ERCC2 - ERCC2

ERCC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IY9, 5IVW, 5IY7, 5IY8, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	ERCC2, эксцизионная репарация, кросс-комплементационная группа 2, COFS2, EM9, TFIIH, TTD, XPD, TTD1, эксцизионная репарация ERCC 2, субъединица геликазы корового комплекса TFIIH
Внешние идентификаторы	OMIM: 126340 MGI: 95413 ГомолоГен: 344 Генные карты: ERCC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.32 Начинать 45,349,837 бп[1] Конец 45,370,918 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 A3 | 7 9,62 см Начинать 19,382,010 бп[2] Конец 19,395,694 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • 4 железа, 4 связки серы • активность протеинкиназы • ДНК-зависимая активность АТФазы • связывание нуклеотидов • GO: 0008026 геликазная активность • связывание с N-концом белка • железо-серное кластерное связывание • GO: 0004003 ДНК-геликазная активность • связывание ионов металлов • гидролазная активность, действующая на ангидриды кислот, в фосфорсодержащих ангидридах • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Активность киназы карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II • GO: 0043141 5'-3 'ДНК-геликазная активность • гидролазная активность • Связывание АТФ • повреждение связывания ДНК • связывание с белками, мостик Сотовый компонент • цитоплазма • холоферментный комплекс киназы, активирующий циклин-зависимую протеинкиназу • шпиндель • холо TFIIH комплекс • GO: 0000441 основной комплекс TFIIH • цитоскелет • ядро клетки • MMXD комплекс • нуклеоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIID • цитозоль • Комплекс CAK-ERCC2 Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла • минерализация костей • процесс цикла волос • ответ на гипоксию • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • эмбриональное дробление • созревание волосяного фолликула • рост многоклеточного организма • сегрегация хромосом • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • дифференциация волосковых клеток • старение • организация внеклеточного матрикса • внутриутробное эмбриональное развитие • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • постэмбриональное развитие • ответ на окислительный стресс • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • глобальная эксцизионная репарация нуклеотидов генома • дифференцировка гемопоэтических стволовых клеток • развитие спинного мозга • УФ защита • положительное регулирование связывания ДНК • образование миелина центральной нервной системы • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточная пролиферация • нуклеотидно-эксцизионная репарация, разрез ДНК • метаболический процесс соединения, содержащего азотистые основания • ответ на УФ • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие кожи • созревание эритроцитов • апоптотический процесс • эксцизионная репарация нуклеотидов • нуклеотидно-эксцизионная репарация, стабилизация предразрезного комплекса • Ремонт ДНК • GO: 0022415 вирусный процесс • фосфорилирование белков • нуклеотидно-эксцизионная репарация, сборка комплекса до разреза • эксцизионная репарация нуклеотидов, разрез ДНК, 5'-очаг поражения • развитие эмбриональных органов • Раскрутка дуплекса ДНК • регуляция митотической рекомбинации • эксцизионная репарация нуклеотидов, раскручивание дуплекса ДНК • положительная регуляция митотической рекомбинации • нуклеотидно-эксцизионная репарация, разрез ДНК, поражение 3'-к • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2068	13871
Ансамбль	ENSG00000104884	ENSMUSG00000030400
UniProt	P18074	O08811
RefSeq (мРНК)	NM_000400 NM_001130867	NM_007949 NM_001363981
RefSeq (белок)	NP_000391 NP_001124339	NP_031975 NP_001350910
Расположение (UCSC)	Chr 19: 45.35 - 45.37 Мб	Chr 7: 19.38 - 19.4 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ERCC2, или же XPD белок, участвующий в эксцизионная репарация нуклеотидов, связанная с транскрипцией.

Ген XPD (ERCC2) кодирует мРНК размером 2,3 т.п.н., содержащую 22 экзоны и 21 интроны. Белок XPD содержит 760 аминокислоты и представляет собой полипептид размером 87 кДа. Дефекты этого гена могут привести к трем различным заболеваниям: синдрому предрасположенности к раку. пигментная ксеродермия группа дополнения D, светочувствительный трихотиодистрофия, и Синдром Кокейна.^[5]

Как XPB, XPD является частью транскрипционной фактор инициирования TFIIH и имеет АТФ-зависимую геликаза Мероприятия.^[6] Он принадлежит к подсемейству геликаз RAD3 / XPD.

XPD необходим для жизнеспособности клеток. Делеция XPD у мышей смертельна для развивающихся эмбрионов.^[7]

Последствия мутации в ERCC2

Белок ERCC2 / XPD участвует в эксцизионная репарация нуклеотидов, и используется для разматывания ДНК двойная спираль после повреждения изначально распознается. Удаление нуклеотидов - это многоступенчатый путь, который устраняет широкий спектр различных повреждений, которые нарушают нормальное спаривание оснований. Такие повреждения включают объемные химические аддукты, индуцированные ультрафиолетом димеры пиримидина и несколько форм окислительное повреждение. Мутации в гене ERCC2 / XPD могут приводить к различным синдромам, либо пигментная ксеродермия (XP), трихотиодистрофия (TTD) или комбинация XP и TTD (XPTTD), или комбинация XP и Синдром Кокейна (XPCS).^[8] И TTD, и CS демонстрируют признаки преждевременного старения. Эти функции могут включать нейросенсорная глухота, дегенерация сетчатки, гипометилирование белого вещества, кальцификация центральной нервной системы, снижение роста и кахексия (потеря подкожно-жировой клетчатки).^[8][9] Фибробласты XPCS и TTD от человека и мыши с мутантным ERCC2 / XPD демонстрируют признаки дефектной репарации окислительных повреждений ДНК, которые могут лежать в основе сегментарных прогероидных симптомов (преждевременного старения).^[10] (видеть Теория повреждений ДНК старения ).

ERCC2 и эксцизионное восстановление нуклеотидов

Белок, названный XPD, экспрессируется под руководством гена ERCC2. Белок XPD является неотъемлемой частью общего комплекса фактора транскрипции IIH (TFIIH), который представляет собой группу белков. Транскрипция генов и восстановление поврежденной ДНК - две жизненно важные функции комплекса TFIIH. С помощью транскрипции генов комплекс TFIIH способен контролировать функционирование многих различных генов в организме, а белок XPD действует как стабилизатор. XPB - это еще один белок в комплексе общего фактора транскрипции IIH (TFIIH), который производится из гена ERCC3, который работает в координации с белком XDP, чтобы запустить процесс транскрипции гена.

Ультрафиолетовые лучи, исходящие от солнца, различные опасные химические вещества, вредное излучение - все это известные параметры саботажа ДНК. Нормальная и здоровая клетка способна исправить повреждения ДНК до того, как начнутся проблемы из-за поврежденной ДНК. Клетки используют эксцизионную репарацию нуклеотидов для исправления поврежденной ДНК. В рамках этого процесса двухцепочечная ДНК, которая окружает повреждение, разделяется комплексом TFIIH. Белок XPD действует как геликаза и помогает в процессе эксцизионного восстановления нуклеотидов, связываясь с конкретными участками ДНК и раскручивая две спиральные нити ДНК. Это обнажает поврежденный белок, что позволяет другим белкам удалить поврежденный участок и заменить поврежденный участок правильной ДНК.^[11]

ERCC2 и пигментная ксеродермия

Xeroderma pigmentosum (XP) связана с отсутствием механизма репарации ДНК и высокой восприимчивостью к раку. Небольшая недостаточность механизма репарации ДНК может привести к развитию рака. Некоторые виды рака были распознаны с помощью связи между однонуклеотидным полиморфизмом и генами. Белок XPD, продуцируемый геном ERCC2, играет важную роль в процессе транскрипции и гибели клеток, а также известен как способ репарации путем эксцизии нуклеотидов. В различных литературных исследованиях рассмотрена корреляция между полиморфизмами в ERCC2 и сниженной эффективностью репарации ДНК и их влияние на развитие рака, а также взаимодействие с воздействием окружающей среды.

Вторая по частоте причина пигментной ксеродермы в США связана с мутациями в гене ERCC2, более двадцати пяти из которых наблюдались у людей с этим заболеванием. Пигментная ксеродерма возникает, когда ген ERCC2 препятствует конструктивному восстановлению поврежденной ДНК комплексом TFIIH.

Следовательно, вся деформация собирается внутри ДНК, саботируя механизм восстановления и приводя к раковым или мертвым клеткам. Таким образом, люди, страдающие пигментной ксеродермой, очень чувствительны к ультрафиолетовым лучам солнечного света из-за проблем с восстановлением ДНК.

Итак, когда ультрафиолетовые лучи повреждают гены, клетка бесконтрольно растет и делится и очень склонна к раку. Пигментная ксеродермия имеет высокий риск развития рака кожи и глаз, поскольку они чаще всего подвергаются воздействию солнца. Пигментная ксеродермия, вызванная мутациями ERCC2, связана с многочисленными неврологическими нарушениями развития, которые включают: потеря слуха, плохая координация, проблемы с подвижностью, отсутствие интеллектуальных способностей, трудности при разговоре, ходьбе, глотании пищи и судороги.

Исследователи подозревают, что эти неврологические аномалии связаны с накоплением повреждений ДНК, несмотря на то, что мозг не подвергается воздействию ультрафиолетовых лучей. Другие факторы также могут вызвать повреждение ДНК в нервных клетках.^[12]

Взаимодействия

ERCC2 был показан взаимодействовать с:

• ERCC5,^[13]
• GTF2H1,^[14][15]
• GTF2H2,^[16][17] и
• XPB.^{[14][13][18][19]}

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Активность фторурацила (5-ФУ) редактировать ]]

Активность фторурацила (5-FU) редактировать

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ФторпиримидинActivity_WP1601».

Смотрите также

• Эксцизионная пластика с перекрестным комплементом

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104884 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030400 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: эксцизионная репарация ERCC2, дополняющая дефицит репарации грызунов, группа комплементации 2 (xeroderma pigmentosum D)».
6. Ли Т.И., Янг Р.А. (2000). «Транскрипция генов, кодирующих эукариотические белки». Ежегодный обзор генетики. 34: 77–137. Дои:10.1146 / annurev.genet.34.1.77. PMID  11092823.
7. Лю, Цзин. «XPD локализуется в митохондриях и защищает митохондриальный геном от окислительного повреждения ДНК». Исследования нуклеиновых кислот. 43 (11).
8. Андрессу Дж.О., Hoeijmakers JH, Митчелл JR (2006). «Расстройства эксцизионного восстановления нуклеотидов и баланс между раком и старением». Клеточный цикл. 5 (24): 2886–8. Дои:10.4161 / cc.5.24.3565. PMID  17172862.
9. Фусс Дж. О., Тайнер Дж. А. (2011). «Хеликазы XPB и XPD в TFIIH организуют открытие дуплекса ДНК и верификацию повреждений для координации репарации с транскрипцией и клеточным циклом через киназу САК». Ремонт ДНК (Amst.). 10 (7): 697–713. Дои:10.1016 / j.dnarep.2011.04.028. ЧВК  3234290. PMID  21571596.
10. Андрессоо Дж.О., Митчелл Дж. Р., де Вит Дж., Хугстратен Д., Фолькер М., Туссент В., Спекснидер Э., Бимс РБ, ван Стиг Х., Янс Дж., Де Зееу К. И., Ясперс Н. Г., Рамс А., Леманн А. Р., Вермёлен В., Хоймейкерс Дж. Х. , ван дер Хорст GT (2006). «Модель мыши Xpd для комбинированной пигментной ксеродермы / синдрома Кокейна, демонстрирующая предрасположенность к раку и сегментарную прогерию». Раковая клетка. 10 (2): 121–32. Дои:10.1016 / j.ccr.2006.05.027. PMID  16904611.
11. Справка, Дом генетики. «Ген ERCC2». Справочник по генетике. Получено 2020-04-16.
12. Бенхаму, Симона; Сарасин, Алена (01.11.2002). «Полиморфизм генов ERCC2 / XPD и риск рака». Мутагенез. 17 (6): 463–469. Дои:10.1093 / mutage / 17.6.463. ISSN  0267-8357. PMID  12435843.
13. Айер Н., Рейган М.С., Ву К.Дж., Канагараджа Б., Фридберг ЕС (февраль 1996 г.). «Взаимодействия с участием комплекса транскрипции / эксцизионной репарации РНК-полимеразы II человека TFIIH, белка эксцизионной репарации нуклеотидов XPG и белка группы B синдрома Кокейна (CSB)». Биохимия. 35 (7): 2157–67. Дои:10.1021 / bi9524124. PMID  8652557.
14. Драпкин Р., Рирдон Дж. Т., Ансари А., Хуанг Дж. К., Завел Л., Ан К., Санкар А., Рейнберг Д. (апрель 1994 г.). «Двойная роль TFIIH в эксцизионной репарации ДНК и в транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Природа. 368 (6473): 769–72. Дои:10.1038 / 368769a0. PMID  8152490. S2CID  4363484.
15. Rossignol M, Kolb-Cheynel I, Egly JM (апрель 1997 г.). «Субстратная специфичность cdk-активирующей киназы (САК) изменяется при ассоциации с TFIIH». Журнал EMBO. 16 (7): 1628–37. Дои:10.1093 / emboj / 16.7.1628. ЧВК  1169767. PMID  9130708.
16. Монета F, Маринони Дж. С., Родольфо С., Фрибург С., Педрини А. М., Эгли Дж. М. (октябрь 1998 г.). «Мутации в гене геликазы XPD приводят к фенотипам XP и TTD, предотвращая взаимодействие между XPD и субъединицей p44 TFIIH». Природа Генетика. 20 (2): 184–8. Дои:10.1038/2491. PMID  9771713. S2CID  28250605.
17. Vermeulen W, Bergmann E, Auriol J, Rademakers S, Frit P, Appeldoorn E, Hoeijmakers JH, Egly JM (ноябрь 2000 г.). «Сублимитирующая концентрация фактора транскрипции / репарации ДНК TFIIH вызывает расстройство трихотиодистрофии TTD-A». Природа Генетика. 26 (3): 307–13. Дои:10.1038/81603. PMID  11062469. S2CID  25233797.
18. Giglia-Mari G, Coin F, Ranish JA, Hoogstraten D, Theil A, Wijgers N, Jaspers NG, Raams A, Argentini M, van der Spek PJ, Botta E, Stefanini M, Egly JM, Aebersold R, Hoeijmakers JH, Vermeulen W (июль 2004 г.). «Новая десятая субъединица TFIIH отвечает за синдром репарации ДНК трихотиодистрофии группы А». Природа Генетика. 36 (7): 714–9. Дои:10,1038 / ng1387. PMID  15220921.
19. Маринони Дж. К., Рой Р., Вермёлен В., Миниу П., Лутц И., Вида Дж., Сероз Т., Гомес Д. М., Хоймейкерс Дж. Х., Эгли Дж. М. (март 1997 г.). «Клонирование и характеристика p52, пятой субъединицы ядра фактора транскрипции / репарации ДНК TFIIH». Журнал EMBO. 16 (5): 1093–102. Дои:10.1093 / emboj / 16.5.1093. ЧВК  1169708. PMID  9118947.

дальнейшее чтение

• Broughton BC, Thompson AF, Harcourt SA, Vermeulen W., Hoeijmakers JH, Botta E, Stefanini M, King MD, Weber CA, Cole J (январь 1995 г.). «Молекулярный и клеточный анализ дефекта репарации ДНК у пациента из группы комплементации пигментной ксеродермы D, у которого имеются клинические признаки пигментной ксеродермы и синдрома Кокейна». Американский журнал генетики человека. 56 (1): 167–74. ЧВК  1801309. PMID  7825573.
• Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». Журнал биомедицинских наук. 5 (1): 24–7. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID  9570510.
• Янкулов К., Бентли Д. (июнь 1998 г.). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Текущая биология. 8 (13): R447-9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID  9651670. S2CID  15480646.
• Кливер Дж. Э., Томпсон Л. Х., Ричардсон А. С., Штаты JC (1999). «Краткое изложение мутаций в заболеваниях, чувствительных к ультрафиолету: пигментная ксеродермия, синдром Кокейна и трихотиодистрофия». Человеческая мутация. 14 (1): 9–22. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (1999) 14: 1 <9 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-6. PMID  10447254.
• Lehmann AR (январь 2001 г.). «Ген xeroderma pigmentosum группы D (XPD): один ген, две функции, три заболевания». Гены и развитие. 15 (1): 15–23. Дои:10.1101 / gad.859501. PMID  11156600.
• Бенхаму С., Сарасин А. (ноябрь 2002 г.). «Полиморфизм генов ERCC2 / XPD и риск рака». Мутагенез. 17 (6): 463–9. Дои:10.1093 / mutage / 17.6.463. PMID  12435843.
• Кларксон С.Г., Вуд Р.Д. (сентябрь 2005 г.). «Полиморфизмы в гене XPD человека (ERCC2), способность к репарации ДНК и предрасположенность к раку: оценка». Ремонт ДНК. 4 (10): 1068–74. Дои:10.1016 / j.dnarep.2005.07.001. PMID  16054878.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о Xeroderma Pigmentosum
• ERCC2 + белок в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)