Гаплогруппа Y (мтДНК) - Haplogroup Y (mtDNA)

Гаплогруппа Y
Мировая карта доисторических миграций человека.jpg
Возможное время происхожденияОт 11 800 до 33 300 YBP
ПредокN9
ПотомкиY1, Y2
Определение мутаций8392 10398 14178 14693 16126 16223 16231[1]

В митохондриальная генетика человека, Гаплогруппа Y это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК).

Источник

Гаплогруппа Y является потомком гаплогруппа N9.[нужна цитата ]

Распределение

Гаплогруппа Y была обнаружена с высокой частотой у многих коренных народов, живущих вокруг Охотское море, в том числе примерно 66% Нивхи, примерно 43% Ulchs,[2] примерно 40% Нанайцы, примерно 21% Негидальцы, и примерно 20% Айнус.[3][4][5][6] Это также довольно распространено среди коренных народов Полуостров Камчатка (Коряки, ительмены) и Приморская Юго-Восточная Азия.[нужна цитата ]

Распределение гаплогруппы Y в популяциях Малайский архипелаг резко контрастирует с отсутствием или крайней редкостью этой клады в популяциях континентальных Юго-Восточная Азия в манере, напоминающей гаплогруппа E. Однако частота гаплогруппы Y более плавно спадает по мере удаления от своего максимума в районе Охотского моря в Северо-Восточной Азии, обнаруживаясь примерно в 2% случаев. корейцы[4] и на юге Сибирский и Среднеазиатский популяции со средней частотой 1%.[7][8]

Субклад Y2 наблюдался в 40% (176/440) большого пула образцов из Ниас в западной Индонезии - от 25% (3/12) среди субпопуляции Залуху до 52% (11/21) среди субпопуляции Ho.[9]

Таблица частот гаплогруппы Y мтДНК

численность населенияЧастотаСчитатьИсточникПодтипы
Нивхский (северный Сахалин )0.66156Стариковская 2005Y1 = 37
Нивхский (северный Сахалин )0.65838Дагган 2013Y1a = 25
Ульчи (Села Старая Булава, Новая Булава, Богородское, Нижняя Гавань)0.431160Сукерник 2012Y1a = 69
Hezhen (Китай)0.40010HGDP ([1][2] Липпольд 2014 )Y1a = 4
Индонезийский (Ниас )0.400440Ван Печь 2011Y2 = 176
Ульч (Старая и Новая Булава)0.37987Стариковская 2005Y1 = 33
Негидальский0.21233Стариковская 2005Y1 = 7
Айны0.19651Satou 2009
Таджима 2004		Y1 = 10
Индонезийский (Медан, Суматра )0.16742Хилл 2006Y2 = 7
Филиппинский (Палаван )0.15020Скоулз 2011Y2 = 3
Четное (Березовка )0.13315Дагган 2013Y1a = 2
Филиппинский0.12962Хилл 2007Y2 = 8
Эвенкийский (Таймыр )0.12524Дагган 2013Y1a = 3
Коряк0.097155Стариковская 2005Y = 15
Эвенкийский (Бурятия )0.08945Деренко 2007Y = 4
Удэгей (Гвасюги, Имени Лазо, Хабаровский край )0.08746Стариковская 2005Y1 = 4
Филиппинский (Минданао )0.07170Таббада 2010Y2 = 5
Удэгей (Гвасюги, Хабаровский край )0.06531Дагган 2013Y1a = 2
Филиппинский0.06364Таббада 2010Y2 = 4
Индонезийский (Пеканбару, Суматра )0.05852Хилл 2006Y2 = 3
Бухарский араб (Узбекистан / Кыргызстан)0.05020Комас 2004Y = 1
Казахский (Узбекистан / Кыргызстан)0.05020Комас 2004Y = 1
Таджикский (Узбекистан / Кыргызстан)0.05020Комас 2004Y = 1
Орок (Сахалин )0.04961Бермишева 2005Y = 3
Четное (Эвено-Бытантайский & Момский )0.048105Федорова 2013Y1a = 5
Филиппинский (Лусон )0.045177Таббада 2010Y2 = 8
Ительмены0.04347Стариковская 2005Y = 2
Батак (Палаван )0.03231Скоулз 2011Y2 = 1
Гелао (Уезд Даочжэнь, Гуйчжоу )0.03231Ли 2007Y1 = 1
Хани (Xishuangbanna, Юньнань )0.03033Вэнь 2004Y = 1
Хамниган (Бурятия )0.03099Деренко 2007Y = 3
Корейский0.029346Маруяма 2003Y = 10
Эвенкийский (Красноярск )0.02773Деренко 2007Y = 2
Якутский (Р. Вилюй бассейн)0.027111Федорова 2013Y1a = 3
Четное (Камчатка )0.02639Дагган 2013Y1a = 1
Таджикский (Таджикистан )0.02344Деренко 2007Y = 1
Якутский (Центральный)0.02388Дагган 2013Y1a = 2
Даур (Знамя Эвенкийского автономного округа )0.02245Kong 2003Y1 = 1
Хан (Синьцзян )0.02147Яо 2004Y1 = 1
Монгольский (Улан-Батор )0.02147Джин 2009Y1 = 1
Калмыцкий (Калмыкия )0.018110Деренко 2007Y = 2
Казахский (Казахстан )0.01855Яо 2004Y1 = 1
Японский (Тохоку )0.018336Умэцу 2005Y = 6
Узбекский (Синьцзян )0.01758Яо 2004Y1 = 1
Индонезийский (Сулавеси )0.017237Хилл 2007Y2 = 4
Корейский (Южная Корея )0.015203Умэцу 2005Y = 3
Аборигены Тайваня0.014640Пэн 2011Y = 9
Бурятский (Бурятия )0.014295Деренко 2007Y = 4
Тайваньский0.013152Маруяма 2003Y = 2
Индонезийский (Адонара )0.01377Мона 2009Y2 = 1
Индонезийский (Бали )0.01282Хилл 2007Y2 = 1
Якутский (близость Якутск )0.012164Федорова 2013Y1a = 2
Китайский0.011263Маруяма 2003Y = 3
Тайваньский (Тайбэй, Тайвань )0.01191Умэцу 2005Y = 1
Корейский (Южная Корея )0.011185Джин 2009Y1 = 1, Y2 = 1
Казахский (Кош-Агачский, Республика Алтай )0.01098Деренко 2012Y1 = 1
Японский (Миядзаки )0.010100Учияма 2007Y = 1
Хмонг (Jishou, Хунань )0.010103Вэнь 2005Y = 1
Корейский (Южная Корея )0.010103Деренко 2007Y = 1
Бурятский0.008126Kong 2003Y1 = 1
Татарский (Буинск, Татарстан )0.008126Малярчук 2010Y1b = 1
Японский (северный Кюсю )0.008256Умэцу 2005Y = 2
Баргут (Hulunbuir )0.007149Деренко 2012Y1 = 1
Окинава0.006326Умэцу 2005Y = 2
Японский0.005211Маруяма 2003Y = 1
Японский (Хоккайдо )0.005217Asari 2007Y = 1
Башкирский (Белорецкий, Стерлибашевский, Илишевский, & Пермская область )0.005221Бермишева 2002Y = 1
Корейский (Южная Корея )0.004261Ким 2008Y = 1
Хан (южный Калифорния )0.003390Ji 2012Y = 1
Хан (Тайвань )0.0011117Ji 2012Y = 1
Дингбан Яо (Mengla, Юньнань )0.00010Вэнь 2005-
Сибань Яо (Fangcheng, Гуанси )0.00011Вэнь 2005-
Чукча (Анадырь )0.00015Деренко 2007-
Дунганский (Узбекистан / Кыргызстан)0.00016Комас 2004-
Уйгурский (Узбекистан / Кыргызстан)0.00016Комас 2004-
Юкагирский (Верхняя Колыма)0.00018Володько 2008-
Хуатоу Яо (Fangcheng, Гуанси )0.00019Вэнь 2005-
Крымскотатарский (Узбекистан /Кыргызстан )0.00020Комас 2004-
Иранский (Узбекистан / Кыргызстан)0.00020Комас 2004-
Каракалпак (Узбекистан / Кыргызстан)0.00020Комас 2004-
туркменский (Узбекистан / Кыргызстан)0.00020Комас 2004-
Йи (Hezhang County, Гуйчжоу )0.00020Ли 2007-
Юкагирский (Верхнеколымский & Нижнеколымский )0.00022Федорова 2013-
Гошань Яо (Цзянхуа, Хунань )0.00024Вэнь 2005-
Индуистский (Читван, Непал )0.00024Форнарино 2009-
Нганасан0.00024Стариковская 2005-
Буну (Дахуа & Тяньлинь, Гуанси )0.00025Вэнь 2005-
Бурятский (Кушун, Нижнеудинск, Иркутская область )0.00025Стариковская 2005-
Кубачи (Дагестан )0.00025Марчани 2008-
Курд (северо-западный Иран )0.00025Деренко 2007-
Кумыкский (Дагестан )0.00026Марчани 2008-
Лантэн Яо (Тяньлинь, Гуанси )0.00026Вэнь 2005-
Ю Миен (Mengla, Юньнань )0.00027Вэнь 2005-
Индонезийский (Палембанг, Суматра )0.00028Хилл 2006-
Андхра-Прадеш (племенной )0.00029Форнарино 2009-
Батек (Малайзия )0.00029Хилл 2006-
Tujia (Уезд Яньхэ, Гуйчжоу )0.00029Ли 2007-
Cun (Хайнань )0.00030Пэн 2011-
Nu (Гуншань, Юньнань)0.00030Вэнь 2004-
Tujia (Юншунь, Хунань)0.00030Вэнь 2004-
Lingao (Хайнань )0.00031Пэн 2011-
Учжоу Яо (Fuchuan, Гуанси )0.00031Вэнь 2005-
Йи (Луси, Юньнань)0.00031Вэнь 2004-
Чуванцы (Марково, Чукотка )0.00032Володько 2008-
Мендрик (Малайзия )0.00032Хилл 2006-
Mien (Шанси, Гуанси )0.00032Вэнь 2005-
Пан Яо (Тяньлинь, Гуанси )0.00032Вэнь 2005-
Ногайский (Дагестан )0.00033Марчани 2008-
Темуан (Малайзия )0.00033Хилл 2006-
Бапай Яо (Liannan, Гуандун )0.00035Вэнь 2005-
тибетский (Чжундянь, Юньнань )0.00035Вэнь 2004-
Алеут (Командорские острова )0.00036Володько 2008-
Пуми (Нинлан, Юньнань)0.00036Вэнь 2004-
Якутский (Якутия )0.00036Деренко 2007-
Сиреники Эскимосский0.00037Володько 2008-
Кет0.00038Стариковская 2005-
Эскимосский (Наукан )0.00039Володько 2008-
Хмонг (Вэньшань, Юньнань )0.00039Вэнь 2005-
Нганасан0.00039Володько 2008-
Хан (Пекин )0.00040Джин 2009-
Ким Мун (Малипо, Юньнань )0.00040Вэнь 2005-
Маньчжурский0.00040Джин 2009-
Тайский0.00040Джин 2009-
Тару (Morang, Непал )0.00040Форнарино 2009-
Узбекский (Узбекистан / Кыргызстан)0.00040Комас 2004-
Йи (Шуанбай, Юньнань)0.00040Вэнь 2004-
Ту Яо (Hezhou, Гуанси )0.00041Вэнь 2005-
Низменность Яо (Fuchuan, Гуанси )0.00042Вэнь 2005-
вьетнамский0.00042Джин 2009-
Индонезийский (Амбон )0.00043Хилл 2007-
Индонезийский (Матарам, Ломбок )0.00044Хилл 2007-
Хуэй (Синьцзян )0.00045Яо 2004-
Индонезийский (Алор )0.00045Хилл 2007-
Наси (Лицзян, Юньнань )0.00045Вэнь 2004-
Тофалар0.00046Стариковская 2005-
Эвенкийский (Новое левое знамя Барага )0.00047Kong 2003-
Кыргызский (Сары-Таш )0.00047Яо 2004-
Монгольский (Улан-Батор )0.00047Деренко 2007-
Уйгурский (Синьцзян )0.00047Яо 2004-
Индуистский (Нью-Дели )0.00048Форнарино 2009-
Корейский (Арун Баннер )0.00048Kong 2003-
Кыргызский (Талас )0.00048Яо 2004-
Монгол (Новое левое знамя Барага )0.00048Kong 2003-
Ойрат Монгол (Синьцзян )0.00049Яо 2004-
Айни (Xishuangbanna, Юньнань )0.00050Вэнь 2004-
Эскимосский (Чаплин )0.00050Володько 2008-
Индонезийский (Waingapu, Сумба )0.00050Хилл 2007-
Джахай (Малайзия )0.00051Хилл 2006-
Корейский (северный Китай)0.00051Джин 2009-
Сенои (Малайзия )0.00052Хилл 2006-
Казахский (Синьцзян )0.00053Яо 2004-
Телеут (Кемерово )0.00053Деренко 2007-
Чувашский (Моргаушский, Чувашия )0.00055Бермишева 2002-
Уйгурский (Казахстан )0.00055Яо 2004-
тибетский (Цинхай )0.00056Вэнь 2004-
Хакасский (Хакасия )0.00057Деренко 2007-
Семелаи (Малайзия )0.00061Хилл 2006-
Коми -Зырян (Сысольский, Республика Коми )0.00062Бермишева 2002-
Манси0.00063Пименов 2008-
Tujia (западный Хунань )0.00064Вэнь 2004-
Чукча0.00066Стариковская 2005-
Бай (Дали, Юньнань)0.00068Вэнь 2004-
Саами (Финляндия)0.00069Тамбец 2004 г.-
Татарский (Азнакаево, Татарстан )0.00071Малярчук 2010-
Telenghit (Республика Алтай )0.00071Деренко 2007-
Тубалар (Турочакский & Чойский, Республика Алтай )0.00072Стариковская 2005-
Коми -Пермяк (Коми-Пермяцкий автономный округ )0.00074Бермишева 2002-
Сибирский эскимос0.00079Стариковская 2005-
Персидский (восточный Иран )0.00082Деренко 2007-
Шор (Кемерово )0.00082Деренко 2007-
Юкагирский (Нижняя Колыма-Индигирка)0.00082Володько 2008-
Алтай Кижи0.00090Деренко 2007-
Тувинский0.00095Стариковская 2005-
Эскимосский (Канада)0.00096Володько 2008-
Манси0.00098Стариковская 2005-
Саами (Швеция)0.00098Тамбец 2004 г.-
Удмуртский (Малопургинский, Удмуртия & Татышлинский, Башкортостан )0.000101Бермишева 2002-
Гелао (Уезд Даочжэнь, Гуйчжоу )0.000102Лю 2011-
Мордовский (Старошайговский, Мордовия )0.000102Бермишева 2002-
Тувинский0.000105Деренко 2007-
Ханты0.000106Пименов 2008-
Якутский0.000117Kong 2003-
Эвенкийский (Усть-Майский, Оленекский, & Жиганский, Якутия )0.000125Федорова 2013-
Тару (Читван, Непал )0.000133Форнарино 2009-
Мари (Звениговский, Марий Эл )0.000136Бермишева 2002-
Хан (Юго-Западный Китай; бассейн из 44 Сычуань, 34 Чунцин, 33 Юньнань и 26 Гуйчжоу)0.000137Ji 2012-
Якутский (северный Якутия )0.000148Федорова 2013-
Долган (Анабарский, Волочанка, Усть-Авам, и Дудинка )0.000154Федорова 2013-
Китайский (Шэньян, Ляонин )0.000160Умэцу 2005-
Алеут (Алеутские острова )0.000163Володько 2008-
Чам (Bình Thuận, Вьетнам )0.000168Пэн 2010-
Татарский (Альметьевский и Елабужский, Татарстан )0.000228Бермишева 2002-
Саами (Норвегия)0.000278Тамбец 2004 г.-
Японский (Tkai )0.000282Умэцу 2005-
тибетский (Тибет )0.000289Ji 2012-
Ли (Хайнань )0.000346Пэн 2011-
Эскимосский (Гренландия )0.000385Володько 2008-

Субклады

Гаплогруппа Y была разделена на два основных субклада, Y1 и Y2. В исследовании, опубликованном в 2016 году, гаплогруппа Y1a мтДНК наблюдалась у ульчей, отобранных в Нижнем Гавани, Нижний Амур, в то время как гаплогруппа Y2a1 мтДНК наблюдалась у Игорот из горной провинции, острова Лусон, Филиппины (отобраны в Сингапуре) и в Гавайский.[10]

Y1 преобладает в северо-восточноазиатском диапазоне гаплогруппы Y, который сосредоточен на Охотское море. Y1 * наблюдался в двух Уйгуры, а Миннан Ханьские китайцы на Тайване и Хамниган. Y1a * наблюдался в Нивхский, в Бурятский в Забайкальский, в Монголии, в даурском и ханьском китайцах в Китае и в Тибете. Y1a с дополнительной мутацией T16189C распространен среди нивхов и у нескольких тунгусских народов (Хежен в КНР, Ульчи, Удэгей, даже в бассейнах р. Колыма и Индигирка реки). Y1a1 наблюдался как минимум в пяти Уйгуры, а Кыргызский, а Бурятский в Республике Бурятия Hezhen в Китае удэгей, трое эвенков в Таймыр, и двое якутов в центральной части Республики Саха. Y1a2 отмечен у коряков и у эвенов на Камчатке. Y1a, по-видимому, является относительно молодой гаплогруппой, возраст которой составляет 6000 (95% ДИ 3,300 <-> 8,800) лет, по оценкам 13 полных геномов (ульчи x 6, нивхский x 3, корякский x 2, эвенский x 1, монгольский x 1. ); однако эта оценка может быть актуальной только для TMRCA Y1a2 и большинства гаплотипов Y1a * и Y1a-T16189C, поскольку нет уверенности в том, что какая-либо из проанализированных мтДНК Y1a принадлежит кладе Y1a1.[2] (Тем не менее, YFull оценил TMRCA всей клады Y1a, включая всех табличных членов Y1a1 и Y1a *, а также Y1a + T16189C и Y1a2, в 7 200 [95% ДИ 4 000 <-> 11 900] лн,[11] поэтому добавление членов субклада Y1a1, по-видимому, не оказывает существенного влияния на оценку времени до последнего общего предка клады Y1a.) Y1b наблюдался у татарина из Буинска, Y1b1 наблюдался в Китае, а Y1b1a - у татарина из Буинска. наблюдается в Китае и Японии. Возраст всей клады Y1 был оценен на основе 17 полных геномов (включая 13 вышеупомянутых членов клады Y1a плюс одного японца, одного китайца и одного татарского члена клады Y1b плюс одного хамниганского члена Y1 *) в 12 400 (95% ДИ 5,900 <-> 19,100) лн.[2]

Y2a преобладает в юго-восточноазиатском диапазоне гаплогруппы Y, который сосредоточен на Филиппины и Суматра. Однако Y2b наблюдался в Япония и в Бурятский, Y2 * наблюдался в пробах Китая, Японии и Хамнигана.

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы Y основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека[1] и последующие опубликованные исследования.[нужна цитата ]

  • Y
    • Y1
      • Y1a
      • Y1b
    • Y2
      • Y2a
      • Y2b

Смотрите также

Филогенетическое дерево гаплогруппы митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

 Митохондриальная Ева (L )  
L0L1–6 
L1L2 L3  L4L5L6
MN 
CZDEграммQ ОАSр яWИксY
CZBFR0 pre-JT п U
HVJTK
ЧАСVJТ

Рекомендации

  1. ^ а б ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Человеческая мутация. 30 (2): E386 – E394. Дои:10.1002 / humu.20921. PMID  18853457. S2CID  27566749. Архивировано из оригинал 4 декабря 2012 г.. Получено 2009-05-20.
  2. ^ а б c Рем И. Сукерник, Наталья В. Володько, Илья О. Мазунин, Николай П. Ельцов, Станислав В. Дремов, Елена Б. Стариковская, «Разнообразие митохондриального генома у тубаларов, эвенов и ульчей: вклад в предысторию коренных сибиряков» и их родство с коренными американцами ". Американский журнал физической антропологии 148: 123–138 (2012). DOI 10.1002 / ajpa.22050
  3. ^ М.А. Бермишева, И.А.Кутуев, В.А.Спицын и др., "Анализ изменчивости митохондриальной ДНК в популяции ороков", Российский журнал генетики, Vol. 41, № 1, 2005, с. 66–71. В переводе с Генетики, Т. 41, № 1, 2005, с. 78–84.
  4. ^ а б Танака М., Кабрера В.М., Гонсалес А.М. и др. (2004). «Вариации митохондриального генома в Восточной Азии и заселение Японии». Геномные исследования. 14 (10A): 1832–1850. Дои:10.1101 / гр.2286304. ЧВК  524407. PMID  15466285.
  5. ^ Таджима А., Хаями М., Токунага К. и др. (2004). «Генетическое происхождение айнов установлено на основе комбинированного анализа ДНК материнской и отцовской линий». Журнал генетики человека. 49 (4): 187–193. Дои:10.1007 / s10038-004-0131-x. PMID  14997363.
  6. ^ Нобору Адачи, Кен-ичи Шинода, Кадзуо Умецу и Хирофуми Мацумура, «Анализ митохондриальной ДНК скелетов Дзёмон с участка Фунадомари, Хоккайдо, и его значение для происхождения коренных американцев», Американский журнал физической антропологии 138: 255–265 (2009)
  7. ^ Разнообразие линий митохондриальной ДНК в Южной Сибири Автор: Derenko1 и др., Анналы генетики человека Том 67 Выпуск 5 Страница 391 - Сентябрь 2003 г.
  8. ^ Юн-Ган Яо, Цин-Пэн Конг, Чэн-Йе Ван и другие., «Различные материнские вклады в генетическую структуру этнических групп в регионе Шелкового пути в Китае», Мол. Биол. Evol. 21(12):2265–2280. 2004
  9. ^ Маннис ван Овен, Йоханнес М. Хэммерле, Марья ван Шур и другие., «Неожиданные островные эффекты в экстремальных условиях: снижение разнообразия Y-хромосомы и митохондриальной ДНК в Nias», Молекулярная биология и эволюция (2010) Дои:10.1093 / молбев / msq300
  10. ^ Свапан Маллик, Хенг Ли, Марк Липсон, и другие., «Проект разнообразия генома Саймонса: 300 геномов из 142 различных популяций». Природа 538, 201–206 (13 октября 2016 г.) doi: 10.1038 / nature18964
  11. ^ Ошибка цитирования: указанная ссылка YПолный был вызван, но не определен (см. страница помощи).

внешняя ссылка