клетки.[15] "[16] У них общий предок с бактерии, но более тесно связаны с эукариотами, чем с бактериями.[17] Некоторые археи способны выжить в экстремальных условиях, что приводит к множеству применений в области генетики. Одним из таких применений является использование ферментов архей, которые могли бы лучше выжить в суровых условиях. in vitro.[18]

Перенос генов и генетический обмен изучались в галофильный Археон Halobacterium volcanii и гипертермофильный Археоны Sulfolobus solfataricus и Sulfolobus acidocaldarius. H. volcani образует цитоплазматические мостики между клетками, которые, по-видимому, используются для передачи ДНК от одной клетки к другой в любом направлении.[19] Когда S. solfataricus и S. acidocaldarius подвергаются воздействию повреждающих ДНК агентов, индуцируется видоспецифическая клеточная агрегация. Клеточная агрегация с высокой частотой опосредует обмен хромосомными маркерами и генетическую рекомбинацию. Считается, что клеточная агрегация улучшает передачу ДНК между видами Сульфолобус клетки, чтобы обеспечить усиленное восстановление поврежденной ДНК с помощью гомологичная рекомбинация.[20][21][22] Археи делятся на 3 подгруппы: галофилы, метаногены и термоацидофилы. Первая группа, метаногены, - это архебактерии, обитающие в болотах и ​​болотах, а также в кишечнике человека. Они также играют важную роль в гниении и разложении с мертвыми организмами. Метаногены - анаэробные организмы, которые погибают при воздействии кислорода. Вторая подгруппа архейбактерий, галофилы - это организмы, которые обитают в районах с высокой концентрацией соли, таких как Большое Соленое озеро и Мертвое море. Третья подгруппа термоацидофилов, также называемых термофилами, - это организмы, обитающие в кислых областях. Они присутствуют в областях с низким уровнем pH, таких как горячие источники и гейеры. Большинство термофилов обитает в Йеллоустонском национальном парке.[23]

Архейская генетика - это изучение генов, состоящих из одноядерных клеток.[24] Археи имеют одиночные кольцевые хромосомы, которые содержат несколько источников репликации для инициации синтеза ДНК.[25] Репликация ДНК архей включает сходные процессы, включая инициацию, удлинение и завершение. Примаза, используемая для синтеза праймера РНК, различается по сравнению с эукариотами. Примаза архей является высокопроизводительной версией мотива распознавания РНК (RRM).[25] Археи происходят от грамположительных бактерий, которые имеют один липидный бислой и устойчивы к антибиотикам. Археи похожи на митохондрии эукариот в том, что они выделяют энергию в виде аденозинтрифосфата (АТФ) посредством химической реакции, называемой метаболизмом.[25] Некоторые археи, известные как фототрофные археи, используют энергию солнца для производства АТФ. АТФ-синтаза используется для фотофосфорилирования для преобразования химических веществ в АТФ.[15]

Археи и бактерии структурно похожи, хотя в древе жизни они не имеют близкого родства. Форма как бактерий, так и клеток архей варьируется от сферической формы, известной как кокк, до формы палочки, известной как палочка. Они также связаны с отсутствием внутренней мембраны и клеточной стенки, которая помогает клетке сохранять свою форму. Несмотря на то, что клетки архей имеют клеточные стенки, они не содержат пептидогликан, что означает, что археи не производят целлюлозу или хитин. Археи наиболее тесно связаны с эукариотами из-за наличия тРНК в архее, но не у бактерий. Археи имеют те же рибосомы, что и эукариоты, которые синтезируются в белки.[26] Помимо морфологии архей и бактерий, между этими доменами есть и другие различия. Археи, которые живут в экстремальных и суровых условиях с низким уровнем pH, таких как соленые озера, океаны и в кишечнике жвачных животных и человека, также известны как экстремофилы. Напротив, бактерии встречаются в различных областях, таких как растения, животные, почва и камни.[27]

Грибы

Грибы могут быть как многоклеточными, так и одноклеточными организмами и отличаться от других микробы кстати они получают питательные вещества. Секрет грибов ферменты в окружающую среду, чтобы разрушить органические вещества.[9] Грибковая генетика использует дрожжи, и нитчатые грибы в качестве модельных организмов для генетических исследований эукариот, в том числе клеточный цикл регулирование хроматин структура и генная регуляция.[28]

Исследования грибок Neurospora crassa внесли существенный вклад в понимание того, как гены работай. N. crassa это разновидность красного хлеба плесень из филюм Аскомикота. Он используется как модельный организм потому что его легко выращивать и гаплоидный жизненный цикл, который делает генетический анализ прост, так как рецессивные черты обнаруживаются у потомства. Анализ генетической рекомбинации облегчается упорядоченным расположением продуктов мейоз в аскоспоры. В своей естественной среде, N. crassa Обитает в основном в тропических и субтропических регионах. Часто его можно найти растущим на мертвых растениях после пожаров.

Нейроспора использовался Эдвард Татум и Джордж Бидл в своих экспериментах[29] за что они выиграли Нобелевская премия по физиологии и медицине в 1958 г. Результаты этих экспериментов привели непосредственно к гипотеза один ген - один фермент этот конкретный гены код для конкретных белки. Эта концепция оказалась первым оружием в том, что стало молекулярная генетика и все последующие события.[30]

Saccharomyces cerevisiae это дрожжи из филюм Аскомикота. Во время вегетативного роста, который обычно происходит при изобилии питательных веществ, С. cerevisiae воспроизводится митоз в качестве диплоид клетки. Однако при голодании эти клетки подвергаются мейоз формировать гаплоидный споры.[31] Спаривание происходит, когда гаплоидные клетки противоположного типы вязки MATa и MATα вступают в контакт. Ruderfer et al.[32] указал, что в природе такие контакты между близкородственными дрожжевыми клетками часты по двум причинам. Во-первых, клетки противоположного типа спаривания присутствуют вместе в одном и том же акус, мешочек, содержащий клетки, непосредственно продуцируемые одним мейоз, и эти клетки могут спариваться друг с другом. Вторая причина в том, что гаплоидный клетки одного типа спаривания при делении клеток часто дают клетки противоположного типа спаривания. Анализ происхождения природных С. cerevisiae Штаммы пришли к выводу, что ауткроссинг происходит очень редко (примерно один раз на каждые 50 000 делений клеток).[32] Относительная редкость мейотических событий, возникающих в результате ауткроссинга, предполагает, что возможные долгосрочные выгоды от ауткроссинга (например, формирование разнообразия) вряд ли будут достаточными для общего сохранения пола от одного поколения к другому. Скорее, краткосрочная выгода, такая как мейотическая рекомбинационная репарация повреждений ДНК, вызванных стрессовыми условиями (такими как голодание)[33] может быть ключом к поддержанию секса в С. cerevisiae.

грибковые микроорганизмы албиканс это диплоидный гриб, который растет как дрожжи, так и нить. C. albicans это самый распространенный грибок возбудитель в людях. Это вызывает как изнурительные инфекции слизистых оболочек, так и потенциально опасные для жизни системные инфекции. C. albicans поддерживает сложный, но в значительной степени скрытый брачный аппарат.[34] Джонсон[34] предположил, что стратегии спаривания могут позволить C. albicans выжить во враждебной среде хозяина-млекопитающего.

Среди 250 известных видов аспергиллы, около 33% имеют определенное сексуальное состояние.[35] Среди тех Аспергиллы виды, демонстрирующие половой цикл, подавляющее большинство в природе гомоталлический (самоопыление).[35] Селфи в гомоталлическом грибе Aspergillus nidulans включает активацию тех же путей спаривания, характерных для пола у ауткроссинговых видов, то есть самооплодотворение не обходит требуемые пути для ауткроссинга, а вместо этого требует активации этих путей внутри одного человека.[36] Слияние гаплоидных ядер происходит в репродуктивных структурах, называемых клейстотеция, в котором диплоидная зигота подвергается мейотическим делениям с образованием гаплоидных аскоспоры.

Простейшие

Простейшие представляют собой одноклеточные организмы, в цитоплазме которых есть ядра и ультрамикроскопические клеточные тела.[9] Одним из аспектов простейших, представляющих интерес для генетиков, является их жгутики, которые очень похожи на человеческие сперма жгутики.

Исследования Парамеций способствовали нашему пониманию функции мейоза. Как все инфузории, Парамеций имеет полиплоид макронуклеус, и один или несколько диплоид микроядра. В макронуклеус контролирует нерепродуктивные функции клеток, экспрессируя гены, необходимые для повседневного функционирования. В микронуклеус является генеративным, или зародышевый ядро, содержащее генетический материал, который передается от одного поколения к другому.[37]

В фазе бесполого деления роста, во время которой происходит деление клеток путем митоз скорее, чем мейоз, происходит клональное старение, ведущее к постепенной потере жизненных сил. У некоторых видов, например у хорошо изученных Paramecium tetraurelia, бесполая линия клонально стареющих парамеций теряет жизнеспособность и умирает примерно через 200 делений, если клетки не проходят мейоз с последующей автогамией (самооплодотворение) или конъюгацией (ауткроссинг) (см. старение в Парамеций ). Повреждение ДНК резко увеличивается во время последовательных делений клональных клеток и является вероятной причиной клонального старения у П. тетраурелия.[38][39][40]

При клональном возрасте П. тетраурелия стимулируются к мейозу в связи с автогамия или же спряжение, потомство омолаживается и может иметь гораздо больше митотических бинарных делений. Во время любого из этих процессов микроядра клетки (ов) подвергаются мейозу, старое макронуклеус распадается, и новое макронуклеус образуется путем репликации микроядерной ДНК, которая недавно подверглась мейозу. Очевидно, что повреждение ДНК в новом макронуклеусе незначительно, если оно вообще есть, что позволяет предположить, что омоложение связано с восстановлением этих повреждений в микроядре во время мейоза.[нужна цитата ]

Вирусы

Вирусы находятся капсид -кодирующие организмы, состоящие из белков и нуклеиновых кислот, которые могут самособираться после репликации в клетке-хозяине с использованием репликационного аппарата хозяина.[41] В науке существуют разногласия относительно того, вирусы живут из-за отсутствия рибосомы.[41] Понимание вирусного генома важно не только для исследований в области генетики, но и для понимания их патогенных свойств.[42]

Многие типы вирусов способны к генетической рекомбинации. Когда два или более отдельных вируса одного типа заражают клетку, их геномы могут рекомбинировать друг с другом с образованием потомства рекомбинантного вируса. И ДНК, и РНК вирусы могут подвергаться рекомбинации. Когда два или более вируса, каждый из которых содержит летальные геномные повреждения, инфицируют одну и ту же клетку-хозяин, вирусные геномы часто могут спариваться друг с другом и подвергаться гомологичной рекомбинационной репарации с образованием жизнеспособного потомства.[43][44] Этот процесс известен как повторная активация множественности.[43][45] Ферменты, используемые для реактивации множественности, функционально гомологичны ферментам, используемым в рекомбинационной репарации бактерий и эукариот. Было обнаружено, что реактивация множественности происходит с патогенными вирусами, включая вирус гриппа, ВИЧ-1, аденовирус обезьяньего вируса 40, вирус осповакцины, реовирус, полиовирус и вирус простого герпеса, а также многочисленные бактериофаги.[45]

Любой живой организм может заразиться вирусом, дав паразитам возможность расти. Паразиты питаются питательными веществами другого организма, что позволяет вирусу процветать. Как только человеческое тело обнаруживает вирус, оно создает боевые клетки, которые атакуют паразита / вирус; буквально, вызывая войну внутри тела.[46] Вирус может поражать любую часть тела, вызывая широкий спектр заболеваний, таких как грипп, простуда и заболевания, передающиеся половым путем.[46] Грипп - это вирус, передающийся по воздуху, который распространяется через крошечные капли и официально известен как грипп. Паразиты путешествуют по воздуху и поражают дыхательную систему человека. Люди, изначально инфицированные этим вирусом, передают инфекцию в результате обычной повседневной деятельности, такой как разговоры и чихание. Когда человек вступает в контакт с вирусом, в отличие от обычной простуды, вирус гриппа поражает людей практически сразу. Симптомы этого вируса очень похожи на простуду, но намного хуже. Боль в теле, боль в горле, головная боль, холодный пот, мышечные боли и усталость - вот многие из многих симптомов, сопровождающих вирус.[47] Вирусная инфекция верхних дыхательных путей приводит к простуде.[48] При таких симптомах, как боль в горле, чихание, небольшая температура и кашель, простуда обычно безвредна и имеет тенденцию проходить в течение недели или около того. Простуда - это также вирус, который распространяется по воздуху, но также может передаваться через прямой контакт. Для развития симптомов этой инфекции требуется несколько дней; это постепенный процесс, в отличие от гриппа.[48]

Применение микробной генетики

Полимераза Taq, которая используется в полимеразной цепной реакции (ПЦР)

Микробы идеально подходят для биохимический и генетика исследования и внесли огромный вклад в эти области науки, такие как демонстрация того, что ДНК является генетическим материалом,[49][50] что ген имеет простую линейную структуру,[51] что генетический код - это тройной код,[52] и что экспрессия генов регулируется специфическими генетическими процессами.[53] Жак Моно и Франсуа Жакоб использовал кишечная палочка, тип бактерий, для развития оперон модель экспрессия гена, которые лежат в основе экспрессии и регуляции генов.[54] Кроме того, наследственный Процессы одноклеточных эукариотических микроорганизмов аналогичны процессам в многоклеточных организмах, что позволяет исследователям также собирать информацию об этом процессе.[55] Еще одна бактерия, которая внесла большой вклад в развитие генетика является Thermus aquaticus, который является бактерией, которая переносит высокие температуры. Из этого микроба ученые выделили фермент Полимераза Taq, который сейчас используется в мощной экспериментальной технике, Полимеразной цепной реакции (ПЦР).[56] Дополнительно разработка технология рекомбинантной ДНК за счет использования бактерий привело к рождению современных генная инженерия и биотехнология.[9]

Используя микробы, были разработаны протоколы для вставки генов в бактериальные клетки. плазмиды, пользуясь их быстрым воспроизведением, чтобы биофабрики для интересующего гена. Такие генно-инженерные бактерии могут производить фармацевтические препараты Такие как инсулин, гормон роста человека, интерфероны и факторы свертывания крови.[9] Эти биофабрики обычно намного дешевле в эксплуатации и обслуживании, чем альтернативные методы производства фармацевтических препаратов. Они похожи на миллионы крошечных фармацевтических машин, которым требуется только базовое сырье и подходящая среда для производства большого количества продукта. Использование одного только гена человеческого инсулина оказало глубокое влияние на медицинскую промышленность. Считается, что биофабрики могут стать ключевым фактором снижения цен на дорогостоящие жизненно важные фармацевтические препараты.

Микробы синтезируют различные ферменты для промышленного применения, такие как ферментированные продукты, реагенты для лабораторных тестов, молочные продукты (такие как ренин ), и даже в одежде (например, Триходермия грибок, фермент которого используется для придания джинсам вида выстиранных как камень).[9]

В настоящее время существует возможность использования микробов в качестве альтернативы поверхностно-активным веществам на нефтяной основе. Микробные поверхностно-активные вещества по-прежнему будут иметь такой же вид гидрофильный и гидрофобный функциональные группы как их аналоги на основе нефти, но они имеют множество преимуществ перед конкурентами. Для сравнения, микробный амфифильный составы имеют устойчивую тенденцию оставаться функциональными в экстремальных условиях, таких как области с высокой температурой или экстремальным pH. все это биологически разлагаемое и менее токсичное для окружающей среды. Этот эффективный и дешевый метод производства может стать решением постоянно растущего глобального потребления поверхностно-активных веществ. По иронии судьбы, применение поверхностно-активных веществ на биологической основе наиболее востребовано в нефтяной промышленности, которая использует поверхностно-активные вещества как в общем производстве, так и при разработке конкретных масляных композиций.[57]

Микробы - обильный источник липазы которые имеют широкий спектр промышленных и бытовых применений. Ферменты выполняют широкий спектр функций внутри клеток живых существ, поэтому имеет смысл только то, что мы можем использовать их для аналогичных целей в большем масштабе. Микробные ферменты обычно предпочтительны для массового производства из-за большого разнообразия доступных функций и их способности производить массово. Ферменты растений и животных обычно слишком дороги для массового производства, однако это не всегда так. Особенно у растений. Промышленное применение липаз обычно включает фермент в качестве более эффективного и экономичного катализатора при производстве коммерчески ценных химикатов из жиров и масел, поскольку они способны сохранять свои специфические свойства в мягких, простых в поддержании условиях и работать с повышенной скоростью. . Другие уже успешные применения липолитических ферментов включают производство биотоплива, полимеров, нестереоизомерных фармацевтических препаратов, сельскохозяйственных соединений и соединений, усиливающих вкус.[58]

Что касается промышленной оптимизации, преимуществом биофабричного метода производства является возможность прямой оптимизации посредством направленной эволюции. Эффективность и специфичность производства со временем увеличатся за счет искусственного отбора. В этом методе повышения эффективности нет ничего нового в сельском хозяйстве, но это относительно новая концепция в промышленном производстве. Считается, что этот метод будет намного лучше обычных промышленных методов, потому что у вас есть оптимизация по нескольким направлениям. Во-первых, микроорганизмы, из которых состоят биофабрики, могут развиваться в соответствии с нашими потребностями. Второй фронт - это традиционный метод оптимизации, вызванный интеграцией передовых технологий. Эта комбинация традиционных и биологических достижений только сейчас находит применение и обеспечивает практически безграничное количество применений.[59]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж «Микробы и инструменты генной инженерии | Микробиология». course.lumenlearning.com. Получено 17 ноября 2018.
  2. ^ Гест, Хау (22 мая 2004 г.). «Открытие микроорганизмов Робертом Гуком и Антони ван Левенгук, членами Королевского общества». Примечания и отчеты Лондонского королевского общества. 58 (2): 137–201. Дои:10.1098 / рснр.2004.0055. PMID  15209075. S2CID  8297229.
  3. ^ «BBC - История - Исторические личности: Антони ван Левенгук (1632–1723)». Получено 17 ноября 2018.
  4. ^ а б "Энтони ван Левенгук: Темы сайта Science.gov". www.science.gov. Получено 17 ноября 2018.
  5. ^ Мортлок, Роберт (2013). Микроорганизмы как модельные системы для изучения эволюции. Springer Verlag. п. 2. ISBN  978-1-4684-4846-7.
  6. ^ Мерфи, Кормак Д. (2 сентября 2014 г.). «Метаболизм лекарств в микроорганизмах». Письма о биотехнологии. 37 (1): 19–28. Дои:10.1007 / s10529-014-1653-8. HDL:10197/7674. PMID  25179825. S2CID  16636885.
  7. ^ а б c d Бакли, Мерри; Рид, Энн (2011). Микробная эволюция.
  8. ^ Чакраборти, Ранаджит; Будоул, Брюс (2011). «Популяционные генетические соображения в статистической интерпретации данных микробной криминалистики в сравнении со стандартом судебной экспертизы ДНК человека». Микробиологическая экспертиза. С. 561–580. Дои:10.1016 / B978-0-12-382006-8.00033-5. ISBN  978-0-12-382006-8.
  9. ^ а б c d е ж Недели, Бенджамин С. (2012). Микробы Алькамо и общество (3-е изд.). Садбери, Массачусетс: Jones & Bartlett Learning. ISBN  978-0-7637-9064-6.
  10. ^ «Бактериальная генетика». Природа. Macmillan Publishers Limited. Получено 8 ноября 2015.
  11. ^ Чен И., Дубнау Д. (2004). «Поглощение ДНК во время бактериальной трансформации». Обзоры природы Микробиология. 2 (3): 241–9. Дои:10.1038 / nrmicro844. PMID  15083159. S2CID  205499369.
  12. ^ Johnsborg O, Eldholm V, Håvarstein LS (2007). «Естественная генетическая трансформация: распространенность, механизмы и функции». Исследования в области микробиологии. 158 (10): 767–78. Дои:10.1016 / j.resmic.2007.09.004. PMID  17997281.
  13. ^ Мичод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (2008). «Адаптивное значение секса у микробных патогенов». Инфекция, генетика и эволюция. 8 (3): 267–85. Дои:10.1016 / j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.
  14. ^ Gray TA, Krywy JA, Harold J, Palumbo MJ, Derbyshire KM (2013). «Распределительный конъюгальный перенос в микобактериях генерирует потомство с мозаицизмом по всему геному, подобным мейотическому, что позволяет картировать локус идентичности спаривания». PLOS Биология. 11 (7): e1001602. Дои:10.1371 / journal.pbio.1001602. ЧВК  3706393. PMID  23874149.
  15. ^ а б Хоган, Майкл. «Что такое археи? - Энциклопедия жизни». Энциклопедия жизни.
  16. ^ «Энциклопедия жизни».
  17. ^ «Архея». Мир микробов. Мир микробов. Архивировано из оригинал 23 ноября 2015 г.. Получено 8 ноября 2015.
  18. ^ Chambers, Cecilia R .; Патрик, Уэйн М. (2015). «Лигазы нуклеиновых кислот архей и их потенциал в биотехнологии». Археи. 2015: 170571. Дои:10.1155/2015/170571. ЧВК  4606414. PMID  26494982.
  19. ^ Rosenshine I, Tchelet R, Mevarech M (1989). «Механизм передачи ДНК в системе спаривания архебактерии». Наука. 245 (4924): 1387–9. Bibcode:1989Научный ... 245.1387R. Дои:10.1126 / science.2818746. PMID  2818746.
  20. ^ Fröls S, Ajon M, Wagner M, Teichmann D, Zolghadr B, Folea M, Boekema EJ, Driessen AJ, Schleper C, Albers SV (2008). «Индуцируемая УФ-излучением клеточная агрегация гипертермофильной археи Sulfolobus solfataricus опосредована образованием пилей» (PDF). Молекулярная микробиология. 70 (4): 938–52. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2008.06459.x. PMID  18990182. S2CID  12797510.
  21. ^ Фрелс С., Уайт М.Ф., Шлепер С. (2009). «Реакции на УФ-повреждение у модельного архея Sulfolobus solfataricus». Сделки биохимического общества. 37 (Pt 1): 36–41. Дои:10.1042 / BST0370036. PMID  19143598.
  22. ^ Аджон М., Фрёльс С., ван Вольферен М., Стокер К., Тейхманн Д., Дриссен А.Дж., Гроган Д.В., Альберс С.В., Шлепер С. (2011). «УФ-индуцируемый обмен ДНК в гипертермофильных архее, опосредованный пилями IV типа» (PDF). Молекулярная микробиология. 82 (4): 807–17. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2011.07861.x. PMID  21999488. S2CID  42880145.
  23. ^ «Примеры архебактерий». BiologyWise.
  24. ^ «Генетика архей - Последние исследования и новости | Природа». www.nature.com.
  25. ^ а б c "Архейская генетика | Безграничная микробиология". course.lumenlearning.com.
  26. ^ «Морфология архей». www.ucmp.berkeley.edu.
  27. ^ «Археи против бактерий - разница и сравнение | Diffen».
  28. ^ «Грибковая генетика». Nature.com. Macmillan Publishers Limited. Получено 9 ноября 2015.
  29. ^ Бидл GW, Татум EL (1941). «Генетический контроль биохимических реакций у нейроспор». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 27 (11): 499–506. Bibcode:1941ПНАС ... 27..499Б. Дои:10.1073 / pnas.27.11.499. ЧВК  1078370. PMID  16588492.
  30. ^ Горовиц Н.Х., Берг П., Зингер М., Ледерберг Дж., Сусман М., Добли Дж., Ворона Дж. Ф. (2004). "Столетие: Джордж Бидл, 1903-1989 годы". Генетика. 166 (1): 1–10. Дои:10.1534 / genetics.166.1.1. ЧВК  1470705. PMID  15020400.
  31. ^ Херсковиц I (1988). «Жизненный цикл зародышевых дрожжей Saccharomyces cerevisiae». Микробиологические обзоры. 52 (4): 536–53. Дои:10.1128 / MMBR.52.4.536-553.1988. ЧВК  373162. PMID  3070323.
  32. ^ а б Рудерфер Д.М., Пратт С.К., Зайдель Х.С., Кругляк Л. (2006). «Популяционный геномный анализ ауткроссинга и рекомбинации у дрожжей». Природа Генетика. 38 (9): 1077–81. Дои:10,1038 / ng1859. PMID  16892060. S2CID  783720.
  33. ^ Birdsell, John A .; Уиллс, Кристофер (2003). «Эволюционное происхождение и поддержание сексуальной рекомбинации: обзор современных моделей». Эволюционная биология. С. 27–138. Дои:10.1007/978-1-4757-5190-1_2. ISBN  978-1-4419-3385-0.
  34. ^ а б Джонсон А. (2003). «Биология спаривания Candida albicans». Обзоры природы Микробиология. 1 (2): 106–16. Дои:10.1038 / nrmicro752. PMID  15035040. S2CID  1826178.
  35. ^ а б Дайер PS, О'Горман CM (2012). «Половое развитие и загадочная сексуальность у грибов: выводы из видов Aspergillus». Обзор микробиологии FEMS. 36 (1): 165–92. Дои:10.1111 / j.1574-6976.2011.00308.x. PMID  22091779.
  36. ^ Паолетти М., Сеймур Ф.А., Алкосер М.Дж., Каур Н., Кальво А.М., Арчер Д.Б., Дайер П.С. (2007). «Тип спаривания и генетические основы самооплодотворения у модельного гриба Aspergillus nidulans». Текущая биология. 17 (16): 1384–9. Дои:10.1016 / j.cub.2007.07.012. PMID  17669651. S2CID  17068935.
  37. ^ Прескотт Д.М. (1994). «ДНК мерцательных простейших». Микробиологические обзоры. 58 (2): 233–67. Дои:10.1128 / MMBR.58.2.233-267.1994. ЧВК  372963. PMID  8078435.
  38. ^ Смит-Зоннеборн Дж. (1979). «Восстановление ДНК и обеспечение долголетия Paramecium tetraurelia». Наука. 203 (4385): 1115–7. Bibcode:1979Научный ... 203.1115С. Дои:10.1126 / science.424739. PMID  424739.
  39. ^ Холмс Г.Е., Холмс Н.Р. (1986). «Накопление повреждений ДНК при старении Paramecium tetraurelia». Молекулярная и общая генетика. 204 (1): 108–14. Дои:10.1007 / bf00330196. PMID  3091993. S2CID  11992591.
  40. ^ Гилли Д., Блэкберн Э. Х. (1994). «Отсутствие укорочения теломер во время старения у Paramecium». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (5): 1955–8. Bibcode:1994ПНАС ... 91.1955Г. Дои:10.1073 / пнас.91.5.1955. ЧВК  43283. PMID  8127914.
  41. ^ а б Рауль, Дидье; Фортер, Патрик (3 марта 2008 г.). «Новое определение вирусов: уроки мимивируса». Обзоры природы Микробиология. 6 (4): 315–319. Дои:10.1038 / nrmicro1858. PMID  18311164. S2CID  24447407.
  42. ^ Сето, Дональд (30 ноября 2010 г.). «Вирусная геномика и биоинформатика». Вирусы. 2 (12): 2587–2593. Дои:10.3390 / v2122587. ЧВК  3185590. PMID  21994632.
  43. ^ а б Бернштейн C (1981). «Восстановление дезоксирибонуклеиновой кислоты в бактериофаге». Микробиологические обзоры. 45 (1): 72–98. Дои:10.1128 / MMBR.45.1.72-98.1981. ЧВК  281499. PMID  6261109.
  44. ^ Чен Д., Бернштейн С. (1987). «Рекомбинационная репарация повреждений ДНК фага Т4, вызванных перекисью водорода». Мутационные исследования. 184 (2): 87–98. Дои:10.1016/0167-8817(87)90064-2. PMID  3627145.
  45. ^ а б Мичод Р.Э., Бернштейн Х., Недельку А.М. (май 2008 г.). «Адаптивное значение секса у микробных патогенов». Инфекция, генетика и эволюция. 8 (3): 267–85. Дои:10.1016 / j.meegid.2008.01.002. PMID  18295550.http://www.hummingbirds.arizona.edu/Faculty/Michod/Downloads/IGE%20review%20sex.pdf
  46. ^ а б Теннант, Паула (12 марта 2018 г.). Вирусы: молекулярная биология, взаимодействия с хозяевами и приложения в биотехнологии. Фермин, Густаво, Фостер, Джером Э. Сан-Диего, Калифорния. ISBN  9780128111949. OCLC  1028979396.
  47. ^ 1956-, Куинн, Том (2008). Грипп: социальная история гриппа. Лондон: Новая Голландия. ISBN  9781845379414. OCLC  232713128.CS1 maint: числовые имена: список авторов (связь)
  48. ^ а б Гринхо, Бет (6 января 2012 г.). «Там, где виды встречаются и смешиваются: эндемичные отношения между человеком и вирусом, воплощенное общение и более чем человеческое участие в отделении общей простуды 1946–90». Культурные географии. 19 (3): 281–301. Дои:10.1177/1474474011422029. ISSN  1474-4740.
  49. ^ Эйвери О. Т., Маклауд К. М., Маккарти М. (1979). «Исследования химической природы вещества, вызывающего трансформацию пневмококков. Индукция трансформации фракцией дезоксирибонуклеиновой кислоты, выделенной из пневмококка III типа». Журнал экспериментальной медицины. 149 (2): 297–326. Дои:10.1084 / jem.149.2.297. ЧВК  2184805. PMID  33226.
  50. ^ Херши А.Д., Чейз М. (1952). «Независимые функции вирусного белка и нуклеиновой кислоты в росте бактериофага». Журнал общей физиологии. 36 (1): 39–56. Дои:10.1085 / jgp.36.1.39. ЧВК  2147348. PMID  12981234.
  51. ^ Benzer S (1959). «О топологии тонкой генетической структуры». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 45 (11): 1607–20. Bibcode:1959ПНАС ... 45.1607Б. Дои:10.1073 / pnas.45.11.1607. ЧВК  222769. PMID  16590553.
  52. ^ Крик Ф. Х., Барнетт Л., Бреннер С., Уоттс-Тобин Р. Дж. (1961). «Общая природа генетического кода белков». Природа. 192 (4809): 1227–32. Bibcode:1961Натура.192.1227C. Дои:10.1038 / 1921227a0. PMID  13882203. S2CID  4276146.
  53. ^ Джейкоб Ф, Монод Дж (1961). «Генетические механизмы регуляции синтеза белков». Журнал молекулярной биологии. 3 (3): 318–56. Дои:10.1016 / S0022-2836 (61) 80072-7. PMID  13718526.
  54. ^ «Микробная генетика». Мир микробиологии и иммунологии. 2003. Получено 9 ноября 2015.
  55. ^ Бейнбридж, Б.В. (1987). Генетика микробов (2-е изд.). Глазго: Блэки. ISBN  978-0-412-01281-5.
  56. ^ Терпе, Кей (1 ноября 2013 г.). «Обзор термостабильных ДНК-полимераз для классических приложений ПЦР: от молекулярных и биохимических основ до коммерческих систем». Прикладная микробиология и биотехнология. 97 (24): 10243–10254. Дои:10.1007 / s00253-013-5290-2. PMID  24177730. S2CID  13920919.
  57. ^ Banat, I.M .; Makkar, R. S .; Камеотра, С. С. (15 мая 2000 г.). «Возможные коммерческие применения микробных поверхностно-активных веществ». Прикладная микробиология и биотехнология. 53 (5): 495–508. Дои:10.1007 / s002530051648. ISSN  0175-7598. PMID  10855707. S2CID  1706157.
  58. ^ Хасан, Фариха; Шах, Амер Али; Хамид, Абдул (26 июня 2006 г.). «Промышленное применение микробных липаз». Ферментные и микробные технологии. 39 (2): 235–251. Дои:10.1016 / j.enzmictec.2005.10.016. ISSN  0141-0229.
  59. ^ Кондо, Акихико; Исии, Джун; Hara, Kiyotaka Y .; Хасунума, Томохиса; Мацуда, Фумио (20 января 2013 г.). «Развитие фабрик микробных клеток для биопереработки посредством синтетической биоинженерии». Журнал биотехнологии. 163 (2): 204–216. Дои:10.1016 / j.jbiotec.2012.05.021. ISSN  0168-1656. PMID  22728424.