Дигидрооротатдегидрогеназа (хинон) - Dihydroorotate dehydrogenase (quinone)
| Дигидрооротат: хинон оксидоредуктаза | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Номер ЕС | 1.3.5.2 | ||||||||
| Количество CAS | 59088-23-2 | ||||||||
| Базы данных | |||||||||
| IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
| БРЕНДА | BRENDA запись | ||||||||
| ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
| КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
| MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
| ПРИАМ | профиль | ||||||||
| PDB структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| |||||||||
Дигидрооротатдегидрогеназы 2 класса (DHOQO, ЕС 1.3.5.2 ) является фермент с систематическое название (S) -дигидрооротат:хинон оксидоредуктаза.[1][2][3][4][5] Этот фермент катализирует перенос электронов из дигидрооротат (донор электронов) к хинон (акцептор электронов):
- (S) -дигидрооротат + хинон ругать + хинол
Эти ферменты отличаются от дигидрооротатдегидрогеназ 1 класса (ДГОДГ) акцептором электронов, структурой и клеточной локализацией. Поскольку реакция, катализируемая DHOQO, является частью электронная транспортная цепь и пиримидин de novo синтез, он был изучен как возможная мишень для лечения рака, иммунологических расстройств и бактериальных / вирусных инфекций. [6][7][8]
Структура
Структурно DHOQO организованы в мономеры, которые имеют (βα) 8 (восьмикратный бета-альфа-баррель) складку.[9] Фермент можно разделить на его N-концевой домен (синий на рисунке) и его C-концевой домен (зеленый на рисунке).
N-концевой домен состоит из двух амфипатических α-спиралей (αA - αB), которые отвечают за липидная мембрана взаимодействие. Считается, что эта область белка опосредует связывание хинона.
Что касается С-концевого домена, многие из его структурных элементов являются общими с растворимыми аналогами DHOQO. Этот домен отвечает за привязку кофактора FMN (делая эти ферменты частью Флавопротеин суперсемейство) и донор электронов дигидрооротат, близко к сердцевине из 8 β-тяжей.
В настоящее время существуют кристаллографические структуры DHOQO из 5 различных организмов:
- кишечная палочка (пример PDB: 1F76)[10]
- Микобактерии туберкулеза (пример PDB: 4XQ6)[11]
- Homo sapiens (пример PDB: 4IGH)[12]
- Раттус норвегикус (пример PDB: 4ORI)[13]
- Плазмодий falciparum (пример PDB: 1TV5)[14]
Рекомендации
- ^ Форман Х. Дж., Кеннеди Дж. (Ноябрь 1978 г.). «Дигидрооротатдегидрогеназа млекопитающих: физические и каталитические свойства первичного фермента». Архивы биохимии и биофизики. 191 (1): 23–31. Дои:10.1016/0003-9861(78)90063-2. PMID 216313.
- ^ Хайнс В., Киз Л.Д., Джонстон М. (август 1986 г.). «Очистка и свойства митохондриальной дигидрооротатдегидрогеназы печени крупного рогатого скота». Журнал биологической химии. 261 (24): 11386–92. PMID 3733756.
- ^ Бадер Б., Кнехт В., Фрис М., Лёффлер М. (август 1998 г.). «Экспрессия, очистка и характеристика меченой гистидином крысы и флавоэнзима дигидрооротатдегидрогеназы человека». Экспрессия и очистка белков. 13 (3): 414–22. Дои:10.1006 / преп.1998.0925. PMID 9693067.
- ^ Фаган Р.Л., Нельсон М.Н., Пагано П.М., Палфей Б.А. (декабрь 2006 г.). «Механизм восстановления флавинов в дигидрооротатдегидрогеназах 2 класса». Биохимия. 45 (50): 14926–32. Дои:10.1021 / bi060919g. PMID 17154530.
- ^ Бьёрнберг О., Грюнер А.С., Рёпсторф П., Йенсен К.Ф. (март 1999 г.). «Активность дигидрооротатдегидрогеназы Escherichia coli зависит от консервативной петли, идентифицированной по гомологии последовательностей, мутагенезу и ограниченному протеолизу». Биохимия. 38 (10): 2899–908. Дои:10.1021 / bi982352c. PMID 10074342.
- ^ J. Leban, D. Vitt. Ингибиторы дигидрооротатдегидрогеназы человека, новый подход к лечению аутоиммунных и воспалительных заболеваний, Arzneimittel-Forschung / Drug Res. (2011). https://doi.org/10.1055/s-0031-1296169
- ^ Р.И. Кристоферсон, С.Д. Лайонс, П. Уилсон, Ингибиторы биосинтеза нуклеотидов de novo как лекарственные средства, Acc. Chem. Res. (2002). https://doi.org/10.1021/ar0000509
- ^ М. Лёффлер, Л.Д. Фэрбенкс, Э. Замейтат, А.М. Маринаки, Х.А. Simmonds, Пути пиримидинов в здоровье и болезнях, Trends Mol. Med. (2005). https://doi.org/10.1016/j.molmed.2005.07.003
- ^ Д. Ланг, Р. Тома, М. Хенн-Сакс, Р. Стернер, М. Уилманнс, Структурные доказательства эволюции каркаса β / α бочонка путем дупликации и слияния генов, Science (80-.). (2000). https://doi.org/10.1126/science.289.5484.1546
- ^ Дигидрооротатдегидрогеназа E. coli обнаруживает структурные и функциональные различия между различными классами дигидрооротатдегидрогеназ. DOI: 10.1016 / s0969-2126 (02) 00831-6
- ^ КРИСТАЛЛИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ДИГИДРООРОТАТ ДЕГИДРОГЕНДА ИЗ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS. DOI: 10.2210 / pdb4XQ6 / pdb
- ^ Оптимизация на основе SAR аналога 4-хинолинкарбоновой кислоты с сильной противовирусной активностью. DOI: 10.1021 / ml300464h
- ^ Фтор модулирует селективность видов в триазолопиримидиновом классе ингибиторов дигидрооротатдегидрогеназы Plasmodium falciparum. DOI: 10.1021 / jm500481t
- ^ Структура дигидрооротатдегидрогеназы Plasmodium falciparum со связанным ингибитором. DOI: 10.1107 / S0907444905042642
внешняя ссылка
- Дигидрооротат + дегидрогеназа + (хинон) в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
 | Этот фермент -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |