PALB2 - PALB2

PALB2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2W18, 3EU7
Идентификаторы
Псевдонимы	PALB2, FANCN, PNCA3, партнер и локализатор BRCA2
Внешние идентификаторы	OMIM: 610355 MGI: 3040695 ГомолоГен: 11652 Генные карты: PALB2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16п12.2 Начинать 23,603,160 бп[1] Конец 23,641,310 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F2 Начинать 122,107,262 бп[2] Конец 122,132,985 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • морфогенез органов животных • сомитогенез • постанальный морфогенез хвоста • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Рекомбинация ДНК • развитие мезодермы • отрицательная регуляция апоптотического процесса • внутриутробное эмбриональное развитие • рост многоклеточного организма • развитие эмбриональных органов • пролиферация клеток внутренней клеточной массы • Ремонт ДНК • репарация двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79728	233826
Ансамбль	ENSG00000083093	ENSMUSG00000044702
UniProt	Q86YC2	Q3U0P1
RefSeq (мРНК)	NM_024675	NM_001081238 NM_001289842 NM_001289843 NM_001289844 NM_001289845 NM_172744
RefSeq (белок)	NP_078951	NP_001074707 NP_001276771 NP_001276772 NP_001276773 NP_001276774
Расположение (UCSC)	Chr 16: 23.6 - 23.64 Мб	Chr 7: 122.11 - 122.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Партнер и локализатор BRCA2, также известный как PALB2 или же FANCN, это белок который у человека кодируется PALB2 ген.^[5][6][7]

Функция

Охарактеризованные домены PALB2

Рекомбинационная репарация двухцепочечных повреждений ДНК - некоторые ключевые шаги. Банкомат (Банкомат) протеинкиназа который набирается и активируется Двухцепочечные разрывы ДНК. Двухцепочечные повреждения ДНК также активируют Основной комплекс анемии Фанкони (FANCA / B / C / E / F / G / L / M).^[8] Основной комплекс ТВС моноубиквитинаты последующие нацелены на FANCD2 и FANCI.^[9] АТМ активирует (фосфорилирует) ЧЕК2 и FANCD2^[10] CHEK2 фосфорилирует BRCA1.^[11] Убихинированные комплексы FANCD2 с BRCA1 и RAD51.^[12] Белок PALB2 действует как концентратор,^[13] объединяя BRCA1, BRCA2 и RAD51 в месте двухцепочечного разрыва ДНК, а также связывается с RAD51C, членом комплекса паралогов RAD51 RAD51B -RAD51C -RAD51D -XRCC2 (BCDX2). Комплекс BCDX2 отвечает за рекрутирование или стабилизацию RAD51 в местах повреждения.^[14] RAD51 играет важную роль в гомологичный рекомбинационный репарация ДНК во время репарации двухцепочечного разрыва. В этом процессе имеет место АТФ-зависимый обмен цепями ДНК, при котором одна цепь вторгается в спаренные по основанию цепи гомологичных молекул ДНК. RAD51 участвует в поиске гомологии и стадиях спаривания цепей этого процесса.

Этот ген кодирует белок, который участвует в поддержании генома (ремонт двухниточного разрыва ). Этот белок связывается и колокализуется с белком раннего начала рака груди 2 (BRCA2 ) в ядерных фокусах и, вероятно, обеспечивает стабильную внутриядерную локализацию и накопление BRCA2.^[5] PALB2 связывает одноцепочечную ДНК и напрямую взаимодействует с рекомбиназой RAD51, чтобы стимулировать инвазию цепи, что является жизненно важным этапом гомологичная рекомбинация,^[15] PALB2 может действовать синергетически с химерой BRCA2 (названной пикколо или piBRCA2), чтобы дополнительно способствовать инвазии цепи.^[15]

Клиническое значение

Варианты в PALB2 ген связаны с повышенным риском развития рака груди ^[16] величины, аналогичной той, что связана с мутациями BRCA2 ^[17] и PALB2-дефицитные клетки чувствительны к Ингибиторы PARP.^[15]

PALB2 недавно был идентифицирован как ген восприимчивости к семейным панкреатический рак ученых из Центра исследования рака поджелудочной железы имени Сола Голдмана в Университете Джонса Хопкинса. Это проложило путь к разработке нового генного теста для семей, в которых рак поджелудочной железы встречается у нескольких членов семьи.^[18] Тесты на PALB2 были разработаны Ambry Genetics. ^[19] и Myriad Genetics^[20] которые сейчас доступны. Группа интересов PALB2 (PALB2.org) - международный консорциум ученых и клиницистов, которые координируют исследования этого гена. Они очень хотят услышать отзывы женщин и мужчин с мутациями PALB2.

Профилактическое мастэктомия следует рассматривать для женщин, у которых был рак груди и мутация PALB2.^[21][22]

Двуаллельные мутации в PALB2 (также известен как FANCN), аналогично двуаллельному BRCA2 мутации, причина Анемия Фанкони.^[7]

Мутации в этом гене связаны с повышенным риском рака яичников, груди и поджелудочной железы.^[23]

Мейоз

Мутантные мыши PALB2 имеют пониженную фертильность.^[24] Это снижение фертильности, по-видимому, связано с истощением зародышевых клеток в результате комбинации неисправленных разрывов ДНК во время мейоз и дефектный синапсис хромосом X и Y. Функция гомологичная рекомбинация во время мейоза, по-видимому, происходит восстановление повреждений ДНК, особенно двухцепочечных разрывов (см. также Происхождение и функция мейоза ).^{[нужна цитата ]} Взаимодействие PALB2-BRCA1, вероятно, важно для восстановления таких повреждений во время мужского мейоза.

Смотрите также

• Анемия Фанкони
• BRCA2
• Ремонт ДНК
• Ген супрессора опухоли
• PALB2 Группа интересов

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000083093 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044702 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: партнер PALB2 и локализатор BRCA2".
6. Xia B, Sheng Q, Nakanishi K, Ohashi A, Wu J, Christ N, et al. (Июнь 2006 г.). «Контроль клеточных и клинических функций BRCA2 ядерным партнером, PALB2». Молекулярная клетка. 22 (6): 719–29. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.05.022. PMID  16793542.
7. Xia B, Dorsman JC, Ameziane N, de Vries Y, Rooimans MA, Sheng Q, et al. (Февраль 2007 г.). «Анемия Фанкони связана с дефектом партнера BRCA2 PALB2». Природа Генетика. 39 (2): 159–61. Дои:10,1038 / ng1942. PMID  17200672. S2CID  36491877.
8. Д'Андреа А.Д. (май 2010 г.). «Пути восприимчивости при анемии Фанкони и раке груди». Медицинский журнал Новой Англии. 362 (20): 1909–19. Дои:10.1056 / NEJMra0809889. ЧВК  3069698. PMID  20484397.
9. Собек А., Стоун С., Ландаис I, де Грааф Б., Хоатлин М.Э. (сентябрь 2009 г.). «Белок анемии Fanconi FANCM контролируется FANCD2 и путями ATR / ATM». Журнал биологической химии. 284 (38): 25560–8. Дои:10.1074 / jbc.M109.007690. ЧВК  2757957. PMID  19633289.
10. Кастильо П., Боглиоло М., Сурралес Дж. (Май 2011 г.). «Скоординированное действие путей анемии Фанкони и телеангиэктазии атаксии в ответ на окислительное повреждение». Ремонт ДНК. 10 (5): 518–25. Дои:10.1016 / j.dnarep.2011.02.007. PMID  21466974.
11. Штольц А., Эртыч Н., Бастианс Н. (февраль 2011 г.). «Опухолевый супрессор CHK2: регулятор реакции на повреждение ДНК и медиатор хромосомной стабильности». Клинические исследования рака. 17 (3): 401–5. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-1215. PMID  21088254.
12. Танигучи Т., Гарсия-Игера И., Андреассен П.Р., Грегори Р.С., Громпе М., Д'Андреа А.Д. (октябрь 2002 г.). «Специфичное для S-фазы взаимодействие белка анемии Фанкони, FANCD2, с BRCA1 и RAD51». Кровь. 100 (7): 2414–20. Дои:10.1182 / кровь-2002-01-0278. PMID  12239151. S2CID  11001855.
13. Park JY, Zhang F, Andreassen PR (август 2014 г.). «PALB2: центр сети опухолевых супрессоров, участвующих в ответах на повреждение ДНК». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Обзоры на рак. 1846 (1): 263–75. Дои:10.1016 / j.bbcan.2014.06.003. ЧВК  4183126. PMID  24998779.
14. Чун Дж., Бюхельмайер Э.С., Пауэлл С.Н. (январь 2013 г.). «Комплексы Rad51 паралогов BCDX2 и CX3 действуют на разных этапах пути BRCA1-BRCA2-зависимой гомологичной рекомбинации». Молекулярная и клеточная биология. 33 (2): 387–95. Дои:10.1128 / MCB.00465-12. ЧВК  3554112. PMID  23149936.
15. Buisson R, Dion-Côté AM, Coulombe Y, Launay H, Cai H, Stasiak AZ и др. (Октябрь 2010 г.). «Сотрудничество белков рака молочной железы PALB2 и piccolo BRCA2 в стимулировании гомологичной рекомбинации». Структурная и молекулярная биология природы. 17 (10): 1247–54. Дои:10.1038 / нсмб.1915. ЧВК  4094107. PMID  20871615.
16. Чен П., Лян Дж., Ван З., Чжоу Х, Чен Л., Ли М. и др. (Сентябрь 2008 г.). «Связь общих полиморфизмов PALB2 с риском рака груди: исследование случай-контроль». Клинические исследования рака. 14 (18): 5931–7. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-08-0429. PMID  18794107.
17. Антониу А.С., Касадей С., Хейккинен Т., Барроудейл Д., Пилкас К., Робертс Дж. И др. (Август 2014 г.). «Риск рака груди в семьях с мутациями в PALB2». Медицинский журнал Новой Англии. 371 (6): 497–506. Дои:10.1056 / NEJMoa1400382. ЧВК  4157599. PMID  25099575.
18. Джонс С., Хрубан Р.Х., Камияма М., Борхес М., Чжан Х, Парсонс Д.В. и др. (Апрель 2009 г.). «Экзомное секвенирование идентифицирует PALB2 как ген предрасположенности к раку поджелудочной железы». Наука. 324 (5924): 217. Bibcode:2009Sci ... 324..217J. Дои:10.1126 / science.1171202. ЧВК  2684332. PMID  19264984.
19. "Амбри Генетикс".
20. "Myriad Genetics".
21. Wright FC, Look Hong NJ, Quan ML, Beyfuss K, Temple S, Covelli A и др. (Февраль 2018). «Показания для контралатеральной профилактической мастэктомии: утверждение консенсуса с использованием модифицированной методологии Delphi». Анналы хирургии. 267 (2): 271–279. Дои:10.1097 / SLA.0000000000002309. PMID  28594745. S2CID  28223281.
22. Резюме песни, Teo SH, Taib NA, Yip CH (2018). «BRCA, TP53 и PALB2: обзор литературы». ракмедицина. 12: 863. Дои:10.3332 / ecancer.2018.863. ЧВК  6113980. PMID  30174725.
23. Ян X, Лесли Дж., Дорощук А., Шнайдер С., Аллен Дж., Декер Б. и др. (Декабрь 2019 г.). "Патогенные варианты PALB2: международное исследование 524 семей". Журнал клинической онкологии. 38 (7): 674–685. Дои:10.1200 / JCO.19.01907. ЧВК  7049229. PMID  31841383.
24. Симхадри С., Петерсон С., Патель Д.С., Хо Й., Цай Х., Боуман-Колин С. и др. (Август 2014 г.). «Дефект мужской фертильности, связанный с нарушением взаимодействия BRCA1-PALB2 у мышей». Журнал биологической химии. 289 (35): 24617–29. Дои:10.1074 / jbc.M114.566141. ЧВК  4148885. PMID  25016020.

дальнейшее чтение

• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж. И др. (Август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р. и др. (Январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Xia B, Sheng Q, Nakanishi K, Ohashi A, Wu J, Christ N, et al. (Июнь 2006 г.). «Контроль клеточных и клинических функций BRCA2 ядерным партнером, PALB2». Молекулярная клетка. 22 (6): 719–29. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.05.022. PMID  16793542.
• Рахман Н., Сил С., Томпсон Д., Келли П., Ренвик А., Эллиот А. и др. (Февраль 2007 г.). «PALB2, который кодирует белок, взаимодействующий с BRCA2, является геном предрасположенности к раку груди». Природа Генетика. 39 (2): 165–7. Дои:10,1038 / ng1959. ЧВК  2871593. PMID  17200668.
• Рид С., Шиндлер Д., Ханенберг Х., Баркер К., Хэнкс С., Калб Р. и др. (Февраль 2007 г.). «Двуаллельные мутации в PALB2 вызывают анемию Фанкони подтипа FA-N и предрасполагают к развитию рака у детей». Природа Генетика. 39 (2): 162–4. Дои:10,1038 / ng1947. PMID  17200671. S2CID  10326242.
• Xia B, Dorsman JC, Ameziane N, de Vries Y, Rooimans MA, Sheng Q, et al. (Февраль 2007 г.). «Анемия Фанкони связана с дефектом партнера BRCA2 PALB2». Природа Генетика. 39 (2): 159–61. Дои:10,1038 / ng1942. PMID  17200672. S2CID  36491877.
• Erkko H, Xia B, Nikkilä J, Schleutker J, Syrjäkoski K, Mannermaa A, et al. (Март 2007 г.). «Повторяющаяся мутация в PALB2 в финских онкологических семьях». Природа. 446 (7133): 316–9. Bibcode:2007Натура.446..316E. Дои:10.1038 / природа05609. PMID  17287723. S2CID  4340489.
• Tischkowitz M, Xia B, Sabbaghian N, Reis-Filho JS, Hamel N, Li G и др. (Апрель 2007 г.). «Анализ семей рака молочной железы, связанных с PALB2 / FANCN». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (16): 6788–93. Bibcode:2007ПНАС..104.6788Т. Дои:10.1073 / pnas.0701724104. ЧВК  1871863. PMID  17420451.
• Оливер А.В., Свифт С., Лорд СиДжей, Эшворт А., Перл Л.Х. (сентябрь 2009 г.). «Структурная основа набора BRCA2 на PALB2». EMBO отчеты. 10 (9): 990–6. Дои:10.1038 / embor.2009.126. ЧВК  2750052. PMID  19609323.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q86YC2 (Партнер и локализатор BRCA2) на PDBe-KB.