Фузобактерии - Fusobacteria

Фузобактерии
Fusobacterium novum в жидкой культуре
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Фузобактерии Гаррити и Холт 2012
Учебный класс:	Фузобактерии Стейли и Уитмен, 2012 г.
Заказ:	Фузобактерии Стейли и Уитмен, 2012 г.
Семьи и роды[1]
Fusobacteriaceae Цетобактерии Фузобактерии Гипноциклический Илиобактер Пропионигений Psychrilyobacter Leptotrichiaceae Caviibacter Лептотрихия Oceanivirga Себальделла Sneathia Стрептобациллы

Фузобактерии находятся обязательно анаэробный неспорообразующий Грамотрицательный бациллы. Со времени первых сообщений в конце девятнадцатого века этим организмам были присвоены разные названия, иногда одно и то же название применялось к разным видам. Совсем недавно были внесены изменения не только в номенклатура, но также пытается провести различие между видами, которые считаются либо патогенными, либо комменсальными, либо тем и другим. Из-за их асахаролитический природа и общая нехватка положительных результатов рутинных биохимических тестов, лабораторная идентификация фузобактерий была затруднена. Однако применение новых молекулярно-биологических методов к таксономии позволило установить ряд новых видов вместе с подвидом Фузобактерии некрофор и F. nucleatum, и предоставил новые методы идентификации. Участие фузобактерий в широком спектре инфекций человека, вызывающих некроз тканей и сепсис, было признано давно, а совсем недавно сообщалось об их значении во внутриамниотических инфекциях, преждевременных родах и тропических язвах.

Начиная с первых сообщений о фузобактериях в конце девятнадцатого века, разнообразие названий видов привело к некоторой путанице внутри родов. Фузобактерии и Лептотрихия. Однако новые методы исследования привели к лучшему пониманию таксономии с описанием нескольких новых видов фузобактерий. Среди новых описанных видов: F. ulcerans от тропических язв и нескольких видов из полости рта. Подвиды важных видов F. necrophorum и F. nucleatum тоже было возможно. Вероятно, в будущем систематика фузобактерий получит дальнейшее развитие.^[2]

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)^[3][4]а филогения основана на высвобождении 123 LTP на основе 16S рРНК Проект "Живое дерево всех видов".^[5]

Leptotrichiaceae Стрептобациллы   С. hongkongensis Woo et al. 2014 г.       С. moniliformis Левадити и др. 1925 г.     Sneathia sanguinegens Collins et al. 2002 г. (тип sp.)           Sebaldella termitidis (Sebald 1962) Коллинз и Шах 1986   Лептотрихия   L. goodfellowii Eribe et al. 2004 г.       L. hofstadii Eribe et al. 2004 г.       L. buccalis (Робин 1853) Тревизан 1879 (тип sp.)       Л. вадей Eribe et al. 2004 г.       Л. шахии Eribe et al. 2004 г.       L. hongkongensis Woo et al. 2011 г.     L. trevisanii Tee et al. 2002 г.                   Fusobacteriaceae   Psychrilyobacter atlanticus Zhao et al. 2009 г.         Ilyobacter tartaricus Шинк 1985         Ilyobacter polytropus Стиб и Шинк 1985 (тип sp.)     Propionigenium maris Янссен и Лизак 1996 исправляют. Watson et al. 2000 г.         Ilyobacter Insetus Brune et al. 2002 г.     Propionigenium modestum Шинк и Пфенниг 1983 (тип sp.)           Цетобактерии   C. ceti Foster et al. 1996 г. (тип sp.)     C. somerae Finegold et al. 2003 г.     Фузобактерии   F. perfoetens (Tissier 1905) Мур и Холдеман 1973         F. некрогены (Вайнберг и др., 1937) Мур и Холдеман, 1970 г.       F. mortiferum (Харрис 1901) Мур и Холдеман 1970     Clostridium rectum (Heller 1922) Холдеман и Мур 1972             F. ulcerans Адриан и Шах 1988     F. varium (Эггерт и Ганьон 1933) Мур и Холдеман 1969           F. gonidiaformans (Танниклифф и Джексон, 1925 г.) Мур и Холдеман, 1970 г.       F. equinum Dorsch et al. 2001 г.   F. necrophorum   F. n. глазное дно (ex Hallé 1898) Shinjo et al. 1991 г.     F. n. некрофор (Flügge 1886) Shinjo et al. 1991 г.             F. russii (Хаудрой и др., 1937) Мур и Холдман, 1970 г.       F. nucleatum polymorphum (ex Knorr 1922) Dzink et al. 1990 г.       F. periodonticum Слоты и др. 1984         F. canifelinum Конрадс и др. 2004 г.       F. nucleatum fusiforme (ex Veillon and Zuber 1898) Гарбия и Шах 1992     F. nucleatum vincentii Дзинк и др. 1990 г.           F. nucleatum nucleatum (Knorr 1922) Дзинк и др. 1990 г. (тип sp.)       F. simiae Слоты и Поттс 1982       F. nucleatum animalis Гарбия и Шах 1992     Filifactor alocis (Като и др., 1985) Ялава и Эерола, 1999 г.

Примечание 1: виды, не используемые в Проект "Живое дерево всех видов"

• Leptotrichiaceae
  • Абсцесс кавиибактера Айзенберг и др. 2016 г.
  • Oceanivirga salmonicida Айзенберг и др. 2016 г.
  • Streptobacillus felis Айзенберг и др. 2015 г.
  • Streptobacillus notomytis Айзенберг и др. 2015 г.
  • Streptobacillus ratti Айзенберг и др. 2015 г.
  • Sneathia amnionii ♠ Harwich et al. 2012 г.
• Fusobacteriaceae
  • Ilyobacter delafieldii Янссен и Харфут 1991
  • Иллиобактер психрофильный ♠ Кура и Антраникян 2005a
  • Fusobacterium naviforme (Джунгано 1909) Мур и Холдеман 1970
  • Fusobacterium plautii корриг. Сеген 1928
  • Fusobacterium polysaccharolyticum ван Гилсвик 1981
  • Fusobacterium prausnitzii (Хаудрой и др., 1937) Мур и Холдман, 1970 г.
  • Fusobacterium sulci Cato et al. 1985 г.

Заметка 2:
♠ Штамм обнаружен на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN

Появляются новые доказательства того, что эти бактерии могут вызывать рак толстой кишки у человека или быть связаны с ним. В 2011 году исследователи сообщили о наличии фузобактерий в ткани рака толстой кишки (Genome Res 2012; 22: 292), а новое многоцентровое исследование предоставило доказательства того, что некоторые случаи, особенно правосторонние, могут быть вызваны инфекцией фузобактериями (1).

1. Bullman S et al. Science 2017 15 декабря; 358: 1443.

Смотрите также

• Веретенообразный

Рекомендации

1. «Фузобактерии». Таксономия NCBI. Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации.. Получено 3 января 2019.
2. Bennett, K. W .; Элей, А. (1 октября 1993 г.). «Фузобактерии: новая систематика и родственные болезни». Журнал медицинской микробиологии. 39 (4): 246–254. Дои:10.1099/00222615-39-4-246. PMID  8411084.^{[постоянная мертвая ссылка ]}
3. J.P. Euzéby. «Фузобактерии». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2016-03-20.
4. Сэйерс; и другие. «Фузобактерии». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2016-03-20.
5. Увидеть Проект "Живое дерево всех видов" [1]. Данные извлечены из «Релиз 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2016-03-20.